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主文
１被告は，原告に対し，以下の各金員を支払え。
(1)金１３億１４８１万２６００円，並びに，うち金１２億８６４５万５０
００円に対する平成１９年１月１日から，うち金２７２４万８０００円に対
する同年７月２３日から及びうち金１１０万８０００円に対する同年８月１
０日から各支払済みまで，同年１２月３１日までについては年４．４パーセ
ントの割合，及び，平成２０年１月１日以降については年７．３パーセント
又は地方税法附則３条の２第１項に規定する特例基準割合（０．１パーセン
ト未満の端数があるときは，これを切り捨てる。）のいずれか低い割合によ
る金員
(2)金１億２７５９万８７１３円
２被告は，原告に対し，以下の各金員を支払え。
(1)金６億６４３７万９７００円，並びに，うち金６億５６７５万７０００
円に対する平成１９年１月１日から，うち金７３２万４０００円に対する同
年７月２３日から及びうち金２９万７０００円に対する同年８月１０日から
各支払済みまで，同年１２月３１日までについては年４．４パーセントの割
合，及び，平成２０年１月１日以降については年７．３パーセント又は地方
税法附則３条の２第１項に規定する特例基準割合（０．１パーセント未満の
端数があるときは，これを切り捨てる。）のいずれか低い割合による金員
(2)金３９３９万４６２３円
３訴訟費用は被告の負担とする。
事実及び理由
第１請求
１主位的請求
(1)主文第１項同旨
(2)主文第２項同旨
２予備的請求
(1)主位的請求(1)の予備的請求
ア神奈川県川崎県税事務所長が原告に対し平成１９年５月２２日付けでし
た，原告の平成１５年４月１日から平成１６年３月３１日までの課税事業
年度の神奈川県臨時特例企業税に係る更正及び過少申告加算金決定を取り
消す。
イ被告は，原告に対し，以下の各金員を支払え。
(ア)金１３億１４８１万２６００円，並びに，うち金１２億８６４５万
５０００円に対する平成１９年１月１日から，うち金２７２４万８００
０円に対する同年６月２３日から及びうち金１１０万８０００円に対す
る同年７月１０日から各支払済みまで，同年１２月３１日までについて
は年４．４パーセントの割合，及び，平成２０年１月１日以降について
は年７．３パーセント又は地方税法附則３条の２第１項に規定する特例
基準割合（０．１パーセント未満の端数があるときは，これを切り捨て
る。）のいずれか低い割合による金員
(イ)金９９８５万３５７９円
(2)主位的請求(2)の予備的請求
ア神奈川県川崎県税事務所長が原告に対し平成１９年５月２２日付けでし
た，原告の平成１６年４月１日から平成１７年３月３１日までの課税事業
年度の神奈川県臨時特例企業税に係る更正及び過少申告加算金決定を取り
消す。
イ被告は，原告に対し，以下の各金員を支払え。
(ア)金６億６４３７万９７００円，並びに，うち金６億５６７５万７０
００円に対する平成１９年１月１日から，うち金７３２万４０００円に
対する同年６月２３日から及びうち金２９万７０００円に対する同年７
月１０日から各支払済みまで，同年１２月３１日までについては年４．
４パーセントの割合，及び，平成２０年１月１日以降については年７．
３パーセント又は地方税法附則３条の２第１項に規定する特例基準割合
（０．１パーセント未満の端数があるときは，これを切り捨てる。）の
いずれか低い割合による金員
(イ)金３４７４万６９４３円
第２事案の概要
本件は，被告が，神奈川県臨時特例企業税条例（平成１３年神奈川県条例第
３７号。同年８月１日施行。以下「本件条例」という。）を制定し，地方税法
４条３項，２５９条以下の規定に基づく道府県法定外普通税として，神奈川県
内に事務所又は事業所を有し資本の金額又は出資金額が５億円以上の法人に対
し，法人の事業税（以下「法人事業税」という。）の課税標準である所得の金
額の計算上繰越控除欠損金額を損金の額に算入しないものとして計算した場合
の所得の金額に相当する金額（当該金額が繰越控除欠損金額を超える場合は繰
越控除欠損金額に相当する金額）を課税標準とし，税率を原則１００分の３
（平成１６年４月１日以降は１００分の２）とする臨時特例企業税（以下「企
業税」という。）を課したところ，その対象となった原告が，本件条例は法人
事業税につき欠損金額の繰越控除を定めた地方税法の規定を潜脱して課税する
ものであり，違法・無効であるなどとして，被告に対し，主位的に，原告が納
付した平成１５年度分及び平成１６年度分の企業税，過少申告加算金及び延滞
金に相当する金額の誤納金としての還付並びにその還付加算金の支払（請求１
(1)，(2)）を，予備的に，神奈川県川崎県税事務所長が原告に対してした上記
各年度分の企業税の更正及び過少申告加算金決定の取消し（請求２(1)，(2)の
各ア），上記金額の過納金としての還付並びにその還付加算金の支払（請求２
(1)，(2)の各イ）を，それぞれ求めた事案である。
第３法令等の定め
１法人事業税に関する規定
法人事業税は，法人の行う事業に対し，事務所又は事業所所在の道府県にお
いて，その法人に課するものである（平成１５年法律第９号による改正（平成
１６年４月１日施行）前の地方税法（以下「改正前地方税法」という。）７２
条１項，同改正後の地方税法７２条の２第１項）。
(1)課税標準に関する規定
ア改正前地方税法７２条の１２は，法人事業税の課税標準につき，電気供
給業，ガス供給業，生命保険業及び損害保険業（以下，併せて「電気供給
業等」という。）については各事業年度の収入金額，その他の事業につい
ては各事業年度の所得及び清算所得によるものと規定していた（なお，同
条は，特定信託に係る信託業について，各特定信託の各計算期間の所得等
を課税標準とするなど規定しているが，同信託業に関する部分については，
以下，判断の対象としない。）。同法７２条の１４第１項は，この法人事
業税の課税標準としての各事業年度の所得につき，各事業年度の益金の額
から損金の額を控除した金額によるものとし，同法又は政令で特別の定め
をする場合を除くほか，当該各事業年度の法人税の課税標準である所得の
計算の例によって算定するものと規定していた。
ただし，改正前地方税法７２条の１９は，法人事業税の課税標準の特例
を設け，電気供給業等以外の事業に対する法人事業税の課税標準について
は，事業の情況に応じ，所得及び清算所得によらないで，資本金額，売上
金額，家屋の床面積若しくは価格，土地の地積若しくは価格，従業員数等
を課税標準とし，又は所得及び清算所得とこれらの課税標準とをあわせ用
いることができるものと規定していた。
イ平成１５年法律第９号による改正後の地方税法（以下，特に「改正後地
方税法」ということがある。ただし，内容は同改正の施行当時のものとす
る。）は，法人事業税につき付加価値割，資本割及び所得割等の区分を設
けた（同法７２条，７２条の２第１項）。そして，同法７２条の１２第１
号は，法人事業税の課税標準につき，電気供給業等以外の事業については，
以下に掲げる法人事業税の区分に応じ，それぞれ以下に定めるものによる
旨を規定する。
「イ付加価値割各事業年度の付加価値額
ロ資本割各事業年度の資本等の金額
ハ所得割各事業年度の所得及び清算所得」
このうち，付加価値額は，各事業年度の報酬給与額，純支払利子及び純
支払賃借料の合計額と各事業年度の単年度損益との合計額によるもの（改
正後地方税法７２条の１４），資本等の金額は，各事業年度終了の日にお
ける資本の金額等によるもの（同法７２条の２１第１項），所得は，各事
業年度の益金の額から損金の額を控除した金額により，地方税法又は政令
で特別の定めをする場合を除くほか，当該各事業年度の法人税の課税標準
である所得の計算の例によって算定するもの（改正後地方税法７２条の２
３第１項）とされている（なお，連結申告法人については別途規定があり，
上記に準じた内容である。）。そして，資本の金額又は出資金額が１億円
を超え同法７２条の２第１項１号イに該当する法人については，付加価値
割額，資本割額及び所得割額の合算額によって法人事業税が課されるもの
とされている（同法７２条の２第１項１号イ）。
上記改正に伴い，改正前地方税法７２条の１９において設けられていた
法人事業税の課税標準の特例は，資本の金額又は出資金額が１億円を超え
付加価値割額，資本割額及び所得割額の合算額によって法人事業税が課さ
れる法人については，廃止された（改正後地方税法７２条の２４の４）。
ウ法人税法２２条１項は，法人税の課税標準である各事業年度の所得の金
額（同法２１条）を，当該事業年度の益金の額から当該事業年度の損金の
額を控除した金額とするものと規定する。
そして，法人税法５７条１項は，確定申告書を提出する内国法人の各事
業年度開始の日前７年（平成１６年法律第１４号による改正前は５年）以
内に開始した事業年度において生じた欠損金額（同項の規定により当該各
事業年度前の事業年度の所得の金額の計算上損金の額に算入されたもの及
び同法８０条（欠損金の繰戻しによる還付）の規定により還付を受けるべ
き金額の計算の基礎となつたものを除く。）がある場合には，当該欠損金
額に相当する金額は，当該各事業年度の所得の金額の計算上，損金の額に
算入するもの（ただし，当該欠損金額に相当する金額が，当該欠損金額に
つき損金の額への算入をしないものとして計算した場合における当該各事
業年度の所得の金額を超える場合は，その超える部分の金額については，
この限りでない。）と規定する。この法人税法５７条１項の規定は，同項
の内国法人が欠損金額の生じた事業年度について青色申告書である確定申
告書を提出し，かつ，その後において連続して確定申告書を提出している
場合に限り，適用される（同条１０項）。
(2)税率に関する規定
ア改正前地方税法７２条の２２は，法人事業税の標準税率を規定し，同条
第８項は，道府県は，標準税率を超える税率で法人事業税を課する場合に
は，標準税率に１．１を乗じて得た率を超える税率で課することができな
いものと規定していた。本件条例の施行当時（平成１３年８月１日），法
人事業税の標準税率は，一般の法人の場合，各事業年度の所得のうち年４
００万円以下の金額の１００分の５，各事業年度の所得のうち年４００万
円を超え年８００万円以下の金額の１００分の７．３並びに各事業年度の
所得のうち年８００万円を超える金額及び清算所得の１００分の９．６と
されていた（同法７２条の２２第１項３号，同法附則４０条１０項）。
イ改正後地方税法７２条の２４の７は，法人事業税の各区分（付加価値割，
資本割及び所得割等）に応じ，それぞれ標準税率を規定し，同条第８項は，
道府県は，標準税率を超える税率で法人事業税を課する場合には，標準税
率に１．２を乗じて得た率を超える税率で課することができないものと規
定する。改正後地方税法において，法人事業税の所得割の標準税率は，各
事業年度の所得のうち年４００万円以下の金額の１００分の３．８，各事
業年度の所得のうち年４００万円を超え年８００万円以下の金額の１００
分の５．５並びに各事業年度の所得のうち年８００万円を超える金額及び
清算所得の１００分の７．２とされた（同法７２条の２４の７第１項１号
ハ，同法附則４０条１０項）。
２道府県法定外普通税に関する規定
地方税法４条２項は，道府県は，普通税として，事業税その他同項各号に掲
げるもの（以下，単に「法定税」ということがある。）を課するものとする
（ただし，徴収に要すべき経費が徴収すべき税額に比して多額であると認めら
れるものその他特別の事情があるものについては，この限りでない。）旨を規
定する。一方，同条３項は，道府県は，同条２項各号に掲げるものを除くほか，
別に税目を起こして，普通税（道府県法定外普通税。以下，単に「法定外税」
ということがある。）を課することができる旨を規定する。
地方税法２５９条１項（平成１６年法律第１７号による改正前は２５９条。
以下同じ。）は，道府県は，法定外税の新設又は変更をしようとする場合にお
いては，あらかじめ，総務大臣に協議し，その同意を得なければならないもの
と規定する。そして，同法２６１条は，総務大臣は，同法２５９条１項の規定
による協議の申出を受けた場合には，当該協議の申出に係る法定外税について
次に掲げる事由のいずれかがあると認める場合を除き，これに同意しなければ
ならないものと規定する。
「一国税又は他の地方税と課税標準を同じくし，かつ，住民の負担が著しく過
重となること。
二地方団体間における物の流通に重大な障害を与えること。
三前二号に掲げるものを除くほか，国の経済施策に照らして適当でないこ
と。」
３本件条例の規定
(1)本件条例の施行当時（平成１３年８月１日）の内容（抜粋）は，以下の
とおりであった（なお，略称は本件条例限りのものである。甲１）。
「（課税の根拠）
第２条県は，地方税法（昭和２５年法律第２２６号。以下「法」とい
う。）第４条第３項の規定に基づき，当分の間の措置として臨時特例
企業税を課する。
（定義）
第３条この条例において，次の各号に掲げる用語の意義は，当該各号に定
めるところによる。
(1)課税事業年度事業年度（法第７２条の１３に規定する事業年度
をいう。以下同じ。）のうち，法人の事業税の課税標準である所得の
金額の計算において繰越控除欠損金額を損金の額に算入した事業年度
（当該事業年度終了の日の資本の金額又は出資金額が５億円未満の事
業年度及び清算中の事業年度を除く。）をいう。
(2)繰越控除欠損金額法人の事業税の課税標準である各事業年度の
所得を法第７２条の１４第１項本文の規定により当該法人の当該各事
業年度の法人税の課税標準である所得の計算の例によって算定する場
合において，法人税法（昭和４０年法律第３４号）第５７条第１項
（略）の規定により当該各事業年度の所得の金額の計算上，損金の額
に算入することとされている欠損金額に相当する金額（略）をいう。
(3)県分割合県内に所在する事務所又は事業所に係る分割基準の数
値（法第７２条の４８第１項の規定により法人の事業税の課税標準の
総額を分割する際に用いられる同条第２項に規定する分割基準の数値
をいう。以下同じ。）を県内及び他の都道府県内に所在する事務所又
は事業所に係る分割基準の数値で除して得た数値をいう。」
「（納税義務者等）
第５条臨時特例企業税は，県内に事務所又は事業所を設けて行う法人の事
業活動に対し，その法人に課する。
２（略）
（非課税）
第６条次の各号のいずれかに該当する法人が行う事業活動並びに電気供給
業，ガス供給業，生命保険業及び損害保険業に係る事業活動に対して
は，臨時特例企業税を課さない。
(1)国及び法人税法第２条第５号に規定する公共法人
(2)法人税法第２条第６号に規定する公益法人等（略）
（課税標準）
第７条臨時特例企業税の課税標準は，各課税事業年度における法人の事業
税の課税標準である所得の金額の計算上，繰越控除欠損金額を損金の
額に算入しないものとして計算した場合における当該各課税事業年度
の所得の金額に相当する金額（当該金額が繰越控除欠損金額に相当す
る金額を超える場合は，当該繰越控除欠損金額に相当する金額）とす
る。
２県と他の都道府県とにおいて事務所又は事業所を設けて事業活動を
行う法人の課税標準は，前項の規定にかかわらず，同項の規定によっ
て計算した金額に県分割合を乗じて得た金額とする。
３（略）
（税率）
第８条臨時特例企業税の税率は，次の各号に掲げる区分に応じ，当該各号
に掲げる率とする。
(1)法第７２条の２２第４項に規定する特別法人１００分の２
(2)その他の法人１００分の３
（徴収の方法）
第９条臨時特例企業税の徴収については，申告納付の方法による。」
(2)平成１６年神奈川県条例第１８号による改正（同年４月１日施行）後の
本件条例は，企業税の課税標準につき，改正前は法人事業税の課税標準であ
る所得の金額の計算を基準としていたところを，法人事業税の「所得割」の
課税標準である所得の金額の計算を基準として，改正前と同様，繰越控除欠
損金額を損金の額に算入しないものとして計算した場合における当該各課税
事業年度の所得の金額に相当する金額（当該金額が繰越控除欠損金額に相当
する金額を超える場合は，当該繰越控除欠損金額に相当する金額）を課税標
準とする旨を規定する（本件条例３条１号，２号，７条１項）（なお，連結
申告法人については別途規定があり，上記に準じた内容である。）。
また，上記改正後の本件条例は，企業税の税率につき，一律に１００分の
２と規定する（本件条例８条）。
さらに，上記改正後の本件条例は，平成１６年４月１日以後に開始する各
事業年度分の企業税の課税標準の計算においては，同年３月３１日以前に開
始した事業年度において生じた欠損金額に相当する金額に限り繰越控除欠損
金額として考慮する旨（本件条例附則３項），及び，平成２１年３月３１日
限り本件条例がその効力を失う（ただし，同日以前に終了する事業年度分の
企業税については，同日後もなお効力を有する。）旨を規定する（同２項）
（甲５０，乙１９）。
(3)本件条例は，要するに，地方税法４条３項の規定に基づく法定外税とし
て，神奈川県内に事務所又は事業所を設けて行う法人の事業活動に対し，そ
の法人に，法人事業税（又はその所得割）の課税標準である所得の金額の計
算上繰越控除欠損金額を損金の額に算入しないものとして計算した場合にお
ける当該各課税事業年度の所得の金額に相当する金額（当該金額が繰越控除
欠損金額に相当する金額を超える場合は，当該繰越控除欠損金額に相当する
金額）を課税標準とし，税率を１００分の３ないし１００分の２とする企業
税を課するものである（本件条例３条１号，２号，７条１項，８条）。
上記の繰越控除欠損金額とは，法人事業税（又はその所得割）の課税標準
である各事業年度の所得を改正前地方税法７２条の１４第１項（改正後地方
税法７２条の２３第１項）の規定により当該法人の当該各事業年度の法人税
の課税標準である所得の計算の例によって算定する場合において，法人税法
５７条１項の規定により，当該各事業年度の所得の金額の計算上，損金の額
に算入することとされている欠損金額に相当する金額である（以下同じ。）。
第４基礎となる事実
（以下の事実は，当事者間に争いがない事実であるか，末尾に記載した証拠な
いし弁論の全趣旨により容易に認められる事実である。）
１原告
原告は，自動車，産業用運搬車両等及びこれらの部品等の製造，販売等を業
とする株式会社であり，東京都品川区に本店を有する一方，神奈川県藤沢市に
工場の一つを有し，同工場において自動車等の製造等を行っている。
原告の資本の金額は，本件に関係のある期間を通じ，５億円以上である（甲
１１６）。
２本件条例の制定及び改正の経緯
(1)神奈川県議会は，平成１３年３月２１日，本件条例案を可決した（甲
１）。
被告は，平成１３年３月２２日，改正前地方税法２５９条の規定に基づき，
総務大臣に対し，企業税の新設について協議の申出をした（甲１１の１）。
上記協議の申出を受けて，総務大臣は，平成１３年４月４日，地方税法２
６０条１項の規定に基づき，財務大臣に対し，被告から協議の申出を受けた
ことを通知したが，財務大臣から同条２項所定の異議の申出はされなかった。
また，総務大臣は，被告との協議の後，同法２６０条の２の規定に基づき，
地方財政審議会に対し，意見を求めたところ，同審議会は，同年６月２０日，
企業税について同意することが適当と考える旨の意見を述べた。これを受け
て，総務大臣は，同月２２日付けで，企業税の新設について同意した（甲４
４，争いのない事実）。
上記同意を受けて，本件条例は，平成１３年７月２日に公布され，同年８
月１日に施行された（甲５０）。
(2)前記第３，１(1)イのとおり，平成１５年法律第９号による地方税法の改
正（平成１６年４月１日施行）により，法人事業税にいわゆる外形標準課税
が一部導入され，付加価値割，資本割及び所得割等の区分が設けられた。こ
れに対応して，前記第３，３(2)のとおり，本件条例も改正（同日施行）さ
れ，企業税の課税標準につき，従前は法人事業税の課税標準である所得の金
額の計算を基準としていたところ，法人事業税の「所得割」の課税標準であ
る所得の金額の計算を基準とすることとされ（本件条例３条１号，２号，７
条１項），また，税率も従前の原則１００分の３から一律１００分の２に引
き下げられた（同８条）。
また，上記の本件条例の改正により，平成１６年４月１日以後に開始する
事業年度において生じた欠損金額は企業税の課税標準において考慮されない
こととされたことから（本件条例附則３項），企業税の課税の範囲が段階的
に縮小していくことになった上，本件条例は原則として平成２１年３月３１
日限りその効力を失うこととなった（同附則２項）。
なお，被告は，上記の本件条例の改正の際には，総務大臣に協議の申出を
しておらず，その同意も得ていない。
３課税及び不服申立て等の経緯（別表１及び２参照）
(1)原告は，法人税につき，欠損金額の生じた事業年度について青色申告書
である確定申告書を提出し，かつ，その後において連続して確定申告書を提
出していたことにより（法人税法５７条１０項），平成１５年４月１日から
平成１６年３月３１日までの事業年度（以下「平成１５年度」という。）及
び平成１６年４月１日から平成１７年３月３１日までの事業年度（以下「平
成１６年度」という。）の法人事業税（又はその所得割）の課税標準である
所得の計算上，繰越控除欠損金額を生じていた。
(2)原告は，申告期限内の平成１６年６月２８日，神奈川県川崎県税事務所
長（以下「県税事務所長」という。）に対し，平成１５年度分の企業税につ
いて，課税標準額を４２８億８１８５万５０００円，税額を１２億８６４５
万５６００円とする申告をし，同月３０日，同額を納付した（甲２，争いの
ない事実）。
しかし，原告は，平成１６年１１月８日，県税事務所長に対し，本件条例
は地方税法に違反するとして，平成１５年度分の企業税の全額の減額を求め
る旨の更正の請求をした。これに対し，県税事務所長は，平成１６年１２月
６日付けで，更正をすべき理由がない旨の通知をした（甲３，４）。
そこで，原告は，平成１７年１月２４日，神奈川県知事に対し，上記通知
についての審査請求をしたが，同知事は，同年４月２７日付けで，これを棄
却する旨の裁決をした（甲５，６）。
(3)原告は，申告期限内の平成１７年６月１５日，県税事務所長に対し，平
成１６年度分の企業税について，課税標準額を３２８億３７８７万９０００
円，税額を６億５６７５万７５００円とする申告をし，同日，同額を納付し
た（甲７，争いのない事実）。
しかし，原告は，平成１７年６月１６日，県税事務所長に対し，本件条例
は地方税法に違反するとして，平成１６年度分の企業税の全額の減額を求め
る旨の更正の請求をした。これに対し，県税事務所長は，平成１７年７月２
０日付けで，更正をすべき理由がない旨の通知をした（甲８，９）。
そこで，原告は，平成１７年７月２２日，神奈川県知事に対し，上記通知
についての審査請求をしたが，同知事は，同年１０月２０日付けで，これを
棄却する旨の裁決をした（甲１０の１・２）。
(4)原告は，平成１７年１０月２５日，平成１５年度分及び平成１６年度分
の企業税に係る更正をすべき理由がない旨の各通知（以下「本件各通知」と
いう。）の取消し等を求めて，本件訴訟を提起した。
(5)県税事務所長は，本件訴訟係属中の平成１９年５月２２日付けで，原告
に対し，平成１５年度分の企業税について，課税標準額を４３７億０７５８
万３０００円，税額を１３億１１２２万７４００円（新たに納付すべき税額
２４７７万１８００円）とする（増額）更正及び過少申告加算金を２４７万
７１００円とする過少申告加算金決定を，平成１６年度分の企業税について，
課税標準額を３３１億７０８０万７０００円，税額を６億６３４１万６１０
０円（新たに納付すべき税額６６５万８６００円）とする（増額）更正及び
過少申告加算金を６６万５８００円とする過少申告加算金決定を，それぞれ
した（甲１６０，１６１。以下，平成１５年度分及び平成１６年度分の各更
正を「本件各更正」といい，同各年度分の各過少申告加算金決定を「本件各
加算金決定」といい，あわせて「本件各更正等」という。）。
原告は，平成１９年６月２２日，平成１５年度分の更正により納付すべき
税額２４７７万１８００円及び過少申告加算金額２４７万７１００円並びに
平成１６年度分の更正により納付すべき税額６６５万８６００円及び過少申
告加算金額６６万５８００円の合計額３４５７万３３００円を納付した（甲
１６２の１）。また，原告は，平成１９年７月９日，平成１５年度分の更正
により生じた延滞金額１１０万８１００円及び平成１６年度分の更正により
生じた延滞金額２９万７８００円の合計額１４０万５９００円を納付した
（甲１６２の２）。
原告は，平成１９年６月２８日，神奈川県知事に対し，本件各更正等につ
いての審査請求をしたが，同知事は，同年８月８日付けで，これを棄却する
旨の裁決をした（甲１６３，１６４）。
(6)原告は，平成１９年８月２４日，本件各更正等の取消しを求める訴え等
を追加した。これに伴い，原告は，本件各通知の取消しの訴えを取り下げた。
第５課税根拠に関する当事者の主張
本件各更正等及び延滞金の根拠に関する被告の主張は以下のとおりであり，
いずれも，本件各更正等及び原告が納付した延滞金の金額と同額である。原告
は，本件条例が適法・有効であるとした場合のこれら各課税根拠事実について
は特に争わない。
１平成１５年度分
(1)更正
ア繰越控除欠損金額を損金の額に算入しないものとして計算した場合の所
得金額５３７億８０７１万１８８９円
上記金額は，次の各金額の合計額である。
(ア)所得金額０
円
(イ)損金の額に算入した繰越控除欠損金額に相当する金額
５３７億８０７１万１８８９円
イ課税基準額５３７億８０７１万１８８９円
ウ県分割合０．８１２７
エ算出標準額４３７億０７５８万３０００円
上記金額は，前記イの課税基準額（ただし，地方税法２０条の４の２第
１項の規定により１０００円未満の端数を切り捨てた後のもの。）に前記
ウの県分割合を乗じて算出した金額（ただし，同様に１０００円未満の端
数を切り捨てた後のもの。）である。
オ納付すべき企業税額１３億１１２２万７４００円
上記金額は，前記エの算出標準額に本件条例８条２号（平成１６年神奈
川県条例第１８号による改正前のもの）の税率１００分の３を乗じて算出
した金額（ただし，地方税法２０条の４の２第３項により１００円未満の
端数を切り捨てた後のもの。）である。
(2)過少申告加算金決定
ア基礎税額２４７７万１０００円
上記金額は，原告が平成１５年度分の企業税に係る更正により新たに納
付すべきこととなった金額２４７７万１８００円につき，地方税法２０条
の４の２第２項の規定により１０００円未満の端数を切り捨てた後のもの
である。
イ過少申告加算金額２４７万７１００円
上記金額は，前記アの基礎税額に，地方税法２７８条１項の規定に基づ
き１００分の１０を乗じて算出した金額である。
(3)延滞金
延滞金額１１０万８１００円
上記金額は，前記(2)アの基礎税額に，地方税法２７７条１項，２項及び
同法附則３条の２第１項の規定に基づき，納期限の翌日から納付の日までの
期間の日数に応じ，各年の特例基準割合（０．１パーセント未満の端数があ
るときは，これを切り捨てる。以下同じ。）を乗じて算出した以下の各金額
（ただし，平成１５年１月３０日税第４５６号により，平成１７年７月１日
から平成１９年５月２２日までの期間の延滞金は減免した。）の合計額（た
だし，同法２０条の４の２第５項の規定により１００円未満の端数を切り捨
てた後のもの。）である。
ア平成１６年７月１日から平成１７年６月３０日まで３６５日間分
１０１万５６１１円
同期間の特例基準割合は，４．１パーセントである。
イ平成１９年５月２３日から同年６月２２日まで３１日間分
９万２５６８円
同期間の特例基準割合は，４．４パーセントである。
２平成１６年度分
(1)更正
ア繰越控除欠損金額を損金の額に算入しないものとして計算した場合の所
得金額４５０億３１７９万９２５４円
上記金額は，次の各金額の合計額である。
(ア)所得金額２７億１６６９万８１３６
円
(イ)損金の額に算入した繰越控除欠損金額に相当する金額
４２３億１５１０万１１１８円
イ課税基準額４２３億１５１０万１１１８円
前記アの金額がア(イ)の金額を超えるため，ア(イ)の金額が課税基準額
となる。
ウ県分割合０．７８３９
エ算出標準額３３１億７０８０万７０００円
上記金額は，前記イの課税基準額（１０００円未満の端数切り捨て）に
前記ウの県分割合を乗じて算出した金額（１０００円未満の端数切り捨
て）である。
オ納付すべき企業税額６億６３４１万６１００円
上記金額は，前記エの算出標準額に本件条例８条（平成１６年神奈川県
条例第１８号による改正後のもの）の税率１００分の２を乗じて算出した
金額（１００円未満の端数切り捨て）である。
(2)過少申告加算金決定
ア基礎税額６６５万８０００円
上記金額は，原告が平成１６年度分の企業税に係る更正により新たに納
付すべきこととなった金額６６５万８６００円につき，１０００円未満の
端数を切り捨てた後のものである。
イ過少申告加算金額６６万５８００円
上記金額は，前記アの基礎税額に，地方税法２７８条１項の規定に基づ
き１００分の１０を乗じて算出した金額である。
(3)延滞金
延滞金額２９万７８００円
上記金額は，前記１(3)と同様，前記(2)アの基礎税額に，納期限の翌日か
ら納付の日までの期間の日数に応じ，各年の特例基準割合を乗じて算出した
以下の各金額（ただし，平成１５年１月３０日税第４５６号により，平成１
８年７月１日から平成１９年５月２２日までの期間の延滞金は減免した。）
の合計額（１００円未満の端数切り捨て）である。
ア平成１７年７月１日から平成１８年６月３０日まで３６５日間分
２７万２９７８円
同期間の特例基準割合は，４．１パーセントである。
イ平成１９年５月２３日から同年６月２２日まで３１日間分
２万４８８０円
同期間の特例基準割合は，４．４パーセントである。
第６争点及び争点に関する当事者の主張
１争点
(1)本件条例の適法性及び有効性
原告が主張する本件条例の違法・無効事由は，
①法人事業税の課税標準につき欠損金額の繰越控除を定めた規定（改正前
地方税法７２条の１４第１項，改正後地方税法７２条の２３第１項）を潜
脱して課税するものであること，
②法人事業税につき制限税率を定めた規定（改正前地方税法７２条の２２
第８項，改正後地方税法７２条の２４の７第８項）を潜脱して課税するも
のであること，
③改正前地方税法７２条の１９の規定によらずに法人事業税の課税標準の
特例を設けるものであること，
④担税力を有しない繰越控除欠損金に課税するものであること，
⑤平成１５年法律第９号による地方税法改正の際に総務大臣の同意を欠く
こと，
⑥地方税法７条の要件を満たすことなく不均一課税をするものであること，
⑦国民の財産権を比例原則に反して侵害するもので憲法２９条に違反する
こと，及び，
⑧租税公平主義に反し，憲法１４条１項及び２９条に反すること，
の各点である。このうち，企業税は地方税法上の法人事業税に係る規定を潜
脱して課税するもので違法である旨の主張（①ないし③）が，中心的な主張
である。
これに対し，被告は，本件条例は地方団体（道府県又は市町村をいう（地
方税法１条１項１号）。以下同じ。）の課税自主権に基づき，同法２５９条
以下に規定する法定外税の新設に係る要件及び手続を満たして制定されたも
のであり，それ以外の法定税に係る規定は法定外税の準則となるものではな
いなどとして，原告主張の各違法事由に理由はなく，本件条例は適法・有効
であると主張する。
(2)本件各更正等の有効性並びに誤納金及び還付加算金の額
原告は，主位的に，違法・無効な本件条例に基づく本件各更正等は無効で
あるとして，納付した企業税，過少申告加算金及び延滞金の誤納金としての
還付並びにその還付加算金の支払を求めている（請求１(1)，(2)）。
(3)本件各更正等の取消事由の有無並びに過納金及び還付加算金の額
原告は，予備的に，違法・無効な本件条例に基づく本件各更正等は仮に無
効でないとしても取り消されるべきであるとして，その取消し，納付した企
業税，過少申告加算金及び延滞金の過納金としての還付並びにその還付加算
金の支払を求めている（請求２(1)，(2)）。
２争点(1)（本件条例の適法性及び有効性）について
＜原告の主張＞
(1)地方税法２６１条所定の総務大臣の同意は法定外税の適法性を審査する
ものではないこと
ア地方税法２６１条は，国の行政機関たる総務大臣が一定の行政目的を実
現するため法定外税の新設又は変更に関して行う，国の関与の一類型とし
ての同意制度（地方自治法２４５条１号ニ）を定めたものである。そして，
地方税法２６１条各号の事由は，国の関与を必要最小限度のものにすると
いう原則（地方自治法２４５条の３）の下，異なる行政主体間の経済施策
等の調整のための関与の規律として，総務大臣による不同意の判断のため
の３要件を限定列挙し，これに該当しなければ総務大臣は必ず同意しなけ
ればならないとしたものであり，租税原則に合致しているかどうかといっ
た観点から法定外税が違法となる場合を類型化したものではない。すなわ
ち，地方税法２６１条に規定する同意制度は，法定外税の創設につき，国
の経済施策との整合性の確保等の行政目的を実現するための事前のチェッ
クの機会を設けたものにすぎず，同条各号の規定は法定外税の適法要件を
定めたものではない。
また，地方税法２６１条所定の総務大臣の同意がされても，同条各号の
いずれの事由にも該当しないと判断したにとどまり，当該法定外税が適法
であると判断したことを意味するものではない。現に，本件条例について
の同意の際にも，総務大臣は，同条に限定列挙された事由の有無のみを審
査しており，それを離れて，企業税が法人事業税に関する地方税法の規定
を潜脱する違法な法定外税かどうかなどといった適法性に関する検討は，
一切行われなかった。
イこのように，地方税法２６１条は法定外税の適法要件を定めたものでは
ないから，同条の同意が得られたとしても，当該法定外税が地方税法上適
法になるものではなく，当該条例が適法であるかどうかは，別途判断され
るべき問題である。すなわち，地方税法２５９条以下の規定に基づいて法
定外税条例が制定されたとしても，地方税法上の他の規律や他の法律に違
反していることがあり，その場合，納税義務者は，その違法性を訴訟手続
において主張し，課税処分を争うことができるというべきである。
横浜市の勝馬投票券販売税に関する国地方係争処理委員会平成１３国地
係１号・平成１３年７月２４日勧告も，地方税法２６１条所定の総務大臣
の同意は施策の整合性を確保するための国の行政機関の関与の一類型であ
るとした上で，法定外税が法律に違反するか否かは，総務大臣の同意の要
件ではなく，訴訟の前提問題として別途取り扱われるべき事柄であるとし
ている。
被告は，総務大臣の同意がされた法定外税については，地方議会の裁量
権の逸脱濫用や総務大臣の同意の判断の誤りの有無についてのみ事後的に
裁判所の司法審査が及ぶ旨を主張するが，課税処分取消訴訟における納税
義務者の主張がこれらの事由に限られるとする根拠はない。
ウ仮に，地方税法２６１条の総務大臣の同意が法定外税の適法性の判断に
基づいて行われたとしても，かかる行政機関による適法性の判断は，後の
課税処分取消訴訟において裁判所を拘束するものではない。
エしたがって，本件の争点は，総務大臣の同意の判断の適否ではなく，端
的に，企業税が地方税法の規律に照らして適法かどうかにある。
(2)法定税に関する規律を潜脱する法定外税条例は違法・無効であること
ア地方団体は，法律の範囲内で，法令に違反しない限りにおいてのみ条例
を制定することができる（憲法９４条，地方自治法１４条１項）。そして，
法律が全国一律の規制を設ける趣旨で規定をしている場合には，これと抵
触する規制を設ける条例は，法令に違反するものとして違法・無効となる。
地方税の課税については，地方税法が制定されており，地方団体は，そ
の枠内で課税権を行使しなければならない。法定税は，枠法としての地方
税法が特定の課税物件を取り上げ，その課税標準と負担水準たる税率を法
定しているものであるから，地方団体の課税権はその限度において制限さ
れている。この制限は，問題となっている租税が法定税の形式をとるか，
それとも法定外税の形式をとるかにかかわらないと解すべきである。そう
でなければ，地方税法が法定税に関して設けている厳格な制限が無に帰し
てしまうからである。
イ法律が全国一律に定める法定税の課税標準，税率等を法定税条例により
変更することは明らかに違法であるところ，法定外税条例の形式で実質的
に同様の変更を加えることも，法定税に係る規定の潜脱であり，許されな
い。
すなわち，地方税法上の法定税に関する規律は，準用規定がなくても法
定外税条例に及び，地方税法が地方団体の選択を認めていない全国一律の
規定（課税標準，制限税率，非課税規定等）に違反する条例は，法定税条
例であろうと，法定外税条例であろうと，違法・無効となる。
ウ法定税について地方税法上全国一律に定められた規律に変更を加えるに
は，法律の特別の委任ないしこれを許容する特別の定めが必要である。
しかし，法定外税に係る地方税法４条３項及び２５９条以下のいずれの
規定も，このような特別の委任ないし規定に該当しないし，法定税として
定めれば地方税法の全国一律のルールに反して違法となる税と実質的に同
視し得る税を，地方団体が法定外税条例により定めることを許容するもの
でもない。
エ被告は，地方税法２６１条１号において法定税と同一の課税標準を持つ
法定外税でさえ許容されている旨を強調する。
しかし，地方税法２６１条は，異なる行政主体間の経済施策等の調整の
ための，国の行政機関たる総務大臣の関与の手続規定にすぎず，法定税の
課税標準や制限税率等に係る委任規定ないし特別の許容規定と見ることは
できない。
例えば，法人事業税に関する制限税率は全国一律の規制であるところ，
仮に法人事業税と同一内容又は実質的にこれと同視し得る租税も，一旦法
定外税の名目で導入すれば，制限税率を超過しても「著しく過重な負担」
（地方税法２６１条１号）に至らない限り許容されるとするのは，明らか
に不合理である。法人事業税における制限税率の規制は，全国的な視点か
らの税財源の調整という役割を果たす全国一律の規制であって，法定税で
あろうと，法定外税であろうと，上乗せ課税を許さないものである。同号
は，法定税の規律に対する特例として，名目・形式を法定外税とすれば
「著しく過重な負担」とならない限り適法に課税できるという趣旨まで含
むものではないのである。
地方税法２６１条各号は抽象的かつ一般的な規定であり，このような抽
象的・一般的規定は，法定税たる法人事業税の課税標準や制限税率等の具
体的かつ詳細な規定の特別規定とはなり得ない。
(3)法人事業税における欠損金額の繰越控除は法律改正によらなければ変更
できない全国一律の規律であること
ア原告をはじめ法人税法上の青色申告法人には，法人税につき欠損金額の
必要的繰越控除が認められており，法人事業税についても，改正前地方税
法７２条の１４，改正後地方税法７２条の２３を介して，同制度が取り込
まれている。同各条は，法人事業税の課税標準である所得につき，「この
法律又は政令で特別の定めをする場合を除くほか」法人税の課税標準であ
る所得の計算の例によるとしており，条例によって変更できるものとはし
ていない。このように，欠損金額の必要的繰越控除は，法律上明記された，
全国一律の重要かつ基本的な制度である。
立法者は，欠損金額繰越控除制度を全国一律のルールとして定めたもの
と解され，法律の特別の委任なしに欠損金額の一部について繰越控除の適
用を遮断することは，書換条例に当たり許されない。
イ法人税法５７条１項は，人為的な課税年度ごとの当期所得課税は課税の
公平性を損ない，また所得課税における企業の担税力を現すものではない
と立法者が判断し，必要的に欠損金額の繰越控除を行わせることにより，
担税力をより適正に示す所得金額の算定をしようとするものである。すな
わち，立法者は，欠損金額の繰越控除を課税上の重要なルールとして定め
ているのである。
そして，このルールは，法人事業税の課税標準の算定上のルールとして
も採用されている。法人事業税についての欠損金額の繰越控除に関する規
定は，全国的な視点からの税財源の調整と納税者の権利保護を図るための
規定であり，全国一律の規制を施す趣旨である。欠損金額の全部又は一部
の繰越控除を認めないことになれば，納税者に大きな影響を及ぼすことに
なるから，必ず法律の改正でこれを行わなければならない。
ウ法人税法上，欠損金額の繰越控除は必要的調整事項とされ，納税者がそ
の適用を選択しなかった場合でも，税務当局がこれを是正して欠損金額の
繰越控除を行うものとされており，このことは，立法者が欠損金額の繰越
控除を重要で必須の制度と考えていることを示している。また，平成１６
年の税制改正において，金融・産業の構造改革を促進し，企業の国際競争
力を高めるため，法人税法上の欠損金額繰越控除制度は，平成１３年に遡
って，その繰越控除の対象期間が５年から７年に延長されたところであり
（同延長は法人事業税にも適用される。），このような重要な国策たる税
制についてその効果を制限するのであれば，税法の改正によらなければな
らないのは当然のことである。
エ現行の日本の租税制度の下において，所得を課税標準とする租税（法人
税，法人事業税，所得税，個人事業税，都道府県民税，市町村民税）のす
べてにおいて，欠損金額繰越控除制度が定められている。このことは，立
法者において，所得を平準化し通期課税の公平性を確保する同制度を，日
本の所得課税における根幹又は基本的構造に関わる重要かつ基本的な制度
と考え，繰越控除欠損金額に相当する利益はすべて所得課税の対象としな
いものとしていることを示している。そして，このような立法者意思に照
らせば，当該利益については，法人事業税のみならず，同税と実質的に同
一又は同種の租税の課税も禁止されると解すべきである。
オ被告は，欠損金額繰越控除制度をいかに定めるかは租税（立法）政策の
問題である旨を強調する。確かに，同制度の内容をどのようにするかは租
税（立法）政策の問題であるが，このような政策論と，一旦その内容が法
定された場合に当該内容を法律ではなく条例によって適法に変更できるか
という法的可能性（解釈論）とは，全く別個のものであって，本件の争点
は後者である。
(4)企業税は実質的に法人事業税の欠損金額の繰越控除を一部遮断するもの
（法人事業税の課税標準を実質的に変更するもの）であること
ア法人事業税と企業税は，いずれも法人の事業活動と都道府県の行政サー
ビスとの受益関係に着目して課する税であって，その趣旨及び目的は同一
である。そして，企業税は，以下のとおり，法人事業税の課税標準を実質
的に変更するものである。
企業税は，繰越控除欠損金額と相殺される当期所得金額を課税標準とし
ている。このような企業税は，結局，当期所得金額から法人事業税の課税
標準である所得を控除した金額を課税標準とし，法人事業税と一体となっ
て，当期所得金額の全体に課税することを可能にする仕組みと見ることが
でき，繰越控除の適用を部分的に否定する効果をもたらしている。
企業税は，法定税たる法人事業税の課税標準の算定過程の一部分のみを
切り出したものにすぎず，法人事業税の課税標準の修正を目的としたもの
であることは明らかである。すなわち，企業税は，法人事業税の所得計算
上の繰越欠損金の控除部分に対して一定の税率による課税を行うものであ
るから，まさに法人事業税の根幹部分の実質的変更に当たるといわなけれ
ばならない。法人事業税の課税標準の算定過程の一部である繰越欠損金の
損金算入部分のみを取り出してみたところで，それは租税理論上法人事業
税と別個独立の租税とはなり得ず，本質的には法人事業税の規定の変更措
置にほかならないのである。
イ(ア)神奈川県地方税制等研究会は，神奈川県知事の諮問を受け，被告の
行政サービスを受け当期損益が黒字になっているにもかかわらず欠損金
額繰越控除制度により法人事業税を負担していない法人に，相応の負担
を求めるため，法人事業税の欠損金額繰越控除制度の適用を遮断する方
策を検討し，その結果，企業税の創設を被告に提言した。同研究会の最
終報告書と本件条例の内容が同一であることからして，被告が同最終報
告書をそのまま受け入れて企業税を創設したことは明らかである。
神奈川県地方税制等研究会の中間報告書及び最終報告書においては，
法人事業税の欠損金額の繰越控除の遮断を行い得る仕組みを持つ新税と
して，法定外税（企業税）を創設すべきことが明記されている。そして，
欠損金額のうち投機的活動に起因するものについては繰越控除の適用を
遮断することが相当であるとの考えの下，当該欠損金額を欠損金全額の
３０パーセント程度とみなし，欠損金額の３０パーセントの繰越控除の
遮断を意図しつつ，これを課税標準ではなく税率設定の中で考慮するこ
ととし，課税標準を繰越控除欠損金額全額とする一方，法人事業税の税
率が約１０パーセントであることから，これに上記３０パーセントを掛
け合わせた３パーセントを税率とすることが適当である旨が記されてい
る。
また，このような企業税の創設の経緯は，本件条例の制定当時被告の
総務部税務課専任主幹の職にあったＰ１氏の論文「「臨時特例企業税」
の概要について」にも明記されている。
(イ)これらのことからすれば，企業税の本質は，法人事業税の課税標準
である所得の算定過程における欠損金額の繰越控除の部分のみを取り出
して，当該欠損金額の一部（３０パーセント）について，繰越控除の適
用を遮断し，法人事業税を課するものといえる。
すなわち，企業税は，法人事業税における欠損金額の繰越控除の適用
を３０パーセント遮断した場合の法人事業税の追加課税（法人事業税の
課税標準に繰越控除欠損金額の３０パーセントを加算して課税するも
の）と全く同一の効果をもたらすものであり，法人事業税と表裏一体の
関係に立つ「追加法人事業税」又は「第２法人事業税」なのである。
このように，企業税の導入の結果，地方税法の改正により初めて可能
となる法定税たる法人事業税の規定の変更と実質的に同じ効果がもたら
されているし，そもそも，企業税は，このような効果をもたらすことを
当初から意図して構築されているのである。
(5)企業税は法人事業税の課税標準につき欠損金額の繰越控除を定めた規定
を潜脱して課税するもので違法であること（違法事由①）
ア法人事業税に関する全国一律の規律である，欠損金額の繰越控除後の所
得を課税標準とする準則（改正前地方税法７２条の１４，改正後地方税法
７２条の２３）を一部変更する法定税条例は，当然に違法・無効である。
そして，これと同内容の法定外税条例も，違法な法定税条例と同一の課税
を行うものであるから，前記(2)のとおり違法・無効である。
この点，本件条例は，前記(4)のとおり，欠損金額の３０パーセントの
遮断割合を課税標準ではなく税率で反映させたものにすぎず，実質的には
欠損金額の繰越控除を一部遮断し，法人事業税の課税標準を一部変更する
ものであって，上記のような，法定税の課税標準を変更して課税する法定
外税条例といえるから，違法・無効というべきである。すなわち，企業税
は，形式上は法人事業税の欠損金額繰越控除規定の変更とは異なるが，実
質的には，改正前地方税法７２条の１４，改正後地方税法７２条の２３に
規定する欠損金額繰越控除制度の効果を否定するもので，これらの規律を
潜脱するものであり，違法というべきである。
イ法人事業税においては，欠損金額があればこれが繰越控除され税負担が
減少するにもかかわらず，企業税においては，かかる欠損金額の繰越控除
が契機となり，繰越控除欠損金額が課税標準となって逆に租税負担をもた
らし，その結果，改正前地方税法７２条の１４，改正後地方税法７２条の
２３の効果が害されることになるから，これが地方税法の立法者意思を阻
害して違法であることは明らかである。
ウ以上のとおり，企業税は，その目的及び効果の両面において，地方税法
上の法人事業税の基本的構造に関わる欠損金額の繰越控除の規定と矛盾・
抵触し，これを一部改正するのと実質的に同じことを，法定外税条例とい
う形式を利用し，地方税法の規制を潜脱して実現することを意図し，現に
これを実現したものといわざるを得ない。
欠損金額の繰越控除は，法人事業税そのものの基本的仕組みの問題であ
り，これを条例レベルで修正することは違法であるところ，企業税は，こ
の欠損金額繰越控除制度の趣旨を実質的に潜脱し，法律改正によらなけれ
ば実現し得ない効果を条例制定により実現しようとしたものであり，違法
というほかない。
(6)企業税は法人事業税につき制限税率を定めた規定を潜脱して課税するも
ので違法であること（違法事由②）
ア改正前地方税法７２条の２２第８項，改正後地方税法７２条の２４の７
第８項は，法人事業税の税率について，標準税率に１．１ないし１．２を
乗じて得た率を超える税率で課することができないものと規定する。制限
税率が設けられている趣旨は，事業税の税額は法人税又は所得税の課税所
得の算定上損金又は必要経費に算入されるため，標準税率を大幅に超える
税率で課税されると，その分所得が減少する結果，他の地方団体の住民税
及び事業税の減少，さらに法人税及び所得税の減少を通じて地方交付税の
減少を来すことになり，国及び地方の財政に大きな影響を及ぼすため，租
税体系の秩序維持及び法人の総合的な税負担の適正化を図ることにある。
この制限税率の定めは，最大限規制の趣旨であり，条例でこれを超える
税率を課することはできず，このことは，実質的に法人事業税と同視し得
る税を法定外税の形式で課することによって，実際上は税率を上げるのと
同じ効果を持つ場合であっても，同様に妥当する。
本件条例は，形式的には法定外税であるものの，実質的に法人事業税と
同一又は同種の税である企業税を課することによって，実質的には，法人
事業税の税率を引き上げたものにほかならず，法人事業税につき制限税率
を定めた規定を潜脱して課税するものであり，違法・無効である。
イ改正後地方税法の下では，法人事業税の付加価値割の課税標準中に，各
事業年度の単年度損益が含まれているところ（同法７２条の１４），この
単年度損益は，欠損金額の繰越控除を行わないで算定される（同法７２条
の１８）。そうすると，欠損金額の繰越控除を行わないで算出される単年
度損益に対して，法人事業税の付加価値割と企業税の二重課税がされるこ
ととなる。
そして，法人事業税の付加価値割の標準税率は０．４８パーセント，制
限税率は０．５７６パーセント（改正後地方税法７２条の２４の７第１項
１号イ，第８項）であるところ，企業税の税率は２パーセントであるから，
企業税は，法人事業税の付加価値割の制限税率の規定を潜脱するもので，
この点でも違法である。
(7)企業税は改正前地方税法７２条の１９の規定によらずに法人事業税の課
税標準の特例を設けるもので違法であること（違法事由③）
ア改正前地方税法７２条の１９は，応益性の観点から，特定の事業，業種
に限って法人事業税に外形標準課税を導入することを許容していた。そし
て，同条以外には法人事業税の課税標準の例外を許容する規定は設けられ
ていなかった。そうすると，改正前地方税法の下では，同条によらなけれ
ば，法人事業税の課税標準の特例を定めることは，例え法定外税という形
式を採ったとしても許されていなかったというべきである。
イ前記(4)のとおり，企業税は，実質的に欠損金額の繰越控除を一部遮断
して法人事業税を課するものであるから，改正前地方税法７２条の１９の
規定によるべき性質のものであった。しかし，被告は，同条の「事業の情
況」との要件を満たすのが法的に困難との神奈川県地方税制等研究会の報
告を踏まえ，同条の適用を回避し，代わりに同じ内容の租税を法定外税と
して創設したのである。すなわち，被告は，外形標準課税導入と実質的に
は同一の効果を，法定外税の形式を用いることによって実現しようとした
のである。
改正前地方税法においては，地方団体が法人事業税の課税標準の特例を
設けるには同法７２条の１９の規定による以外なく，これによらずに法定
外税の形式を用いて繰越控除の適用の遮断を行うことは認められていなか
ったにもかかわらず，被告は，法定外税条例によって法人事業税の特例た
る企業税を定めたのであるから，本件条例は違法・無効である。
また，企業税は，特定の業種に限定せず，すべての業種に適用されるも
のであるから，改正前地方税法７２条の１９に規定する「事業の情況に応
じ」との要件を充足せず，同条の下で創設すれば違法な租税と解されたこ
とは明らかである。このような企業税が，単に名前を法定外税に付け替え，
法定外税の手続に沿って創設されれば，途端に適法と解されるべきではな
い。
ウさらに，平成１５年法律第９号により外形標準課税が一部導入されたこ
とに伴い，改正前地方税法７２条の１９の課税標準の特例は，資本金１億
円超の法人について廃止され（改正後地方税法７２条の２４の４），法人
事業税の所得割の課税標準は一律に欠損金額の繰越控除後の所得となった。
このように，企業税適用法人のような外形標準課税適用法人については，
課税標準の特例が廃止されたのであるから，法人事業税の全国一律性は一
層強化されており，企業税と地方税法との抵触の問題は，明確さを増した
といえる。
(8)本件条例は徳島市公安条例事件判決の基準に照らしても違法・無効であ
ること
条例が国の法令に違反するかどうかは，両者の対象事項と規定文言を対比
するのみでなく，それぞれの趣旨，目的，内容及び効果を比較し，両者の間
に矛盾抵触があるかどうかによって決しなければならない（徳島市公安条例
事件判決，最高裁昭和５０年９月１０日大法廷判決・刑集２９巻８号４８９
頁）。
本件条例が地方税法の法定税に関する規律に反し違法であるかどうかを判
断するについては，既に述べたとおりの潜脱論が直截かつ適切である。しか
し，本件条例は，上記基準に照らしても，違法・無効である。
すなわち，企業税は，実質的に法人事業税と表裏一体であり，地方税法の
法人事業税の規定と目的を共通にするといえるが，例え両者が目的を異にす
るといえたとしても，企業税は，法人事業税の規定の目的と効果を阻害し，
違法と解さざるを得ない。法人事業税について，改正前地方税法７２条の１
４，改正後地方税法７２条の２３の下で，欠損金額の繰越控除が認められ，
その結果課税標準である所得の金額が減少するものとされているにもかかわ
らず，本件条例が繰越控除欠損金額相当額に課税を行っているのは，地方税
法の法人事業税に関する規律の趣旨，目的及び効果に反し，同規律と矛盾抵
触するものである。
(9)課税自主権ないし地方議会の裁量が企業税の適法性の根拠とならないこ
と
憲法が地方公共団体の組織及び運営に関する事項は「法律で」これを定め
る旨を規定していることからして（憲法９２条），憲法が地方団体に対して
直接具体的な課税権を与えているとは認められない。地方団体は，国から，
準則法たる地方税法２条の規定に基づいて，地方税法の定める統一的な準則
や枠の下に課税権を付与されている。したがって，地方団体は，地方税法の
枠を超える課税自主権を発揮することはできないのである。
このように，地方団体の課税自主権という抽象的理念からは被告の具体的
な課税権を導くことはできず，あくまでも個別具体的な条例が地方税法その
他の法律又は法令に反しないかどうかの解釈が問題となるにすぎない。地方
分権の推進や課税自主権の尊重といった理念の問題と実定法の解釈の問題は，
区別して考えることが必要である。そして，地方団体は，地方税法の規定に
従って，地方税の賦課徴収を行うのであり（同法２条），租税条例が法律の
範囲外で又は法令に違反して制定された場合には，もはや地方議会の裁量に
ついて議論する余地は残されていない。
企業税は，法人事業税の課税標準である所得の算定過程の一部を取り出し
て法定外税という名称を付したにすぎず，租税理論上は，本来，法定外税で
はなく法定税たる法人事業税の世界の中で，地方税法の改正によって規定さ
れるべきものであった。地方議会の裁量権を根拠に，かかる法定税たる法人
事業税の基本的構造の実質的変更という本質を有する企業税を，法定外税と
して創設されたことを理由に正当化することはできない。
(10)租税政策論と現行法の解釈論（法的可能性）とを峻別すべきであること
ア被告は，欠損金額繰越控除制度は課税標準である所得の計算における例
外を政策としてどこまで認めるかという問題にすぎない旨を主張する。
しかし，立法政策の問題と，現行の法人事業税制度の存在を前提にした
法的可能性とは，別次元の問題である。地方団体は，地方税法の制約の下
にあるので，一定の租税理論が望ましいからといって，条例によって地方
税法に抵触する内容の租税を導入することはできないのである。
イまた，被告は，法人税法上の欠損金額繰越控除制度は青色申告の恩恵に
すぎない旨を主張する。
しかし，前記(3)のとおり，法人税及び法人事業税についての欠損金額
繰越控除制度は，現行法上，単なる青色申告の恩恵ではなく，課税上の公
平の要請から法定された重要かつ基本的な制度である。また，例え青色申
告の恩恵であるとしても，同制度自体が既に法定されている以上，同制度
は法律の改正によらなければ変更できないのであって，これを実質的に変
更する内容の本件条例が違法・無効であるという結論に影響を及ぼすもの
では全くない。
ウさらに，被告は，法人税について規定された欠損金額繰越控除制度は法
人事業税においては不可欠のものではない旨を主張する。
しかし，法人税法５７条１項の下で必要的に繰越控除される欠損金額は，
改正前地方税法７２条の１４，改正後地方税法７２条の２３により，法人
事業税においても必ず控除されるのであって，課税の公平の観点からの欠
損金額の繰越控除は法人事業税においても必ず認められなければならない
というのが，立法者の意思というべきである。立法政策論は別として，現
行法上は，法人税と法人事業税は連動しているのである。
エ被告は，改正前地方税法下の法人事業税が応益性の観点から不十分で税
負担の不公平を生じさせていたとの観点から，当期課税の公平性を達成す
るため，企業税を創設した。
しかし，法人事業税をどの程度応能性又は応益性の強いものとすべきか
という問題は，全国一律に適用すべき国の重要な租税制度に関わる問題で
あるから，これを一地方団体が軽々に取り上げて，国が採用した租税制度
を不十分と判断してその修正を図ることは許されない。この問題は，全国
一律の外形標準課税導入等の地方税法改正に委ねられるべきであり，かか
る権限を有しない被告が条例によって対処できる問題ではないのである。
オさらに，外国において類似の制度があること，企業税が臨時・特例的な
ものであること，本件条例の適用対象が大企業に限定されていること，企
業税による収入が法人事業税による収入に比べ少ないことといった事情は，
立法政策論としての当否はともかく，企業税が地方税法の規定に反する以
上，その違法性を阻却するものではない。
(11)企業税は担税力を有しない繰越控除欠損金に課税するもので違法である
こと（違法事由④）
本件条例７条１項は，実質的には，繰越控除欠損金額を課税標準とするも
のと読み替えることができる。
そうすると，本件条例は繰越控除欠損金の存在そのものに担税力があると
見ていると理解するほかないが，それは「マイナスの担税力」であり，企業
税はマイナスの担税力が大きくなるほど租税負担が増大する税といえる。繰
越控除欠損金は，客観的に担税力の存在を推定させる物，行為又は事実に当
たらないところ，このようなマイナス項目である繰越控除欠損金を課税物件
として取り上げるような条例を制定することは許されない。
したがって，企業税を法人事業税との関係が切断された別個の租税と見て
も，全く担税力のないところに課税するもので租税の基本原則に反するから，
企業税は違法な租税である。
(12)本件条例は地方税法改正の際の総務大臣の同意を欠き違法であること
（違法事由⑤）
本件条例は，法人事業税に外形標準課税が導入されるまでの当分の間の臨
時的，特例的な措置であり，かかる前提で総務大臣の同意を得たものである。
しかし，被告は，平成１６年４月１日施行の地方税法改正（平成１５年法律
第９号）により法人事業税に外形標準課税が導入された後も，企業税の税率
を引き下げるなどの一部改正を行っただけで，本件条例を存続させた。この
ように平成１６年４月１日以降も本件条例を存続させたことは，本件条例の
適用期間の延長といえ，地方税法２５９条１項に規定する法定外税の「変
更」に該当する。
また，上記の地方税法改正により，法人事業税に外形標準課税が導入され，
また，欠損金額の繰越期間が５年から７年に延長されたが，これにより，実
質的には企業税の負担が重くなったのであるから，この意味でも，企業税の
「変更」に該当する。
しかし，被告は，以上のような企業税の「変更」について，総務大臣との
協議及び同意を得ていない。したがって，本件条例は，その変更について地
方税法２５９条以下の総務大臣との協議及び同意を得ていないという手続違
反によっても，違法・無効である。
(13)その他の違法事由
ア不均一課税であること（違法事由⑥）
本件条例は，資本の金額又は出資金額が５億円以上の法人に限って，欠
損金額繰越控除制度の適用を遮断し，法人事業税の課税標準を変更するも
のであり，この意味で実質的に法人事業税について不均一課税を行うもの
である。地方税法７条は，人的な一部ではなく地域的な一部に不均一課税
をすることを認めるものであるし，また，本件条例は，同条にいう「特に
利益がある事件」について課税するものではない。したがって，本件条例
は，同条の不均一課税の要件を満たしておらず，違法・無効である。
イ比例原則に違反すること（違法事由⑦）
本件条例は，投機的損失と事業損失から生じた欠損金額のうち，前者に
ついてのみ繰越控除を遮断することを目的とするものである。しかし，投
機的損失の有無及びその割合は企業ごとに大きく異なるのに，これを捨象
して，一律に欠損金額の３０パーセントについて繰越控除の適用を遮断す
ることは，上記目的との間で何らの合理的関連性も認められないし，上記
目的を達成するについて必要な限度を超えた不必要な規制であることも明
らかである。したがって，本件条例は，国民の財産権を比例原則に違反し
て侵害するものであり，憲法２９条に違反する違憲・無効な条例である。
また，仮に本件条例自体が違憲ではなくても，原告には投機的損失は存
在せず，通常の事業損失しか存在しなかった以上，本件条例は，原告に適
用される限度で適用違憲である。
ウ租税公平主義に違反すること（違法事由⑧）
本件条例は，被告から行政サービスを受けながら法人事業税を負担して
いない法人のうち，欠損金額の繰越控除を行った企業のみに課税するもの
であるから，租税公平主義に反し，憲法１４条１項及び２９条に違反する
違憲・無効な条例である。
(14)まとめ
以上のとおりであるから，本件条例は，違法・無効である。
＜被告の主張＞
(1)本件条例の制定の経緯について
ア被告は，かつては「財源の豊かな団体」と言われたりもしたが，バブル
経済崩壊後の長期の景気低迷により，主力の法人税収がピークの半分以下
の水準まで落ち込み，県税収入だけでは義務的経費すら賄えない不均衡な
状況が続くようになった。このように被告の県税収入が大幅に減少したの
は，県税が景気に左右されやすい法人事業税及び法人県民税を主力として
いるためであった。
このような危機的財政状況において，地方税制度全体の改革や臨時の財
源対策としての県独自の取組（法定外税の創設を含む）により財源を確保
することが必要不可欠であった。
イ法人は，都道府県から広範な行政サービスという一種の生産要素の提供
を受けながら事業活動を営んでおり，法人事業税は，この行政サービスの
対価と位置付けることができる。しかし，現行の課税方式の下では，所得
の多寡によって税負担が決定されることから，行政サービスとの受益関係
が税負担に的確に反映されない。加えて，全法人のうち約７割（平成１０
年当時）が欠損法人であり，法人事業税を負担していないため，結果的に，
都道府県の最大基幹税目である法人事業税は一部の利益法人によってのみ
支えられていたのが実情であって，応益課税という地方税法の考え方から
乖離した，明らかな税負担の不公平が生じていた。
ウそこで，被告は，平成１０年１２月，神奈川県地方税制等研究会を設置
し，神奈川県知事において，同研究会に対し，「県独自の税源充実策及び
大都市圏自治体にふさわしい地方税財政制度のあり方」の検討を諮問した。
神奈川県地方税制等研究会は，平成１２年５月，中間報告書において，
地方税法改正による法人事業税の外形標準課税の導入，超過課税の活用及
び法定外普通税・法定外目的税の活用等を提言した。そして，平成１３年
度の税制改正において法人事業税の外形標準課税の導入が見送られてしま
ったことを踏まえ，同研究会は，法律の範囲内で被告がどのような独自の
課税措置を採るべきかを検討した結果，平成１３年１月，最終報告書を神
奈川県知事に提出し，臨時的かつ特例的な措置として，現行の法人事業税
を中心とした都道府県の法人税制を公平性及び安定性の観点から補完する
制度が必要であり，被告において，課税自主権を活用して，新税（企業
税）を導入することが適切である旨の提言をした。
エ最終報告書は，新税の内容について以下のような提言をしている。
すなわち，新税は，地方税法４条３項の規定に基づく法定外税として創
設するもので，被告の行政サービスを享受しかつ当該事業年度において利
益が発生していながら欠損金額の繰越控除により相応の税負担をしていな
い法人に対し，担税力に見合う一定の税負担を求めるものである。
新税の納税義務者については，その担税力に配慮し，相当程度体力があ
り社会的責任を求められる大会社に限ることが適当であるから，資本の金
額又は出資金額が５億円以上のものとする。また，企業活動に対する行政
サービスの対価として応分の負担を求めるという課税の趣旨を踏まえ，公
共法人，公益法人等及び清算法人については除外する。
課税標準については，法人事業税の欠損金額の繰越控除の遮断という措
置ではなく，単年度損益（当期利益）を課税標準とすることが妥当である。
また，税率については，法人事業税の税率水準が約１０パーセントである
ことなどを総合的に勘案して，３パーセント（特別法人は２パーセント）
とする。
なお，新税の課税により欠損金額の繰越控除を遮断する経済的効果を生
じる可能性があるが，欠損金額の損金算入は政策上の判断に委ねられた事
項であり，租税政策上行い得る内容である。
オ神奈川県知事は，上記最終報告書の内容を慎重に検討した上で，本件条
例案を作成した。そして，本件条例は，神奈川県議会の議決及び地方税法
２５９条以下に規定する手続を経て，制定されたものである。
(2)地方団体の自主財政主義について
ア憲法は，「地方公共団体の組織及び運営に関する事項は，地方自治の本
旨に基いて，法律でこれを定める。」（９２条）と規定し，さらに，「地
方公共団体は，その財産を管理し，事務を処理し，及び行政を執行する権
能を有し，法律の範囲内で条例を制定することができる。」（９４条）と
している。これは，憲法が，地方自治を保障し，地方団体に，その事務を
住民の民主的コントロールの下に自らの責任で自主的に処理する力を認め
たことを意味する。
ところで，地方団体が地方自治の本旨に従ってその事務を処理するため
には，課税権，すなわち必要な財源を自ら調達する権能が不可欠である。
その意味で，地方団体の課税権は，地方自治に不可欠の要素であり，地方
団体の自治権の一環として憲法により直接に地方団体に与えられていると
解すべきである。したがって，地方団体は，憲法上は，いかなる租税をい
かなる課税要件の下に賦課・徴収するかを自主的に決定することができる
（福岡地裁昭和５５年６月５日判決・訟務月報２６巻９号１５７２頁）。
イもっとも，自主財政主義は，地方団体ごとに税制が区々になり，住民の
負担が著しく不均衡になるのを防ぐため，地方団体の課税権に対して国の
法律で統一的な準則や枠を設けることを全面的に否定するものではない。
そのような準則を設定したものとして，地方税法がある。しかし，自主財
政主義の趣旨にかんがみると，地方団体の自主性が十分に尊重されるべき
であって，国の法律で地方税のすべてを一義的に規定しつくすことは適当
ではなく，また国の行政機関の指揮監督権はなるべく排除する必要がある。
(3)法定外税が地方団体の課税自主権に基づくものであること
ア地方税法が新設を許容している法定外税は，まさに上述のような地方団
体の自治権（課税自主権）に基づいて，地方団体が設定することができる
ものである。すなわち，それぞれの地方団体の実情によっては，法定税以
外の税源に着目して課税することが適当な場合もあるので，法定外税は，
このような地方団体の財政需要を充足するために認められているのである。
イ現行の法定外税に相当する制度は明治時代以来存在しており，地方団体
は，法定された税目のほかに，許可制又は届出制の下，自主的判断におい
て，独立税を設定することができるものとされてきた。戦後，法定外税の
税目数こそ減少したものの，地方団体がその自治権に基づいて独自に税目
を設定できるという基本的考え方に変わりはない。
そして，「地方分権の推進を図るための関係法律の整備等に関する法
律」（平成１１年法律第８７号。以下「地方分権推進一括法」という。）
は，課税自主権の尊重による地方税の充実・確保という観点から，法定外
普通税の許可制度を廃止して，代わりに同意を要する事前協議制度（地方
税法２５９条以下）を採用した。また，新たに法定外目的税を導入して，
同じく同意を要する事前協議制度を採用した（同法４条６項，７３１条以
下）。そして，国の関与を減少させる観点から，従前は法定外税の許可要
件とされていた税源の存在及び財政需要の存在を協議の対象から除外し，
これらについては地方団体の責任において地方議会が判断すべきものとし
た。
地方分権推進委員会の最終報告において，「地方税源の充実・確保のた
めには，法定税の充実を図るとともに，自主課税の努力が必要である。こ
の自主課税については，法定外税のほか，超過課税などの活用についても
幅広く検討していくべきである。」とされ，また，税制調査会の答申（平
成１２年７月）において，「地方公共団体が，地域住民の意向を踏まえ，
自らの判断と責任において，課税自主権を活用することにより，財源確保
を図ることは地方分権の観点から望ましいものです。」とされていること
からすれば，法定外税の積極的な利用を念頭に，上記の制度改正がされた
ものといえる。
ウそもそも，地方税の応益課税の原則は，課税自主権の憲法的保障にも内
在する憲法原理であると解すべきところ，現実の地方税法においても，法
定外税について，不同意事由や非課税物件といった若干の規定を置くほか
は，課税標準や税率等について一義的に明確な制限規定を特に置いておら
ず，応益的地方税収を保障した規定ぶりになっているところである。
(4)地方税法２５９条以下の規定の趣旨（同法２６１条所定の要件は法定外
税が地方税法上違法となる場合を類型化したものであること）
ア以上のような地方団体の自主財政主義及び法定外税制度の趣旨からすれ
ば，地方税法は，法定外税の税目，課税客体，納税義務者，課税標準及び
税率等を具体的にどのようにするかといった問題を，地方団体の課税自主
権（地方議会の裁量的判断）に委ねているというべきである（同法４条３
項）。ただ，弊害防止のため，準則法（枠法）という観点から，必要最小
限度の制限をする趣旨で，同法２５９条以下で具体的準則（枠）を規定し
ているものである。
イ地方税法２６１条所定の要件は，地方団体が法定外税を自主的判断にお
いて自由に創設できることを前提としつつ，国家的観点から，地方税法の
定める租税の一般原則に合致するかどうかを審査するために設けられたも
のである。その意味で，同条所定の要件は，地方税法の定める租税一般原
則の観点から，法定外税として容認できない場合（法定外税が地方税法上
違法となる場合）を類型化したものであり，当該法定外税が地方税法上適
法かどうかを判断する分水嶺となっている。
この点は，金沢地裁昭和２８年１１月７日判決・行裁例集４巻１１号２
６８７頁も，「本件税が法定外普通税として適法かどうかは結局右第２６
１条第１項に規定した要件を充たしているかどうかの判断に帰する」とし
ているところである。
ウ原告は，法定外税の適法性は総務大臣の同意とは別途に検討される旨を
主張する。しかし，原告が引用する横浜市の勝馬投票券販売税に関する国
地方係争処理委員会勧告は，法定外税が地方税法以外の法律に違反するか
どうかを議論したものであるのに対し，本件の問題は，法定外税が地方税
法自体に違反するかどうかである。原告の主張によれば，地方税法に違反
する条例に総務大臣が同意することになってしまい，地方税法自体が矛盾
を含むことになりかねない。
また，原告は，総務大臣は本件条例につき地方税法２６１条所定の要件
の有無のみを審査し，法定税に係る規定の潜脱の有無等の適法性の審査を
しなかったと主張するが，これは，後記のとおり法定税に係る規定が法定
外税の準則とはならないという法解釈に基づいて，協議・同意が行われた
ことを意味するにすぎない。
原告が主張するような，ある法定外税が地方税法に反している場合でも
総務大臣が消極要件に該当しないために同意を与えねばならないシステム
ではないのである。
エ結局，総務大臣が地方税法２６１条各号に掲げる事由のいずれかがある
と認めて不同意としたり，非課税範囲の規定（同法２６２条）に違反した
り，同法２６３条以下の徴税手続の規定に違反するなど，同法２５９条以
下に定める準則（枠）に反する場合には，法定外税条例が違法となる余地
があるが，そうではない限り，地方税法上違法の問題は生じないというべ
きである。
ただし，上記主張は，事後的な司法審査の可能性を一切排除するわけで
はない。すなわち，地方税法２６１条所定の要件の存否について，地方議
会の政策的判断に誤り（裁量権の逸脱濫用）があったかどうか及び総務大
臣の同意の判断に誤りがあったかどうかという問題については，事後的に
裁判所の司法審査の対象となるものと解される。
(5)法定税である法人事業税に係る規定が法定外税の準則となるものではな
いこと（違法事由①ないし③の潜脱論は根拠を欠くこと）
地方税法が定める法定外税に関する準則（枠）は，同法２５９条以下の規
定に尽きているのであって，以下のとおり，法定税である法人事業税に係る
規定が法定外税の準則となるものではない。
ア法定税である法人事業税は，法定外税を含む地方税全体に共通する事項
を規定した「第一章総則」ではなく，「第二章道府県の普通税」にお
いて，「第十一節道府県法定外普通税」と並列的対等なものとして規定
された別の節である「第二節事業税」に規定されているものにすぎない。
これは，地方税法が法定外税を法定税である法人事業税とは別個の制度と
して規定していることを示している。
イ法定外税は，地方議会の議決では足りず，総務大臣との協議及び同意を
要し，その制定手続が法定税よりも格段に厳格になっている。国の行政機
関の判断も反映しつつ，厳格な立法手続を経ることからすれば，地方税法
は，法定外税の課税標準等につき，より緩やかな枠（準則）を予定してい
るというべきである。
この意味で，法定外税について法定税のような詳細な規定を置く必要は
ないし，また法定外税に法定税の規定を準用していないのはむしろ当然な
のである。
ウ地方税法２６１条１号は，法定外税が，単に「国税又は他の地方税と課
税標準を同じく」するのみならず，「かつ，住民の負担が著しく過重とな
ること」を満たす場合にのみ不同意にできるものと規定している。そうす
ると，地方税法は，法定税と課税標準が同一の法定外税でさえも，税負担
が著しく過重であるとか，国の経済施策に照らし適当でない（同条３号）
といった事情がなければ，適法として自ら明文で許容していると解するほ
かない。そのほか，同法２５９条以下において法定外税の課税標準を制限
する規定は見当たらないことからして，地方税法が法定外税の課税標準を
いかに定めるかにつき地方団体の課税自主権を尊重する趣旨であることは
明らかである。また，同法２６１条１号は「著しく過重となること」を禁
止するのみで，法定税の制限税率の基準を適用すべきものともしていない。
エ法定外税の非課税範囲の規定（地方税法２６２条）は，本来課税範囲に
含まれるもののうち，一部について例外的に課税しないことを定めたもの
と解すべきである。そして，法人事業税の課税標準となる所得ないし法人
の当期利益から控除される繰越欠損金額相当額を非課税とする旨の規定は
置かれていないから，地方税法は，法定外税によって当該所得に課税する
ことも許容する場合があることを前提としているものと考えられる。
オ法定税である法人事業税の課税標準や制限税率等の諸規定を法定外税に
援用する明文の定めは全くなく，そうである以上，法定外税の準則（枠）
に法人事業税の課税標準や制限税率等の規定を含めて考えるのは，地方団
体の課税自主権を不当に制約する地方税法解釈であり，到底許されない。
法定外税制度は，法定税である法人事業税等とは別個の制度として，地
方税法自らが明文で規定するものである以上，法定税である法人事業税に
関する規律を法定外税に適用することは，地方税法上予定されていないと
いうほかない。
地方税法の規制とは別個に地方団体が独自の租税条例を作った場合には，
いわゆる潜脱論が機能し得るが，本件条例は，地方税法という法律が認め，
その要件も同法上に規定された，法定外税の一つとして制定されたもので
あって，地方税法という法律に根拠を置く租税なのである。
カ以上のことからすれば，法定外税についての準則（枠）は，地方税法が
「第十一節道府県法定外普通税」（同法２５９条以下）において規定し
ている事項のみであって，法定税である法人事業税の課税標準や制限税率
等の規定は，法定外税の準則（枠）ではない。
したがって，地方税法２５９条以下の規定に従って法定外税が創設され
ている以上，同法２６１条所定の要件の存否について地方議会の政策的判
断に誤り（裁量権の逸脱濫用）があったかどうか及び総務大臣の同意の判
断に誤りがあったかどうかという問題は別個に事後的な司法審査の対象と
なり得るとしても，それ以外に地方税法違反の事態は生じ得ないのである。
キこのことは，以下の実例からも裏付けられる。
(ア)昭和２３年の地方税法改正により，法定税として木材引取税（素材
の引取りを課税客体とし，素材の価格又は容積を課税標準とし，その引
取者に対して課するもの）が設けられていたところ，その後も，法定外
普通税である林産物移輸出税（素材，薪炭及び加工林産物等を課税客体
とし，その価格又は容積を課税標準として，その移輸出者に対して課す
るもの）は廃止を免れていた。
法定外普通税である林産物移輸出税は，法定税である木材引取税の課
税標準である素材の価格等を課税標準とし，しかも，立法者が意図的に
木材引取税の課税標準から除外した薪炭等の価格も課税標準に含むもの
である。
(イ)熱海市が市町村法定外普通税として設けている別荘等所有税は，一
定の家屋又は部分を課税客体とし，延べ面積を課税標準として，１平方
メートル当たり６５０円（平成１３年の条例改正前は５００円）の税率
でその所有者に課するものである。この課税標準は，固定資産税の課税
標準と同一と評価することができる。
(ウ)昭和３０年ころ市町村法定外普通税として存在した固定資産使用税
は，地方税法３４８条１項の規定によって固定資産税を課することがで
きない者が所有する固定資産に対し，その使用者に課するものであった。
このような固定資産税の使用者課税は，当初法定されていたものの，昭
和２６年以降廃止されている。
そうすると，固定資産使用税は，地方税法が明文で非課税とする者が
所有する固定資産につき，同法が納税義務者から意図的に除外した固定
資産の使用者に対して，固定資産税と同一の課税標準で課税するものと
いえ，原告の主張に従えば法定税の規定を潜脱するものとなるはずであ
るが，実際には，存続を許容されていたのである。
(エ)以上の実例のように，地方税法は，法定税の課税標準等に関する規
定を法定外税の規定に優先して適用することを全く予定していない。
(6)地方議会の判断や総務大臣の同意の判断に誤りがないこと
ア地方議会の判断や総務大臣の同意の判断を検討するに当たっては，地方
税法２６１条所定の要件が地方税法上容認できない法定外税を類型化した
ものであるから，このような要件に該当するかどうかが問題となる。その
際，課税自主権にかんがみれば，これらの判断が著しく合理性を欠く場合
に限って違法になると解すべきである。
イそして，企業税が地方税法２６１条所定の要件に該当しないことは以下
のとおりである。
(ア)企業税と法人事業税の課税標準は重ならないから，「課税標準を同
じくし」（地方税法２６１条１号）に該当しない。
両税の課税標準が重なるという見解もあり得るとしても，地方税法２
６１条１号の要件から明らかなように，法律上そうであってはならない
わけではなく，要するに，税率，税収，納税義務者の範囲等を総合的に
考えた程度問題である。そして，企業税の税率は低く抑えられており，
例え法人事業税における欠損金の利用を相殺するような経済的効果があ
ったとしても，「著しく過重」（同号）とはいえない。
すなわち，企業税の税率は，当初３パーセントであり，改正前地方税
法下の法人事業税の税率９．６パーセントの３分の１以下にとどまる。
また，課税標準に上限が付されているから，法人事業税の課税標準が増
大するに伴い，企業税の課税標準は低減する。さらに，企業税の課税の
対象は，資本金が５億円以上で当期利益が出ている法人であり，相当程
度担税力がある。したがって，企業税による税負担は「著しく過重」な
ものではない。
(イ)企業税は，流通税ではないから，およそ「地方団体間における物の
流通に重大な障害を与える」（地方税法２６１条２号）ものではない。
(ウ)現行法上の法人税は，各事業年度に生じた課税所得を各事業年度ご
とに独立して課税の対象としており，前期からの繰越利益や繰越欠損金
は当期の所得計算に関係させないのが原則である（課税年度独立の原則
ないし事業年度独立の原則）。そして，法人税法は，一つの租税政策と
して，青色申告法人のみに，租税政策上恩恵として，例外的に欠損金額
の繰越控除を認めているにすぎない（同法５７条等）。そうであるから
こそ，わが国の法人税において，欠損金額の繰越控除は，その適用が全
く認められない場合や，１年間又は３年間等とされた場合があり，さら
に，欧米においても，その適用の全部又は一部を遮断する事例が見られ
るところである。
ましてや，原告が抵触を問題とする法人事業税は，事業と行政サービ
スとの応益関係に着目して課される物税であるから，その課税標準は事
業の活動量を最も端的に表現するもの，すなわち外形的な課税標準（当
然，繰越欠損金は控除されない。）がより適当である。にもかかわらず，
法人事業税の課税標準が法人税の課税標準である所得の計算の例による
とされているのは，徴税官庁及び一般納税者の利便という，単に便宜的
な理由によるものにすぎない。
要するに，繰越控除制度を具体的にどのように定め，それと他の租税
政策との関係をどのように調整するかは，国税，地方税を通じた全体の
租税政策として様々な選択肢のあり得るところである。そして，欠損金
の利用に制限を設け，単年度利益の一定割合までしか繰越欠損金の控除
を認めないこととしたり，あるいは，消極的な投資活動から生ずる損失
は同種の活動から生ずる利益としか相殺できないとするという租税制度
には，一定の合理性があるところ，企業税も，経済的に見れば同一方向
のものである。
さらに，企業税は，神奈川県の厳しい財政状況を踏まえ，必要最小限
度で臨時的かつ特例的に，現在生じている課税の不公平を是正するため，
繰越控除欠損金額相当額の当期利益のうちわずか３パーセントの負担を
求めるという内容である。
以上を総合的に検討すれば，企業税が「国の経済施策に照らして適当
でないこと」（地方税法２６１条３号）に該当しないことは明らかであ
る。
ウ上記のとおり，本件条例は，地方議会の判断や総務大臣の同意の判断に
逸脱濫用ないし誤りがなく，その他地方税法２５９条以下の手続に従って
創設されたものであるから，適法である。
(7)違法事由①ないし③への反論
法定税に係る規定が法定外税の準則ともなる旨の原告の潜脱論の理論的不
当性は前記(5)で述べたところであるが，この問題はひとまず措くとしても，
企業税につき，原告が主張するような潜脱に当たる事情は存在しない。
ア企業税と法人事業税は同一の趣旨・目的を有するものではないこと
(ア)法人事業税は，事業は地方団体による各種の行政サービスの受益に
応じた負担をすべきであるとの考え（応益課税）に基づいて課せられる
税であり（ただし，所得を課税標準とすることから，応能課税との混合
タイプである。），具体的には，事業年度ごとの法人の所得を課税標準
として課される法定税である。
他方，企業税は，神奈川県の厳しい財政状況を踏まえた上で，当分の
間の臨時的措置として，応益課税の観点から，法人課税における負担の
公平と税収の安定化を図る目的で，資本金５億円以上の法人を対象に，
繰越控除欠損金額に相当する当期利益を課税標準として相応の負担を課
する法定外税である。
以上の比較から明らかなとおり，両税は，応益課税の考え方のみに基
づくものか，神奈川県の財政事情を踏まえたものか，行政サービスを受
け当期利益が黒字になっている法人でも税負担を生じないという現状に
おいて負担の公平，税収の安定化を図るものかどうか，といった点で明
白に異なり，同一の趣旨・目的を有するものでも，企業税が法定税に係
る規定の潜脱を目的とするものでもない。
両税が同一の趣旨・目的を有する旨の原告の主張は，両税を経済的に
統合して考えるという前提での議論であるが，このような経済的な位置
付けと，「両税の趣旨・目的が同一であるか」という法的評価とは，全
く関係がない。原告は，法的評価と経済的評価を混同している。
(イ)これを具体的に見ると，法人事業税の課税標準は，繰越欠損金を控
除した後の所得の金額であり，一方，企業税の課税標準は，各課税事業
年度における法人事業税の課税標準である所得の金額の計算上，繰越控
除欠損金額を損金の額に算入しないものとして計算した場合における当
該課税事業年度の所得の金額に相当する金額（当該金額が繰越控除欠損
金額に相当する金額を超える場合は，当該繰越控除欠損金額に相当する
金額）であって，両者の課税標準は全く重ならない。
また，両税の税率は異なっている。さらに，企業税は，「事業活動」
に対する行政サービスの対価として負担を求めるという考え方を明確に
するため，法人事業税の場合とは異なり，事業活動を終了した清算法人
や公益法人等の収益事業を課税の対象から除外している。
このように，企業税の課税標準，税率及び課税の対象は法人事業税の
それとは異なっているから，企業税は，法人事業税とは別個の法定外税
として創設されたものといえ，法人事業税と同一の税であるなどとは到
底いえない。本件条例は，課税標準等において地方税法にふさわしい要
素を加味した独自の税目になっているのである。
(ウ)原告は，企業税の課税標準は法人事業税の付加価値割の課税標準中
の単年度損益と同一である旨も主張するが，企業税の課税標準は，繰越
控除欠損金額相当額の当期利益であって，しかも，地方税法改正による
外形標準課税導入前に発生した欠損金額の繰越控除額相当額の当期利益
であるから，単年度損益と同じではない。また，そもそも，地方税法２
６１条１号は，課税標準を同じくする法定外税であっても許容している。
イ企業税は法人事業税の欠損金額の繰越控除を遮断するものではないこと
(ア)企業税は，繰越控除欠損金額相当額の当期利益を課税標準とするも
のであり，法人事業税の課税標準の計算方法を変更するものではない。
また，企業税は，資本金５億円以上の法人に対し欠損金額の繰越控除を
行う年度においてのみ課税されるものであるし，清算法人や公益法人等
の収益活動を課税の対象から除外しており，単に，法人事業税の課税標
準の計算上の繰越控除欠損金額相当額の当期利益に課税することのみを
内容とするものではない。さらに，企業税は，当期利益に課税するもの
であるから，マイナスの所得ないし欠損金そのものに課税するものでは
ない。このような意味で，企業税の本質を法人事業税の欠損金額の繰越
控除を遮断することと表現するのは，全くの誤りである。
企業税は，少なくとも法的観点から見た場合，法人事業税における繰
越欠損金の利用を妨げるという構造にはなっておらず，あくまでも当期
利益に対して課税する法定外税である。
(イ)被告は，神奈川県地方税制等研究会の最終報告書の内容をそのまま
受け入れて本件条例を制定したものではない。
すなわち，被告は，県財政の当時の状況等についての詳細な検討を経
た上で本件条例を制定したものであり，最終報告書の内容をそのまま受
け入れたわけではない。本件条例は，電気供給業等の事業活動を非課税
事項とし，適用期間を「当分の間」としている点で最終報告書と異なる
内容を盛り込んでいる。また，税率についても，被告は，最終報告書を
参考にしつつ，課税理論の面ばかりでなく，税収確保の必要性と納税者
の理解等の幅広い観点から検討を行い，一般法人について３パーセント
としたところである。
(ウ)原告が指摘する，中間報告書及び最終報告書中の，法人事業税の欠
損金額の繰越控除の遮断を行うための方策の検討について記載された部
分は，企業税の課税標準をどのように定めるかに関する記述であり，換
言すれば，企業税の手段に関するものであって，目的に関するものでは
ない。また，原告が指摘するＰ１氏の論文も，企業税の手段に関するも
のであって，目的に関するものではない。
そもそも，最終報告書では，中間報告書が示すような，繰越控除制度
の適用を遮断する案は採用されず，結局，繰越控除欠損金額に相当する
利益に課税するという考え方が採用された。企業税においても，欠損金
額の繰越控除の遮断という考え方とは区別された考え方として，繰越控
除欠損金額に相当する利益に課税することとしているところである。
ウ法人事業税における欠損金額の繰越控除は政策的な制度にすぎないこと
法人事業税における欠損金額の繰越控除は法律改正によらなければ変更
できない全国一律の重要かつ基本的な制度である旨の原告の主張は，以下
のとおり誤りであり，当該規定の潜脱はそもそも問題とならない。
前記(6)イ(ウ)のとおり，法人税法は欠損金額の繰越控除を例外的に青
色申告法人の恩恵として認めているにすぎないこと，地方税法が法人事業
税につき応益課税の考え方からは本来望ましくない所得を課税標準とした
のは徴税官庁や一般納税者の便宜を考慮したためであること，しかも地方
税法は一部業種について収入金額を課税標準としたり，「事業の情況」に
よっては外形標準課税も容認していたこと（改正前地方税法７２条の１
９）からすれば，地方税法が法人事業税の課税標準である所得の計算にお
いて繰越欠損金を控除することを必要不可欠の原則としているとは到底考
えられない。要するに，繰越控除制度を具体的にどのように定め，それと
他の租税政策との関係をどのように調整するかは，国税，地方税を通じた
全体の租税政策の問題であり，様々な選択肢のあり得るところである。
判例も，「欠損金額の繰越控除を青色申告者の特典としていること自体，
租税政策上の考慮に出でたものであることは明らかである」としている
（最高裁昭和４３年５月２日第一小法廷判決・民集２２巻５号１０６７
頁）。そして，法人事業税については青色申告の制度が設けられていない
ところ，法人事業税において，青色申告書を提出する法人にのみ認められ
ている法人税法上の政策的特別措置が適用されるのは，手続上の便宜を重
視して，法人税の所得の計算の例によることとした結果にすぎない。
結局，過年度の繰越欠損金は原則として考慮しないという制度の中で，
政策的にどこまでその控除を許容するかの問題にすぎず，所得の金額の計
算上これを絶対に控除すべきものとは認められない。むしろ，応益的地方
税制の下では，法人の所得の経理上の処理をそのとおりに扱わないことは
応益課税として当然のことであり，行政サービスの対価としての必要性を
考慮した場合には，欠損金額の控除を暫定的に停止することも租税政策的
に許容されるのである。
なお，原告は，欠損金額の繰越控除の遮断は納税者に重大な影響を及ぼ
すため，法律改正によるべき必要性が大きい旨を主張するが，このような
経済的効果の問題は，地方税法２６１条各号（特に１号後段と３号）の政
策的判断を通じて適切に調整されることが予定されている。
エ法人事業税の制限税率の規定を潜脱するものではないこと
企業税と法人事業税の課税標準が異なる以上，企業税の創設によって法
人事業税の税率が上がることにはならない。また，企業税の創設から平成
１６年度までの同税の税収の合計額は，同期間の法人事業税の税収の合計
額の３．５パーセントにすぎず，仮にこれを法人事業税の税収に含めて税
率を試算しても，制限税率である１．１倍の範囲内に十分とどまっている。
したがって，原告の制限税率違反の主張はおよそ成り立たない。
オ改正前地方税法７２条の１９に反するものではないこと
原告は，改正前地方税法７２条の１９が法人事業税の課税標準の唯一の
特例であった旨を主張するが，法定外税に関する同法２６１条１号は，法
定税の課税標準と同一の法定外税の創設でさえも税負担が過重とならない
限り明文で認めているのであって，原告の主張は失当である。
カ小括
以上のとおり，企業税には法定税に係る規定を潜脱して違法であること
を基礎付ける具体的事情は一切存在しない。
実定法の解釈上は，地方税法上も法人税法上も，繰越欠損金を控除しな
いで計算した当期利益を課税標準とする企業税のような租税を，法定外税
として創設することまで禁止しているなどとは，到底考えられない。
むしろ，本件条例が，当期に利益があるにもかかわらず地方税の負担が
軽減されている企業に，その負担能力にふさわしい穏当な負担を求めるた
めに創意工夫された法定外税であるということを，適切に評価すべきであ
る。このような創意工夫が，「実質」的に地方税法の「規制」を「潜脱」
しているという二重，三重の解釈により制限されるのであれば，もはや法
定外税制定の余地はなくなってしまう。
(8)徳島市公安条例事件判決は本件に当てはまらないこと
最高裁判所の徳島市公安条例事件判決は，特定の事項についてある法律が
規制しており，当該法律に条例による上乗せができるかどうか明文を欠く場
合において，当該特定の事項に条例で上乗せ規制を行うことの可否が問題と
なったものである。しかし，本件では，地方税法が準則法として明文で法定
外税の創設を許容しているため，同判決が前提としていた法律と条例との関
係とは異なって，単に法定外税に関する地方税法の規定を解釈すれば足り，
同判決の基準を持ち出す必要はない。
(9)企業税は繰越控除欠損金に課税するものではないこと（違法事由④）
既に述べたとおり，企業税は，繰越控除欠損金額相当額の当期利益を課税
標準とし，当期利益に課税するものであって，マイナスの所得ないし欠損金
そのものに課税するものではない。
(10)地方税法の改正の際に総務大臣の同意は不要であったこと（違法事由
⑤）
ア総務省自治税務局長作成に係る通知（平成１５年１１月１１日総税企第
１７９号）は，「地方税法第２５９条，第６６９条及び第７３１条第２項
の規定に基づき総務大臣への協議・同意が必要となる法定外税の「変更」
とは，税率，課税標準，課税を行う期間，徴収方法等について，住民（納
税者）に対し，負担を追加し又は負担を重くすることとなるような実質的
な変更を行うことをいうものであり，既存の法定外税に係る税率の引下げ，
課税を行う期間の短縮及び廃止については，協議・同意を要しないもので
ある。」としていた。
このような実務上の解釈・取扱いは，平成１６年４月１日施行の地方税
法改正により法定化され，改正後地方税法２５９条１項，同法施行令４５
条の２は，総務大臣との協議及び同意が必要となる「変更」から，法定外
税の税率の引下げ，廃止及び法定外税に係る条例の規定が効力を有する期
間の短縮を除外している。
イ本件条例は，「当分の間」の措置として制定されており（本件条例２
条），失効期限の定めは存在しなかったので，他の法規によって廃止され
ない限り，法規としての効力を失うものではない。総務大臣も，本件条例
の創設の際，そのような「当分の間」の適用について同意したものである。
一方，平成１６年４月１日施行の地方税法改正に伴う平成１６年神奈川
県条例第１８号による本件条例の改正により，企業税は，税率を引き下げ
られるとともに，対象年度が段階的に縮小され，有効期間も平成２１年３
月３１日限りとされた。すなわち，この改正により，企業税の税率が引き
下げられ，条例の規定が効力を有する期間も短縮されたのであって，原告
が主張するような適用期間の延長は存在しない。
現に，上記改正の際，被告は，総務省の担当職員から，総務大臣の同意
を要しない旨の判断を受けた。
ウしたがって，本件において，地方税法２５９条１項に規定する総務大臣
との協議及び同意が必要な「変更」は存在しないから，協議及び同意の不
存在は，本件条例の手続違背を招来するものではない。
(11)その他の原告主張の違法事由について
ア不均一課税ではないこと（違法事由⑥）
地方税法７条に規定する不均一課税とは，一つの税制度のなかで一定の
範囲を限って異なる税率を適用する場合に検討すべき事項である。そして，
企業税は，形式的にも実質的にも法人事業税と同一の税ではなく，別個の
制度である法定外税として創設されているから，不均一課税は問題となら
ない。
イ比例原則に違反しないこと（違法事由⑦）
租税法の定立が立法府の広範な裁量的判断に委ねられているのは，後記
大島訴訟判決に判示のとおりであり，このことは，地方団体の立法（条
例）についても同様に当てはまる。租税としてどのようなものを採用する
かは，まさに立法政策の問題であるところ，企業税は，あくまでも当期利
益の範囲内で，３パーセントの税率による，相当程度担税力がある者に対
する課税であるから，合理的裁量の範囲内に収まっており，憲法２９条違
反その他の違憲・違法の問題は生じない。
ウ実質的公平に合致すること（違法事由⑧）
企業税は，当期利益をあげている法人に対し，繰越控除欠損金額相当額
の当期利益に課税するものであって，実質的公平に合致する。
(12)司法府は地方団体の裁量的判断を尊重すべきこと
租税法の定立は，立法府の広範な裁量的判断に委ねられており，判例も，
「租税法の定立については，国家財政，社会経済，国民所得，国民生活等の
実態についての正確な資料を基礎とする立法府の政策的，技術的な判断にゆ
だねるほかはなく，裁判所は，基本的にはその裁量的判断を尊重せざるを得
ないものというべきである。」としている（大島訴訟判決，最高裁昭和６０
年３月２７日大法廷判決・民集３９巻２号２４７頁）。
この立法府の裁量的判断を尊重しなければならないという考え方は，地方
の経済，財政，税制等の実態を了知し，これらについての正確な資料を有す
る地方税当局の裁量的判断を尊重しなければならないという考え方に共通す
るものである。すなわち，上記判示は，条例による課税立法についても，司
法府の判断のあり方として妥当するものである。
(13)まとめ
以上のとおり，本件条例は，地方税法２５９条以下に規定する法定外税の
新設に係る要件及び手続を充足して制定されたもので，原告主張の各違法事
由にも理由はないから，適法・有効である
３争点(2)（本件各更正等の有効性，誤納金・還付加算金の額）について
＜原告の主張＞
(1)前記２＜原告の主張＞のとおり，本件条例は地方税法等に違反する違法
・無効な条例であるところ，課税処分においてその根拠となる条例が無効で
あることは，当該課税処分につきこの上ない極めて重大な瑕疵というべきで
ある。そして，一般に，課税処分が課税庁と被課税者との間にのみ存するも
ので，処分の存在を信頼する第三者の保護を考慮する必要がないことからす
れば，本件各更正等については，上記瑕疵の重大性に照らし，徴税行政の安
定とその円滑な運営の要請を斟酌してもなお，被課税者に本件各更正等によ
る不利益を甘受させることが著しく不当と認められるような例外的事情があ
るというべきである。
したがって，本件各更正等は，その瑕疵が明白なものか否かにかかわらず
無効であり，原告は，本件各更正等の取消しを待つまでもなく，原告が被告
に対して納付した金員を誤納金として還付請求することができる（いわゆる
東京都銀行税条例事件についての東京高裁平成１５年１月３０日判決・判時
１８１４号４４頁及び東京地裁平成１４年３月２６日判決・判時１７８７号
４２頁参照）。
(2)誤納金及びその還付加算金の額は，以下のとおりである。
ア平成１５年度分（主位的請求(1)）
(ア)誤納金の額１３億１４８１万２６００
円
以下の各金額の合計額である。
ａ平成１６年６月３０日に納付した平成１５年度分の企業税額
１２億８６４５万５６００円
ｂ平成１９年６月２２日に納付した，平成１５年度分の企業税に係る
更正及び過少申告加算金決定により新たに納付すべき金額
２７２４万８９００円
ｃ平成１９年７月９日に納付した，上記更正に係る延滞金額
１１０万８１００円
(イ)還付加算金の起算日及び割合
誤納金の還付加算金の起算日は，納付があった日の翌日から起算して
１月を経過する日の翌日である（地方税法１７条の４第１項４号，同法
施行令６条の１５第１項２号）。したがって，前記(ア)の誤納金のうち，
ａについては平成１６年８月１日，ｂについては平成１９年７月２３日，
ｃについては同年８月１０日が，それぞれ還付加算金の起算日となる。
また，過誤納金に係る還付加算金の割合は，年７．３パーセント又は
地方税法附則３条の２第１項に規定する特例基準割合のいずれか低い割
合である（同法１７条の４第１項，同法附則３条の２第３項）。
(ウ)請求の内訳
主位的請求(1)中主文第１項(1)対応部分は，前記(ア)の誤納金の還付
に加え，ａに係る還付加算金のうち平成１９年１月１日以降のもの並び
にｂ及びｃに係る還付加算金の支払を求めるものである。ただし，地方
税法２０条の４の２第２項，第７項により，還付加算金の額の計算の基
礎となる過誤納金の額につき１０００円未満の端数を切り捨てた（以下
同じ。）。なお，平成１９年の特例基準割合は，４．４パーセントであ
る。
また，主位的請求(1)中主文第１項(2)対応部分は，前記(ア)ａに係る
還付加算金のうち，平成１６年８月１日から平成１８年１２月３１日ま
での期間のものとして，１億２７５９万８７１３円（１２億８６４５万
５０００円×４．１パーセント×８８３／３６５（日））の支払を求め
るものである。なお，当該期間の特例基準割合は，４．１パーセントで
ある。
イ平成１６年度分（主位的請求(2)）
(ア)誤納金の額６億６４３７万９７００
円
以下の各金額の合計額である。
ａ平成１７年６月１５日に納付した平成１６年度分の企業税額
６億５６７５万７５００円
ｂ平成１９年６月２２日に納付した，平成１６年度分の企業税に係る
更正及び過少申告加算金決定により新たに納付すべき金額
７３２万４４００円
ｃ平成１９年７月９日に納付した，上記更正に係る延滞金額
２９万７８００円
(イ)還付加算金の起算日
前記(ア)の誤納金のうち，ａについては平成１７年７月１６日，ｂに
ついては平成１９年７月２３日，ｃについては同年８月１０日が，それ
ぞれ還付加算金の起算日となる。
(ウ)請求の内訳
主位的請求(2)中主文第２項(1)対応部分は，前記(ア)の誤納金の還付
に加え，ａに係る還付加算金のうち平成１９年１月１日以降のもの並び
にｂ及びｃに係る還付加算金の支払を求めるものである。
また，主位的請求(2)中主文第２項(2)対応部分は，前記(ア)ａに係る
還付加算金のうち，平成１７年７月１６日から平成１８年１２月３１日
までの期間のものとして，３９３９万４６２３円（６億５６７５万７０
００円×４．１パーセント×５３４／３６５（日））の支払を求めるも
のである。
(3)よって，原告は，主位的請求として，請求１(1)，(2)の各請求をする。
＜被告の主張＞
本件条例は適法・有効であるから，その違法・無効を前提とする原告の各請
求に理由はない。ただし，原告が主張する誤納金及びその還付加算金の額の計
算方法が正しいことは認める。
４争点(3)（本件各更正等の取消事由の有無，過納金・還付加算金の額）につ
いて
＜原告の主張＞
(1)仮に，本件各更正等が無効とまではいえず，一応有効であると判断され
るとしても，前記２＜原告の主張＞のとおり，本件条例は地方税法等に違反
する違法・無効な条例であるから，これに基づく本件各更正等は，違法であ
り，取り消されるべきである。
なお，原告は，平成１５年度分及び平成１６年度分の企業税について申告
をした後，それぞれにつき，税額の全額の減額を求める旨の更正の請求を行
い，かつ，本件各通知に対し適法に不服申立て及び取消訴訟の提起をするこ
とにより，本件各通知の確定を防いでいるから，その後にされた増額更正で
ある本件各更正につき，申告額を下回る部分を含め，その全部の取消しを求
めることができる（予備的請求(1)，(2)の各ア）。
この場合，原告が被告に対して納付した金員は，本件各更正等の取消しに
より過納金に当たることになり，原告はその還付を請求することができる。
(2)過納金及びその還付加算金の額は，以下のとおりである。
ア平成１５年度分（予備的請求(1)イ）
(ア)過納金の額１３億１４８１万２６００
円
その内訳は，前記３＜原告の主張＞(2)ア(ア)のａないしｃのとおり
である。
(イ)還付加算金の起算日
更正の請求に基づく更正（当該請求に対する処分に係る不服申立てに
ついての判決を含む。）により納付すべき額が減少した地方税に係る過
納金の還付加算金の起算日は，その更正の請求があった日の翌日から起
算して３月を経過する日と当該更正があった日の翌日から起算して１月
を経過する日とのいずれか早い日の翌日である（地方税法１７条の４第
１項２号）。原告は，平成１６年１１月８日付けで，前記(ア)の過納金
のうち，申告納付したａについてその全額の減額を求める更正の請求を
しているから，ａについては平成１７年２月９日が還付加算金の起算日
となる。
また，更正又は加算金の決定により納付すべき額が確定した地方団体
の徴収金（当該地方団体の徴収金に係る地方税に係る延滞金を含む。）
に係る過納金の還付加算金の起算日は，当該過納金に係る地方団体の徴
収金の納付があった日の翌日である（地方税法１７条の４第１項１号）。
したがって，前記(ア)の過納金のうち，ｂについては平成１９年６月２
３日，ｃについては同年７月１０日が，それぞれ還付加算金の起算日と
なる。
(ウ)請求の内訳
予備的請求(1)イ(ア)は，前記(ア)の過納金の還付に加え，ａに係る
還付加算金のうち平成１９年１月１日以降のもの並びにｂ及びｃに係る
還付加算金の支払を求めるものである。
また，予備的請求(1)イ(イ)は，前記(ア)ａに係る還付加算金のうち，
平成１７年２月９日から平成１８年１２月３１日までの期間のものとし
て，９９８５万３５７９円（１２億８６４５万５０００円×４．１パー
セント×６９１／３６５（日））の支払を求めるものである。
イ平成１６年度分（予備的請求(2)イ）
(ア)過納金の額６億６４３７万９７００
円
その内訳は，前記３＜原告の主張＞(2)イ(ア)のａないしｃのとおり
である。
(イ)還付加算金の起算日
原告は，平成１７年６月１６日付けで，前記(ア)の過納金のうち，申
告納付したａについてその全額の減額を求める更正の請求をしているか
ら，ａについては同年９月１７日が還付加算金の起算日となる。
また，前記(ア)の過納金のうち，ｂについては平成１９年６月２３日，
ｃについては同年７月１０日が，それぞれ還付加算金の起算日となる。
(ウ)請求の内訳
予備的請求(2)イ(ア)は，前記(ア)の過納金の還付に加え，ａに係る
還付加算金のうち平成１９年１月１日以降のもの並びにｂ及びｃに係る
還付加算金の支払を求めるものである。
また，予備的請求(2)イ(イ)は，前記(ア)ａに係る還付加算金のうち，
平成１７年９月１７日から平成１８年１２月３１日までの期間のものと
して，３４７４万６９４３円（６億５６７５万７０００円×４．１パー
セント×４７１／３６５（日））の支払を求めるものである。
(3)よって，原告は，予備的請求として，請求２(1)，(2)の各請求をする。
＜被告の主張＞
本件条例は適法・有効である。そして，本件各更正等の課税根拠は，前記第
５のとおりであり，いずれも本件各更正等の金額と同額であるから，本件各更
正等は適法である。また，本件各更正による延滞金の根拠は，前記第５のとお
りであり，いずれも原告が納付した延滞金の金額と同額であるから，同延滞金
の徴収も適法である。したがって，原告の各請求に理由はない。ただし，原告
が主張する過納金及びその還付加算金の額の計算方法が正しいことは認める。
第７当裁判所の判断
１争点(1)（本件条例の適法性及び有効性）について
(1)地方団体の課税権
憲法は，第８章「地方自治」において，「地方公共団体の組織及び運営に
関する事項は，地方自治の本旨に基いて，法律でこれを定める。」（９２
条）と規定し，さらに，「地方公共団体は，その財産を管理し，事務を処理
し，及び行政を執行する権能を有し，法律の範囲内で条例を制定することが
できる。」（９４条）と規定している。そして，地方団体が，地方自治の本
旨に従い，国から独立した地位においてその財産を管理し，事務を処理し，
及び行政を執行していくには，その財源を自ら調達する権能，すなわち課税
権を有することが必要であることからすると，地方団体の課税権は，地方自
治の不可欠の要素であり，地方団体の自治権の一環として，憲法上保障され
ているものと解すべきである。
もっとも，地方団体の課税権が憲法上保障されたものであるとしても，憲
法はその具体的内容について規定するものではないこと，地方団体はその組
織及び運営に関する事項につき「法律でこれを定める」ものとされ（憲法９
２条），「法律の範囲内」で条例を制定することができるものとされている
こと（同９４条），及び，租税の賦課については国民の総合的な税負担の程
度や国・地方間ないし地方団体相互間の財源の配分等の観点から国家的な調
整が必要であることに照らせば，地方団体が課することができる租税の税目，
課税客体，課税標準，税率その他賦課徴収のあり方については，法律によっ
てその準則ないし枠を定めることが予定されているものというべきである。
すなわち，法律は，地方団体が課税権を行使する際の具体的準則ないし枠を
設けるものであり，当該法律が地方団体の課税権を実質的に否定するものと
して地方自治の本旨に反する場合は格別，地方団体の課税権は，具体的には，
当該法律の規定に従って行使されなければならない。
このような観点から，地方自治法は，「普通地方公共団体は，法律の定め
るところにより，地方税を賦課徴収することができる。」（同法２２３条）
ものとしている。そして，地方税法は，「地方団体は，この法律の定めると
ころによって，地方税を賦課徴収することができる。」（同法２条）として，
地方団体の課税権の具体的準則を設けたものであり，その上で，「地方団体
は，その地方税の税目，課税客体，課税標準，税率その他賦課徴収について
定をするには，当該地方団体の条例によらなければならない。」（同法３条
１項）としている。そうすると，地方団体の課税権は，地方税法が定める具
体的準則の枠内において，地方団体の議会が制定する条例の定めるところに
よって行使されるものということができる。
地方団体の課税権が地方自治の不可欠の要素として憲法上保障されている
と解されることに照らし，地方税法上の規定もこのような地方団体の課税権
の趣旨に即して解釈，運用するようにしなければならないとしても（地方自
治法２条１２項参照），当該課税権は，上記のとおりあくまでも地方税法上
の具体的準則に従って行使されなければならないものというべきである。
(2)法定外税の沿革及び趣旨
ア地方税法は，地方団体において，法定の税目を除くほか，別に税目を起
こして普通税を課することができるものと規定しているところ（同法４条
３項，５条３項）（なお，都も道府県に準じて法定外普通税を課すること
ができる（同法１条２項）。），その沿革について，以下の事実を認める
ことができる。
(ア)現在の法定外普通税に相当する制度は，明治１３年までさかのぼる
ことができ，同年当時，府県・市町村は，雑種税，特別税の一種として，
内務大臣及び大蔵大臣の許可を得て，法定された税目以外の税を課する
ことができるものとされていた（乙３２，４２）。
(イ)昭和１５年の地方税法制定（昭和１５年法律第６０号）に際し，市
町村のみが，内務大臣及び大蔵大臣の許可を得て，法定された税目以外
の法定外独立税を課することができるものとされ，道府県についてはそ
の権能はなく，法定された税目のみしか課することができないものとさ
れた。しかし，昭和２１年の法改正において，道府県も市町村と同様の
手続で法定外独立税を課することができるものとされた（乙３２，４
２）。
(ウ)昭和２３年の地方税法改正（昭和２３年法律第１１０号）において
は，地方団体は，徴収に要する経費が徴収すべき税額に比し多額である
と認められるものその他特別の事情のあるものを除き，法定された税目
の独立税を課するものとされる一方（同法４６条１項，１０３条１項），
そのほか，別に税目を起こして独立税を課することができるものとされ
（同法４６条２項，１０３条３項），この法定外独立税の新設や変更に
つき，従来のような許可を要せず，内閣総理大臣に報告すれば足りるも
のとされた（同法１２２条１項３号）。この場合において，内閣総理大
臣は，「当該条例について国民の租税負担，国の経済施策等に照し適当
でないものがあると認めるとき」は，地方税審議会の審査に付し，その
審査に基づいて条例を取り消し，又は変更するものとされた（同法１２
３条）（乙３０，３２，４２）。
この法案の提案理由として，国務大臣は，「法定外独立税の新設変更
（略）等の場合におきましては，内閣総理大臣及び大蔵大臣又は都道府
県知事の許可を要することとなっておりますが，地方団体における財政
自主権を確立する方向から見まして，この際許可制度を全廃することを
適当と考えたのであります。（略）併しながら，一面地方団体が財政運
営の方針を誤り，その財政の健全性を失い，国又は住民に迷惑をかける
ようになりますと，却って自治の基盤を破壊することになりますので，
財政自主権を尊重しつつ而もかかる弊害に陥らぬようにいたしますため，
地方審議会による審査の制度を設けたのであります。」と述べている
（昭和２３年６月２４日第２回国会参議院治安及び地方制度委員会会議
録第２６号２頁。乙３１）。
(エ)昭和２４年当時，法定外独立税として，都道府県では３０税目を延
べ９０団体が，市町村では１８４税目を延べ１０９５５団体が，それぞ
れ課していた（乙４８）。
このような状況に対し，シャウプ使節団は，以下のような勧告を行っ
た。「われわれの計算によれば，法定外独立税は将来においては減少す
べきことになっているが，われわれは，地方団体間の事情の相異によっ
て特別な場合にはこれを必要とすることがあるかも知れないということ
を承認する。われわれは，このような税を認可する適当な規定を存置す
るように勧告する。」（シャウプ勧告第一三章Ｃ五），「地方自治のた
めに，われわれは，地方行政単位がこれらの租税（当時の約３０種の法
定外独立税）を，その賦課しようとするかも知れない他の法定外独立税
とともに，法定外独立税として課することを許されるように勧告するも
のであるが，地方当局に対して法定外独立税の数はこれを制限するよう
に忠告したい。（略）委員会は現行の法定外独立税を否認し，また新た
に法定外独立税を起こそうとする地方当局の申請を却下する権限を持た
ねばならない。かかる租税は，それらが国家の利益に反することが明ら
かである場合にのみ，たとえば，それらが煩わしい内国「関税」の効果
をもつとき，あるいは耐え難い差別を課するとき，あるいは国税の徴収
を不当に妨害する時にのみ拒否されるであろう。委員会には国の利益を
制限することを許すべきである。」（シャウプ勧告附録Ａ・Ｅ）（乙６，
３２，４２）。
(オ)上記シャウプ勧告を受けて，昭和２５年，現在の地方税法が制定さ
れ（昭和２５年法律第２２６号），道府県については，徴収に要すべき
経費が徴収すべき税額に比して多額であると認められるものその他特別
の事情のあるものを除き，法定された税目の普通税（法定税）を課する
ものとされる一方（同法４条２項），そのほか，別に税目を起こして普
通税（法定外税）を課することができるものとされ（同条３項）（この
ほか，法定された税目の目的税を課することもできる（同条４項）。），
この法定外税を新設し又は変更しようとする場合においては，あらかじ
め，地方財政委員会（その後，自治大臣に変更された。）の許可を受け
なければならないものとされた（同法２５９条）。そして，地方財政委
員会は，申請に係る法定外税について，「当該道府県にその税収入を確
保できる税源があること及びその税収入を必要とする当該道府県の財政
需要があることが明らかであるとき」は，これを許可しなければならな
いが（同法２６１条１項本文），同項１号ないし３号（内容は現行の地
方税法２６１条１号ないし３号と同じ）に掲げる事由があると認める場
合においては，その許可をすることができないものとされた（同項ただ
し書）。また，市町村の法定外普通税についても，同様の定めがされた
（同法５条，６６９条，６７１条）（乙３３）。
さらに，上記の地方税法制定に伴い，「地方税法の施行に伴い廃止す
る法定外独立税の税目に関する地方財政委員会規則」（昭和２５年８月
１１日地方財政委員会規則第４号）により，従前の道府県法定外独立税
のうち温泉税等１４税目が，また市町村法定外独立税のうち特別事業税
等１２２税目が，それぞれ廃止された（乙３２，４０，４２）。
(カ)自治庁が昭和３３年に出した通達「法定外普通税に係る当面の問題
点について」（昭和３３・４・５自丙府発第３２号各道府県総務部長・
東京都主税局長あて自治庁税務局長通達）は，法定外普通税につき，
「個々の税目については，地方団体が自主的に諸般の事情を総合検討し，
特に設定後における情勢の変化を充分勘案して適宜措置をとることを期
待するものである。」とし，また，「現在の地方税制度においては，府
県及び市町村とも住民税，事業税，固定資産税をはじめ，有力な税種が
与えられており，地方交付税制度その他と相まって，地方税財政制度は
近時充実の方途をたどっている。また，国民生活の内容も逐年充実向上
しており，租税負担も可及的に軽減，合理化されてきているが，なお一
般的にはその軽減に努めるべきであるといわれている。かかる際に数多
くの法定税目に加えて法定外普通税を課することは，税制改正の基本的
方向，国民負担の現況，国民に与える圧迫感等からして再検討を要する
と考えられる。」とした（乙４５）。
(キ)同通達に基づき，法定外普通税の課税は減少を続け，平成１１年当
時，都道府県では４税目を延べ１４団体が，市町村では２税目を延べ６
団体が，それぞれ課するにとどまっていた（乙４９）。
(ク)しかし，平成１０年５月２９日に閣議決定された「地方分権推進計
画」は，「法定外普通税の許可制度については，より課税自主権を尊重
する観点から廃止し，都道府県又は市町村が法定外普通税を新設又は変
更するに当たっては，国と事前協議を行うこととする。この場合，国の
同意を要することとする。ただし，税源の存在及び財政需要の有無につ
いては，事前協議の際の協議事項から除外し，国の関与を縮減すること
とする。」と定めた（乙３）。
これを受けて，平成１１年，地方分権推進一括法による地方税法改正
により，法定外税の新設又は変更につき，従前の許可制に代えて，前記
第３，２のとおり，自治大臣（その後，総務大臣に変更された。）との
同意を要する協議制（地方税法２５９条，２６１条）が採用され，自治
大臣は，協議の申出に係る法定外税について，同法２６１条１号ないし
３号に掲げる事由のいずれかがあると認める場合を除き，同意しなけれ
ばならないものとされた。また，従前は許可についての積極要件とされ
た税源及び財政需要の存在については，同意の判断事項から除外された
（同法２６１条）。さらに，道府県は法定外目的税を課することもでき
るものとされた（同法４条６項）。市町村の法定外普通税・目的税につ
いても，同様の定めがされた（同法５条７項，６６９条，６７１条）
（乙３８）。
(ケ)平成１７年４月１日当時，道府県法定外普通税（法定外税）として
５税目を延べ１５団体が，市町村法定外普通税として５税目を延べ７団
体が，道府県法定外目的税として３税目を延べ２３団体が，市町村法定
外目的税として６税目を延べ６団体が，それぞれ課している。なお，企
業税又はこれに類する税目を課している地方団体は，被告のみである
（甲６９，乙５０）。
イ法定外税は，現行の地方税法上，以下のような位置付けとされている。
すなわち，道府県は，道府県税として，普通税及び目的税を課すること
ができる（地方税法４条１項）。このうち普通税については，道府県は，
道府県民税等８税目の法定税を課するものとされる一方（ただし，徴収に
要すべき経費が徴収すべき税額に比して多額であると認められるものその
他特別の事情があるものについては，この限りでない。同法４条２項），
そのほか，別に税目を起こして法定外税を課することができるものとされ
ている（同条３項）。そして，地方税法は，第２章第１節ないし第１０節
において（ただし，第７節及び第１０節は削除された。），各法定税につ
いてそれぞれ，課税客体，課税標準，税率及び賦課徴収手続等を規定し，
同章第１１節において，法定外税について，その新設又は変更に係る要件
及び手続並びにその賦課徴収手続等を規定している。
ウ以上のような法定外税の課税は，その税目，課税客体，課税標準及び税
率等があらかじめ法定されておらず，道府県が自己の判断においてこれら
を決定できる性質のものであることからして，法定税の場合に比べ，道府
県の課税権がより直接的・自主的な形で現れたものということができる。
もっとも，法定税の課税も道府県の課税権の行使の一態様といえるところ
であるから，法定外税を法定税とどのような関係に置くか，また，法定外
税をどのような要件及び手続の下に認めるかについては，道府県の課税権
という概念から直ちに導かれるものではなく，法律において具体化される
べき問題というべきである。
この点，前記アの沿革のとおり，法定外税の新設又は変更の具体的要件
及び手続については，国民の租税負担や国の経済施策への影響，地方団体
の財政の健全性確保の必要性，地方団体内の税源や財政需要の存在の要請
及び（少なくとも日本国憲法施行後は）地方団体の自主的な課税権の重要
性等の種々の要素を考慮して，その時々の法律によって定められてきたも
のである。そして，現行の地方税法上は，地方分権の推進の観点から，地
方団体の自主的な課税権が特に尊重され，道府県において，総務大臣との
同意を要する協議という比較的軽微な手続によって，法定外税の新設又は
変更をすることができるものとされているところである。
ただし，前記アの沿革から明らかなとおり，地方団体は，法律上，あら
かじめ法定された税目を課するものとされる一方で（昭和２３年法律第１
１０号及び昭和２５年法律第２２６号による地方税法の下では，いずれも，
地方団体は，特別の事情のあるものを除き法定された税目の独立税ないし
普通税を課するものとされていた。），これに加えて法定された税目以外
の税目を課することができるという形で，一定の要件及び手続の下に，法
定外税の課税を認められてきたものである。そして，このような法定税と
法定外税との基本的関係は，前記イのとおり，現行の地方税法上も維持さ
れている。このような地方税法の基本的構造からすれば，地方団体の自主
的な課税権を重視する現行法上も，法定外税は，法定税を補充するものと
して位置付けられているものと解される。
そして，以上の法定外税の沿革及び現行法上の位置付けのとおり，法定
外税の根拠として地方団体の自主的な課税権が強調されてきたこと，シャ
ウプ勧告においては地方団体間の事情の相異による法定外税の必要性が指
摘されていたこと，当該地方団体の税源及び財政需要の存在が明示的に要
件とされていたことがあったこと，また，法定外税の課税は法定税の課税
に加えてそれ以外の税目を課する形でされるものであることなどに照らせ
ば，法定外税の趣旨は，道府県において，第一義的には法定税を課する一
方で，道府県の自主的な課税権に基づき，その実情に応じて法定税の課税
を補充するため，法定税以外の課税をすることにあるということができる。
(3)総務大臣との同意を要する協議制度及び不同意事由の趣旨
ア道府県から法定外税の新設又は変更についての協議の申出（地方税法２
５９条１項）を受けた総務大臣は，「１号国税又は他の地方税と課税標
準を同じくし，かつ，住民の負担が著しく過重となること。２号地方
団体間における物の流通に重大な障害を与えること。３号前２号に掲
げるものを除くほか，国の経済施策に照らして適当でないこと。」のいず
れかがあると認める場合を除き，これに同意しなければならないものとさ
れている（同法２６１条）。
ところで，地方分権推進一括法による改正後の地方自治法は，普通地方
公共団体に対する国又は都道府県の関与につき，国の行政機関又は都道府
県の機関が行う関与の行為の類型を定めた上で（同法２４５条），「普通
地方公共団体は，その事務の処理に関し，法律又はこれに基づく政令によ
らなければ，普通地方公共団体に対する国又は都道府県の関与を受け，又
は要することとされることはない。」（同法２４５条の２）として，関与
の法定主義を定め，さらに，「国は，普通地方公共団体が，その事務の処
理に関し，普通地方公共団体に対する国又は都道府県の関与を受け，又は
要することとする場合には，その目的を達成するために必要な最小限度の
ものとするとともに，普通地方公共団体の自主性及び自立性に配慮しなけ
ればならない。」（同法２４５条の３第１項）として，国が法律又は政令
により関与の規定を設ける際の基本原則（必要最小限度の原則）を定めて
いる。
地方税法２５９条１項及び２６１条に規定する総務大臣との同意を要す
る協議は，上記の普通地方公共団体に対する国の関与のうち，地方自治法
２４５条１号ニに規定する「同意」及び同条２号に規定する「協議」に該
当する。地方分権推進一括法による地方税法の改正により，法定外税の新
設又は変更につき，従前の許可制に代えて総務大臣との同意を要する協議
制が採用されたのは，道府県の事務の処理に関する国の関与を必要最小限
度のものとする観点から，国と道府県とが対等・協力の立場に立つという
関係に基づき，両者が相互に誠実に協議し，その結果一定の事項について
双方の意思の合致としての同意を要するものとすることによって，道府県
の自主的な課税権を尊重しつつ，国の施策との整合性の確保を図ろうとし
たものと解される。すなわち，国は，「国又は都道府県の施策と普通地方
公共団体の施策との整合性を確保しなければこれらの施策の実施に著しく
支障が生ずると認められる場合を除き，自治事務の処理に関し，（略）国
又は都道府県の関与のうち第２４５条第１号ニに規定する行為（同意）を
要することとすることのないようにしなければならない」ものとされてい
るところ（地方自治法２４５条の３第４項），法定外税の新設又は変更は，
特定の道府県の住民のみの租税負担を増加させ，地方団体間の物の流通に
影響を及ぼすことがあり，また，その他国の経済施策の実施に影響を与え
る可能性があるため，国の施策との整合性を確保し，その施策の実施に著
しい支障が生ずることを防ぐという観点から，法定外税の新設又は変更に
ついて，総務大臣の同意を要するものとされ，地方税法２６１条各号の事
由が定められているものと解される。
イそうすると，法定外税の新設又は変更に係る同意を要する協議制度は，
国の行政機関たる総務大臣が，道府県の法定外税の新設又は変更に事前に
関与することにより，異なる行政主体間において経済施策等の施策の整合
性を確保するという，行政目的の下に設けられているものということがで
きる。そして，地方税法２６１条各号に規定する不同意事由は，上記の関
与の必要最小限度の原則（地方自治法２４５条の３第１項）や同意を要す
る場合を限定する規定（同条第４項）の趣旨に照らせば，これらの不同意
事由に該当しなければ同意しなければならないものとすることによって，
上記行政目的の下での国の関与の態様を限定する趣旨のものということが
できる。すなわち，法定外税の新設又は変更に係る同意を要する協議にお
いて，総務大臣は，地方税法２６１条各号の事由に該当するかどうかとい
う点に限って，国の施策との整合性の確保という行政目的の下に，検討・
判断をするものということができる。
ウこの点につき，被告は，地方税法２６１条各号の事由は，同法の定める
租税一般原則に合致するかどうかを審査するために設けられたもので，租
税一般原則の観点から法定外税として容認できない場合（法定外税が地方
税法上違法となる場合）を類型化したものであり，当該法定外税が地方税
法上適法かどうかを判断する分水嶺となっている旨を主張する。
しかし，地方税法２６１条各号の事由は，住民の負担が著しく過重とな
るか，国の経済施策に照らして適当でないかといった，政策的判断を含む
抽象的・一般的な定めをしているにすぎないこと，また，地方税法の想定
する「租税一般原則」があるとしても，法定外税がそれに合致して適法か
どうかは，客観的に定まるべきものであって，国の行政機関と道府県とが
協議して相互の意思の合致に至るような性質のものとは解されないことか
らすれば，同条各号の事由が，上記のような異なる行政主体間の施策の整
合性を確保するという趣旨を超えて，「租税一般原則」といった観点から
法定外税の適法性を審査するためのものであるとは解することができない。
（なお，被告の上記主張の意図は，むしろ，法定外税が同条各号の事由に
該当せずに総務大臣の同意を得れば，それが施策の整合性の確保の趣旨か
らされるものであるにせよ，当該法定外税は地方税法上許容されることに
なるという趣旨をいうことにあるとも解し得るところであり，この点につ
いては，法定外税が法定税に係る規定に違反するとして違法となる場合が
あるかという観点から，後記(4)において検討する。）
エこの点に関し，総務省が出した通知「法定外普通税又は法定外目的税の
新設又は変更に対する同意に係る処理基準等及び留意事項について」（平
成１３年４月１２日総税企第６４号各道府県道府県税所管部長・市町村税
所管部長，東京都総務・主税局長あて総務省自治税務局長通知）は，地方
税法２６１条各号の不同意事由につき，以下のとおりとしている（甲４
３）。
「(1)「国税又は他の地方税と課税標準を同じくし，かつ，住民の負担が
著しく過重となること」（第１号）については，「国税又は他の地方税
と課税標準を同じくし」とは，実質的に見て国税又は他の地方税と課税
標準が同じである場合を含むものであり，「住民の負担が著しく過重と
なること」とは，住民（納税者）の担税力，住民（納税者）の受益の程
度，課税を行う期間等から判断して明らかに，住民の負担が著しく過重
となると認められることをいうものである。
(2)「地方団体間における物の流通に重大な障害を与えること」（第２
号）とは，課税の目的，内容及び方法，流通の状況，流通価格に与える
影響等から判断して，当該法定外税が内国関税的なものであるなど，地
方団体間における物の流通に重大な障害を与えると認められることをい
うものである。
(3)「国の経済施策に照らして適当でないこと」（第３号）については，
「国の経済施策」とは，経済活動に関して国の各省庁が行う施策のうち，
特に重要な，又は強力に推進を必要とするものをいい，「国の経済施策
に照らして適当でないこと」とは，課税の目的，内容及び方法，住民
（納税者）の担税力，住民（納税者）の受益の程度，課税を行う期間，
税収入見込額，特定の者によって惹起される特別な財政需要に要する費
用のために負担を求める税については当該税収を必要とする特別な財政
需要の有無等の諸般の事情から判断して，国の経済施策に照らして適当
でないと認められることをいうものである。」
このように，総務省の所管部局が示す地方税法２６１条各号の不同意事
由に関する実務上の解釈基準においても，同条３号についてもっぱら経済
活動に関して国の各省庁が行う施策との整合性が問題とされていることか
ら明らかなように，「租税一般原則」に合致して適法かどうかといった観
点からの検討は予定されていないところである。
オ以上のとおり，法定外税の新設又は変更に係る総務大臣との同意を要す
る協議（地方税法２５９条１項，２６１条）は，異なる行政主体間におい
て経済施策等の施策の整合性を確保するという，行政目的の下にされるも
のであって，当該法定外税の適法性を審査する性質のものではないから，
企業税の適法性は，総務大臣の同意の判断如何にかかわらず，本訴におい
て別途判断されるべき問題である。
すなわち，本訴において，企業税の適法性については，被告が主張する
ような，地方税法２６１条各号の事由に該当するかどうかや，同条の規定
に基づき総務大臣がした同意の判断の適否にとどまらず（当該同意に違法
があれば当該法定外税条例が違法になることは当然である。），端的に，
企業税が法令に適合するかどうか自体も判断されるべきことになる。
カもっとも，いかなる場合に法定外税が違法となるのかという問題は，さ
らに検討を要するところである。
既に述べたとおり，地方税法２６１条に規定する同意は，異なる行政主
体間において経済施策等の施策の整合性を確保するという，行政目的の下
にされるものであって，法定外税の適法性を審査する性質のものではない
が，この場合においても，当該同意その他同法２５９条ないし２９０条に
規定する要件及び手続を満たした法定外税が，なお地方税法上違法となる
場合があるのか，また，いかなる場合に違法となるのかを，別途検討しな
ければならない。例えば，施策の整合性の確保という観点からの総務大臣
の同意を得，その他同法２５９条ないし２９０条に規定する要件及び手続
を満たしさえすれば，地方税法上，道府県において自由に法定外税の新設
又は変更ができるという解釈も，理論上あり得るところである。
この点について，原告は，法定外税が地方税法２５９条ないし２９０条
に規定する要件及び手続を満たしたとしても，地方税法上の法人事業税等
の法定税に係る規定に違反する場合には，当該法定外税は違法となる旨を
主張し，これに対し，被告は，法定外税の準則は同法２５９条ないし２９
０条の規定に尽きており，法人事業税等の法定税に係る規定が法定外税に
関する準則となるものではない旨を主張するので，次に，法定外税が地方
税法上の法定税に係る規定に違反するとして違法となる場合があるのかに
ついて，検討することとする。
(4)法定税に係る規定と法定外税との関係
以下，法定外税が地方税法上の法定税に係る規定に違反するとして違法と
なる場合があるのかについて検討する。
ア地方税法は，道府県において，徴収に要すべき経費が徴収すべき税額に
比して多額であると認められるものその他特別の事情があるものを除き
（同法４条２項ただし書），法定税を課するものとし（同項本文），さら
に，各法定税について，課税客体，課税標準，税率及び賦課徴収手続等を
詳細に規定し，法定税の課税の際の具体的準則を設けている（同法第２章
第１節ないし第１０節）。すなわち，地方税法は，道府県において，上記
特別の事情がある場合を除き，法定税として定める各税目を，それぞれ定
められた課税客体，課税標準，税率及び賦課徴収手続等の規定に従い課す
べきものとしているところである。
一方，地方税法は，道府県において，法定税以外の税目を起こして，法
定外税を課することができるものとしているが（同法４条３項），この法
定外税は，前記(2)ウのとおり，上記のように道府県において原則として
法定税を課すべきことを前提に，これに加えて法定税以外の税目を課する
形で，法定税の課税を補充するものとして課されるものである。そして，
同条２項ただし書は法定外税に触れるところはなく，法定税を課さない特
別の事情と法定外税の課税自体とに直接の関係はないものと解されること
からすれば，法定外税を課する場合であっても，上記のとおり道府県にお
いて法定税を法定の準則に従い課すべきことに変わりはない。
以上のとおり，地方税法は，道府県において，法定税を，これを課さな
い特別の事情がある場合を除くほかは，それぞれ定められた課税客体，課
税標準，税率及び賦課徴収手続等の規定，すなわち法定の準則に従い課す
べきということを前提としつつ，これに付加するものとして，法定外税の
課税を認めているものということができる。
イそうすると，道府県において，地方税法の規定に従い法定税を課すべき
場合であるにもかかわらず，法定外税の創設により，実質的には地方税法
が当該法定税について定めた規定の趣旨に反するような課税をすることは，
道府県において法定税を法定の準則に従い課すべきものとした地方税法の
趣旨に反し，許されないものといわなければならない。（なお，本件は法
定税が課されない場合ではないので，その場合に法定外税の創設により当
該法定税に係る規定の趣旨に反する課税をすることができるかという問題
については，特に触れない。）
法定外税という形式を採ることにより，法定税に係る法定の準則と関わ
りなく課税できるとすれば，道府県は，法定外税の形式を用いることによ
り，法定税に係る法定の準則を回避し，いわばこれを潜脱して，実質的に
当該準則に反する課税をすることも可能になりかねないが，このことが，
法定税の課税の準則として詳細な規定を設け，その定めるところによって
地方団体が地方税を賦課徴収することができる（地方税法２条）こととし
た地方税法の趣旨に反することは，明らかというべきである。
例えば，地方税法は，法人事業税につき，制限税率を標準税率の１．１
倍（改正前地方税法７２条の２２第８項）ないし１．２倍（改正後地方税
法７２条の２４の７第８項）と規定するところ，仮に，法定外税として法
人事業税と課税客体及び課税標準が全く同じ租税をいかなる税率において
も課することが許されるとすれば，道府県はこれにより法人事業税の制限
税率の規定の適用を実質的に回避できることになるが，これが法人事業税
につき制限税率を設けた地方税法の趣旨に反することは明らかである。
ウ確かに，法定外税は，条例の制定だけでなく，総務大臣との同意を要す
る協議（地方税法２５９条１項，２６１条）という，法定税よりも厳格な
手続を経て新設又は変更されるものである。
しかし，総務大臣との同意を要する協議は，前記(3)イのとおり，法定
外税につき国の経済施策等の施策との整合性を確保するという行政目的の
下にされるものであって，地方税法が，このような手続を経ていることの
一事をもって，当該法定外税と法定税に係る法定の準則との法的な整合性
を不問に付す趣旨であるとは解することができない。地方税法は，法定税
の税目，課税客体，課税標準，税率及び賦課徴収手続等につき具体的かつ
詳細な規定を置いており，これらは道府県が課税する際の法律による準則
となっているところ，行政機関たる総務大臣による，住民の負担が著しく
過重となるかどうか，国の経済施策に照らして適当でないかどうかといっ
た行政的・裁量的判断により，道府県がこのような規定の趣旨と関係なく
課税できるようになるという解釈は，不合理なものといわなければならな
い。
すなわち，被告の主張に従えば，道府県は，地方税法２５９条ないし２
９０条の規定を満たす限り，法定税に係る法定の準則にかかわらず，法定
外税を創設しこれを課することができることとなるが，その場合に道府県
の課税権の行使の実体面での準則として機能するのは，主として，同法２
６１条所定の不同意事由となる。しかし，同条に掲げる事由は，地方税の
課税について考慮されるべき事由のうちの一部についてのみ，抽象的な要
件を定めているものにすぎない。地方税法が，この規定を満たすことによ
って，同法が種々の立法政策的判断の結果として規定している法定税に関
する具体的かつ詳細な準則にかかわらず，その趣旨に反する課税をも可能
とすることを想定しているとは，到底考えることができない。
また，法定税に係る法定の準則と関わりなく，総務大臣による地方税法
２６１条所定の不同意事由への該当性の裁量的判断によって，道府県の課
税権の行使の許否が定まることは，行政機関の判断に過大な権能を与える
ことにもなりかねない。地方税法は，前記(1)のとおり，地方団体による
課税権の行使につき，法律による準則ないし枠を定めるものである。これ
らの準則ないし枠が，行政機関たる総務大臣による裁量的な判断を経るこ
とによって，実体面において実質的な機能を失うというのは，地方団体の
課税権の行使につき法律上の準則ないし枠を設けるという地方税法の性質
や，立法と行政との関係からしても，不合理な解釈というべきである。
むしろ，法定外税の制度は，当該枠の趣旨に抵触しない限度で，地方税
法が具体化した以外の課税を可能とするもので，その場合に，同法２６１
条に規定する事由の下，総務大臣において国の施策との整合性を確保する
手段を設けたものと解すべきであり，法定外税の創設によって，その枠自
体をも変更することは予定されていないものというべきである。そして，
このような理解は，前記(2)のとおり，道府県において法定税を課する一
方で，これに加えて法定税以外の税目を課する形で一定の要件及び手続の
下に認められてきたという，法定外税の沿革とも整合的である。
エ被告は，事業税（第２章第２節）と法定外税（同章第１１節）とは，地
方税法上，並列的対等な節に規定されているから，法人事業税に係る規定
が法定外税の準則となるものではない旨の主張をする。
しかし，地方税法は，第２章第１節ないし第１０節に並列的に規定する
法定税について，それぞれが同時に課されることを予定している以上，そ
れぞれが相互に整合的な内容となるように規定しているものと解される。
そして，法定外税もこれらの法定税と並列的な節において規定されている
のであるから，法定税に係る規定と両立し，相互に整合的な内容となるこ
とが予定されているものというべきである。
したがって，法定外税の創設により，法定税に係る規定の趣旨に反する
課税を行うことは，むしろ，これらを規定した地方税法の趣旨に反するも
のというべきであり，被告の上記主張は採用できない。
オ被告は，地方税法２６１条１号において，「国税又は他の地方税と課税
標準を同じくし，かつ，住民の負担が著しく過重となること」が総務大臣
の不同意事由とされていることから，地方税法は法定税と課税標準を同じ
くする法定外税でさえ一定の場合には許容している旨を主張する。
確かに，上記規定からすれば，地方税法は，国税又は他の地方税と課税
標準を同じくする法定外税についても，総務大臣において住民の負担が著
しく過重となると判断しなければ，許容される場合があることを予定して
いるものということができる。しかし，このことは，法定税に係る規定の
趣旨に反する法定外税が許容されることを直ちに意味するものではない。
地方税法２６１条の同意制度が国の施策との整合性を確保する趣旨で設け
られていることからすれば，同条１号の事由は，同一の課税標準に重ねて
課税されることによって特定の道府県の住民の負担が著しく過重となる場
合には，国の施策の実施に支障が生じることも考慮し，その場合には国が
関与して当該法定外税につき不同意とできることを定めたものと解され，
それを超えて，国税又は他の地方税と課税標準を同じくする法定外税の適
法性についてまで，「住民の負担が著しく過重となる」かどうかの判断に
委ねたものとは解することはできない。
例えば，法定税と課税客体及び課税標準を同じくする法定外税は，前記
イのように当該法定税の制限税率の規定の趣旨に反する場合には，住民の
負担が著しく過重となるかどうかにかかわらず，許されないものというべ
きである。
そうすると，地方税法２６１条１号の規定をもって，地方税法が，法定
税に係る法定の準則と関わりなく法定外税の課税ができるものとしている
ということはできず，被告の上記主張は採用できない。
カ被告は，法定税に係る規定にかかわらず法定外税の課税が認められてい
た又は認められている実例として，林産物移輸出税，別荘等所有税及び固
定資産使用税を挙げる。
(ア)このうち，林産物移輸出税は，素材，薪炭及び加工林産物等を課税
客体とし，その価格又は容積を課税標準として，従価税率又は従量税率
によって，その移輸出者に対して課されるもので，山林所在の地方団体
では重要な税として古くから存在していた。地方税法下では，これを法
定外普通税として課する市町村があった（ただし，平成元年までにすべ
て廃止された。）。他方，地方税法においては，木材引取税が規定され
ていた。これは，昭和２３年に道府県の法定税目とされ，昭和２５年の
地方税法制定に際し市町村の法定税目とされたものであり，素材の引取
りを課税客体とし，素材の価格又は容積を課税標準として，従価税率又
は従量税率によって，その引取者に対して課されるものであった（ただ
し，昭和６３年法律第１１０号により廃止された。乙４２，４３，４８，
４９）。
両税の関係につき，自治庁の出した通達「木材引取税の運用につい
て」（昭３２・１・１６自乙市発第１号各都道府県知事あて自治庁次長
通達）は，「木材引取税の徴税費が，その徴収すべき税額に比して多額
であると認められるもの，その他特別の事情がある市町村にあっては，
地方税法第５条第２項の趣旨により本税を課さないで立木伐採税，林産
物移，輸出税等の法定外普通税を創設してもさしつかえないものである
こと。」としていた（乙４４）。また，国会での政府委員の答弁におい
ては，「木材移出税は，木材引取税にかえまして木材移出税を起してい
るわけでありまして，実体的には全く同じでございます。ただ，引き取
りのつどそれを捕捉して課税をいたしますよりは，道は一本道でありま
すので，そこの出口で見ておれば完全に把握できますので，村外に搬出
する場合に捕捉をして課税する，こういうやり方をしているわけであり
ます」と述べられている（昭和３３年３月１８日地方行政委員会議録第
１８号４頁。乙４６）。
そうすると，林産物移輸出税が法定外普通税として課されていたのは，
市町村法定普通税たる木材引取税が地方税法５条２項ただし書の規定に
より課されていない場合であって，前者の課税により後者の課税の趣旨
が損なわれるという関係にはなかったと解することもできる。また，木
材引取税の課税客体ではなかった薪炭等が林産物移輸出税の課税客体と
されていたという点についても，地方税法は薪炭等への課税を禁じる趣
旨までは含まず，林産物移輸出税の課税は木材引取税に係る規定の趣旨
に反するものではなかったと解することもできる。
(イ)また，別荘等所有税は，熱海市において，市町村法定外普通税（地
方税法５条３項）として，居住の用に供しない家屋で主として保養の用
に供する目的で所有するものなど（別荘等）の所有者に対し，別荘等の
延べ面積を課税標準として，１平方メートル当たり６５０円の税率（平
成１３年熱海市条例第１号による改正後のもの）で課しているもので，
昭和５１年２月に許可されたものである（乙４２，４７）。
この別荘等所有税につき，自治省市町村税課法制第二係長及び同課職
員による解説「市町村法定外普通税の概要について」（「地方税」昭和
５１年９月号（（財）地方財務協会）３７頁。乙４２）は，「熱海市と
しては，別荘利用者のためにゴミ処理，下水道施設の整備や道路の改良
等の特別な財政需要が生じ，これらの費用を別荘等の所有者に負担分任，
応益の原則により，応分に分担してもらうために創設されたものである。
別荘等の所有者には，法定税目として固定資産税（都市計画税を含
む。）及び住民税均等割が課税されているので，二重課税が問題となる
が，現在の社会通常上，別荘等の所有者には一般的に相当の担税力が認
められているところであり，本税により著しく過重な負担を強いるとは
いえないであろう。」とし，別荘等所有税は「地方団体が特別な施策を
行うため，その経費の分担を，応益原則に基づき利益を受けるものに課
税するもの」に該当するとしている。
そうすると，別荘等所有税は，別荘等の存在によって特定の地方団体
に生じる特別の財政需要につき，別荘等の所有者に応分の負担を求める
とともに，その特別の担税力に着目して課されるもので，固定資産税と
は租税としての趣旨・目的を異にし，その課税の趣旨に反するものでは
ないと解することもできる。
(ウ)さらに，固定資産使用税の例として，呉市においては，昭和２７年
制定の条例により，市町村法定外普通税（地方税法５条３項）として，
同法３４８条１項の規定によって固定資産税を課することができない者
が所有する固定資産につき，使用者がある場合においてその使用者に対
し，固定資産の価格を課税標準として，１００分の１．４の税率で固定
資産使用税を課していた。昭和３０年当時，７課税団体が固定資産使用
税を課していたが，昭和４５年までにいずれも廃止された（乙４９，６
８）。
この固定資産使用税については，地方税法は，同法３４８条１項の規
定により，一定の者に対しては固定資産税を課することができないもの
としていたものの，これらの者が固定資産を所有する場合において，そ
の使用者に対し固定資産税と同様の内容の課税をすることを禁じる趣旨
までは含まず，固定資産使用税の課税は固定資産税に係る規定の趣旨に
反するものではなかったと解することもできる。
(エ)以上のように，法定外税が法定税に係る規定の趣旨に反するかどう
かは，当該租税や各関係規定の趣旨等についての個別具体的な検討を要
するところであって，上記の各法定外普通税が法定税と同様の課税標準
を用い，あるいは法定税が対象としていない課税をしていたことをもっ
て，直ちに，法定外税によって法定税に係る規定の趣旨に反する課税を
することが許されていた例ということはできない。
なお，仮にこれらの法定外普通税が法定税に係る規定の趣旨に反する
とすれば，当該法定外普通税は違法であったといえるのであって，いず
れにしても，当該法定外普通税の存在がこれまでに述べた解釈を覆すも
のではない。
キ以上のとおりであるから，法定外税の創設により法定税に係る規定の趣
旨に反する課税をすることは，道府県において法定税を法定の準則に従い
課すべきものとした地方税法の趣旨に反し許されず，同法２５９条ないし
２９０条に規定する要件及び手続を満たしたかどうかにかかわらず，違法
というべきである。
そして，法定外税が法定税に係る規定の趣旨に反するかどうかの検討に
は，当該法定外税及び当該法定税並びに各関係規定の，趣旨，目的，内容
及び効果を比較対照することが必要である。本件においては，本件条例が
創設した法定外税たる企業税が，法定税たる法人事業税に係る規定の趣旨
に反するかどうかが問題とされているから，以下，これら両税について，
上記の観点から検討する。
(5)企業税及びその規定の趣旨・目的
ア本件条例の制定の経緯は，以下のとおりである。
(ア)被告が平成１２年３月に示した「県財政の現状と今後の展望−財政
健全化の指針−」は，当時の被告の財政の状況について，以下のような
分析をした（甲１１の８の２）。
すなわち，「本県財政は，平成１０年度に急激な県税の減収に見舞わ
れ，危機的な状況に陥りました。このため，県民の皆様や県議会のご協
力をいただきながら，全職員一丸となり様々な取組に務めた結果，何と
か財政再建団体への転落は回避できたものの，平成１０年度決算は２９
３億円の赤字となり，２３年ぶりの赤字団体となりました。」とした上
で，被告の財政が悪化した原因は，①経済構造の変化と景気に左右され
やすい不安定な税収構造，②大幅な抑制が困難な歳出構造，③十分でな
かった地方交付税，及び④基金が底をつき安定的確保が困難な臨時的な
財源に依存していることにあるとした。特に①については，「我が国経
済は，バブル経済の崩壊によって急激に悪化し，以来１０年が経過しよ
うとしていますが，いまだ混迷の域を脱することができません。本県の
財政危機は，歳入の大宗を占める県税収入が，こうした経済の大きな変
化を受けて大幅に落ち込んでしまったことが最大の要因となっていま
す。」「本県の県税収入は，景気に連動して大幅に減少しましたが，こ
れは，県税が景気に左右されやすい法人事業税・法人県民税を主力とし
ているためで，こうした不安定な税収構造により，本県では税収予測が
立てにくく，平成１０年度のように年度途中での大幅減収も避けられな
いばかりか，中・長期の計画的な財政運営を難しくしています。」とし
た。そして，特別な対策を講じない場合，平成１２年度以降の５年間に
おいて，合計１兆０１５０億円の財源不足が見込まれると試算し，その
上で，財政健全化に向けた具体的な方策として，被告独自の当面の対策
としては，一般施策経費，人件費及び県債・公債費の抑制のほか，新た
な県税の創設を含む自主財源の確保が，また，（国レベルでの）地方税
財政制度の改革による根本的な対策としては，法人事業税に外形標準課
税を導入することを含む税制改正等が必要であるとした。
(イ)被告は，上記のような財政状況の下，平成１０年１２月，神奈川県
地方税制等研究会を設置し，神奈川県知事において，同研究会に対し，
「神奈川県をはじめとする大都市圏の地方自治体は，いずれも深刻な財
政危機に直面しているが，今後の少子高齢社会への対応や分権型社会の
実現に向けて，住民ニーズに的確に応え得る，確固たる財政基盤を構築
したい。このため，県独自の税源充実策及び大都市圏自治体にふさわし
い地方税財政制度のあり方について検討してほしい。」旨の諮問をした。
同研究会は，東京大学経済学部教授その他の研究者を委員とするもので
あった（甲１１の８の４）。
(ウ)神奈川県地方税制等研究会は，１２回の研究会を経て，平成１２年
５月２５日付けで，「地方税財政制度のあり方に関する中間報告書」
（以下「中間報告書」という。）を作成し，神奈川県知事に報告した。
中間報告書は，被告の財政の現状につき，長期に及ぶ景気の低迷により，
基幹税目である法人２税（法人事業税及び法人県民税）を中心とした県
税収入が大幅に減少している一方で（ピーク時の平成２年度には約４５
００億円あった法人事業税の税収が，平成１０年度にはその半分程度の
２３８０億円にまで落ち込んだことなどを指摘している。），義務的経
費は増加を続け，歳出入ギャップが一段と拡大しており，危機的状況に
置かれていると分析した上で，「応益原則の観点から，景気に左右され
ない税制を組み込み，安定した財政基盤を構築しておくことが重要であ
る」などとして，以下のような提言をした（甲１１の８の４，乙６３）。
すなわち，まず，「法人は，（都道府県から）行政サービスという一
種の生産要素の提供を受けながら事業活動を営んでいるわけであり，法
人事業税は，こうした生産要素の一つである行政サービスの対価として
位置付けることができる。（略）しかしながら，現行の課税方式の下で
は，所得の多寡によって税負担が決定されることから，行政サービスと
の受益関係が税負担に的確に反映されていない。加えて，全法人のうち
約７割を占める欠損法人は法人事業税を負担していないため，結果的に，
都道府県の最大の基幹税目である法人事業税は，一部の利益法人によっ
てのみ支えられているのが実態である。」ということや，法人事業税は
「所得を課税標準としているため，景気動向の影響を受けやすく，税収
が大きく振幅する極めて不安定なものとなっている。」ということなど
から，全国一律方式により法人事業税に外形標準課税を導入することが
適当であるとした上で，課税標準の定め方等について，望ましい外形標
準課税のあり方を提言した。
次に，「外形標準課税については，全国的な制度として導入されるこ
とが望ましいが，国の論議の動向から，早期に導入される見通しが立た
ない場合には，現下の厳しい財政状況を踏まえ，臨時的・時限的な対応
として，法人事業税について欠損金の繰越控除制度の適用を遮断する措
置を講ずることが適当と考えられる。」とし，その理由として，「本来，
法人事業税は，法人の事業活動と都道府県の行政サービスとの受益関係
に着目して課する税であり，こうした税の性格にかんがみれば，法人事
業税の課税標準の算定において，過去の事業活動の結果として生じた欠
損金額を控除する合理的理由は認められない」こと，「この繰越控除制
度は，単年度課税方式の例外的措置として設けられているものであり，
（略），法人の所得金額を計算する上での絶対的な制度とは言えず，政
策的側面を持った制度として位置付けることができる」ことを挙げ，
「外形標準課税が導入されるまでの間の臨時的・時限的な対応として，
地方税法の改正により，法人事業税について繰越控除制度の適用を遮断
することが適当である。」とした。
さらに，「この制度改正が実現されない場合には，法定外普通税・目
的税又は地方税法第７２条の１９の活用により，県独自の措置として，
繰越控除制度を遮断するための方策を検討していくことが必要と考えら
れる。」とした。
このほか，法人２税等の超過課税の活用，上記以外の法定外普通税・
目的税の活用の提言をした。
(エ)平成１２年７月，政府税制調査会から，法人事業税の外形標準課税
について，景気の状況等を踏まえつつ早期に導入することが必要との中
期答申が出され，また，同答申を受けて，同年１１月には，自治省から，
平成１３年度の税制改正による制度化を目指して，外形標準課税の導入
を内容とする法人事業税の改革案が示されるに至った。しかし，同年度
の税制改正においては，法人事業税の外形標準課税の導入は見送られる
こととなった（甲１１の８の３，４７）。
(オ)このような状況の下，神奈川県地方税制等研究会は，中間報告書の
作成後５回の研究会を経て，平成１３年１月，「法人課税の臨時特例措
置に関する報告」（以下「最終報告書」という。）を作成し，神奈川県
知事に報告した。この最終報告書は，「平成１３年度税制改正では，外
形標準課税の導入が見送られ，早期導入が困難になったので，法律上認
められた課税自主権を有効に活用し，神奈川県の危機的な財政状況に起
因する県民生活へのマイナス影響を，少しでも縮小する必要があるとの
観点に立って，早急に法定外普通税として「臨時特例企業税」を導入す
ることが適当であるとの結論を得たので，ここに取り急ぎ報告するもの
である。」として，以下の提言をした（甲１１の８の３，乙６３）。
ａすなわち，法人事業税が行政サービスの対価として応益的な性格を
持った税として位置付けられながら，現行の課税方式の下では所得の
多寡によって税負担が決定されることから，行政サービスとの受益関
係が税負担に的確に反映されておらず，一部の利益法人のみが法人事
業税を負担しているという，中間報告書での問題認識を踏まえ，地方
団体としても全国的な制度としての法人事業税の外形標準課税の早期
実現を支援すべきとしつつ，「神奈川県の危機的な財政状況を見ると，
国の制度改正をただ待つことなく，可能な限り課税自主権を活用して，
安定的な税制を構築しつつ，財源不足を解消していく努力をすべきと
考える。したがって，国において検討されている法人事業税の外形標
準課税について，早期導入がされない場合には，課税自主権を活用し
て，臨時的，かつ特例的な措置として，現行の法人事業税を中心とし
た都道府県の法人税制を，公平性及び安定性の観点から補完する制度
を早急に構築するよう提言したい。」とした。
ｂそして，「中間報告書において，（略）制度改正が実現されない場
合には，法定外普通税・目的税又は地方税法第７２条の１９の活用に
より，県独自の措置として，繰越制度を遮断するための方策を検討し
ていくことが必要であるとしたところであ」り，「この措置を法定外
税で講ずるか又は法第７２条の１９の活用で行うかがまず問題になる
が，法第７２条の１９の規定は，（略）「事業の情況」に応じて，所
得によらないで，資本金額，売上金額等の外形標準課税を用いること
ができるとしているが，これは，特定の業種について適用が予測され
ている規定であり，すべての業種を対象とするならばこの規定の意味
がないと解されるところ，我々が意図している「繰越欠損金控除」の
遮断については，所得を課税対象とするすべての法人に共通すること
であることから，同条の活用は適当でないと考えられる。そこで法定
外税の活用を前提として，制度の構築を考えていくことにする。」と
した。
ｃその上で，「繰越欠損金の遮断を法定外税で措置しようとするとき，
次の論点について整理しなければならない」として，「①繰越欠損金
を遮断する効果のある税制を構築することの是非，②新たな法定外税
の課税標準を何にするのか，③法定外税の法律上の要件への適合」を
挙げた。
①については，所得の金額の計算上「損金とすべき欠損金を何年間
認めるかについては，政策上の判断にゆだねられているというべきで
あり，また，臨時的にその適用を一部又は全部遮断することは，我が
国においても過去に事例があることに加え，外国でも事例が見受けら
れる。また，繰越欠損金についても，その性格は，２種類あると言え
る。すなわち一つは，通常の事業活動から生じた欠損金であり，もう
一つは，本来の事業活動から離れて行った土地や株式等の投機活動に
より生じた欠損金である。この場合，損金として，必ず認めなければ
ならないのは，前者の通常の活動から生じた繰越欠損金であって，後
者の投機活動から生じた繰越欠損金は，必ずしも認める必然性はない。
したがって，「所得」を課税標準とする税において，繰越欠損金のす
べてを，恒久的に認めない制度を構築することは，課税理論上，疑問
視せざるを得ないが，臨時的・時限的にその全部を認めなかったり，
また，投機活動から生じた欠損金の繰越を認めないという考え方に立
って，欠損金の一定割合の控除を認めないとすることは，税政策上，
行い得ると考えられる。」とした。
また，②については，「そこで繰越欠損金の遮断を行いうる仕組み
を持つ新税を考えると，まず，その課税標準として，「当該事業年度
において損金に算入した繰越欠損金の額」が考えられるが，このよう
に企業会計上の一定の項目に対して税をかけるという方法も一つの手
法としてはあり得る。しかしながら，このように課税標準が繰越欠損
金そのものに連動することは，あたかも欠損金に課税するようで，課
税理論上，説明しがたい面がある。そこで，繰越欠損金の控除をした
場合は，必ず，当該事業年度において，必ず繰越欠損金に相当する利
益が生じていることから，その利益に対して課税するという考え方で
課税標準を設定すれば，こうした問題は解消される。また，（略）バ
ブル経済以降において，欠損金のかなりの部分が投機的な損失であっ
たことを踏まえて，すべての繰越欠損金の控除を認めないとするので
はなく，その一定割合に限って控除を認めない制度として構築するこ
とが，繰越控除制度の本質に矛盾しない制度構築として考えられる。
その場合の一定割合は，外国の制度等を勘案すると，概ね３０％程度
までが妥当な範囲と考えられる。」とした。
さらに，③については，地方税法２６１条所定の不同意要件のうち，
２，３号は特に問題にならず，１号については以下で触れるとした。
ｄその上で，新税である「臨時特例企業税」の具体的内容について，
以下のとおり提言した。
すなわち，課税の根拠及び趣旨については，「法人事業税は，行政
サービスに対する応益原則の考え方に立って，すべての法人が応分の
税負担をすべきであるが，企業活動の結果，当期利益がある法人であ
っても，欠損金の繰越控除制度の適用により，当期利益に見合った税
負担が生じないこととなっているため，外形標準課税が導入されるま
での間の臨時的，特例的な措置として，一定規模以上の法人に，相応
の負担を求める法定外普通税として創設することが適当と考える。」
とした。
そして，課税標準については，「欠損金の繰越控除額の一定割合
（３０％×法人事業税の分割基準の相当する割合）に相当する当期利
益が課税標準になる案が考えられる（略）。しかしながら，こうした
率を課税標準の中に組み込むことは，分かりやすい税制度とする観点
からすると，かならずしも適当とは言えないことから，当研究会にお
いては，この率は，税率設定の中で考慮することが，適当であるとの
結論を得たところである。したがって，課税標準については，「各事
業年度の法人事業税の課税標準である所得に，当該所得の計算に当た
って損金に算入した繰越欠損金に相当する額を加算した額に一定の割
合（法人事業税の分割基準の相当する割合）を乗じた額。ただし，当
該額が，繰越欠損金に相当する額を上回る場合は，当該繰越欠損
（金）に相当する額を上限とする。」ことが適当である。」とした。
上記の３０％は，「臨時的に繰越欠損金の全部又はその一部を適用し
ないことが税政策上とることが可能であること，繰越欠損金には投機
的損失が含まれており，その部分については，欠損金の繰越を否定し
うること等を，総合的に勘案して繰越欠損金のうち課税対象とする部
分の割合を設定したものである」。さらに，地方税法２６１条１号の
事由に該当するかどうかも検討したが，新税の課税標準と法人税や法
人事業税の課税標準とは形式的に異なり，また，「実質でみても，新
税の課税標準は，当該事業年度において控除した繰越欠損金額と同額
になることから，二重課税の問題は生ぜず，法人税や法人事業税の課
税標準との重複の問題は生じ得ないと考えられる。」とした。
次に，納税義務者については，法人の担税力に配慮し，課税の対象
を相当程度体力があり社会的責任を求められる大会社に限定すること
が適当であるとの観点から，「各事業年度の法人事業税の課税標準で
ある所得の計算に当たって繰越欠損金に相当する額を損金に算入した
法人で，資本金額又は出資金額が５億円以上のもの」とすることが適
当とした。また，「企業活動に対する行政サービスの対価として応分
の負担を求めるという課税の趣旨を踏まえ，営利目的の企業活動を目
的としない公共法人及び公益法人等並びに企業活動を終了した清算法
人については納税義務者から除外すべきである。」とした。
さらに，税率については，「先に述べたとおり，繰越欠損金の一部
について控除を認めないという考え方を，課税標準で反映せずに，税
率で反映するという考え方に立って，その一定割合分３０％と，法人
事業税の税率水準が１０％程度であること（を）踏まえ，両者を掛け
合わせた３％（特別法人は２％）とすることが適当と考える。」とし
た。
そのほか，名称を「臨時特例企業税」とすること，及び，賦課徴収
の方法について，新税が法人事業税を補完する性格を有することから，
法人事業税の賦課徴収制度を参考にして，申告納付の方法等を採用す
ることを提言した。
(カ)神奈川県知事は，上記最終報告書の提言を受けて，本件条例案を作
成し，平成１３年２月１５日，これを神奈川県議会に提出した。
神奈川県議会での本件条例案の審議の過程で，神奈川県知事は，「私
ども，地方税は基本的には応益負担ということを念頭に置いた形で考え
るということが基本であろうと思っております。法人事業税につきまし
ても，そういう性格として位置づけられたものとして受けとめていると
ころでございますけれども，現在の法人事業税のあり方は，形としては
収益課税ということで，それを何とか応益課税の性格，あるいは受益と
いう観点から見た性格をより強めていただきたいということで，外形標
準課税の導入をお願いしているわけでございますけれども，それがまだ
実現を見ておらないわけでございます。したがいまして，それが実現す
るまでの間，臨時特例的な措置といたしまして，法人にかかわる税につ
きまして，ある程度，より応益負担という考え方を強めた中で，法人課
税の法人間の公平さをより保つ，さらには税収の安定化も図るという観
点から，臨時特例の企業税をお願いする，こういう考え方で今，提案を
させていただいているところでございます。」と答弁した（平成１３年
２月２０日神奈川県議会２月定例会会議録第２号５７頁。乙５５）。
そして，神奈川県議会は，平成１３年３月２１日，本件条例案を全会
一致で可決した。
(キ)被告は，平成１３年３月２２日，総務大臣に対し，企業税の新設に
ついて，協議の申出をした。
その際に神奈川県知事が総務大臣に提出した理由書には，「本県とい
たしましては，外形標準課税が導入されるまでの臨時的，かつ特例的な
措置として，県の行政サービスを受け当期利益が黒字になっているにも
かかわらず，欠損金の繰越控除制度により，法人事業税について税負担
が生じない法人について相応の負担を求めるため，法定外普通税として
の「臨時特例企業税」を新設いたしたく，地方税法第２５９条の規定に
基づき，協議を申し出るものです。」などと記載されている（甲１１の
１・２）。
その後，前記第４，２(1)のとおり，本件条例は，総務大臣との協議
及びその同意を経て，平成１３年７月２日に公布され，同年８月１日に
施行された。
(ク)Ｐ１・神奈川県総務部税務課専任主幹の作成による論文「「臨時特
例企業税」の概要について」（「税経通信」２００１年１０月号１６４
頁。以下「Ｐ１論文」という。甲１６，乙１１）は，企業税の創設の経
緯につき，以下のとおり説明している。
すなわち，企業税の創設については，神奈川県地方税制等研究会の中
間報告書において述べられた法人事業税の繰越欠損金制度に対する問題
提起が端緒となっている。「その後，この中間報告書で述べられた法人
事業税の繰越控除制度の適用の遮断について，（略）地方税法第７２条
の１９の規定を活用すれば，「事業の情況に応じ」て繰越控除制度の適
用の遮断ができるのか，また，新税として仕組む場合の納税義務者や課
税客体，更に，県民に理解されるような税制の考え方等について事務レ
ベルで研究を行ってきたところである」。このような中で，最終報告書
において，早急に法定外普通税として企業税を導入することが適当であ
る旨の提言がされるとともに，企業税の理論的な整理が行われた。「こ
のような研究会からの論点整理を踏まえて，本県は，臨時特例企業税の
条例案を固めたところである」。
また，Ｐ１論文は，企業税の内容につき，以下のとおり解説している。
すなわち，「法人事業税は，都道府県の行政サービスの対価としての応
益的な性格を有する税でありながら，原則として所得を課税標準として
いるため，行政サービスとの受益関係が税負担に的確に反映されず，税
収も不安定なものとなっている。本来，こうした法人事業税における制
度的課題については，全国一律，全業種を対象とする外形標準課税の導
入によってその解決を図るべきであるが，本県が直面している厳しい財
政状況を踏まえ，外形標準課税が導入されるまでの当分の間の措置とし
て，法人課税の負担の公平と税収の安定化を図る観点から，一定規模以
上の法人に相応の税負担を求める臨時特例企業税を法定外普通税として
創設することとした」。納税義務者については，法人の担税力に配慮し，
課税の対象を相当程度体力があり社会的責任を求められる大会社に限定
することが適当であるなどの観点から，資本の金額又は出資金額が５億
円以上の法人に限定した。課税標準については，最終報告書における考
え方を受けて，「各課税事業年度における法人事業税の課税標準である
所得の金額の計算上，繰越控除欠損金額を損金の額に算入しないものと
して計算した場合における当該各課税事業年度の所得の金額に相当する
金額（当該金額が繰越控除欠損金額に相当する金額を超える場合は，当
該繰越控除欠損金額に相当する金額）」とした。税率については，最終
報告書において，投機活動から生じた欠損金は必ずしも繰越控除の対象
として認める必要はないという考え方もあること，わが国の過去の例や
諸外国の例を踏まえれば繰越欠損金の一部（３割程度）を認めないとす
ることも可能であること，また，本来課税標準は繰越控除の一定割合と
すべきであるが，税制の仕組みを簡素化する観点からその一定割合とい
う考え方を税率の中にとけ込ませる方法を採用することも可能であるこ
とが示されたことから，「本県としては，欠損金の繰越控除を３割相当
分認めないこととし，かつ，一般法人に対する法人事業税の税率水準が
約１０％（一般法人９．６％，特別法人６．６％）であることを勘案し
て，３％（特別法人２％）の税率を設定したところである」。
(ケ)神奈川県地方税制等研究会は，平成１５年法律第９号による地方税
法の改正により，法人事業税にいわゆる外形標準課税が一部導入される
こととなったこと（前記第３，１(1)イ）を受けて，平成１５年１０月，
「法人事業税への外形標準課税の導入に伴う臨時特例企業税の見直し等
について」と題する報告書（以下「見直し報告書」という。）を作成し
た（甲４９）。
見直し報告書は，この法人事業税への外形標準課税の導入について，
「中小法人を外形標準課税の対象外とするとともに，対象となる大法人
についても所得課税の割合が高いことなどから，当研究会が考えた外形
標準課税の本来の目的（略）の達成には，今回の外形標準課税では不十
分」であるとし，「今回の外形標準課税の導入をもって，直ちに臨時特
例企業税を廃止すべきとの結論は導けない。しかしながら，臨時特例企
業税を，そのまま継続することになると，今回の外形標準課税の導入の
意義や，その税負担の変動を全く考慮しないことになる。そこで，今回
の外形標準課税の導入が，所得課税分４分の３，外形標準課税分４分の
１という形で行われたことを踏まえ，法人事業税全体における外形標準
課税分の割合を考慮して，臨時特例企業税の税率を１％程度引き下げる
ことが，最も適当な選択であると考える。」とした。
(コ)その後，前記第３，３(2)のとおり，本件条例は，平成１６年神奈
川県条例第１８号により改正され（同年４月１日施行），企業税の税率
が一律に１００分の２に引き下げられるなどした（甲５０）。
(カ)なお，被告の法人事業税及び企業税による税収は，それぞれ，平成
１４年度につき，２００６億６４００万円及び１億５１００万円（ただ
し，企業税は年度途中からの課税である。），平成１５年度につき，２
１９２億９３００万円及び５０億３１００万円，平成１６年度につき，
２７３０億６０００万円及び１５５億９１００万円，平成１７年度（当
初予算）につき，２５８０億６８００万円及び９０億４８００万円であ
った（いずれも１００万円未満切り捨て）（乙５７の１ないし３，争い
のない事実）。
イ以上の本件条例の制定の経緯から明らかなとおり，被告は，景気の悪化
により法人事業税を初めとする県税収入が減少したことによる財政的な危
機を受けて，神奈川県地方税制等研究会に対し，地方税財政制度のあり方
について諮問し，同研究会が，国レベルでの法人事業税の外形標準課税の
導入が見送られたことを踏まえて，法定外税として企業税を創設すること
を提言したことを受けて，企業税の新設を内容とする本件条例を制定した
ものである。そして，このような経緯に加え，本件条例の内容が最終報告
書における提言の内容と主たる部分において共通すること，本件条例案を
神奈川県議会に提出した神奈川県知事も，企業税の趣旨・目的につき最終
報告書の内容と同様の説明をしていること，本件条例の制定事務を担当し
た被告の職員による解説（Ｐ１論文）においても，最終報告書の提言に沿
って本件条例の内容を定めた旨が記されていることに照らせば，本件条例
が定める企業税及びその各規定の趣旨・目的については，基本的に，最終
報告書の内容に沿って理解されるべきである。
この点につき，被告は，本件条例は電気供給業等に係る事業活動を非課
税とし，適用期間を「当分の間」としている点で最終報告書と異なるから，
本件条例は最終報告書の内容をそのまま受け入れたものではない旨を主張
する。しかし，これらの点は，企業税や本件条例のその他の各規定の趣旨
・目的の理解に直接影響する性質のものではなく（そもそも，電気供給業
等については，法人事業税の課税標準は所得ではなく（改正前地方税法７
２条の１２，改正後地方税法７２条の１２第３号），欠損金額の繰越控除
は行われないから，もとより最終報告書が提言する新税の課税の対象外で
ある。），企業税自体の趣旨・目的や，最終報告書の提言と同様の内容と
なっている本件条例の各規定の趣旨・目的について，最終報告書の内容に
沿って理解されるべきことに変わりはない。
ウそこで，主として最終報告書の内容を踏まえて，本件条例が定める企業
税及びその各規定の趣旨・目的を検討する。
まず，最終報告書において繰り返し述べられ，神奈川県知事及びＰ１論
文も同旨を述べているように，企業税の，課税の根拠ないし性格という意
味における租税としての趣旨・目的（以下，「租税としての趣旨・目的」
をこのような意味で用いる。）は，法人の事業活動に対する行政サービス
の対価として法人に応分の負担を求めることにある。
これを法人事業税との関係について見ると，中間報告書及び最終報告書
において述べられ，神奈川県知事及びＰ１論文も同旨を述べているように，
企業税は，法人事業税の課税標準において欠損金額の繰越控除がされる結
果，当期利益ないし受益に見合った法人事業税の負担をしていない法人に，
応分の負担を求めることで，法人課税の公平化及び税収の安定化を図ろう
とするものであり，法人事業税の外形標準課税の導入に準じた効果を，こ
れが実現するまでの臨時的・特例的な措置として達成しようとするもので
ある。企業税が法人事業税の外形標準課税の導入に準じた効果を意図して
いることは，平成１５年法律第９号による地方税法の改正により法人事業
税に外形標準課税が一部導入されることになったことについて，見直し報
告書が，外形標準課税の導入の本来の目的からすれば不十分であるとして，
法人事業税の外形標準課税の導入の程度に対応する形で税率を一部引き下
げた上で企業税を存続させることを提言し，本件条例がこれに沿った内容
に改正されたことにも示されている。また，最終報告書において述べられ，
Ｐ１論文も同旨を述べているように，企業税の創設に当たっては，法人事
業税の課税標準の特例を定めた改正前地方税法７２条の１９の規定を活用
して法人事業税自体の欠損金額の繰越控除を遮断することが検討されたも
のの，その要件を満たすことが困難であるとの判断の下に，法定外税の形
式が採られたものであるし，企業税の税率（原則３パーセント）について
は，法人事業税における欠損金額の繰越控除のうち控除を否定すべき一定
割合（３０パーセント）を法人事業税の税率（約１０パーセント）に掛け
合わせるという方法により，算出されたものである。以上のことからすれ
ば，企業税は，法定の法人事業税に代わり，これと異なる課税標準の下に，
同税に相当する性質の課税をする趣旨・目的のものということができる。
次に，本件条例の各規定の趣旨・目的について見ると，最終報告書にお
いて述べられ，Ｐ１論文も同旨を述べているように，企業税の課税標準及
び税率の趣旨・目的は，法人事業税における欠損金額の繰越控除のうち一
定割合（３０パーセント）について，その控除を実質的に遮断し，当該部
分に相当する額を課税標準として課税する効果を意図しつつ，この割合を
税率の設定に反映させ，課税標準を繰越控除欠損金額に相当する利益（所
得）額とし，税率を当該割合と法人事業税の税率（約１０パーセント）を
掛け合わせた原則３パーセントとしたものということができる。そして，
この３０パーセントという割合は，主として，投機的な損失による欠損金
額についてはその繰越控除を否定し得るとの考えの下，諸外国の制度等も
勘案して，このような欠損金額の欠損金額全体に占める割合を数値化した
趣旨のものである。
なお，被告は，企業税の税率の設定の経緯につき，最終報告書を参考に
しつつ，課税理論の面ばかりでなく，税収確保の必要性と納税者の理解等
の幅広い観点から検討を行った旨を主張するが，仮に被告において税収や
租税負担の程度についての検討も加えたものであるとしても，３パーセン
トという税率が基本的に上記のような考えの下に導かれたことは，前記ア
の経緯に照らせば，明らかである。
(6)法人事業税と企業税との関係（企業税の効果）
ア法人事業税（改正後地方税法についてはその所得割。以下同じ。）は，
前記第３，１のとおり，法人の行う事業に対し，事務所又は事業所所在の
道府県において，その法人に，電気供給業等の場合を除き，各事業年度の
所得及び清算所得を課税標準として課されるものである（改正前地方税法
７２条１項，同法７２条の１２，改正後地方税法７２条の２第１項，同法
７２条の１２第１号ハ）。そして，この法人事業税の課税標準としての各
事業年度の所得は，各事業年度の益金の額から損金の額を控除した金額に
より，当該各事業年度の法人税の課税標準である所得の計算の例によって
算定するものとされているところ（改正前地方税法７２条の１４第１項，
改正後地方税法７２条の２３第１項），法人税の課税標準である所得の計
算上，当該事業年度前の一定の事業年度において生じた欠損金額がある場
合には，青色申告書等の提出要件を満たす限り，当該欠損金額に相当する
金額は，当該各事業年度の所得の金額の計算上，損金の額に算入するもの
（ただし，当該欠損金額に相当する金額が，当該欠損金額につき損金の額
への算入をしないものとして計算した場合における当該各事業年度の所得
の金額を超える場合は，その超える部分の金額については，この限りでな
い。）とされている（法人税法５７条１項，１０項）（このように損金の
額に算入される欠損金額に相当する金額が「繰越控除欠損金額」である
（本件条例３条２号）。）。
一方，本件条例が定める企業税は，前記第３，３のとおり，神奈川県内
に事務所又は事業所を設けて行う法人の事業活動に対し，その法人に（本
件条例５条１項），各課税事業年度における法人事業税の課税標準である
所得の金額の計算上，繰越控除欠損金額を損金の額に算入しないものとし
て計算した場合における当該各課税事業年度の所得の金額に相当する金額
（当該金額が繰越控除欠損金額に相当する金額を超える場合は，当該繰越
控除欠損金額に相当する金額）を課税標準とし（本件条例７条１項），税
率を原則１００分の３として課されるものである（本件条例８条）。
イ上記のとおり，企業税の課税標準は，法人事業税の課税標準である所得
の金額の計算過程を用い，繰越控除欠損金額を控除しない場合の当該課税
事業年度の所得（以下「当期所得」という。）の金額とされている。そし
て，企業税の課税標準について，繰越控除欠損金額に相当する金額が上限
とされていること（本件条例７条１項括弧書），また，その繰越控除欠損
金額について，当期所得（すなわち企業税の課税標準）の金額が上限とさ
れていること（法人税法５７条１項ただし書）からすれば，法人事業税の
課税標準である所得の計算上繰越控除欠損金額が存在しない場合には，企
業税の課税標準もゼロとなるし，繰越控除欠損金額が存在する場合には，
企業税の課税標準もこれと同額となる。そうすると，結局，企業税の課税
標準は，常に繰越控除欠損金額と同額となるように設計されているものと
いえる。この点については，最終報告書においても，企業税の課税標準は
繰越控除欠損金額と同額となる旨の説明がされているところである。
本件条例の文言上，企業税の課税標準は，繰越控除欠損金額を控除しな
い場合の所得すなわち当期所得の金額（ただし，繰越控除欠損金額を超え
ない額。）として規定されており（本件条例７条１項），繰越控除欠損金
額の存在それ自体を課税対象（なお，「課税対象」とは「課税客体」とほ
ぼ同旨であるが，やや前法律的に理解し，神奈川県地方税制等研究会がそ
の最終報告書で使用している概念（前記(5)ア(オ)参照）にほぼ一致して
いる。）とする構成にはなっていない。しかし，課税標準は課税客体を金
額化ないし数量化したものであるところ，上記のとおり企業税の課税標準
の金額は常に繰越控除欠損金額と同額なのであるから，少なくとも課税標
準の計算上は，本件条例７条１項の規定は，実質的には「企業税の課税標
準は，法人事業税における繰越控除欠損金額とする。」という趣旨に読み
替えることが可能である。
また，企業税は，当期所得又はその一部を課税対象とする構成になって
いるが，上記の企業税の課税標準と繰越控除欠損金額との関係から明らか
なとおり，課税対象となる部分の当期所得は，法人事業税において欠損金
額の繰越控除が行われる場合に初めて存在し，また，当該繰越控除欠損金
額の限度で存在する。すなわち，企業税の課税対象は，欠損金額の繰越控
除によって法人事業税の課税対象である所得から控除される部分の当期所
得ということができる。
そうすると，企業税は，実質的には，欠損金額の繰越控除によって法人
事業税の課税対象である所得から控除される部分の当期所得を課税対象と
し，繰越控除欠損金額を課税標準として課税する効果を持つものというこ
とができる。
ウ前記(5)ウのとおり，企業税及びその規定の趣旨・目的は，法人事業税
における欠損金額の繰越控除のうち一定割合についてその控除を実質的に
遮断し，当該部分に相当する額を課税標準として法人事業税に相当する性
質の課税をする効果を意図しつつ，この割合を税率の設定に反映させ，課
税標準を繰越控除欠損金額に相当する当期所得額として，同性質の課税を
することにある。
そして，前記イのとおり，企業税の課税は，その規定の解釈上，欠損金
額の繰越控除によって法人事業税の課税対象である所得から控除される部
分の当期所得を課税対象とし，繰越控除欠損金額を課税標準として課税す
る効果を持つものということができ，これと税率の設定の経緯とを併せて
考慮すると，上記の趣旨・目的のとおり，実質的には，法人事業税におけ
る欠損金額の繰越控除のうち一定割合についてその控除を遮断し，当該控
除によって法人事業税の課税対象である所得から控除される部分の当期所
得を課税対象とし，当該部分に相当する額を課税標準として，法人事業税
に相当する性質の課税をする効果を持つものということができる。
エこの点につき，被告は，企業税は当期所得に対して課税するもので，法
人事業税における欠損金額の繰越控除を遮断するものではない旨を主張す
る。
確かに，本件条例は，形式的には，法人事業税自体の欠損金額の繰越控
除を否定するものではないし，繰越控除欠損金額又はその一部を直接に課
税標準とするものでもない。しかし，企業税が，実質的に，法人事業税に
おける欠損金額の繰越控除を一部否定ないし遮断し，当該部分に法人事業
税に相当する性質の課税をする趣旨，目的及び効果を持ったものであるこ
とは，これまでに述べた本件条例の制定の経緯及び本件条例の内容からし
て，明らかというほかない。
被告は，最終報告書中の記載（前記(5)ア(オ)ｃ第３段落の「そこで繰
越欠損金の遮断を行いうる」から「課税理論上，説明しがたい面があ
る。」まで。）をもって，最終報告書では繰越控除制度の適用を遮断する
案は採用されなかった旨を主張する。
しかし，当該部分で「課税理論上，説明しがたい」とされているのは，
繰越控除欠損金額自体を課税標準とすることであって，当該部分の前で，
法定外税により繰越欠損金を遮断する効果のある税制を構築することの是
非について肯定に解され（前記(5)ア(オ)ｃ第１，２段落），その後も，
新税につき，繰越欠損金の一定割合に限って控除を認めない制度として構
築することや（同ｃ第３段落），その税率につき，繰越欠損金の一部につ
いて控除を認めないという考え方を反映させたものであること（同ｄ第５
段落）などが述べられていることからして，最終報告書が，法人事業税の
欠損金額の繰越控除の一部を実質的に遮断する効果を意図して企業税の創
設を提言したことは，もとより明らかである。そして，本件条例もこのよ
うな趣旨・目的の下に制定されたことは，Ｐ１論文において，「本県とし
ては，欠損金の繰越控除を３割相当分認めないこととし」て企業税の税率
を設定した旨の説明がされていること（前記(5)ア(ク)）からも認められ
るところである。
オ本件においては，以上のような趣旨，目的，内容及び効果を持つ企業税
の課税が，地方税法上の法人事業税に係る規定，具体的には，法人事業税
の課税標準につき欠損金額の繰越控除を定めた規定の趣旨に反するかどう
か（違法事由①）が，最大の問題である。
なお，これまでに述べた企業税の趣旨，目的及び効果は，平成１６年神
奈川県条例第１８号による本件条例改正後の企業税についても，法人事業
税における欠損金額の繰越控除のうち実質的に控除が遮断される割合に変
化があるほかは，特に変わるところはない。
(7)法人事業税及びその規定の趣旨，目的及び効果
ア法人事業税は，法人の行う事業に対し，事務所又は事業所所在の道府県
において，その法人に，電気供給業等の場合を除き，各事業年度の所得及
び清算所得を課税標準として課されるものである（改正前地方税法７２条
１項，同法７２条の１２，改正後地方税法７２条の２第１項，同法７２条
の１２第１号ハ）。その租税としての趣旨・目的は，原告及び被告がいず
れも主張するように，法人の事業は道府県による各種の行政サービスを受
けて行われていることから，法人に対し当該行政サービスに応じた負担を
求めるというものであり，いわゆる応益原則に基づくものと解される。
この点につき，法人事業税の課税標準が所得とされていることから，現
実の課税の際には，法人の資力ないし能力に応じた課税がされているもの
といえ，現行の地方税法の規定はいわゆる応能原則を反映したものという
理解もし得るところである。学説上も，現行の法人事業税は応能課税と応
益課税の混合タイプであり，しかも応能課税の要素のより強い混合タイプ
であるなどと説明されている（金子宏・東京大学名誉教授「事業税の改革
（外形標準化）を考える」（「地方税」１９９９年８月号４頁）。甲３
５）。
しかし，課税の根拠ないし性格という意味において，法人事業税の租税
としての趣旨・目的が，本来的に応益原則に基づくものであることは，格
別に争いはない。そして，例えば，自治省税務局府県税課編「地方税制度
解説−地方法人課税と都道府県税−」４６頁は，事業税の性格につき，
「すべての事業は，道路，港湾，橋りょう，公衆衛生施設その他の都道府
県の施設の恩恵に浴し，これを利用しながら収益活動を行っている。事業
は，（略）これらの施設に必要な経費の財源を負担すべきであると考えら
れ，これらの施設に必要な経費を分担せしめるものとして都道府県に事業
税の課税権が賦与されているのである。このことが，事業税が応益原則に
立脚した税であるといわれる理由である。」と説明しているところである
（甲３６）。
イ次に，法人事業税の課税標準である各事業年度の所得は，各事業年度の
益金の額から損金の額を控除した金額により，当該各事業年度の法人税の
課税標準である所得の計算の例によって算定するものとされており（改正
前地方税法７２条の１４第１項，改正後地方税法７２条の２３第１項），
法人税の課税標準である所得の計算上，青色申告書等の提出要件を満たす
限り，一定の欠損金額を繰り越して損金の額に算入することが定められて
いる（法人税法５７条１項，１０項）。
そこで，このように法人事業税の課税標準である所得の計算において欠
損金額の繰越控除をするものとされていることの趣旨・目的について検討
する。
(ア)法人税の課税標準である所得の計算において，欠損金額の繰越控除
が定められているのは，各事業年度ごとの所得によって課税する原則を
貫くときは，所得額に変動がある数年度を通じて所得計算をして課税す
るのに比して税負担が過重となる場合が生ずるので，その緩和を図るた
めである（最高裁昭和４３年５月２日第一小法廷判決・民集２２巻５号
１０６７頁参照）。すなわち，法人税について欠損金額の繰越控除を定
めた規定の趣旨・目的は，次のとおりであると解される。つまり，法人
は長期的に継続して活動するにもかかわらず，法人に対し，人為的に設
けられた事業年度の期間所得によって課税することは，課税の公平性を
損なうことがあり，所得課税における法人の担税力を的確に反映するも
のとはいえない。そこで，特定の事業年度に生じた欠損金額を以後の一
定の事業年度の利益と通算することによって，法人の所得を長期的に把
握し，もって法人の担税力を所得課税により的確に反映させるとしたも
のである。
ところで，法人税法は，各事業年度の所得の金額を，当該事業年度の
益金の額から当該事業年度の損金の額を控除した金額として計算し，こ
れを課税標準として法人税を課することを原則としており（同法２１条，
２２条１項），欠損金額の繰越控除は，青色申告書等の提出要件を満た
して初めて行われるものである（同法５７条１０項）。このように欠損
金額の繰越控除を青色申告者に限定しているのは，繰越控除を認める欠
損金額については，その根拠が明確である必要であるため，その発生し
た事業年度については，青色申告書の提出を必要とする趣旨であると解
される。なお，このように法人税法が欠損金額の繰越控除を青色申告者
の特典としていること自体，租税政策上の考慮に出でたものということ
ができるが（上記最高裁昭和４３年判決参照），租税政策上の考慮の結
果として設けられた欠損金額の繰越控除規定の趣旨・目的が，上記のと
おりであることには，変わりはない。
(イ)法人事業税の課税標準である所得の計算が法人税の課税標準である
所得の計算の例によるものとされている結果，法人事業税の課税標準の
計算においても，欠損金額の繰越控除が行われることとなる。
このように法人事業税の課税標準の計算が法人税の課税標準の計算の
例によるものとされている目的の一つは，両税の課税標準の計算を同一
の方法とすることによって，徴税官庁及び納税者の便宜を図ることにあ
るものと解される。
しかし，租税の課税標準は，税額の基礎とするため課税客体を数値と
して具体化する趣旨のものであることからすれば，法人事業税の課税標
準の計算につきこのような構造が採用されているのは，立法者において，
単に他の課税標準を流用する便宜にとどまらず，法人税と同様の課税標
準の計算方法を採ることが，法人事業税の課税客体を具体化する上にお
いても適当であると判断したからであると解すべきである。すなわち，
法人事業税の課税標準は，法人税の課税標準と同様の所得の金額とする
ことが適当であるとの判断の下に規定されたものであり，その所得の計
算において欠損金額の繰越控除が行われることについても，法人税と同
様，特定の事業年度に生じた欠損金額を以後の一定の事業年度の利益と
通算することによって，法人の所得を長期的に把握し，もって法人の担
税力を的確に課税に反映させることが，その趣旨・目的とするところで
あるというべきである。
確かに，法人事業税の租税としての趣旨・目的は，行政サービスの対
価の負担という，応益原則に基づくものと解されるところである。しか
し，行政サービスの対価を負担させることを租税としての趣旨・目的と
しつつ，具体的な課税標準の設定の段階においては，法人の担税力を考
慮に入れ，その担税力に見合う限度で税負担を求めることは，租税政策
上の当否はともかくとして，何ら矛盾するものではない。すなわち，現
行の法人事業税は，課税の根拠ないし性格としては行政サービスの対価
の負担を求めるものであるが，その具体的な租税負担については，法人
の担税力も考慮して設定されているものと解するのが相当である。法人
事業税が応益原則と応能原則の混合タイプという説明は，このような観
点から理解することができる。
ウ上記のような理解は，法人事業税の沿革からも裏付けることができる。
(ア)現在の事業税の沿革は，明治１１年に府県税として創設された営業
税にさかのぼる。営業税は，その後国税及び地方税に分かれ，また，そ
の課税標準も，業種に応じた一定額，外形標準額，純収益額等と変遷し
たが，昭和２２年の地方税制の改正により，営業税は，道府県の独立税
として，法人及び個人の営業に対し，それぞれ純益又は営業収益を課税
標準として課税するものとされた（甲３３，３５，３６）。
(イ)昭和２３年，地方税法の改正により，営業税が廃止されて事業税が
創設され，原則として，法人及び個人の行う事業に対して所得を課税標
準として課税するものとされた（甲３３，３６）。
(ウ)昭和２４年８月に発表されたシャウプ第１次勧告は，「都道府県が，
事業にある種の税を課することは正当である。というのは，事業及び雇
用者が，その地方に存住するために必要となってくる地方行政サービス
の費用を，事業とその住民等が負担することは当然だからである。例え
ば，工場とその雇用者がある地域に入ってくれば，公衆衛生費は当然増
加してくるのである。」と述べて，応益原則の見地から事業税の存続を
勧告した上で，その最善の課税方法は，「単に事業利益だけでなく，事
業利益と利子，賃貸料および給与支払額の合計額に税率を適用すること
である。右の課税標準を別の方法で定義すると，それは他の企業からの
資本設備，土地，建物等の購入総額を全収入額から差し引いたものにな
る。この残額は，原料等，他の事業から購入したものの価値に，その企
業が附加した価値を示している。」として，事業税の課税標準として所
得ではなく「附加価値」を採用することを勧告した（甲３２，３３）。
(エ)これを受けて，昭和２５年法律第２２６号による地方税法制定によ
り，事業税に代わるものとして附加価値税が創設され，法人に対する附
加価値税の課税標準は，各事業年度の附加価値額，すなわち各事業年度
の総売上金額から特定の支出金額を控除した金額とされた（甲３３，３
６）。
しかし，附加価値税は，その実施が延期された上，昭和２９年法律第
９５号による地方税法改正により，一度も実施されることなく廃止され
た。一方，この改正において，従前の事業税と特別所得税を統合し，そ
の名称を事業税として存置することとなり，現在の事業税に至っている
（甲３３，３６）。
上記改正後の地方税法において，法人事業税の課税標準は，現在と同
様，電気供給業等の場合を除き，各事業年度の所得及び清算所得による
ものとされ（同法７２条の１２），この所得は当該各事業年度の法人税
の課税標準である所得の計算の例によって算定するものとされた（同法
７２条の１４第１項）（甲３３）。
(オ)このように附加価値税を廃止して，所得を課税標準とする事業税を
存置することになった理由につき，上記昭和２９年の地方税法改正につ
いての国会審議の過程で，自治庁の政府委員は，「事業の分量に応じて
経費を分担してもらうような課税方式の方が，府県税としての事業税に
はふさわしい」，また，「理論的には，附加価値税は非常によろしいの
であります」としつつ，「よろしいのだが，経済の基礎が非常に浅いも
のだから千億にもなろうとする税金の賦課方法をかえるといたしますと，
業界によって非常に重くなったり，軽くなったりいたします。このよう
な負担の激変を与えること，この激変に打ちかつためには，現在のわが
国の産業界の基礎があまりに弱過ぎるのではなかろうか。そういうよう
なものについてはやむを得ず従前通りにしておくよりいたし方ないので
はなかろうか。」と説明している。また，法人事業税の課税標準である
所得の算定方法については，「要するに法律または政令で例外を設けま
せん限りは，法人税の所得の算定の例によることにいたしたわけであり
ます。二重調査というものを避けようとする趣旨を持っているわけであ
ります。」と説明している（昭和２９年３月８日第１９回国会衆議院地
方行政委員会議録第２５号１１頁。甲３４）。
同様に，自治省府県税課編「事業税逐条解説」１１頁は，附加価値税
が実施されることなく廃止された理由について，「附加価値税は，シャ
ウプ勧告を受けて制定されて以来，その実施の是非について諸々の議論
がかわされたが，昭和２６年９月の税制懇談会の中期答申において，そ
の廃止が答申された。これは，附加価値税が原則として利益のあがらな
い企業に対しても負担を求める等当時の社会経済等の情勢が容易にその
実施を許さない状況にあったためであり，その後，昭和２８年１０月の
地方制度調査会における地方制度の改革に関する答申及び同年１１月の
税制調査会の答申においても，いずれも附加価値税を廃止する旨の答申
がなされ，逐年，その実施が延期されてきた附加価値税は一度も実施さ
れることなく遂に廃止することとされたのである。」と説明している
（甲３３）。
(カ)以上のように，シャウプ勧告を受けて，応益原則に基づき事業の外
形に課税標準を求める附加価値税が創設されながら，昭和２９年の地方
税法の改正により，同税が実施されることなく廃止され，所得を課税標
準とする現在の法人事業税が整備されることになったのは，立法担当者
において，当該租税の租税としての趣旨・目的からすれば課税標準は事
業の外形を基準とすることが望ましいものの，当時の社会経済等の情勢
に照らし，法人の担税力に配慮した課税標準として，所得を採用するこ
とが適当であるとの結論に至ったからであると解される。確かに，立法
担当者においても，当該所得の算定方法として法人税の課税標準である
所得の計算の例を用いることとした理由として，二重調査の回避という
便宜面をあげているが，そもそも法人事業税の課税標準として法人税と
同様の所得の金額を採用した理由は，上記のとおり，法人の担税力に配
慮したことにあると解されるところである。
このようなことからすれば，法人の所得を長期的に把握し，もって法
人の担税力を的確に課税に反映させるという欠損金額の繰越控除規定の
趣旨・目的は，法人事業税についても妥当するものと解すべきであり，
このことは，昭和２９年の地方税法改正において定められた法人事業税
の課税標準の枠組みを維持している改正前地方税法下の法人事業税及び
改正後地方税法下の法人事業税の所得割に至るまで，別異に解する理由
はない。
エそして，法人事業税の課税標準である所得の計算において欠損金額の繰
越控除が行われる結果，法人に一定の事業年度内の欠損金額がある場合に
は，当期の所得から繰越控除欠損金額を除いた額が課税標準となり，その
限度で法人事業税の課税がされることとなるという効果を生じている。
(8)企業税が法人事業税に係る規定の趣旨に反するかどうか
法人事業税及び同税の課税標準の計算において欠損金額の繰越控除が行わ
れることを定めた規定の趣旨，目的，内容及び効果は，上記(7)のとおりで
あるから，これと既に述べた企業税及びその規定の趣旨，目的，内容及び効
果（前記(5)，(6)）とを比較対照し，企業税が法人事業税に係る規定，具体
的には法人事業税の課税標準につき欠損金額の繰越控除を定めた規定の趣旨
に反するかどうかを検討する。
ア租税としての趣旨・目的
まず，課税の根拠ないし性格という意味において，法人事業税と企業税
の租税としての趣旨・目的は，法人の事業に対する行政サービスの対価と
して法人に応分の負担を求めることにあり，共通するものというべきであ
る。このように両税の租税としての趣旨・目的が共通することは，前記
(5)ウのとおり，企業税が，その創設の経緯から見て，法定の法人事業税
に代わり，これに相当する性質の課税をする趣旨・目的のものといえるこ
とからも明らかである。
もっとも，企業税は，資本の金額又は出資金額が５億円以上の法人に限
って課されるという点で，そのような限定のない法人事業税とは納税義務
者の範囲を異にする。しかし，最終報告書及びＰ１論文においては，その
理由として，法人の担税力に配慮し，課税の対象を相当程度体力があり社
会的に責任を求められる大会社に限定することが適当である旨が述べられ
ている。そうすると，企業税の納税義務者が限定されているのは，一般的
に見て大規模の会社であれば追加的な租税負担に耐え得るという理由から
であると解され，法人事業税において想定していない性質の特別の行政サ
ービスの提供や特別の担税力に着目したからであるとは解されない。すな
わち，課税の根拠ないし性格という意味において，企業税の租税としての
趣旨・目的は，一般的な意味での行政サービスの対価ということの域を出
ないものである。同様に，企業税の納税義務者から清算中の法人や公共法
人及び公益法人等が除かれていることも（本件条例３条１号，６条），法
人事業税との差異ではあるが，上記の趣旨・目的の理解を左右するものと
はいえない。
被告は，企業税は，被告の厳しい財政状況を踏まえ法人課税における負
担の公平と税収の安定化を図るもので，法人事業税と同一の趣旨・目的を
有するものではない旨を主張するが，この点は，課税の方法及びその効果
に関する指摘であって，課税の根拠ないし性格という意味での企業税の租
税としての趣旨・目的は，上述のとおり法人事業税と共通するものという
べきである。
イ課税客体
また，法人事業税は課税客体を「法人の行う事業」としているところ
（改正前地方税法７２条１項，改正後地方税法７２条の２第１項），企業
税は課税客体を「法人の事業活動」としており（本件条例５条１項），そ
の表現に若干の差を設けているが，いずれも，行政サービスの対象として
の法人の事業を課税客体にしているものと解され，両税の課税客体につい
て実質的な差異があるものとは解されない。
なお，被告は，企業税について，「事業活動」に対する行政サービスの
対価として負担を求めるという考え方を明確にするため，法人事業税とは
異なり，事業活動を終了した清算法人や公益法人等の事業を非課税とした
旨を主張する。しかし，企業税の課税の対象とされている法人については，
行政サービスの対象としての法人の事業が一般的な意味において課税客体
とされているという点において，法人事業税の課税客体と異なるところは
ない。
ウ目的及び効果
前記(7)イ(イ)及びエのとおり，法人事業税の課税標準である所得の計
算において欠損金額の繰越控除が行われることを定めた規定は，特定の事
業年度に生じた欠損金額を以後の一定の事業年度の利益と通算することに
よって，法人の所得を長期的に把握し，もって法人の担税力を的確に課税
に反映させることを，その目的とするところであり，一定の事業年度内に
欠損金額がある場合には，当期の所得から繰越控除欠損金額を除いた額が
課税標準となり，その限度で法人事業税の課税がされることとなるという
効果を有するものである。
一方で，前記(6)ウのとおり，企業税の課税は，法人事業税における欠
損金額の繰越控除のうち一定割合についてその控除を実質的に遮断し，当
該控除によって法人事業税の課税対象である所得から控除される部分の当
期所得を課税対象とし，当該部分に相当する額を課税標準として，法人事
業税に相当する性質の課税をする目的を有し，その効果を持つものである。
そうすると，法人事業税における欠損金額の繰越控除と，企業税の課税
とは，その目的及び効果が相反するものであり，法人事業税と企業税が同
時に課せられる法人については，企業税の課税により，法人事業税の課税
標準につき欠損金額の繰越控除を定めた規定の目的及び効果が阻害される
ことになるといえる。
そこで，このように，法定外税の課税により法人事業税の課税標準につ
き欠損金額の繰越控除を定めた規定の目的及び効果が阻害されることが，
当該規定を定めた地方税法の趣旨に反するか，あるいは，地方税法はこの
ような結果も許容しているものかについて，以下に検討する。
エ検討
改正前地方税法は，法人事業税の課税標準である所得の計算の方法を規
定する一方（同法７２条の１２，７２条の１４第１項），その課税標準の
特例を設け，事業の情況に応じ，所得（及び清算所得）によらないで，資
本金額，売上金額，家屋の床面積若しくは価格，土地の地積若しくは価格，
従業員数等を課税標準とし，又は所得（及び清算所得）とこれらの課税標
準をあわせ用いることができるものとし（同法７２条の１９），その際の
税率は，上記課税標準の特例を用いなかったときの税率による場合におけ
る負担と著しく均衡を失することのないようにしなければならないものと
していた（同法７２条の２２第９項）。また，改正後地方税法においては，
一定の範囲で法人事業税に外形標準課税が導入されたことに対応して，上
記課税標準の特例は，資本の金額又は出資金額が１億円を超え当該外形標
準課税の対象となった法人については，廃止された（同法７２条の２４の
４）。
このように，改正前地方税法下では，限定された要件の下で初めて，欠
損金額の繰越控除を含めた法人事業税の課税標準の特例が認められていた
ことからすれば，当該特例の要件を満たす場合以外は常に，改正後地方税
法下では，当該特例の適用外とされた法人については常に，欠損金額の繰
越控除を含めた地方税法所定の法人事業税の課税標準の規定を全国一律に
適用すべきものとする趣旨であると解される。
そして，特定の租税の課税標準は，その租税としての趣旨・目的に基づ
き，これを税額に具体的に反映させるために特定の課税客体を数値化する
ものである。そうすると，法人事業税についても，当該趣旨・目的に基づ
く当該課税客体に対する租税については，地方税法が法人事業税について
定めた課税標準の規定に従って当該課税客体を数値化し，これに課税すべ
きとする趣旨であると解される。すなわち，法人事業税が予定するところ
の租税としての趣旨・目的及び課税客体に係る租税については，地方税法
が法人事業税について定めた課税標準の規定に従い，その規定の目的及び
効果を実現したところによって課すべきものとする趣旨であると解される。
そうすると，少なくとも，法人事業税と租税としての趣旨・目的及び課
税客体が共通する法定外税の創設によって，全国一律に適用すべき法人事
業税の課税標準の規定の目的及び効果が阻害されることになることは，当
該課税標準の規定を定めた地方税法の趣旨に反するものといわなければな
らない。
上記のことは，地方税法が法人事業税につき制限税率を設けていること
（改正前地方税法７２条の２２第８項，改正後地方税法７２条の２４の７
第８項）からも裏付けることができる。すなわち，租税の税額は基本的に
課税標準と税率とによって決せられるところ，法が制限税率を設けている
のは，単に税率の上限を設けるにとどまらず，一定の課税標準を前提に，
これに税率を乗じて得られるところの当該租税の負担の程度に制限を設け
る趣旨であると解される。そして，地方税法が法人事業税につき制限税率
を設けているのは，上記の課税標準について述べたところと同様に，法人
事業税が予定するところの租税としての趣旨・目的及び課税客体に係る租
税につき，その租税の負担の程度に制限を設けるという趣旨であると解さ
れる。
そうすると，法人事業税と租税としての趣旨・目的及び課税客体が共通
する法定外税の創設によって，法人事業税の課税標準の規定の目的及び効
果が阻害されることになることは，地方税法が当該租税の負担の程度を制
限するため当該課税標準を前提に制限税率を設けていることからしても，
同法の趣旨に反するものというべきである。
オ小括
以上のとおりであるところ，法人事業税と企業税とは，租税としての趣
旨・目的及び課税客体を共通にするものであり，企業税の課税により，法
人事業税の課税標準につき欠損金額の繰越控除を定めた規定の目的及び効
果が阻害されることは，既に判断したとおりであるから，企業税の課税は，
地方税法上の当該規定の趣旨に反するものというべきである。
カ課税標準の変更ともいえること
既に判断したとおり，企業税は，租税としての趣旨・目的及び課税客体
を法人事業税と共通にし，かつ，法人事業税における欠損金額の繰越控除
のうち一定割合についてその控除を実質的に遮断し，当該控除によって法
人事業税の課税対象である所得から控除される部分の当期所得を課税対象
とし，当該部分に相当する額を課税標準として，法人事業税に相当する性
質の課税をする効果を持つものである。そして，欠損金額の繰越控除後の
所得については本来の法人事業税が課せられることを併せ考慮すれば，企
業税は，法人事業税と一体として，実質的には，法人事業税に係る課税標
準の規定を変更し，新たな課税標準において法人事業税を課する効果を持
つものということもできる（本件条例の目的に即し，法人事業税の課税標
準に繰越控除欠損金額のうち一定割合を付加して法人事業税を課するもの
とも，本件条例の規定に即し，法人事業税の課税標準に繰越控除欠損金額
を付加して当該付加部分には低率の法人事業税を課するものとも評価する
ことができる。）。
このような法定税の課税標準の変更は，被告自身が本件条例の制定過程
において当初から第一義的に意図していたように地方税法自体の改正によ
って行われるか，そうでなければ，同法が法人事業税の課税標準の例外を
一定の要件の下に唯一認めていた改正前地方税法７２条の１９の規定に基
づいて行われるべきものであって，法定外税の形式によってこれを実質的
に実現しようとすることは，地方税法の趣旨に反するものといわなければ
ならない。
前記(5)アの本件条例の制定の経緯から明らかなとおり，被告は，欠損
金額の繰越控除を含む現行の法人事業税の課税標準では，行政サービスの
対価の負担を求めるという法人事業税の本来の趣旨・目的が十分に実現さ
れないとの見地から，地方税法の改正により法人事業税に外形標準課税が
導入されることを期待していたものの，これが早期に実現されなかったた
めに，法定外税の形式を用いて，当期利益を有しながら欠損金額の繰越控
除により法人事業税の全部又は一部の課税がされていない法人への課税を
可能としようとしたものであって，結局，法人事業税の租税としての趣旨
・目的を達成するために，条例によって，地方税法が同税について定めた
課税方法（課税標準）を実質的に修正しようとしたものともいえる。しか
し，前記(4)アのとおり，法定外税は，法定税が法定の準則に従い課され
るべきことを前提としつつ，これに付加するものとして認められているも
のであり，法定税に係る法定の課税方法を実質的に変更する目的での法定
外税の利用は，地方税法の予定しないところというほかない。
このように，前記オの小括で述べたところは，企業税の課税は欠損金額
の繰越控除を含む法人事業税の課税標準の規定を実質的に変更するもので，
当該規定を定めた地方税法の趣旨に反するものともいえる。
キ欠損金額の繰越控除の意義に関する被告の主張について
(ア)被告は，法人事業税の課税標準について欠損金額の繰越控除がされ
るのは，法人税の課税標準の計算の例を用いるという手続上の便宜に由
来するものにすぎず，法人事業税にとって不可欠の要素ではないから，
これと抵触する法定外税を創設することも許されるという趣旨の主張を
する。
しかし，法人事業税の課税標準につき欠損金額の繰越控除を定めた規
定が，単に他の課税標準を流用する便宜にとどまらず，法人税と同様の
課税標準の計算方法を採ることが法人事業税の課税客体を具体化する上
においても適当であるとの判断に基づくものと解すべきであることは，
前記(7)イ(イ)のとおりである。
地方税法は，法人事業税の課税標準である所得につき，「この法律又
は政令で特別の定めをする場合を除くほか」，法人税の課税標準である
所得の計算の例によって算定するものとしている（改正前地方税法７２
条の１４第１項，改正後地方税法７２条の２３第１項）。この特別の定
めの一例として，海外投資等損失準備金としての積立金額を法人税の課
税標準である各事業年度の所得の金額の計算上損金の額に算入する旨の
規定（租税特別措置法５５条）は，法人事業税の課税標準である所得の
計算においては適用されないものとされている（改正前地方税法７２条
の１４第１項ただし書，改正後地方税法７２条の２３第１項ただし書）。
これは，立法者において，当該損金算入規定の趣旨・目的からして，こ
のような損金算入を法人事業税についても認めることは適当でないと判
断したことによるものと解される。このように，地方税法は，単に手続
上の便宜のみを考慮して，法人事業税の課税標準を法人税の課税標準の
計算の例により算定するものとしているわけではなく，法人税の課税標
準である所得の計算に係る諸規定につき，その趣旨・目的からして法人
事業税の課税標準である所得の計算の際にも用いることが適当であるか
どうかの判断を踏まえて，法人事業税の課税標準に係る規定を定めてい
るものと解されるところである。
このようなことからすれば，法人事業税の課税標準につき欠損金額の
繰越控除を定めた規定についても，法人事業税の課税標準を画する実質
的な意味を認めるべきであって，これを単に手続上の便宜を図る意味し
かなく，法定外税等の他の形式の租税によって実質的に否定することが
許される趣旨のものと見ることはできないというべきである。よって，
被告の上記主張は採用できない。
(イ)これに関連して，被告は，欠損金額の繰越控除の要件である青色申
告の制度が法人事業税には設けられていないことをもって，法人事業税
における欠損金額の繰越控除は単に手続上の便宜から法人税の課税標準
である所得の計算の例によることとした結果にすぎない旨も主張する。
しかし，前記(7)イ(ア)のとおり，法人税における欠損金額の繰越控
除を青色申告者に限定しているのは，繰越控除を認める欠損金額の根拠
を明確にするためであるところ，このような趣旨は，法人税の課税標準
の計算の例を用いる法人事業税の課税標準の計算にも及ぶところである。
すなわち，法人税に係る青色申告は，法人事業税の課税標準の計算に関
しても，繰越控除すべき欠損金額の根拠を明確にするという機能を果た
しているのであり，法人事業税の課税標準の計算と無関係でありながら
便宜上その欠損金額の繰越控除の要件とされているという性質のもので
はない。よって，被告の上記主張は採用できない。
(ウ)また，被告は，被告提出の各意見書に基づき，欠損金額繰越控除制
度を具体的にどのように定めるかは租税政策として様々な選択肢があり
得る旨や，応益課税を趣旨・目的とする法人事業税において欠損金額の
繰越控除が本質的であるとは考えられない旨等を主張する。
確かに，法人事業税の租税としての趣旨・目的が行政サービスの対価
の負担を求めることにあることからすれば，このような応益的性格を課
税標準の設定にも徹底し，欠損金額の繰越控除を制限することは，立法
政策上は考え得るところであるし，現に，改正後地方税法は，一定の範
囲で法人事業税に外形標準課税を導入し，所得によらない課税標準の設
定を行っているところである。
しかし，このように立法政策上種々の可能性があることと，現に存在
する法律上の準則の下にいかなる租税条例を制定できるかという法的可
能性とは，区別して考えなければならない。法定外税は，道府県の課税
権に基づくものではあるが，前記(1)及び(2)ウのとおり，当該課税権は，
あくまでも地方税法上の具体的準則に従って行使されなければならない
ものである。そして，地方税法は，法人事業税の課税標準である所得の
計算について欠損金額の繰越控除を規定しており，これが法律による準
則となっているのであるから，地方団体の特定の政策的判断によってこ
れを実質的に否定することは許されないものというべきである。
被告は，企業税について法人課税における負担の公平と税収の安定化
を図るものであるとするが，行政サービスの対価としての趣旨・目的を
有する租税を課するに当たり，その課税標準等の課税方法は，このよう
な負担の公平性や税収の安定性のほか，納税義務者たる法人の担税力等
諸般の事情を考慮して，立法政策的判断により定められるものである。
地方税法は，このような立法政策的判断の結果として，法人事業税の課
税標準に係る規定を置き，これが地方団体が課税権を行使する際の法定
の準則となっているところ，本件条例は，地方団体の別途の政策的判断
をもって，実質的に当該準則と異なる課税方法を採ろうとしたものであ
って，地方税法の準則法ないし枠法としての性質上，許されないものと
いわざるを得ない。
(9)結論
以上のとおり，企業税の課税は，法人事業税の課税標準である所得の計算
につき欠損金額の繰越控除を定めた規定（改正前地方税法７２条の１４第１
項，改正後地方税法７２条の２３第１項）の趣旨に反し違法であるから，こ
れを定める本件条例は違法である。
原告の主張のうち違法事由①は，これと同旨をいうものとして，理由があ
る。また，原告が違法事由②及び③として主張する事由は，前記(8)エのと
おり，上記結論を導く理由として考慮した。その余の違法事由の主張につい
ては，上記結論が導かれる以上，判断する必要がない。
そして，地方団体は，法令に違反しない限りにおいて条例を制定すること
ができ（地方自治法１４条１項），地方税法の定めるところによって地方税
を賦課徴収することができるとされていること（同法２条）に照らせば，上
記のような地方税法に違反する租税を創設する条例を制定することは，地方
団体の有する条例制定権を超えるものであるから，本件条例は無効というべ
きである。
２争点(2)（本件各更正等の有効性，誤納金・還付加算金の額）について
(1)本件各更正等の有効性について
一般に，課税処分が課税庁と被課税者との間にのみ存するもので，処分の
存在を信頼する第三者の保護を考慮する必要のないこと等を勘案すれば，当
該処分における内容上の過誤が課税要件の根幹についてのそれであって，徴
税行政の安定とその円滑な運営の要請を斟酌してもなお，当該処分の効力を
争うには法定の手続に従って当該処分の取消しを訴求すべきという負担を被
課税者に負担させることが，著しく不当と認められるような例外的な事情の
ある場合には，上記の過誤による瑕疵は，当該処分を当然無効ならしめるも
のと解するのが相当である（最高裁昭和４８年４月２６日第一小法廷判決・
民集２７巻３号６２９頁参照）。
本件各更正等は，本件条例に基づいてされたものであるところ，本件条例
が無効であることは前記１のとおりである。地方団体は，条例の定めに基づ
いて地方税の賦課徴収をするものであるから（地方税法３条１項），地方税
の課税処分の根拠となった条例が無効であることは，当該課税処分につきこ
の上ない極めて重大な瑕疵があるというべきであって，本件各更正等には，
課税要件の正に根幹に関する内容上の過誤があるというほかない。そして，
本件各更正等の存在を信頼する第三者の保護を考慮する必要は特にうかがわ
れないことからすれば，本件各更正等については，その過誤による瑕疵の重
大性に照らし，徴税行政の安定とその円滑な運営の要請を斟酌してもなお，
当該処分の効力を争うには法定の手続に従って当該処分の取消しを訴求すべ
きという負担（本件において，原告は法定の手続に従って本件各更正等の全
部についての取消しも訴求しており，当然無効の主張が認められなくても不
服申立期間の徒過による不可争的効果が発生することはないが，当然無効の
主張が認められないとすると，申告納付した税額に係る還付加算金の起算日
の点において不利益を受けることとなる（同法１７条の４第１項２号，４号，
同法施行令６条の１５第１項２号）。）を被課税者に負担させることが，著
しく不当と認められるような例外的な事情のある場合ということができる。
そうすると，本件各更正等は，無効な条例に基づくものであるという瑕疵
により，当然に無効というべきであり，本件各通知も同様に当然に無効であ
る。
(2)誤納金の還付請求について
原告が申告納付した企業税額については，無効な本件条例に基づいて納付
されたもので，これを是認した本件各通知及び本件各更正も無効であり，原
告が本件各更正により追加納付した企業税額については，その根拠である本
件各更正が無効であり，原告が本件各加算金決定により納付した過少申告加
算金額については，その根拠である本件各加算金決定が無効であり，原告が
納付した延滞金額については，その根拠である本件各更正が無効である。
したがって，原告が納付したこれらの金額については，本件各更正等を取
り消すまでもなく，被告にとって法律上の原因を欠く利得であるから，原告
は，被告に対し，同金額につき誤納金としてその還付を請求することができ
る。
原告が還付を請求することができる誤納金の額は，前記第６，３＜原告の
主張＞(2)において原告が主張するとおり，平成１５年度分の企業税に関す
るものが１３億１４８１万２６００円，平成１６年度分の企業税に関するも
のが６億６４３７万９７００円と認めることができる（計算関係自体につい
ては，前記第６，３＜被告の主張＞のとおり，当事者間に争いがない。）。
(3)還付加算金について
上記誤納金について，その還付加算金の起算日，割合その他の計算過程は，
前記第６，３＜原告の主張＞(2)において原告が主張するとおり認めること
ができる（計算関係自体については，前記第６，３＜被告の主張＞のとおり，
当事者間に争いがない。）。
したがって，原告は，平成１５年度分の企業税に関する誤納金の還付加算
金として，平成１８年１２月３１日までの期間に発生したものとして１億２
７５９万８７１３円，並びに，１２億８６４５万５０００円に対する平成１
９年１月１日から，２７２４万８０００円に対する同年７月２３日から及び
１１０万８０００円に対する同年８月１０日から各支払済みまで，同年１２
月３１日までについては年４．４パーセントの割合，及び，平成２０年１月
１日以降については年７．３パーセント又は地方税法附則３条の２第１項に
規定する特例基準割合のいずれか低い割合による金額の支払を求めることが
できる。
また，原告は，平成１６年度分の企業税に関する誤納金の還付加算金とし
て，平成１８年１２月３１日までの期間に発生したものとして３９３９万４
６２３円，並びに，６億５６７５万７０００円に対する平成１９年１月１日
から，７３２万４０００円に対する同年７月２３日から及び２９万７０００
円に対する同年８月１０日から各支払済みまで，同年１２月３１日までにつ
いては年４．４パーセントの割合，及び，平成２０年１月１日以降について
は年７．３パーセント又は地方税法附則３条の２第１項に規定する特例基準
割合のいずれか低い割合による金額の支払を求めることができる。
(4)以上のとおり，原告が本件各更正等の無効を前提として被告に対し誤納
金の還付及びその還付加算金の支払を求める主位的請求（請求１(1)，(2)）
は，いずれも理由がある。
第８結論
よって，原告の主位的請求を認容することとし，なお，仮執行宣言の申立て
は相当でないのでこれを却下することとして，主文のとおり判決する。
横浜地方裁判所第１民事部
裁判長裁判官北澤章功
裁判官植村京子
裁判官貝阿彌亮

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