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　　　　　　　主　　　文
１　原告の被告横浜地方法務局川崎支局登記官に対する訴えを却下する。
２　原告の被告国に対する請求を棄却する。
３　訴訟費用は原告の負担とする。
　　　　　　　事実及び理由
第１　請求
１　請求の趣旨
（１）　被告横浜地方法務局川崎支局登記官が原告に対し平成１２年８月１０日付
けでした登録免許税還付通知拒絶処分を取り消す。
（２）　被告国は，原告に対し，３６万６１００円を支払え。
２　被告横浜地方法務局川崎支局登記官の答弁
　原告の請求を棄却する。
３　被告国の答弁
（１）　本案前の答弁
　原告の被告国に対する訴えを却下する。
（２）　本案の答弁
　原告の請求を棄却する。
第２　事案の概要
　原告，別紙選定者目録記載の選定者Ａ及び同Ｂ（以下「原告ら」という。）は，
土地・建物を購入し，その所有権移転登記に際して登録免許税を納付したところ，
その後，建物の固定資産税の課税標準額が修正されたので，上記登録免許税が過誤
納になるとして，横浜地方法務局川崎支局登記官（以下「被告登記官」という。）
に対して，登録免許税法（以下「法」という。）３１条２項に基づいて，所轄税務
署長に還付通知すべき旨の請求をしたところ，被告登記官がこれを拒否する旨の通
知をした。原告らはこれを不服として，被告登記官に対して上記通知の取消しを，
被告国に過誤納金の返還を求めた。これが本件の事案の概要である。
第３　基礎となる事実
（証拠の記載のない事実は争いがない。証拠の記載のある事実は主に当該証拠によ
り直接認められる事実である。認定に用いた書証の成立は弁論の全趣旨により認め
られる。）
１　本件売買
　原告らは，平成１２年７月１９日，訴外中原証券株式会社から，川崎市α７番６
の宅地（以下「本件土地」という。）及び同土地上の建物（以下「本件建物」とい
う。）を買った（以下「本件売買」という）。
　本件土地及び本件建物は原告らの共有であるが，その持分は原告（後藤経営管理
有限会社）が１０分の５，選定者Ａが１０分の３，選定者Ｂが１０分の２である。
（甲２から４）
２　本件登録免許税と本件納付
　原告らは，平成１２年７月３１日，本件土地及び本件建物について，本件売買を
原因とする所有権移転登記（以下「本件登記」という。）をしたが，その際，以下
の算式に従って，登録免許税２９５万１１００円（以下「本件登録免許税」とい
う。）を納付（以下「本件納付」という。）した。
土地　９３４９万９８５３円×１／３＝３１１６万６６１７円
建物　　　　　　　　　　　　　　　　２７８５万７３２３円
合計　　　　　　　　　　　　　　　　５９０２万３９４０円
課税価格（法１５条による端数処理）　５９０２万３０００円
登録免許税額　　　　　　　　　　　　　２９５万１１００円
（本件登記及び本件納付については争いがなく，その余の事実については甲３）
３　還付請求
　原告らは，平成１２年８月７日，横浜地方法務局川崎支局に対し，本件登録免許
税は本来１９０万２８００円であり，本件納付税額との差額１０４万８３００円が
還付されるべきであるとの請求（以下「本件還付請求」という。）をした（上記の
請求がされたことは争いがなく，内容は甲５）。
４　本件拒絶通知
　被告登記官は，本件還付請求を法３１条２項に基づき登記官が所轄税務署長へ還
付通知（以下「税務署長への還付通知」という。）をすべき旨の請求と理解した
上，平成１２年８月１０日付けで税務署長への還付通知をすべき理由がない旨の通
知をした（以下「本件拒絶通知」という。甲６）。
５　不服申立て
　原告らは，本件拒絶通知を不服として，平成１２年９月１４日付けで東京国税不
服審判長に対して審査請求をしたが，平成１３年４月２６日付けで審査請求は棄却
された（甲７，８）。
６　本件建物の固定資産税額の修正
　川崎市川崎区長は，原告らに対して平成１３年５月１１日付けで，平成１２年７
月３１日に生じた理由により本件建物について平成１３年度の固定資産税の課税標
準額を，２７８５万７３２３円から２０５３万５１４１円に修正する旨（以下「本
件修正」という。）通知した（本件修正通知があったことは争いがなく，内容は甲
９）。
第４　主な争点
１　本件拒絶通知の処分性の有無
２　本件納付における過誤納の有無
第５　主な争点に対する当事者の主張
１　本件拒絶通知の処分性の有無
（被告国の主張）
　法３１条２項は，登記を受けて登録免許税を納付した者（以下「登録免許税納付
者」という。）は同条１項の通知（税務署長への還付通知）を登記官に請求ができ
る旨規定しているにすぎないが，登記機関から税務署長に上記の通知がされた場合
には，その通知を受けた税務署長は，国税通則法５６条に基づき遅滞なく過誤納金
の還付をしなければならない。そうである以上，法３１条１項は，還付請求権の行
使に関し登記機関に対する税務署長への還付通知の請求という手続きによるべきこ
とを定め，登録免許税納付者に対し，その手続上の権利を認めたものと解すべきで
あり，また，上記権利が行使された場合，同条２項は，登記機関に対しこれを放置
することを容認しているとは解されないから，同項は，登記機関に還付通知請求に
対する応答義務があることを併せて規定しているというべきである。
　そうとすれば，税務署長への還付通知の請求に対し登記機関がなす還付通知でき
ない旨の通知（以下「拒絶通知」という。）は，単に還付の事務を円滑ならしめる
ための認識の表示にすぎないものではなく，手続上の権利の行使を否定する行政処
分であって，これにより国民は還付通知請求という手続によって還付を受けること
ができなくなるから，この点において，上記拒絶通知は不利益処分であり，公定力
を有する行政処分というべきである。
　また登記実務においても，登録免許税納付者による法３１条２項に基づく請求に
対し，登記官が過誤納付に該当せず，税務署長への還付通知を要しないと認めると
きは，その旨を請求者に通知する取扱いがされており，当該拒絶通知に処分性があ
ることが前提とされている。
　したがって，本件拒絶通知が取り消されていない段階においては，原告らの還付
請求の主張は許されないので，被告国に対する還付請求の訴えは却下されるべきで
ある。
（原告の主張）
　争う。
２　本件納付における過誤納の有無
（原告らの主張）
　川崎市の固定資産の価格が市の現況調査により修正された（本件修正）ところ，
本件修正は，登録免許税法施行令（以下「施行令」という。）附則４項の「特別の
事情」に該当する。そして，登録免許税の課税標準は，基本的に市の固定資産課税
価格に委ねられるところ，本件では登記官が特別の事情がある場合の認定をしてい
ない以上，本件建物についての登録免許税の課税標準は，本件修正後の２０５３万
５１４１円とすべきである。そうすると，本件登録免許税における課税標準は土地
価格３１１６万６６１７円との合計５１７０万１０００円，登録免許税額は２５８
万５０００円となる。
　したがって，原告らは，本件登録免許税として２５８万５０００円を納付すれば
足りたのであり，本件納付との差額３６万６１００円は支払う必要がなかった。
　また，固定資産税の課税価格に依拠して１月１日付けの価格をもって不動産の価
格を評価する課税方法は，本件売買によって不動産を取得した原告らが課税額に異
議を述べることを不可能とするものであり，不当である。
　よって，原告らは，本件拒絶通知の取消しと被告国に対し，３６万６１００円の
支払いを求める。なお，本訴においては，第３「基礎となる事実」３の内容の主張
はせずに，専ら，上記３６万６１００円の過誤納の返還を求める。
（被告らの主張）
（１）　登録免許税の課税標準たる不動産の価額については，当該登記の時におけ
る不動産の価額によるとされ（法１０条１項），この場合における不動産の価額と
は，当分の間，当該登記の申請日の属する年の前年１２月３１日現在又は当該申請
の属する年の１月１日現在において地方税法３４１条９号に掲げる固定資産課税台
帳に登録された当該不動産の価格（以下「台帳登録価格」という。）を基礎として
政令で定める価額によることができるとされる（法附則７条）。
　そして，施行令附則３項は，法附則７条に規定する政令で定める価額は，台帳登
録価格のある不動産については，当該不動産の登記の申請の日の属する日の区分に
応じ，施行令附則３項各号に掲げる金額に相当する価額とするとしている。
（２）　本件登記申請にかかる不動産は，いずれも台帳登録価格のある不動産であ
るから，施行令附則３項の定める価額が不動産の価額ということになる。そして，
本件登記申請日は平成１２年７月３１日であるので，施行令附則３項２号により申
請の日が４月１日から１２月３１日の期間内にあるから，その年の１月１日現在に
おける台帳登録価格に１００分の１００を乗じて計算した金額が不動産の価額とい
うことになり，原告らの登記申請書に記載された課税価額に誤りはなく，本件登録
免許税の算定は適正になされている。
（３）ア　原告らは，本件修正をもって，施行令附則４項の「特別の事情」に該当
すると主張するが，同附則は，不動産の登記で不動産の価額を課税標準とするもの
につき，当該不動産について増築，改築，損壊，地目の変換その他これらに類する
特別の事情があるため同附則３項の価額を課税標準の額とすることを適当でないと
認めるときは，同附則３項の規定にかかわらず，その事情を考慮して登記官が認定
した価額とする旨定めており，それを受けて，実務上の取扱いは，登記簿上の土地
の地目・地積，建物の種類・構造・床面積等の不動産の表示が課税台帳の不動産の
表示と異なる場合，その不動産の現況が特に課税台帳の表示と異なっていることが
明白に認められない限り，課税台帳の評価額によるものとするとしている（乙
１）。
　したがって，施行令附則４項の「特別の事情」とは同附則４項に列挙されている
ような事情により質的又は量的な形の変化が生じたため，例外的な取扱いを認めた
ものであると解されるから，本件修正が「特別の事情」に当たらないことは明らか
である。
イ　また，原告らは本件建物の維持管理が通常以下であることをもって「特別の事
情」に当たるとも解しているようであるが，このような事情も「特別の事情」に該
当しないことは明らかである。
ウ　さらに，原告らは，登録免許税の課税標準は，基本的には市の固定資産税課税
価格によるべきであるから，川崎市による本件修正後の価格をもって課税標準とす
べきである旨主張する。
　しかし，本件登録免許税の算定基礎となるべき台帳登録価格は平成１２年度の価
格であるところ，本件修正の通知は平成１３年度以降についての台帳登録価格の修
正の通知であることから，原告らの主張は失当である。
第６　争点に対する判断
（事実を認定する場合には，認定事実の前後に証拠を記載して，その旨を示す。一
度説示した事実は，原則としてその旨を断らない。認定に用いた書証の成立は弁論
の全趣旨により認められる。）
１　本件拒絶通知の性格
（１）　登録免許税は，申告や行政庁の処分を要しないで，登記と同時にその納税
義務と共に納付すべき税額が確定する国税である（国税通則法１５条２項１２号，
３項５号）から，納税義務がないのに納付された登録免許税は納付の時点で直ちに
過誤納金となり，税務署長はこれを返還しなければならず（同法５６条１項），登
記機関も登録免許税納付者の請求がなくても，その事実を税務署長に通知（税務署
長への還付通知）しなければならない（法３１条１項）とされており，過誤納金の
有無が公権力で確定される構造とはなっていない。
　法３１条２項は，「登記…を受けた者は，…登録免許税の過誤納があるときは，
当該登記…を受けた日…から１年を経過する日までに，政令で定めるところによ
り，その旨を登記機関に申し出て，前項の通知をすべき旨の請求をすることができ
る。」と規定されているところ，この請求は，登記機関に対し，税務署長に過誤納
の事実を通知すべき旨の請求であって，過誤納金を返還すべき旨の請求ではない。
同条の規定ぶりからみて，もとより登記官はこのような請求に対して，少なくとも
応答する事実上の責務があると解されるところ，そのことと，応答が行政処分かど
うかとは連動する事柄ではない。まず，登記官から承諾の応答があって，税務署長
への還付通知がされれば，登録免許税納付者にとっては，望む結果を得たことにな
り，何ら問題はない。反対に，拒絶通知があった場合には，その拒絶通知の是非自
体を必ず訴訟で争わせることとするのも立法政策としては合理性があると思われる
が，前段の検討のとおり，現行制度はその拒絶通知に公定力を与えてこれを訴訟で
争わせるといった規定を設けていない。現行の規定からすれば，上記の拒絶通知
は，税務署長への還付通知を登記官が拒否するとの内容しか持たないのであって，
それが，過誤納金返還請求権の不存在を確定する効力を有するとまで解することに
は無理がある。そうすると，上記の拒絶通知があっても，登録免許税納付者らには
被告国を相手に過誤納金返還請求をする手段が残されており，何ら登録免許税納付
者らの権利の保護に欠けるところはないと解するのが相当である。ちなみに，応答
がされない場合においても，そのことは，事実上の責務を怠るものではあるが，直
ちに法的不利益を与えるものではないと解される。
（２）　本件拒絶通知は，登録免許税納付者である原告らがした税務署長への還付
通知の請求に対して拒否するというものであり，（１）のことがそのままあてはま
る。したがって，本件拒絶通知は行政処分性を有しないといわざるを得ない。な
お，原告らが被告登記官に対して税務署長への還付通知の請求をしたかどうか定か
ではない面があるものの，被告登記官においては，この請求（基礎となる事実３の
本件還付請求）を税務署長への還付通知の請求と解した上，その拒絶の通知（本件
拒絶通知）をしているところ，この扱いについては原告らは何ら異議を述べていな
い。したがって，本件拒絶通知は，税務署長への還付通知の請求を被告登記官に求
めたところ，それが拒絶されたものとして，判断を進めてよいと解される。
（３）　被告国は，本件拒絶通知（拒否の回答）が，手続上の権利の行使を否定す
る行政処分であって，これにより国民は還付通知請求という手続によって還付を受
けることができなくなるから，この点において，本件拒絶通知は不利益処分であ
り，公定力を有する行政処分というべきであると主張する。
　しかしながら，本件拒絶通知によっても登録免許税の過誤納金返還請求権の不存
在を確定する効力が認められず，本件拒絶通知に不服を持つ者が国を相手に過誤納
金返還請求することもできると解されるので，本件拒絶通知は排他的な不利益を請
求人にもたらすものではない。
（４）　以上のとおりであり，本件拒絶通知は，取消訴訟の対象となる行政処分に
は当たらないというべきであるから，被告登記官に対する本件拒絶通知の取消しを
求める訴えは不適法である。
２　本件登録免許税額と過誤納の有無
（１）　本件建物の課税標準
　本件土地の価額については当事者間に争いがないので，以下において，本件建物
の価額について検討する。
　登録免許税の課税標準及び税率は，法に別段の定めがある場合を除くほか，登記
等の区分に応じ，法の別表第１の課税標準欄に掲げる金額又は数量及び同表の税率
欄に掲げる割合によるとされている（法９条）。本件登記は，所有権移転の登記で
あり，別表第１「一（二）ニ」の登記に該当し，課税標準は不動産の価額であり，
税率は１０００分の５０となる。
　課税標準たる不動産の価額は，当該登記の時における不動産の価額による（法１
０条１項）。そして，法の別表第１の「一」号に掲げる不動産の登記の場合におけ
る同法１０条１項の課税標準たる不動産の価額は，当分の間，当該登記の申請の日
の属する年の前年の１２月３１日現在又は当該申請の日の属する年の１月１日現在
の台帳登録価格を基礎として政令で定める価額によることができるとされる（法附
則７条）。
　この法附則７条に規定する政令で定める価額は，台帳登録価格のある不動産につ
いては，施行令附則３項各号に掲げる当該不動産の登記の申請の日の属する日の区
分に応じ当該各号に掲げる金額に相当する価額とするとされている（同項）。そし
て，本件建物は，台帳登録価格のある不動産であり（甲９），本件登記申請は，平
成１２年７月３１日になされており，施行令附則３項２号に該当するので，その年
の１月１日現在における台帳登録価格に１００分の１００を乗じて計算した金額
が，本件建物についての課税標準たる不動産の価額になる。
（２）　本件修正
　本件建物の台帳登録価格が２７８５万７３２３円から２０５３万５１４１円に修
正されたところ，原告らは，本件納付は専らこの点において過誤納になっている旨
主張する。
　本件修正は，本件建物の価格を２７８５万７３２３円から２０５３万５１４１円
に修正して固定資産課税台帳に登録するというものであるものの，平成１３年５月
１１日になされ，平成１３年度分固定資産税・都市計画税を同年度２期分から修正
するというものであり，平成１２年度分に遡って修正するというものではない（甲
９）。このように価格の修正がされた場合でも，修正がされたことで，初めてその
価格が台帳登録価格となるのであり，修正原因発生時に遡って台帳登録価格が修正
されるものではない。ちなみに，本件修正の通知書の「理由」の「その他」の欄に
チェックが入っており，日付けとして「平成１２年７月３１日」とされている。こ
れは，同日に新築，増改築，床面積訂正以外のその他の理由によって本件建物の台
帳登録価格を修正するということであるが，上記に述べたとおり，同日に遡って台
帳登録価格が修正されるわけではなく，現実に修正された日（平成１３年５月１１
日）に初めて同価格が修正されたものであり，不動産の価格は，この事実に従って
判断されるべきである。そうすると，本件修正によって，本件登録免許税額が遡っ
て変更されることにはならない。
（３）　「特別の事情」の該当性の有無
　また，原告らは，本件修正をもって，施行令附則４項の「特別の事情」に該当す
ると主張する。
　施行令附則４項は，法別表第１の第１号に掲げる登記で不動産の価額を課税標準
とするものについて登録免許税を課税する場合において，登記官が当該登記の目的
となる不動産について増築，改築，損壊，地目の変換その他これらに類する特別の
事情があるため，施行令附則３項の規定により計算した金額に相当する価額を課税
標準の額とすることを適当でないと認めるときは，同項の規定にかかわらず，法附
則７条に規定する政令で定める価額は，同項の規定により計算した金額を基礎とし
当該事情を考慮して当該登記官が認定した価額とする，と規定している。つまり施
行令附則４項の「特別の事情」とは，文字通り，増築，改築，損壊，地目の変換や
それらに準じるものがある場合である。したがって，本件修正が特別の事情に該当
しないことは明らかである。また，本件建物についてその他に特別の事情に該当す
る事情は見当たらない。
（４）　不服申立手段との関係
　原告らは，固定資産税課税価格に依拠して１月１日時点における価格をもってす
る課税方法は，本件売買によって不動産を取得した原告らがその評価額に異議を述
べることができなくするもので，不当であると主張する。
　原告らの主張は必ずしも明確ではないが，本件建物の購入に伴う登録免許税の課
税標準は，地方税法３５９条により当該年度の初日の属する年の１月１日を賦課期
日とする固定資産税の台帳登録価格を基に計算されるところ，台帳登録価格につい
ては，地方税法４３２条１項によって不服申立期間が制限されているので（台帳登
録価格については，縦覧期間の初日から納税通知書の交付を受けた日後３０日まで
等），原告らが本件建物を取得した時点では既に不服申立期間が過ぎており，この
ような不服申立てができない課税評価額をもってする課税方法が不当であると主張
するものと解される。
　しかしながら，上記の制度は全国に大量に存在する固定資産の課税評価を公平に
行う必要等から設けられており，十分な合理性があるので，課税台帳についての不
服申立期間が当該不動産単位で定められ，その所有者が替わることによって所有者
単位に不服申立期間が設けられていないことをもって，不当であるということはで
きない。したがって，原告らが本件売買で購入した本件建物の当該年度の台帳登録
価格について不服申立てをすることができず，かつその価格で本件登録免許税額が
算定されることに格別不当な点はない。
（５）　過誤納の有無
　以上のとおり，本件建物の平成１２年１月１日現在の台帳登録価格は，２７８５
万７３２３円であり，これに基づき本件登録免許税額が計算されることになる。
　したがって，本件登録免許税額（本件土地の分を含む。）は，２９５万１１００
円となり過誤納は生じていない。
　前示のとおり，登記時に課される登録免許税は，不動産の価格を課税標準とする
が，その価格は当分の間，登記申請日を基準として，前年の１２月３１日現在又は
その年の１月１日現在の台帳登録価格によるとされている。このことから明らかな
とおり，不動産登記について課される登録免許税は，登記に際して必要な一定の税
額を算出するための手段として，不動産の台帳登録価格を流用する立法技術を用い
ているのであり，厳密な意味での時価や遡及した修正後の価格をもって課税標準と
するものではなくても，そのことは，大量にされる不動産取引における登録免許税
を画一的にかつ公平に課するという合理的な制度的要請から生ずるやむを得ない結
果である。そうである以上，本件登録免許税額の算定に違法はない。
第７　結論
　よって，被告登記官に対する本件拒絶通知の取消を求める訴えは却下することと
し，原告の被告国に対する過誤納金返還請求は理由がないから棄却することとし，
訴訟費用の負担につき行政事件訴訟法７条，民事訴訟法６１条を適用して，主文の
とおり判決する。
横浜地方裁判所第１民事部
裁判長裁判官　岡光民雄
裁判官　堤雄二
裁判官窪木稔は，差し支えのため，署名押印することができない。
裁判長裁判官　岡光民雄

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