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平成２８年３月１７日判決言渡
平成２４年（行ウ）第７６１号関税更正処分取消請求事件
主文
１原告の請求をいずれも棄却する。
２訴訟費用は原告の負担とする。
事実及び理由
第１請求（請求１と請求２は選択的請求）
１取消請求
(1)別紙１「処分目録１」の各「処分行政庁」欄記載の処分行政庁が，各「処
分日」欄記載の日付けで各「通知書番号」欄記載の通知書番号により原告に
対して行った各「輸入申告書番号」欄記載の輸入申告書番号の納税申告に係
る関税についての各更正のうち，同目録の各「申告税額」欄記載の金額を超
える部分を，いずれも取り消す。
(2)別紙２「処分目録２」の各「処分行政庁」欄記載の処分行政庁が，各「処
分日」欄記載の日付けで各「通知書番号」欄記載の通知書番号により原告に
対して行った各「輸入申告書番号」欄記載の輸入申告書番号の納税申告に係
る関税についての各過少申告加算税賦課決定を，いずれも取り消す。
２無効確認請求
(1)別紙１「処分目録１」の各「処分行政庁」欄記載の処分行政庁が，各「処
分日」欄記載の日付けで各「通知書番号」欄記載の通知書番号により原告に
対して行った各「輸入申告書番号」欄記載の輸入申告書番号の納税申告に係
る関税についての各更正のうち，同目録の各「申告税額」欄記載の金額を超
える部分が無効であることを確認する。
(2)別紙２「処分目録２」の各「処分行政庁」欄記載の処分行政庁が，各「処
分日」欄記載の日付けで各「通知書番号」欄記載の通知書番号により原告に
対して行った同目録の各「輸入申告書番号」欄記載の輸入申告書番号の納税
申告に係る関税についての各過少申告加算税賦課決定が無効であることを確
認する。
第２事案の概要
本件は，食肉の輸出入，販売等を行う株式会社である原告が，平成１６年１月
２６日から平成１７年２月７日までの間，前後８２３回にわたり，外国産冷凍豚
部分肉（以下「本件各輸入貨物」という。）を輸入するに当たり，東京税関大井
出張所ほか３庁において，課税価格が別紙３「更正後関税額等一覧表」（以下「別
表」という。）の⑧「当初関税課税標準額（円）」欄記載の金額（合計１３０億
８７０６万２０３３円）であり，関税暫定措置法（平成１５年４月１日から平成
１６年３月３１日までに輸入されたものについては平成１６年法律第１５号によ
る改正前のもの。平成１６年４月１日から平成１７年３月３１日までに輸入され
たものについては平成１７年法律第２２号による改正前のもの。以下，「関税暫
定措置法」という場合，特に断りのない限り，上記の輸入日に応じた改正前のも
のをいう。）２条２項，別表第１の３の規定するいわゆる豚肉の差額関税制度（以
下「本件差額関税制度」という。）を適用した関税額が別表の⑩「当初関税額（円）」
欄記載の金額（合計５億６２６８万４９００円）であるとして輸入（納税）申告
をし，その都度，各処分行政庁から本件各輸入貨物の輸入許可を受けたところ，
各処分行政庁から，原告が輸入した本件各輸入貨物の正当な課税価格は別表の⑪
「真正関税課税標準額（円）」欄記載の金額（合計７１億１４２７万１７５５円）
であり，本件差額関税制度によれば納付すべき関税額は別表の⑬「更正後関税額
（円）」欄記載の金額（合計６５億２４２４万４３００円）であったから，原告
は納付すべき関税額と申告関税額との差額である別表の⑭「納付すべき額（円）」
欄記載の関税（合計５９億６１５５万９３００円）を免れているとして，平成１
９年２月２０日及び同月２１日付けで各更正及び各過少申告加算税賦課決定を受
けたことから，国を被告とし，「世界貿易機関を設立するマラケシュ協定」（平
成６年条約第１５号。以下，附属書を含めて「ＷＴＯ協定」という。また，ＷＴ
Ｏ協定のうち，前文，協定本体の部分，末文及び注釈を総称して，「ＷＴＯ設立
協定」といい，附属書は，順に「附属書１」，附属書１Ａ」，「附属書２」など
という。）の附属書１Ａの一内容である「農業に関する協定」（以下「ＷＴＯ農
業協定」という。）４条２項が我が国において直接適用されることを前提として，
同項に違反する本件差額関税制度が憲法９８条２項により無効であると主張し，
上記各更正のうちの申告税額を超える部分及び上記各過少申告加算税賦課決定の
取消し又は無効確認を求める事案である。
１関係法令等の定め
本件の主な関係法令等の定めは，別紙４「関係法令等の定め」記載のとおり
である。
２前提事実（証拠等の掲記のないものは当事者間に争いがない。）
(1)本件差額関税制度の概要等
本件差額関税制度の概要等は，別紙５「本件差額関税制度の概要等」記載
のとおりである。（乙６の１ないし乙１２）
(2)原告及びその関係者
ア原告は，平成４年９月１１日に設立された株式会社であり，牛，豚，馬，
鶏等の肉及び内臓の輸出入並びに加工，販売等を目的とし，平成２４年９
月１８日まではＰ１がその代表取締役を務めていた。（乙４の１）
イＰ２社（以下「Ｐ２」という。）は，デンマーク王国最大の豚と畜業者
であり，日本を始め世界各国へ豚肉を供給していた。（乙５の６頁）
ウＰ３株式会社（以下「Ｐ３」という。）は，平成１４年１２月１６日に，
農水産物，畜産物の輸出入及び加工販売等を目的に設立された株式会社で
ある。Ｐ３は，平成１７年１０月頃，原告に買収され，その後，Ｐ１がそ
の代表取締役を務めるようになり，その本店所在地も原告と同所となって
いた。（乙４の２，乙５の６頁，弁論の全趣旨）
エＰ４社（以下「Ｐ４」という。）は，平成１３年，Ｐ１が出資して香港
を事業所所在地として設立された会社であり，当初は，Ｐ１が代表取締役
を務めていたが，平成１６年中には，Ｐ１に代わってＰ５が代表取締役に
就任した。なお，Ｐ４の事業所所在地は香港であるが，実際の業務は，本
邦においてＰ５が行っていた。（乙５の６頁）
(3)本件各輸入貨物に係る輸入（納税）申告の概要等
原告は，Ｐ２から冷凍豚部分肉（関税定率法別表（関税率表）第１部第２
類０２０３・２９・２（以下，関税率表の分類番号を表記するに当たり，４
桁の番号の場合には，「項」といい，さらに，「項」の下位の分類番号であ
る６桁の番号の場合には，「号」と表記する。関税暫定措置法においても同
様とする。）の規定する「豚の肉（生鮮のもの及び冷蔵し又は冷凍したもの
に限る。）」のうちの「冷凍したもの」のうちの「その他のもの」のうちの
「二その他のもの」に該当するもの。本件各輸入貨物。）を輸入するに当
たり，本件各輸入貨物がＰ２からＰ４に販売され，これをＰ４からＰ３が輸
入したものとして，Ｐ３名義を用いて，別表記載のとおり，平成１６年１月
２６日から平成１７年２月７日までの間，合計８２３回にわたり，東京税関
大井出張所，大阪税関大手前出張所，大阪税関南港出張所及び大阪税関桜島
出張所において，冷凍豚部分肉合計２２２７万５０９０．４４ｋｇ（本件各
輸入貨物）の真正な課税価格は別表の⑪「真正関税課税標準額（円）」欄記
載のとおりであり，本件差額関税制度の適用を前提とすると関税額は別表の
⑬「更正後関税額（円）」欄記載のとおりであるのに，課税価格が別表の⑧
「当初関税課税標準額（円）」欄記載のとおりであり，本件差額関税制度を
適用した関税額合計が別表の⑩「当初関税額（円）」欄記載のとおりである
旨の輸入（納税）申告（以下「本件各輸入（納税）申告」という。）をして，
各処分行政庁から輸入許可を受けた。（甲１，甲８，甲９，乙３の１ないし
３，乙５）
(4)刑事事件
ア原告及びＰ１は，本件各輸入（納税）申告により納付すべき関税額と申
告関税額との差額合計５９億６１５５万９４００円を免れたという関税法
違反の罪により，平成１９年２月２６日，千葉地方裁判所に起訴された（以
下，この起訴に係る刑事事件を「本件刑事事件」という。）。（甲１）
イ千葉地方裁判所は，本件刑事事件について，平成２１年３月２６日，原
告を罰金２億５０００万円に，Ｐ１を懲役２年４月及び罰金１５００万円
に処する旨の判決をした。（乙３の１）
ウ原告及びＰ１は，それぞれ，上記イの判決に対して東京高等裁判所に控
訴したが，東京高等裁判所は，平成２２年８月３０日，原告及びＰ１によ
る各控訴を棄却する旨の判決をした。（乙３の２）
エ原告及びＰ１は，上記ウの判決に対して上告をし，上告理由として本件
差額関税制度がＷＴＯ農業協定４条２項に違反するため憲法９８条２項に
違背するという主張も新たにしたものの，最高裁判所は，平成２４年９月
４日，上記上告を棄却する旨の決定をし，これにより，本件刑事事件に係
る前記イの有罪判決が確定した。（甲８，甲９，乙３の３）
(5)更正等
関税法１０７条，関税法施行令９２条１項２号により東京税関長又は大阪
税関長からそれぞれ権限の委任を受けた各処分行政庁（東京税関大井出張所
長，大阪税関大手前出張所長，大阪税関南港出張所長及び大阪税関桜島出張
所長）は，それぞれ，同法７条の１６，１２条の２の各規定に基づき，原告
に対し，別紙１「処分目録１」の各「処分行政庁」欄記載の処分行政庁にお
いて，各「処分日」欄記載の日付けで，各「通知書番号」欄記載の通知書番
号の更正通知書により，各「輸入申告書番号」記載の輸入申告書番号の納税
申告に係る関税について，関税額を別表の⑬「更正後関税額（円）」欄（別
紙１「処分目録１」の各「輸入申告書番号」と同一の別表の②「申告番号」
に係るもの。以下同じ。）記載の金額，納付すべき税額を別表の⑭「納付す
べき額（円）」欄記載の金額とする各更正（以下「本件各更正処分」という。）
をするとともに，別紙２「処分目録２」の各「処分行政庁」欄記載の処分行
政庁において，各「処分日」欄記載の日付けで，各「通知書番号」欄記載の
通知書番号の過少申告加算税賦課決定通知書により，各「輸入申告書番号」
欄記載の輸入申告書番号の納税申告に係る関税について，過少申告加算税の
額を別表の⑱「加算税合計額（円）」欄（別紙２「処分目録２」の各「輸入
申告書番号」と同一の別表の②「申告番号」に係るもの。以下同じ。）記載
の金額とする各過少申告加算税賦課決定（以下「本件各賦課決定処分」とい
い，本件各更正処分と併せて「本件各更正処分等」という。）をした。
(6)不服申立ての経緯
ア原告は，本件各更正処分等について，平成１９年４月１８日付けで東京
税関長に対し，同月１９日付で大阪税関長に対し，それぞれ異議申立てを
した。
イ原告は，本件各更正処分等について，平成２１年３月６日付けで財務大
臣に対し，審査請求をしたが，審査請求があった日から３箇月を経過して
も裁決はされなかった
(7)本件訴えの提起
原告は，平成２４年１１月２日，本件訴えを提起した。（顕著な事実）
３本件各更正処分等の根拠と適法性に関する被告の主張
本件各更正処分等の根拠と適法性に関する被告の主張は，別紙７「本件各更
正処分等の根拠及び適法性」記載のとおりである。
４争点及び争点に関する当事者の主張
本件の争点は，本件各更正処分等の適法性であり，具体的には，①ＷＴＯ
農業協定４条２項の我が国における直接適用可能性の有無，②同項の我が国
における直接適用可能性がある場合における本件差額関税制度の同項違反の有
無が争われている。これらに関する当事者の主張は，別紙８「原告の主張」及
び別紙９「被告の主張」記載のとおりであり，その要旨は次のとおりである。
(1)ＷＴＯ農業協定４条２項の直接適用可能性の有無
（原告）
ア関税法３条ただし書によりＷＴＯ農業協定４条２項が我が国において
直接適用されること
関税法３条は，「輸入貨物（信書を除く。）には，この法律及び関税定
率法その他関税に関する法律により，関税を課する。ただし，条約中に関
税について特別の規定があるときは，当該規定による。」と規定している
ところ，関税法基本通達（以下「基本通達」という。）３－１は「法３条
ただし書《条約による特別規定》に定める「関税についての特別の規定」
とは，関税の税率のほか関税の軽減，免除，払出しその他関税の賦課及び
徴収に関しての国内法の規定に対する特別の規定をいう。」と定めている。
そして，ＷＴＯ農業協定４条２項の内容は，端的にいうと，「課税標準
及び税率を同項記載の禁止の制度に該当しないよう定めることの対外的
約束」であり，「課税標準設定及び税率設定の禁止枠組み」を定めるもの
であるから，関税法３条ただし書の「特別の規定」に該当する。
したがって，ＷＴＯ農業協定４条２項は，関税法３条ただし書により，
我が国において直接適用される。
イ条約の直接適用可能性の基準
(ア)条約の直接適用可能性の有無は，主観的基準と客観的基準から判断
する必要があるところ，主観的基準については，条約締結国の総意とし
て直接適用可能性を排除しているのか否かと，当該国が直接適用を排除
する国内法制を採用する意思を有するか否かをメルクマールとすべきで
ある。
これに対し，条約の直接適用可能性が認められるための主観的要件と
して，条約締結国による私人の権利義務の創設の意思が必要であるとい
う考え方は，直接適用される場面をあまりに狭く限定しすぎるという点
と，個人の権利義務を創設していなくても直接適用されている条約が現
に存在することを説明できないという点に問題がある。
また，条約の直接適用可能性の主観的要件として，条約締結国が各国
内で直接適用することを積極的に意図したことが必要であるという考え
方も，特に多国間条約についてはそのような当事国の意思が見いだされ
ることはほとんどないため，条約の直接適用可能性が認められる余地が
なくなってしまう点に問題がある。
結局，条約の国内における完全実施の方法について各国の主権を尊重
するには，「（条約中に直接適用可能性の排除が明示されない限り）原
則として直接適用可能性は認めた上で，各々の国に，直接適用を排除す
る国内法制を採用するか否かの選択肢を与える」と解するほかはない。
(イ)また，条約の直接適用可能性の客観的基準としては，まず，当該条
約の内容が明確であることが必要となり，次に，完全であること，すな
わち，条約の執行に必要な機関や手続が定められていることが必要とな
る。
ウＷＴＯ農業協定４条２項の直接適用可能性に係る主観的基準について
(ア)ＷＴＯ農業協定４条２項について，直接適用可能性についての主観
的要件を充足するかを検討するに，主観的基準のうちの直接適用可能性
を排除するという条約締結国の総意の有無については，ＷＴＯ協定その
ものは，各国が国内の条約違反状態の是正を，立法機関，行政機関だけ
ではなく，司法機関によっても行うことを奨励こそすれ，排除するもの
ではないと考えられること，また，ＷＴＯ協定によって設立された世界
貿易機関（以下「ＷＴＯ」という。）は，１９４７年に締結された「関
税及び貿易に関する一般協定」（以下，「関税及び貿易に関する一般協
定」を「ＧＡＴＴ」という。）よりも実効性の高い紛争解決制度を用意
しており，ＷＴＯはＧＡＴＴ以上にＷＴＯ協定を各国が遵守するように
体制強化を図っていることからすると，各国が自主的にＷＴＯ協定違反
の国内状態を是正することは，ＷＴＯの目的に合致こそすれ，反するも
のではないことなどからすると，ＷＴＯ農業協定４条２項については，
直接適用可能性を排除するという条約締結国の総意は認められない。
(イ)次に，我が国は，そもそも条約全般について直接適用可能性を排除
するという法秩序は採用しておらず，また，関税に係る事項については，
むしろ積極的に直接適用可能性を認める旨の関税法３条ただし書を用意
しており，通商政策上もＷＴＯ協定の直接適用可能性を排除する国内法
制を取りにくい政策を採用している。そして，ＷＴＯ農業協定４条２項
の直接適用可能性を排除する国内法制が我が国には存在しない以上，我
が国には，ＷＴＯ農業協定４条２項について，その直接適用可能性を排
除する意思は存在しないというべきである。
(ウ)以上によれば，ＷＴＯ農業協定４条２項は，我が国における直接適
用可能性についての主観的基準を満たしている。
エＷＴＯ農業協定４条２項の直接適用可能性に係る客観的基準について
(ア)まず，ＷＴＯ農業協定４条２項の規定内容をみると，「通常の関税」
とは定率関税及び定額関税のことであり，また，「最低輸入価格」とは，
一般に輸入産品の輸入価格と特定の価格限界との差額を関税額とするも
のであって，当該特定の輸入産品が当該価格限界を下回って国内市場に
侵入することのないようにする措置をいうことは明らかである。このよ
うに，「通常の関税」「最低輸入価格」の意味内容は自明であり，疑義
をはさむ余地はないから，同項の内容が明確であることは明らかである。
(イ)次に，完全性については，条約の執行に必要な機関や手続に欠ける
か否かは各国ごとに補足的措置がとられているか否かによるところ，我
が国において適当な機関や手続が既に存在するかどうかを検討するに，
機関としては税関があり，手続については関税三法が詳細に定めている
のであるから，完全性に欠けるところはない。そもそも，関税法３条た
だし書があることそれ自体が，そのような完全性の裏付けがあることを
初めから前提としているところであるから，ＷＴＯ農業協定４条２項が
完全なものであることも明らかである。
(ウ)以上のとおり，農業協定４条２項という条約条項は，明確であり，
また，完全であるから，我が国における直接適用可能性についての客観
的基準を満たしている。
オその他
(ア)日本国憲法の前文には「国際社会において名誉ある地位を占めたい」
という理念が示されていること，また，他国における条約の実施状況を
踏まえて裁判所が国際交渉における利益不利益を考慮すること自体が，
行政府及び立法府の権限に属する判断をしていることであって職域を超
えており，これこそがむしろ権力分立の理念に違背することからすると，
アメリカ合衆国（以下「米国」という。）及びヨーロッパ共同体（以下
「ＥＵ」という。）がそれぞれの国内法秩序に従ってＷＴＯ協定の国内
（域内）における直接適用を認めていないことは，我が国においてＷＴ
Ｏ農業協定４条２項の直接適用を認めない理由とはならない。
(イ)また，三権分立，国内法制の状況等を理由にＷＴＯ農業協定４条２
項の直接適用を否定することはできない。
(ウ)さらに，国会が関税法３条ただし書を成立させ，また，ＷＴＯ農業
協定４条２項を承認している以上，国会又は政府の裁量権を理由にＷＴ
Ｏ農業協定４条２項の直接適用を否定することはできない。
カ直接適用可能性に関する結論
以上によれば，ＷＴＯ農業協定４条２項は，我が国において直接適用可
能性を有している。
（被告）
ア前提
本件差額関税制度の有効性を判断するに当たり，ＷＴＯ農業協定４条２
項を裁判規範として用いるためには，同項について，我が国における直接
適用可能性が認められなければならない。
イ条約の直接適用可能性の判断基準
ある条約の規定を国内裁判所において直接裁判規範として適用するため
には，①条約締結国の国内裁判所で執行可能なものにするという条約条
約締結国の具体的な意思が確認できること（主観的基準），及び，②そ
の内容を具体化する法令を待つまでもなく国内で直接適用できるだけの
具体性及び明確性があること（客観的基準）を要すると考えられる。
ウＷＴＯ農業協定４条２項は直接適用可能性に関する主観的基準を満たさ
ないこと
我が国は，ＷＴＯ協定の交渉過程において，ＷＴＯ農業協定４条２項の
直接適用可能性について議論されたとは認識しておらず，ＷＴＯ協定の関
連規定の内容やその交渉経緯，ＷＴＯ農業協定４条２項の国内実施措置等
によれば，我が国が，ＷＴＯ農業協定４条２項について，私人に対し，「通
常の関税」に当たらない国境措置を適用されない権利を認めてこれを直接
に国内裁判所で執行可能にするなどという意思を有していなかったこと
は明らかである。
したがって，ＷＴＯ農業協定４条２項は直接適用可能性に関する主観的
基準を満たさない。
エＷＴＯ農業協定４条２項は直接適用可能性に関する客観的基準を満たさ
ないこと
条約解釈の原則に従って解釈したとしても，ＷＴＯ農業協定４条２項の
規定内容が，当該内容を具体化する法令を待つまでもなく国内で直接適用
できるだけの具体性及び明確性を有するとは認められない。
オ直接適用可能性に関する結論
以上によれば，ＷＴＯ農業協定は，我が国において直接適用可能性を有
していない。
(2)本件差額関税制度のＷＴＯ農業協定４条２項違反の有無
（原告）
ア本件差額関税制度は通常の関税に該当しないこと
本件差額関税制度のうち，関税として基準輸入価格と課税価格の差額を
課すという部分は，従量税率でもなければ，従価税率でもなく，「通常の
関税」ではないから，当該部分は「通常の関税に転換することが要求され
た措置その他これに類するいかなる措置（注）も維持し，とり又は再びと
ってはならない。」と定めるＷＴＯ農業協定４条２項に違反する。
また，ＷＴＯ協定の附属書１にある日本国の譲許税率表には，上記の部
分に関する記載は一切なく，現行の本件差額関税制度は，日本国の譲許表
と異なっており，外見的にも実際的にも日本国は国際的に二枚舌を使った
結果となっている。
イ本件差額関税制度は最低輸入価格に該当すること
本件差額関税制度は，課税価格と基準輸入価格の差額を関税として賦課
するというものであり，基準輸入価格は特定の価格限界としての機能を有
していることからすると，ＷＴＯ農業協定４条２項（注）が，特に掲名し
て禁じている最低輸入価格に該当することは明らかである。
ウ本件差額関税制度のＷＴＯ農業協定への適合性の結論
以上によれば，本件差額関税制度は，ＷＴＯ農業協定４条２項，特に同
項の（注）に違反する。
（被告）
ＷＴＯ農業協定４条２項は，関税という「税」の形式で課されていたとし
ても，それが「従量税，従価税又はその組合せの形式で譲許」されていない
場合は，そもそも「通常の関税」ではないとして，これを禁止しているもの
と解される。また，「通常の」関税の形式を採るものであっても，実質的に
みて，関税化の特質である透明性及び予測可能性を著しく欠いている場合に
は，同項の趣旨目的に反し，同項に適合しないということができる。
しかるに，本件差額関税制度は，従量税と従価税の組合せで譲許された関
税であるから，「通常の関税」に当たる。また，本件差額関税制度は，実質
的にみて透明性及び予測可能性を著しく欠くものとはいえないから，ＷＴＯ
農業協定４条２項の趣旨にも反しない。さらに，効果の点に着目してみても，
本件差額関税制度には輸入量規制効果や価格伝達阻害効果は認められず，第
１次及び第２次チリ価格帯事件の上級委員会が挙げたような「最低輸入価格」
としての特徴を有するものではない。したがって，本件差額関税制度は最低
輸入価格又はこれに類する措置に当たらない。
以上によれば，本件差額関税制度は，ＷＴＯ農業協定４条２項に違反する
ものではない。
第３当裁判所の判断
１ＷＴＯ農業協定４条２項の我が国における直接適用可能性の有無について
(1)問題の所在
ア原告は，本件各更正処分等の前提となっている我が国における豚肉の輸
入に係る本件差額関税制度について，ＷＴＯ農業協定４条２項に違反する
ものであるから憲法９８条２項により無効であり，それゆえ，本件各更正
処分等は違法又は無効であると主張している。
イこの点，ＷＴＯ協定は，二以上の国際法主体にその効果が帰属する文書
による合意であるから，その一部であるＷＴＯ農業協定を含めて条約であ
るところ，我が国において国会による承認を経て締結し公布された条約は，
他に特段の立法措置を講ずるまでもなく当然に，憲法９８条２項，７条１
号により国内的効力を有し，法律に優位するものと解される。
しかしながら，このことは，我が国の憲法体制の下において，条約が他
に特段の立法措置を講ずるまでもなく我が国の法体系に受け容れられ（す
なわち，自動的に受容され），国内的効力を有することを意味しているに
とどまるから，それ以上の措置を必要とすることなく，個々の国民が条約
を直接の法的根拠として具体的な権利ないし法的地位を主張したり，ある
いは，裁判所が法的紛争を解決するに当たり条約を直接適用して結論を導
いたりすることが可能か（条約がそのまま国内で裁判規範として適用可能
か）は別途問題となる。これが本件において検討されるべき条約の直接適
用可能性の問題である。
ウなお，条約の直接適用可能性の有無は，当該条約全体として判断される
のではなく，個々の条項について判断されるべきものであるから，条約中
の特定の条項について直接適用可能性が認められるからといって，他の条
項についても直ちに直接適用可能性が認められるということにはならない。
例えば，ＷＴＯ協定の附属書１Ａに含まれる１９９４年のＧＡＴＴの譲許
表に関する規定は，我が国において直接適用可能性を有するものとされて
いるが（基本通達３－２。甲２０，甲２１），そうであるからといって，
同じくＷＴＯ協定に含まれるＷＴＯ農業協定４条２項についても当然に直
接適用可能性が認められることにはならない。
エこの点，原告は，関税法３条が「輸入貨物（信書を除く。）には，この
法律及び関税定率法その他関税に関する法律により，関税を課する。ただ
し，条約中に関税について特別の規定があるときは，当該規定による」と
規定しているところ，同条ただし書により，ＷＴＯ農業協定４条２項が我
が国において直接適用されることは明らかであるかのような主張をしてい
る。
しかしながら，同条ただし書は，条約中の関税に関する規定全般につい
て無条件に直接適用を認めるというものではなく，当該条項が直接適用可
能性を有している場合には適用されるということを注意的に規定したも
のと解するのが相当であるから，同条ただし書の存在をもって，直ちにＷ
ＴＯ農業協定４条２項が我が国において直接適用可能性を有するものと
解することはできず，同項が我が国において直接適用可能性を有するか否
かは，関税法３条ただし書の存在にかかわらず，具体的に検討すべきこと
になる。
(2)条約の直接適用可能性の判断基準について
ア前記(1)イで説示したとおり，我が国では，所定の公布手続を了した条約
は，他に特段の立法措置を講ずるまでもなく，当然に国内的効力を承認し
ているものと解されるところ，国内的効力が認められた条約が国内におい
て直接適用可能か否かは，次のとおり，主観的基準と客観的基準によって
判断するのが相当である。
イまず，条約の直接適用可能性の有無の判断においては，主観的基準とし
て，条約締結国の具体的な意思如何が重要となる。
なぜなら，そもそも国家等の国際法主体は，それぞれ交渉して条約を締
結する権限を有しているのであって，当該条約の条項が条約締結国の内部
的法秩序においてどのような効力を生じるかについても，自由に合意する
ことが可能であり，それゆえに当該条約の条項の直接適用可能性の有無の
判断においては，条約締結国が当該条約の直接適用可能性についてどのよ
うな意思を有していたのかが極めて重要な要素となるからである。
そして，具体的には，条約の条項の直接適用可能性の有無は，それぞれ
の条約締結国において，当該条項につき，国内において直接適用可能性を
有するものとして当該条約を締結しているか否かによって決せられるべ
きものと解するのが相当である。
なお，上記のような条約締結国の意思は，必ずしも条約規定の文言のみ
に示されるのではなく，場合に応じて，条約締結国間の合意や条約の作成，
実施の過程の事情などをも考慮して判断されるものであるから，条約の特
定の条項についての直接適用可能性の有無は，当該条項の文言のみによっ
て判断されるべきものではなく，当該条約の全体の構成や内容，交渉経過
を踏まえて判断されるべきことになる。
ウ次に，条約の規定を国内的に直接適用するためには，客観的基準として，
当該規定の文言につき条約解釈の原則に従って解釈した上で，そのまま国
内的に適用できる程度に明確であることが必要であると解される。
なぜなら，権力分立の原則によれば，法の定立は原則として立法府の権
限であり，不明確で国家に広い裁量の余地を残している条約の規定につい
て，司法府がこれを直接適用すると，実質的に司法府が法の定立をするこ
とになり，立法府の権限を侵害し，また，法的安定性も害することとなる
ため，一般的抽象的な概念を含んでいる条約規定や，一般的抽象的原則を
定めるにすぎない条約規定が直接適用されることは許容し得ないからで
ある。
また，条約の直接適用可能性が認められるためには，当該条項が上記の
ような狭い意味で明確であることに加え，当該条項の執行に必要な機関や
手続について定められているという意味で，完全でなければならないと解
される。
なぜなら，条約は，条項の執行に必要な機関や手続については定めてい
ないことが少なくなく，このような完全ではない条約の条項は，例え狭い
意味で明確で具体的な内容をもっていても，実際上直接適用されるのは困
難だからである。
エ以上によれば，条約の直接適用可能性の有無は，それぞれの条約締結国
において，当該条約の条項につき，国内において直接適用可能性を有する
ものとして当該条約を締結しているか否かという主観的基準と，その内容
を具体化する法令を待つまでもなく国内で直接適用できるだけの明確性，
完全性があるかという客観的基準によって判断されるべきことになる。
オこれに対し，原告は，直接適用可能性の主観的要件として，直接適用可
能であるという積極的な当事国の意思を厳格に要求すると，ほとんどの条
約（規定）は直接適用可能でないことになってしまうなどとして，条約に
ついては，原則として直接適用可能性を認めた上で，条約の直接適用可能
性において問題とされる条約締結国の意思は，直接適用可能性を排除する
基準として意味を持つものと解すべきであると主張する。
しかしながら，前記イで説示したとおり，そもそも，条約は国家間の合
意であるから，条約の直接適用可能性の有無については，条約締結国の意
思が重要となることは否定することができず，また，条約は，国家と国家
の権利義務関係を定めるものであって，必ずしも個人の権利等を直接創設
するものではないことや，条約の条項を遵守するということとこれを国内
で直接適用することは別の問題であることからすると，条約の条約締結国
において，条約の条項を遵守するという意思を有しているということ以上
に，原則として条約の条項の直接適用可能性を認める意思を有しているこ
とまで推認することはできないから，条約の条項の直接適用可能性が認め
られるためには，条約締結国において条約の当該条項について直接適用可
能性を認める意思を有していることが必要であると解さざるを得ないと
いうべきである。そして，この点に関しては，条約締結国において，当該
条約の条項を「国内で直接適用する」という意思が明示的あるいは直接的
に示されているという意味で積極的な意思を確認することが困難であっ
たとしても，問題となるのは飽くまで条約締結国において当該条項を直接
適用可能であることを認めていたかどうかであり，当該条約の条項におい
て加盟国の国内における直接適用可能性の有無が明記されていなかった
としても，交渉経過や条文の規定内容等から，直接適用可能であることを
前提とした締結されたかどうかの判断は可能なことも想定され，ほとんど
の条約（規定）が直接適用可能でないということになるとまではいえない。
したがって，条約の直接適用可能性の主観的要件として，原則として直
接適用可能性が認められることを前提として，条約締結国がこれを排除す
る意思を有していたか否かを問題とすべきであるという原告の主張につ
いては，採用することはできない。
(3)ＷＴＯ協定の概要
証拠（甲２，甲３，甲４，甲１９，甲２５，乙８，乙１０の２，乙１３，
乙１４，乙３６，乙３７，乙３８，乙３９，乙４４）及び弁論の全趣旨によ
れば，ＷＴＯ協定に至る経緯及びその内容は，次のとおりであると認めるこ
とができる。
ア関税その他の貿易障害を実質的に軽減するための多国間協定としては，
１９４７年（昭和２２年）にＧＡＴＴが締結されていたものの，実際に行
われている多様な貿易に十分な規律を及ぼし多角的自由貿易体制を効果的
に維持，強化することができない状況になってきたことから，物品の貿易
のみならず，サービス，知的所有権，貿易関連投資等の新分野をも包括的
にカバーするルールの策定に向けて，１９８６年（昭和６１年）にウルグ
アイ・ラウンド交渉が開始された。
ＷＴＯ協定は，このウルグアイ・ラウンド交渉の成果として，１９９４
年（平成６年）４月１５日にモロッコのマラケシュにおいて作成されたも
のであり，１９９５年（平成７年）１月１日にその効力を生じ，世界貿易
機関（ＷＴＯ）が発足した。
ＷＴＯ協定は，我が国において批准，承認され，平成６年１２月２８日，
条約第１５号として公布された。我が国は，ＷＴＯの原加盟国の一つであ
る。
（以上につき，甲２，甲１９，乙８の１２頁以下，乙１０の２の資料３，
乙１３の８頁以下，１３頁，乙３７の９０８頁）
イＧＡＴＴを継承したＷＴＯ協定は，前文，協定本体の部分，末文，注釈
及び附属書（大きく分けると４つ）によって構成されており，加盟国は，
ＷＴＯ協定を，附属書４の複数国間貿易協定を除いて一括して受諾してい
る。そのため，附属書１，２及び３は，全てのＷＴＯ加盟国を拘束するの
に対し（ＷＴＯ設立協定２条２項），附属書４の複数国間貿易協定は，そ
れぞれの協定を受諾した加盟国のみを拘束するとされている（同条３項）。
（甲４のⅶ頁，甲２５の２頁，乙１３の１３頁以下）
ウＷＴＯ設立協定は，前文，末文，注釈のほか，ＷＴＯ基本的な組織及び
手続について規定する１６の条文によって構成されている。（甲４のⅶ頁，
甲１７，乙１３の１５頁以下，乙４４，弁論の全趣旨）
(ア)ＷＴＯ協定前文は，「この協定の締約国は，貿易及び経済の分野に
おける締約国間の関係が，生活水準を高め，完全雇用並びに高水準の実
質所得及び有効需要並びにこれらの着実な増加を確保し並びに物品及び
サービスの生産及び貿易を拡大する方向に向けられるべきであることを
認め，他方において，経済開発の水準が異なるそれぞれの締約国のニー
ズ及び関心に沿って環境を保護し及び保全し並びにそのための手段を拡
充することに努めつつ，持続可能な開発の目的に従って世界の資源を最
も適当な形で利用することを考慮し，更に，成長する国際貿易において
開発途上国特に後発開発途上国がその経済開発のニーズに応じた貿易量
を確保することを保証するため，積極的に努力する必要があることを認
め，関税その他の貿易障害を実質的に軽減し及び国際貿易関係における
差別待遇を廃止するための相互的かつ互恵的な取極を締結することによ
り，前記の目的の達成に寄与することを希望し，よって，関税及び貿易
に関する一般協定，過去の貿易自由化の努力の結果及びウルグァイ・ラ
ウンドの多角的貿易交渉のすべての結果に立脚する統合された一層永続
性のある多角的貿易体制を発展させることを決意し，この多角的貿易体
制の基礎を成す基本原則を維持し及び同体制の基本目的を達成すること
を決意して，次のとおり協定する。」旨定めている。
(イ)ＷＴＯ設立協定２条は，その２項において，附属書１，附属書２及
び附属書３に含まれている協定及び関係文書は，ＷＴＯ設立協定の不可
分の一部を成し，全ての加盟国を拘束する旨，その３項において，附属
書４に含まれている協定及び関係文書は，これらを受諾した加盟国につ
いてはこの協定の一部を成し，当該加盟国を拘束するが，これらを受諾
していない加盟国の義務又は権利を創設することはない旨定めている。
(ウ)ＷＴＯ設立協定１１条は，ＷＴＯ設立協定の効力発生の日における
１９４７年のＧＡＴＴの締約国及び欧州共同体であって，ＷＴＯ設立協
定及び多角的貿易協定を受諾し，かつ，１９９４年のＧＡＴＴに自己の
譲許表が附属され，サービス貿易一般協定に自己の特定の約束に係る表
（約束表）が附属されているものは，ＷＴＯの原加盟国となる旨定めて
いる。
(エ)ＷＴＯ設立協定１６条４項は，加盟国は，自国の法令及び行政上の
手続を附属書の協定に定める義務に適合したものとすることを確保する
旨定めている。
(オ)ＷＴＯ設立協定には，ＷＴＯ協定の各条項について，加盟国の国内
における直接適用可能性があると定めた条項は存在しない。
エ附属書１では，貿易に関する各加盟国の規制を一定の規律の下に置く実
体的な規則及び関連する手続規則が定められており，物品の貿易に関する
多角的協定（附属書１Ａ），サービスの貿易に関する一般協定（附属書１
Ｂ）及び知的所有権の貿易関連の側面に関する協定（附属書１Ｃ）によっ
て構成されている。（甲３の２１８頁，甲４，甲１９，甲２５，乙１３の
１３頁，１０２頁以下，乙１４の２１８頁以下，乙３７，乙３９，弁論の
全趣旨）
(ア)附属書１Ａには，１９４７年のＧＡＴＴ（ＷＴＯ協定発効前に改正
等が行われた規定を含む。），ＷＴＯ協定発効前に１９４７年のＧＡＴ
Ｔの下で発効した議定書及び１９４７年のＧＡＴＴの条文に関する了解
等から構成される１９９４年のＧＡＴＴが含まれている。
１９４７年のＧＡＴＴでは，「各締約国は，他の締約国の通商に対し，
この協定に附属する該当の譲許表の該当の部に定める待遇より不利でな
い待遇を許与するものとする。」と規定されており（１９９４年のＧＡ
ＴＴ２条１項(a)で読み替え。），ＧＡＴＴと不可分一体のものとして附
属されている譲許表には（ＧＡＴＴ２条７項），ＷＴＯ加盟国のそれぞ
れの関税譲許，非関税譲許及び農業補助金に関する約束が具体的に記載
されている。なお，譲許表のうちの我が国の国別表（第３８表）では，
豚肉の関税には従量税率と従価税率だけで構成されている。
(イ)附属書１Ａの一部であるＷＴＯ農業協定は，ウルグアイ・ラウンド
交渉の結果作成されたものであり，農産品貿易における自由競争をゆが
めるような国内助成や輸出補助金を削減するとともに，農産品の輸入に
際して執られる通常の関税以外の措置を原則として全て通常の関税に転
換し（いわゆる関税化），全ての関税を譲許し引き下げるという約束の
実施に関する規律を定めたものである。
ＷＴＯ農業協定４条２項は，「加盟国は，次条及び附属書５に別段の
定めがある場合を除くほか，通常の関税に転換することが要求された措
置その他これに類するいかなる措置（注）も維持し，とり又は再びとっ
てはならない。」と規定して，加盟国における非関税措置の関税化を義
務付けている。
また，ＷＴＯ農業協定４条２項は，注として，「これらの措置（注：
本文でいう「通常の関税に転換することが要求された措置その他これに
類するいかなる措置」のこと）には，輸入数量制限（quantitativeimport
restrictions），可変輸入課徴金（variableimportlevies），最低輸
入価格（minimumimportprices），裁量的輸入許可（discretionaryimport
licensing），国家貿易企業を通じて維持される非関税措置（non-tariff
measuresmaintainedthroughstate-tradingenterprises），輸出自主
規制（voluntaryexportrestrains）その他これらに類する通常の関税
以外の国境措置（特定の国について承認された１９４７年のガットの規
定からの逸脱として維持されているものであるかないかを問わない。）
が含まれるが，１９９４年のガット又は世界貿易機関協定附属書１Ａに
含まれている他の多角的貿易協定における国際収支に関する規定その他
の農業に特定されない一般的な規定に基づいて維持される措置は含まれ
ない。」と規定している。
(ウ)附属書１Ｂの「サービスの貿易に関する一般協定」（以下「ＧＡＴ
Ｓ」という。）では，「加盟国は，この協定の対象となる措置に関し，
他の加盟国のサービス及びサービス提供者に対し，他の国の同種のサー
ビス及びサービス提供者に与える待遇よりも不利でない待遇を即時かつ
無条件に与える。」（２条１項），「加盟国は，第１条に規定するサー
ビスの提供の態様による市場アクセスに関し，他の加盟国のサービス及
びサービス提供者に対し，自国の約束表において合意し，特定した制限
及び条件に基づく待遇よりも不利でない待遇を与える」（１６条１項），
「加盟国は，その約束表に記載した分野において，かつ，当該約束表に
定める条件及び制限に従い，サービスの提供に影響を及ぼすすべての措
置に関し，他の加盟国のサービス及びサービス提供者に対し，自国の同
種のサービス及びサービス提供者に与える待遇よりも不利でない待遇を
与える」（１７条１項）などと規定されている。
オＧＡＴＴにおける紛争解決手続は実効性に欠けるものであったのに対し，
ＷＴＯ協定は，ＷＴＯは附属書２の紛争解決に係る規則及び手続に関する
了解を運用するものとした上で（ＷＴＯ設立協定３条３項），附属書２の
「紛争解決に係る規則及び手続に関する了解」において，概要として次の
ような内容の紛争解決手続（以下「ＷＴＯ紛争解決手続」という。）を定
めている。（甲３４，乙１３，乙３６，乙３８，乙４４，弁論の全趣旨）
(ア)ＷＴＯ紛争解決手続では，紛争当事者にとって相互に受け入れるこ
とが可能であり，かつ，対象協定に適合する解決が明らかに優先される
べきであるとされており，相互に合意する解決が得られない場合には，
ＷＴＯ紛争解決手続の第一の目的は，通常，関係する措置がいずれかの
対象協定に適合しないと認められるときに当該措置の撤回を確保するこ
とであるとされている（３条７項）。また，問題となっている措置が対
象協定に適合しないと判断される場合，「当該措置を直ちに撤回するこ
とが実行可能でない場合に限り，かつ，対象協定に適合しない措置を撤
回するまでの間の一時的な措置としてのみ，」代償に関する規定を適用
すべきであるとされている（３条７項）。
(イ)ＷＴＯ紛争解決手続において，ある加盟国が，他の加盟国が協定に
違反していることを理由として違反申立てをするに当たっては，まず，
その紛争の相手国に対して協議を要請し，相手国と協議を行うものとさ
れている（４条１項ないし６項）。
なお，ＷＴＯ紛争解決手続においては，その自動性や予測可能性が高
まった結果，ＧＡＴＴの紛争解決手続よりも，紛争当事国間の協議によ
って解決する紛争が増えたとされている。
(ウ)紛争当事国間で協議が整わず，紛争を解決することができない場合
には，紛争解決機関による小委員会（パネル）の設置を要請することが
できる（４条７項。相手国が協議の要請に回答しない場合について４条
３項）。
小委員会（パネル）では，独立性等が確保される３名の委員が，事実
の認定，協定の適用について判断をして，紛争当事国，加盟国及び紛争
解決機関に報告するものとされているが，パネルが紛争当事国に対して
和解を促すことが奨励されており，そのための特別な仕組みも設けられ
ている。
(エ)紛争当事国は，小委員会（パネル）の報告中の法的事項に関して，
上級委員会に対し申立てをすることができる。
上級委員会は７人の専門家によって構成され，そのうちの３人で構成
される部会が審理を担当し，小委員会の報告の法的認定を支持し，修正
し又は取り消す旨の報告をする。
(オ)小委員会又は上級委員会の報告が紛争解決機関によって採択され
た場合には，被申立国は採択された報告を実施する義務を負う。
(カ)被申立国が採択された報告を実施しない場合，申立てを行った加盟
国は，代償交渉を行うことになるが，代償交渉についての合意が成立し
なかった場合，紛争解決機関の承認を得て，相手方加盟国に対し対象協
定に基づく譲許その他の義務の履行を停止することができる。
(4)ＷＴＯ農業協定４条２項に係る条約の直接適用可能性の主観的基準につ
いて
ア前提
本件で問題となるＷＴＯ農業協定４条２項の我が国における直接適用可
能性の有無については，まず，主観的基準について，我が国が，同項につ
き，我が国で直接適用可能性を有するものとしてＷＴＯ協定を締結してい
るかについて検討する。
イ締約国の間でＷＴＯ協定ないしＷＴＯ協定４条２項が直接適用可能性を
有するものとして締結されているか否か
(ア)まず，前記(3)で認定したＷＴＯ協定の内容等によれば，そもそも
ＷＴＯ協定は，加盟国間の国際貿易関係を規律し，多角的貿易体制の基
礎を成す基本原則を維持するとともに同体制の基本目的を達成するもの
として位置付けられており，ＷＴＯ協定自体は，その基本的な性格とし
て，国家と私人との間の権利義務を規定することを直接的な目的とした
条約であるとは認められない。
(イ)また，ＷＴＯ設立協定には，締約国の国内における直接適用可能性
を否定した条項は存在しないものの，直接適用を否定した条項が存在し
ないことをもって直ちに直接適用可能性を前提として締結されていると
認めることはできないし，むしろ，前記(3)エ(ウ)のとおり，ＧＡＴＳに
は直接適用可能性を認めるかのような個別の規定が存在するのに対し，
ＷＴＯ設立協定自体には，ＷＴＯ協定について，当然に加盟国の国内に
おける直接適用可能性を認めるかのような条項は存在しないことに加え，
前記(3)ウ(エ)のとおり，ＷＴＯ設立協定１６条４項が，加盟国は，自国
の法令及び行政上の手続を附属書の協定に定める義務に適合したものと
することを確保することを定めていることからすると，締約国の間で，
ＷＴＯ協定が加盟国の国内において当然に直接適用可能性を有するもの
として締結されたものではないことがうかがわれる。
(ウ)さらに，前記(3)オのとおり，ＷＴＯ協定では，信頼性の高い，包
括的な紛争解決手続であるＷＴＯ紛争解決手続が整備されているところ，
ＷＴＯ協定において紛争解決制度が整備されていること自体，ＷＴＯ協
定が加盟国の国内で直接適用されることを当然の前提とはしていないこ
とをうかがわせるものといえる。
また，ＷＴＯ協定における紛争解決手続の内容をみても，紛争当事者
（加盟国）相互にとって受け入れることが可能であり，かつ，対象協定
に適合する解決が明らかに優先されるべきであるとされていること，Ｗ
ＴＯ紛争解決手続において，ある加盟国が，他の加盟国が協定に違反し
ていることを理由として違反申立てをするに当たっては，その紛争の相
手国に対して協議を要請するものとされており，協議によって紛争が解
決されない場合に初めて小委員会（パネル）の設置を要請できるとされ
ていることなどからすると，ＷＴＯ協定における紛争解決手続において
は，加盟国相互間による協議（合意）による解決が優先されているもの
と解される。また，上記のような協議（合意）による解決が得られない
場合でも，ＷＴＯの紛争解決制度の目的は，「通常，関係する措置がい
ずれかの対象協定に適合しないと認められるときに当該措置の撤回を確
保することである」とされていることや，問題となっている措置が対象
協定に適合しないと判断される場合，「当該措置を直ちに撤回すること
が実行可能でない場合に限り，かつ，対象協定に適合しない措置を撤回
するまでの間の一時的な措置としてのみ，」代償に関する規定を適用す
べきとされていること，「最後の解決手段」として，「紛争解決機関の
承認を得て，他の加盟国に対し対象協定に基づく譲許その他の義務の履
行を差別的に停止することができる」とされていることからすると，Ｗ
ＴＯ紛争解決手続は，加盟国による対象協定に適合しない措置の撤回の
確保に向けられているものと解される。
このように，ＷＴＯ協定を巡る紛争については，第一次的には加盟国
間の協議や交渉によって解決が図られることが予定されており，ＷＴＯ
紛争解決手続による最終的な救済も，加盟国による対象協定に適合しな
い措置の撤回によって図られることが前提となっているものと解される。
しかるに，仮にＷＴＯ協定が加盟国の国内で当然に直接適用可能なも
のであるとすると，上記のような協議や交渉による解決の手段を結果的
に否定するという事態が生じかねず，上述したＷＴＯ紛争解決手続の内
容からすると，ＷＴＯ協定は，締約国の間において加盟国の国内で当然
に直接適用可能であることを前提として締結されたものではないことが
うかがわれる。
もとより，原告が指摘するように，ＷＴＯ協定の加盟国の国内におい
てＷＴＯ協定の直接適用可能性が有るものとされれば，私人において，
ＷＴＯ協定自体に基づいて国内裁判所に訴えを提起し，あるいは，ＷＴ
Ｏ協定違反を主張して国内裁判所の判断を求めることが可能となるため，
ＷＴＯ協定の国内的実施について私人による監視をすることが期待でき
るということになり，ＷＴＯ協定の定める義務が履行される実効性がよ
り高まるということはできるものの（甲１７の８０頁以下，甲３４の７
頁以下），そもそも，ＷＴＯ協定の定める義務履行の実効性が高まると
いうこと自体から直ちに，締約国が直接適用可能性があることを前提と
してＷＴＯ協定を締結していたと推認することはできないというべきで
あるし，一方で，前記(3)オのとおり，ＷＴＯ協定には実効性の高い紛争
解決手続が設けられているところ，ＷＴＯ協定の国内における直接適用
可能性を認めた場合には，他国との協議や交渉による解決の途が閉ざさ
れる可能性があることからすると，ＷＴＯ協定の締約国が国内における
直接適用によってＷＴＯ協定の実効性を高めることを当然の前提として
ＷＴＯ協定を締結したとまで認めることはできず，結局のところ，原告
が主張するＷＴＯ協定の義務履行の実効性の向上自体は，ＷＴＯ協定が
加盟国の国内で当然に直接適用可能であることを前提として締結された
ことを直ちに基礎付けるものではないというべきである。
(エ)加えて，証拠（甲１５の１２６頁，甲１７の８９頁，乙４５の３２
頁以下）及び弁論の全趣旨によれば，ＷＴＯ協定の主要条約締結国（Ｗ
ＴＯの主要加盟国）である米国では，条約は，憲法，制定法とともに，
「国の最高法規」としての国内的効力が与えられるとともに，連邦の法
律と同等の効力を持つことが判例上確立しているとされているものの，
ＷＴＯ協定を締結した際に制定したウルグアイ・ラウンド協定法（Urguay
RoundAgreementAct）において，ＷＴＯ協定の直接適用可能性を否定し
ており，結局，米国は，当然に直接適用可能性があるものとしてＷＴＯ
協定を締結してはいないものと認めることができる。
また，証拠（甲１７の９０頁以下，乙２６の２６５頁，乙２８の訳文
１０頁以下，乙２９の９２頁）及び弁論の全趣旨によれば，ＷＴＯ協定
締結に関するＥＵの理事会決定９４／８００の前文では，「附属書を含
め，世界貿易機関設立協定は本来的に共同体又は加盟国の裁判所におい
て直接に援用され得ない」とされており（甲１７の９４頁，乙２６の２
６５頁，乙２８の訳文１１頁），ＥＵでＷＴＯ協定が直接効果（直接適
用可能性）を持つかが争われた１９９９年のポルトガル対理事会事件
（PortugueseRepublicvCounciloftheEuropeanUnion,C-149/96）
において，欧州司法裁判所は，①ＷＴＯ協定が１９４７年のＧＡＴＴ
と同様に依然として「相互かつ互恵的な取決めを締結する」ことを目的
とする交渉原則に基礎を置いていること（パラ４２），②ＷＴＯ紛争
解決手続も交渉による解決の余地を残していること，③ＥＵの主要な
貿易相手国がＷＴＯ協定の直接適用可能性を否定していること（パラ４
３）等を理由として，「共同体法がＷＴＯルールに適合するよう確保す
る役割が，共同体の司法権に直接委ねられるのを受け容れるならば，共
同体の立法機関又は執行機関は，共同体の貿易相手国の立法機関又は執
行機関が享受してきた裁量権を行使する機会を奪われることになる。」
（パラ４６）と判示し，ＷＴＯ協定の直接効果（直接適用可能性）を否
定したものと認めることができる。
このように，ＷＴＯの主要加盟国である米国及びＥＵでは，ＷＴＯ協
定の締結当初から，ＷＴＯ協定が国内（域内）において当然に直接適用
可能性があるものとは取り扱われていないことからすると，少なくとも，
締約国の間で，ＷＴＯ協定が加盟国の国内において直接適用可能性があ
ることを当然の前提として締結されたわけではないことがうかがわれる。
(オ)ＷＴＯ農業協定４条２項についてみても，同項は，前記(3)エ(イ)
のとおり，農産品の輸入に際して執られる通常の関税以外の措置を原則
として全て通常の関税に転換するという趣旨の関税に関する国家間の合
意に係る条項である。
この点，そもそも関税とは，輸入貨物に課し，原則としてその貨物を
輸入する者から徴税する租税であり，財政収入を主要な目的として課さ
れる財政関税と，国内産業の保護を主要な目的として課される保護関税
とがあるところ，我が国を含め先進国の関税は，一般には保護関税であ
るとされている（乙７の６７４頁，乙８の１２頁）。そして，このよう
な国内産業の保護を目的とする関税の性格に加え，関税を，いかなる品
目につき，いかなる範囲で課するかという点に関しては，関係国も多大
な利害関係を有しており，国家間の交渉を経た上で決せられるべき性質
のものであることからすると，関税が関税について合意された条約の条
項に適合するかどうかに関する紛争については，本来的に国家間におい
て解決すべきものであり，国家と私人との間で解決するという性格のも
のではないと考えられ，そうすると，関税について定めるＷＴＯ農業協
定４条２項は，他のＷＴＯ協定の条項と同様，基本的には加盟国の国内
における直接適用可能性を認めることを前提として締結されたものでは
ないと考えるのが自然である（関税に関する規定であっても，例えば譲
許表等の規定について，それぞれの締約国において国内での直接適用可
能性を認めるということは，別の問題である。）。
また，ＷＴＯ農業協定４条２項は，「加盟国は」と規定していること
からすると，通常の解釈によれば，同項は，加盟国に向けた規範として，
加盟国に対し，農産品貿易に係る国際的な規律を強化する目的の下，締
約国に対して特例措置を適用したものを除き通常の関税以外の国境措置
を包括的に関税化する国際法上の義務を負わせることを規定するものと
解するのが自然である（乙１３の１１５頁）。
この点，原告は，ＷＴＯ農業協定４条２項は，ＧＡＴＴ時代になし得
なかった農業分野での完全関税化を実現したものであり，ＷＴＯ農業協
定の要というべき条項であり，ＷＴＯ農業協定の中でも，特に各国の遵
守が求められる規定という位置付けがされており，とりわけ，同項の（注）
で列挙された，最低輸入価格制度，可変課徴金といった個別の制度は，
ＷＴＯ農業協定締結時にこれを採用する国が存在したため，各個別の制
度を厳に禁止する趣旨で，わざわざ個別に制度を列挙して掲名したもの
であるとして，加盟国の国内において直接適用可能性が認められると主
張する。しかしながら，原告が主張する点を考慮しても，関税が条約の
条項に適合するかどうかという紛争が本来的に国家間で解決されるべき
ものであるということが左右されるものではなく，同項が加盟国の国内
において直接適用可能性を有することを前提としてＷＴＯ協定が締結さ
れたものと認めることはできない。
そうすると，ＷＴＯ農業協定４条２項の性格やその規定内容をみても，
同項が加盟国の国内において当然に直接適用可能性を有するものとして
ＷＴＯ協定が締結されたとは認められない。
(カ)以上のとおり，①ａＷＴＯ協定自体は，その基本的な性格として，
国家と私人との間の権利義務を規定することを直接的な目的としている
とは認められないこと，ｂＷＴＯ設立協定自体には，ＷＴＯ協定につ
いて，当然に加盟国の国内における直接適用可能性を認めるかのような
条項は存在せず，一方で，ＷＴＯ設立協定１６条４項が，加盟国におい
て，自国の法令及び行政上の手続をＷＴＯ協定に適合したものにするよ
うに定めていること，ｃＷＴＯ協定では，信頼性の高い，包括的な紛
争解決手続であるＷＴＯ紛争解決手続が整備されており，その内容も，
加盟国相互間による協議（合意）による解決が優先されるものとなって
いること，ｄＷＴＯの主要加盟国ではＷＴＯ協定には国内（域内）に
おける直接適用可能性がないものとして取り扱われていることなどから
すると，ＷＴＯ協定自体について，ＷＴＯ協定が条約締結国の国内にお
いて当然に直接適用可能性を有するものとして締結されたものとは認め
られず，また，②ＷＴＯ農業協定４条２項自体についても，これが国
内産業の保護を目的とする関税について規定するものであり，当然に加
盟国の国内において直接適用されるというような規定内容になっていな
いことからすると，ＷＴＯ農業協定４条２項につき，加盟国の国内にお
いて当然に直接適用可能性を有するものとしてＷＴＯ協定は締結された
ものではないと認めるのが相当である。
ただ一方で，ＷＴＯ農業協定４条２項について，それが加盟国の国内
において直接適用可能性を有するものとして取り扱われることが否定さ
れているとも解されないから，ＷＴＯ農業協定４条２項が我が国におい
て直接適用可能性を有するか否かについては，我が国が同項につき直接
適用可能性を有するものとしてＷＴＯ協定を締結したか否かを検討する
必要がある。
ウ我が国がＷＴＯ農業協定４条２項につき我が国で直接適用可能性を有す
るものとしてＷＴＯ協定を締結したか
(ア)証拠（乙４７）及び弁論の全趣旨によれば，我が国においては，条
約の締結に当たり，一般的には，当該条約上の義務を国内的に実施し得
る体制が整っていることを締結の前提としており，そのために国内立法
措置が必要であれば，このような措置を執った上で条約を締結している
ものと認めることができる。
そうすると，条約を締結するに当たり，当該条約上の義務を実施する
ための国内立法措置が執られている場合には，一般的に，我が国におい
て，当該義務につき直接適用することは想定されていないというべきで
ある。
(イ)しかるに，証拠（甲２０，乙１３の１１０頁，乙４８）及び弁論の
全趣旨によれば，我が国がＷＴＯ協定を締結するに当たっては，ＷＴＯ
協定を国内的に実施するための国内措置を執ることが必要とされ，ＷＴ
Ｏ農業協定４条２項が関係する関税化については，その実施のため，関
税定率法等の改正，加工原料乳生産者補給金等暫定措置法の改正，主要
食糧の需給，価格安定法の制定等の立法措置が執られているものと認め
られる一方，同項の直接適用可能性の有無について，国会において説明
や議論が行われたと認めるべき証拠はない。
(ウ)そうすると，我が国は，ＷＴＯ協定を締結するに際し，ＷＴＯ農業
協定４条２項が直接適用可能性を有することを前提とした対応を行って
おらず，同項については，専ら関係する国内法の整備等によって間接的
にこれを適用することが予定されていたものと解されるから，我が国は，
同項について，直接適用可能性を有しないことを前提としてＷＴＯ協定
を締結したものと認めるのが相当である。
なお，ＷＴＯ協定の附属書１Ａに含まれる１９９４年のＧＡＴＴの譲
許表に関する規定（甲２，甲１９，乙１０の２）は我が国において直接
適用可能性が認められるものとされているところ（基本通達３－２。甲
２０，甲２１），証拠（乙４９）及び弁論の全趣旨によれば，この譲許
表については，ＷＴＯ農業協定４条２項とは異なり，ＷＴＯ協定を締結
する以前の段階で，国会において，直接適用可能性を有することを前提
とした説明がされていたものと認められ，また，譲許法の定める譲許税
率は，ＷＴＯ農業協定４条２項に比べ，その内容が明確であり，直接適
用可能性を認めた場合における適用要件や効果も明確に定まるものであ
ることからすると，我が国は，ＷＴＯ農業協定４条２項とは異なり，上
記の譲許表については我が国における直接適用可能性があるものとして
締結したものと解するのが相当である。
(エ)これに対し，証拠（甲３１，甲３２）及び弁論の全趣旨によれば，
財務省関税課長は，平成２６年８月５日に開かれた関税・外国為替等審
議会関税分科会企画部会において，経済連携協定と関税関係法令との関
係について，関税法３条の規定に基づいて，輸入貨物には原則として関
税法，関税定率法，その他の関税に関する法律により関税を課するとい
うことになっているが，一方で，同条ただし書の規定に基づいて，経済
連携協定等といった条約中に関税についての特別の規定があるときは，
これら条約中の規定を直接適用して関税を課すこととされている旨発言
しており，また，財務省ホームページにおいて，関税法３条ただし書に
関する質問に対して，「ＷＴＯ協定等の条約において輸入者等の権利義
務及び関税率適用のための課税要件が明確であり，国内法の規定を整備
することなくその適用が可能なものについては，関税法第３条ただし書
により条約の規定を適用されることとされております。したがいまして，
この場合の条約の規定については，同時に国内法たる性質を持つもので
あると解されます。」と回答しているものと認められるところ，原告は，
上記の財務省関税課長の発言や財務省ホームページの記載を根拠として，
ＷＴＯ農業協定４条２項が我が国で直接適用可能性を有していると主張
している。
しかしながら，前記(1)エで説示したとおり，関税法３条ただし書は，
直接適用可能性を有する条約について，国内で適用されるということを
注意的に示したものであり，上記の財務省関税課長の発言も財務省ホー
ムページの記載も，直接適用可能性が認められる条約については，関税
法３条ただし書によって我が国において適用が認められるという上記の
考え方や，あるいは，前記(ウ)で説示したとおり，現にＷＴＯ協定の一
部である１９９４年のＧＡＴＴの譲許表に関する規定が我が国において
直接適用されるということなどを前提としたものと解するのが相当であ
り，ＷＴＯ協定の全ての条項が当然に関税法３条ただし書により我が国
で直接適用されるとしたものと解することはできないから，上記の財務
省関税課長の発言及び財務省ホームページの記載は，我が国がＷＴＯ農
業協定４条２項につき国内における直接適用可能性があることを前提と
してＷＴＯ協定を締結したことの根拠となるものとはいえない。
(オ)また，証拠（甲２８）及び弁論の全趣旨によれば，財務省関税局（以
下「関税局」という。）は，「ＷＴＯ農業協定第４条（市場アクセス）
は裁判規範性があります」とメールで回答したことがあるものと認めら
れるところ，原告は，上記の回答は，我が国がＷＴＯ協定の我が国にお
ける直接適用可能性を認めたものであると主張する。
しかしながら，証拠（乙５２）及び弁論の全趣旨によれば，上記回答
は，財務省ホームページにおける「関税局・各関税へのご意見・ご要望
の受付」というサイトに寄せられた質問に対するものであるところ，こ
のサイトを通じた関税局の回答は，税関ホームページの掲載内容の更な
る充実や使い易さの利便性の向上を図るとともに，一般国民の税関行政
及び関税制度に関する理解と協力を求めることを目的として，行政サー
ビスの一環，あるいは，税務行政に関する広報サービスとして，財務省
関税局総務課広報係が，関税局及び各税関を窓口として，一般国民から
の関税局及び各税関に対する意見，要望及び質問等を受け付け，これら
に対してメールで回答を行っているというものにすぎず，上記ホームペ
ージには「免責事項」として「当ホームページに掲載されている情報の
正確性については万全を期しておりますが，財務省は利用者が当ホーム
ページの情報を用いて行う一切の行為について，何ら責任を負うもので
はありません。」との注意書きが置かれているものと認められるほか，
国際約束の解釈に関する事務は外務省の所掌とされていること（外務省
設置法４条５号）などからすると，関税局又は各税関が独自に行った上
記回答をもって，我が国の公式見解と解することはできず，ＷＴＯ農業
協定４条の我が国における直接適用可能性を肯定する根拠とするのは相
当ではないというべきである。
(カ)さらに，証拠（甲３０）及び弁論の全趣旨によれば，在ジュネーブ
国際機関日本政府代表部は，韓国政府からの質問に対して１９９６年（平
成８年）７月２９日に回答文書（甲３０）を提出しており，原告の訳文
によると，韓国政府から，①「国内法規に関連の規定がない場合，Ｗ
ＴＯ協定は適用されるか。」，②「現行の国内法の規定がＷＴＯ協定
に適合しない場合，ＷＴＯ条約の規定は適用されるか。」という質問が
されたのに対し，我が国において，①「ＷＴＯ条約を実施するために
必要な国内法の改定は行われている。」「関税法が，ＷＴＯ協定の規定
が直接適用可能であることを確認している。」，②「もし国内法とＷ
ＴＯ協定に矛盾があれば，ＷＴＯ協定が国内法に優先する。」と回答し
ているものと認められるところ，原告は，上記の回答は，我が国がＷＴ
Ｏ協定の我が国における直接適用可能性を認めたものであると主張する。
しかしながら，上記の回答について，被告は，ＷＴＯ協定が直接適用
可能性を有しているのであれば，関税法３条ただし書により，我が国に
おいて法律に優先して適用されるということを示しているだけで，ＷＴ
Ｏ協定が我が国において当然に直接適用可能性を有することを示すもの
ではないと主張しており，上記の回答のうちの①については，必ずしも
ＷＴＯ協定の全ての条項が直接適用可能性を有するということを前提と
したものではなく，直接適用可能性のある条項を前提とした回答である
と解することができるし，②についても，同様に，直接適用可能性があ
る条項を前提としたものと解することができることからすると，上記の
回答をもって直ちに，我が国がＷＴＯ農業協定４条２項が直接適用され
ることを前提として同項を含むＷＴＯ協定を締結したとまでは認められ
ないというべきである。
(キ)その他，原告は，我が国において，憲法９８条２項や前文が国際協
調主義を定め，条約が法律に優先するという公定解釈が存在するほか，
関税法３条ただし書により，関税に関する事項について直接適用可能性
を積極的に認めていこうとする国内法制を採っているとして，我が国が
ＷＴＯ農業協定４条２項の直接適用可能性を排除する意思を有していな
いなどと主張するが，前記(1)イで説示したとおり，一般的に条約が国内
法に優位すると解されていることは，当該条約に直接適用可能性が認め
られることと論理的関連性はないというべきであるし，また，原告が言
及する関税法３条ただし書が直接適用可能性が認められる条約の規定は
直接適用するということを注意的に定めた規定（確認規定）にすぎない
ことは前記(1)エで説示したとおりであるから，原告の主張する憲法に係
る公定解釈や関税法３条ただし書の存在は，直ちに我が国がＷＴＯ農業
協定４条２項につき国内において直接適用可能性を有するものとしてＷ
ＴＯ協定を締結したという根拠となるものとはいえない。
また，原告は，我が国が，外国政府の施策や措置を評価する基準とし
てＷＴＯ協定や経済連携協定等の国際的に合意されたルールを用いると
いう立場に立っているとして（甲２３，甲２５の１１頁），これもＷＴ
Ｏ農業協定４条２項の直接適用可能性を認めるべき根拠として主張する
が，そもそも，我が国において，ＷＴＯ協定４条２項につき国内におけ
る直接適用可能性がないものとしてＷＴＯ協定を締結したとしても，我
が国がＷＴＯ農業協定４条２項を遵守する意思がないことを意味するも
のではないことは明らかであり，我が国が原告の主張するような立場に
立っているとしても，そのことをもって，我が国がＷＴＯ農業協定４条
２項の国内における直接適用可能性を認めてＷＴＯ協定を締結したと認
めることはできない。
エ小括
以上によれば，我が国は，ＷＴＯ協定を締結するに際し，ＷＴＯ農業協
定４条２項が直接適用可能性を有することを前提としていたとは認めら
れないから，条約の直接適用可能性の有無についての主観的基準からする
と，ＷＴＯ農業協定４条２項は，我が国における直接適用可能性はないも
のと認めるのが相当である。
したがって，ＷＴＯ農業協定４条２項の直接適用可能性が認められるこ
とを前提として，同項に違反する本件差額関税制度が憲法９８条２項によ
り無効になるという原告の主張は，その前提を誤るものであって採用する
ことができない。
２本件各更正処分等の適法性
(1)本件各更正処分の適法性
本件各輸入（納税）申告の概要等は，前提事実(3)のとおりであり，原告が
実質的な輸入者としてＰ２から輸入した冷凍豚部分肉に係る課税価格は，別
表の⑪「真正関税課税標準額（円）」欄記載のとおりである。そして，本件
差額関税制度がＷＴＯ農業協定４条２項に違反するものとして憲法９８条２
項により無効とならないことは，前記１で説示したとおりであり，前提事実
(1)の本件差額関税制度の概要等（別紙５「本件差額関税制度の概要等」の第
２の１(2)ウ）のとおりの本件差額関税制度によれば，本件各輸入貨物に係る
関税額は，別表の⑬「更正後関税額（円）」欄記載のとおりとなる（関税法
１３条の４及び国税通則法１１９条１項の規定により１００円未満の端数を
切り捨てた金額）。
そして，本件各更正処分（前提事実(5)）によって原告に課された本件各輸
入貨物に係る関税額は，上記の関税額と一致するから，本件各更正処分は適
法なものと認めることができる。
(2)本件各賦課決定処分の適法性
ア上記(1)のとおり，本件各更正処分はいずれも適法であるところ，原告は
本件各輸入貨物に係る関税について，納付すべき税額を過少に申告してい
たものであり，納付すべき税額を過少に申告していたことについて，関税
法１２条の２第３項に規定する正当な理由を認めることはできない。
イ関税に係る過少申告加算税の税率は，原則としては更正によって増加し
た関税額（納付すべき額）の１０％であるが（関税法１２条の２第１項），
増差税額が過大である場合には，一定額を超える部分について，更に５％
加重される。具体的には，増差税額が当初申告税額又は５０万円のいずれ
か多い金額を超える場合には，当該超える部分の５％に相当する金額が加
重される（同条２項）。
本件各輸入（納税）申告は，いずれも増差税額が当初申告税額及び５０
万円を超えることから，これらのうちの多い金額の超える部分の５％に相
当する金額が加重されることとなり，本件各更正処分により新たに納付す
べきこととなった関税額を基準として過少申告加算税額を計算すると，別
表の⑱「加算税合計額（円）」欄記載のとおりとなる。
ウそして，本件各賦課決定処分（前提事実(5)）によって原告に課された過
少申告加算税の額は，上記イの過少申告加算税の額と一致するから，本件
各賦課決定処分は適法なものと認めることができる。
３結論
以上によれば，本件各更正処分等の取消し又は無効確認を求める原告の請求
はいずれも理由がないから，これらを棄却することとし，主文のとおり判決す
る。
東京地方裁判所民事第２部
裁判長裁判官増田稔
裁判官齊藤充洋
裁判官池本拓馬
（別紙４）
関係法令等の定め
１関税法
(1)関税法３条は，その本文において，輸入貨物には，関税法及び関税定率法そ
の他関税に関する法律により，関税を課する旨，そのただし書において，条約
中に関税についての特別の規定があるときは，当該規定による旨，それぞれ定
めている。
(2)関税法６条は，関税は，この法律又は関税定率法その他関税に関する法律に
別段の規定がある場合を除く外，貨物を輸入する者が，これを納める義務があ
る旨定めている。
(3)関税法６条の２第１項１号は，関税額の確定については同項２号に掲げる関
税以外の関税は，納付すべき税額又は当該税額がないことが納税義務者のする
申告により確定することを原則とし，その申告がない場合又はその申告に係る
税額の計算が関税に関する法律の規定に従っていなかった場合その他当該税額
が税関長の調査したところと異なる場合に限り，税関長の処分により確定する
方式（以下「申告納税方式」という。）が適用される旨定めている。
(4)関税法７条は，その１項において，申告納税方式が適用される貨物を輸入し
ようとする者は，税関長に対し，当該貨物に係る関税の納付に関する申告をし
なければならない旨，その２項において，同条１項の申告は，政令で定めると
ころにより，同法６７条（輸出又は輸入の許可）の規定に基づく輸入申告書に，
同条の規定により記載すべきこととされている当該貨物に係る課税標準その他
の事項のほか，その税額その他必要な事項を記載して，これを税関長に提出す
ることによって行なうものとする旨定めている。
(5)関税法７条の１６は，その１項において，税関長は，納税申告があった場合
において，その申告に係る税額等の計算が関税に関する法律の規定に従ってい
なかったとき，その他当該税額等がその調査したところと異なるときは，その
調査により，当該申告に係る税額等を更正する旨定めている。
(6)関税法１２条は，その１項本文において，納税義務者が法定納期限までに関
税（附帯税を除く。以下同じ。）を完納しない場合又は同法１３条の２（過大
な払戻し等に係る関税額の徴収）の規定により過大に払戻し若しくは還付を受
けた関税額を徴収される場合には，当該納税義務者は，その未納又は徴収に係
る関税額に対し，法定納期限（当該過大に払戻し又は還付を受けた関税につい
ては，その払戻し又は還付を受けた日）の翌日から当該関税額を納付する日ま
での日数に応じ，年７．３％の割合を乗じて計算した金額に相当する延滞税を
併せて納付しなければならない旨，同項ただし書において，納期限（当該過大
に払戻し又は還付を受けた関税については，その納税告知に係る納期限）の翌
日から２月を経過する日後の延滞税の額は，その未納に係る関税額に年１４．
６％の割合を乗じて計算した額とする旨，その３項において，延滞税の額の計
算の基礎となる関税額が１万円未満である場合においては，１項の規定を適用
せず，当該関税額に１万円未満の端数がある場合においては，これを切り捨て
て計算する旨，その４項において，延滞税の額が１０００円未満である場合に
おいては，これを徴収せず，当該延滞税の額に１００円未満の端数がある場合
においては，これを切り捨てる旨，それぞれ定めている。
(7)関税法１２条の２は，その１項において，同法７条１項（申告）の規定によ
る申告（以下「当初申告」という。）があった場合において，修正申告又は更
正がされたときは，当該納税義務者に対し，当該修正申告又は更正に基づき同
法９条１項又は２項（申告納税方式による関税等の納付）の規定により納付す
べき税額に１００分の１０の割合を乗じて計算した金額に相当する過少申告加
算税を課する旨，その２項において，前項の場合において，同項に規定する納
付すべき税額（同項の修正申告又は更正前に当該修正申告又は更正に係る関税
について修正申告又は更正がされたときは，その関税に係る累積増差税額を加
算した金額）がその関税に係る当初申告に係る税額に相当する金額と５０万円
とのいずれか多い金額を超えるときは，同項の過少申告加算税の額は，同項の
規定にかかわらず，同項の規定により計算した金額に，当該超える部分に相当
する税額（同項に規定する納付すべき税額が当該超える部分に相当する税額に
満たないときは，当該納付すべき税額）に１００分の５の割合を乗じて計算し
た金額を加算した金額とする旨，その３項において，前二項に規定する納付す
べき税額の計算の基礎となった事実のうちにその修正申告又は更正前の税額の
計算の基礎とされていなかったことについて正当な理由があると認められるも
のがある場合には，前二項に規定する納付すべき税額からその正当な理由があ
ると認められる事実に基づく税額として政令で定めるところにより計算した金
額を控除して，前二項の規定を適用する旨，その５項において，前条３項及び
４項（延滞税）の規定は，過少申告加算税について準用するとし，この場合に
おいて，同条３項中「関税額」とあるのは「税額」と，「第一項」とあるのは
「次条第一項及び第二項」と，同条４項中「千円」とあるのは「五千円」と読
み替えるものとする旨，それぞれ定めている。
(8)関税法１３条の４は，国税通則法１１８条１項及び２項（国税の課税標準の
端数計算）の規定は関税の課税標準の端数計算について，同法１１９条１項及
び３項（国税の確定金額の端数計算）の規定は関税の額の端数計算について，
同法第１２０条１及び２項（還付金等の端数計算）の規定は関税に係る払い戻
し又は還付の額の端数計算について準用する旨定めている。
２関税定率法
(1)関税定率法３条は，関税は，輸入貨物の価格又は数量を課税標準として課す
旨定めている。
(2)関税定率法３条及び別表（関税率表）第１部第２類０２０３（以下，関税率
表の分類番号を表記するに当たり，４桁の番号の場合には，「項」といい，さ
らに，「項」の下位の分類番号である６桁の番号の場合には，「号」と表記す
る。関税暫定措置法においても同様とする。）は，豚肉の関税は，「いのしし
のもの」を除いて，価格を課税標準として税率５％とする旨定めている。
３関税暫定措置法（昭和３５年法律第３６号）
(1)関税暫定措置法（平成１５年４月１日から平成１６年３月３１日までに輸入
されるものは平成１６年法律第１５号による改正前のもの。平成１６年４月１
日から平成１７年３月３１日までに輸入されるものは平成１７年法律第２２号
による改正前のもの。）２条２項及び別表第１の３（暫定関税率表）は，豚肉
の関税について，課税価格が１ｋｇにつき，①従量税適用限度価格（基準輸
入価格から１ｋｇ当たりの従量税額を控除した価格）以下のものについては，
貨物重量を基準として課する税率（従量税），②従量税適用限度価格を超え，
分岐点価格（基準輸入価格を③の税率に１を加えた数で除して得た価格）以下
のものについては，従量税を基準輸入価格と課税価格との差額に引き下げた額
（差額関税），③分岐点価格を超えるものについては，課税価格を基準とし
て課する税率（従価税）という３つの税率を定めているところ，「豚の肉（生
鮮のもの及び冷蔵し又は冷凍したものに限る。）」のうちの「冷凍したもの」
のうちの「その他のもの」のうちの「二その他のもの」（同表０２０３項２
９号２）については，上記①について，１ｋｇにつき４８２円，上記②につい
て，１ｋｇにつき部分肉に係る基準輸入価格と課税価格との差額，上記③につ
いて，４．３％と定めており，同法別表第１の３の２（基準輸入価格表）は，
上記の基準輸入価格を１ｋｇにつき５４６円５３銭と定めている（同表３項１
号）。
(2)関税暫定措置法（平成１５年４月１日から平成１６年３月３１日までに輸入
されるものは平成１６年法律第１５号による改正前のもの。平成１６年４月１
日から平成１７年３月３１日までに輸入されるものは平成１７年法律第２２号
による改正前のもの。）７条の６は，その１項において，平成７年度から平成
１６年度までの各年度において，「豚の肉（生鮮のもの及び冷蔵し又は冷凍し
たものに限る。）」のうちの「冷凍したもの」のうちの「その他のもの」のう
ちの「二その他のもの」（同表０２０３項２９号２）について，次の各号に
掲げる場合に該当する場合には，当該各号に定める期間内に輸入されるものに
課する関税の率は，別表第１の３第０２０３項１２号２の(1)中「同表第三項第
一号」（１ｋｇにつき５４６円５３銭）とあるのは「同表第三項第二号」（１
ｋｇにつき６８１円０８銭）と読み替えて適用する同表に定める税率とする旨
定めている。
ア当該年度の初日から当該年度の第１四半期，第２四半期及び第３四半期に
属する各月の末日までの豚肉等の輸入数量が，当該年度の前年度までの過去
３年度における各年度の初日から同年度の当該各月の属する四半期の末日ま
での豚肉等の輸入数量を合計したものの３分の１に相当する数量に１００分
の１１９を乗じて得た数量としてあらかじめ財務大臣が告示する数量を超え
た場合その超えることとなった月の属する四半期の翌四半期の初日（その
超えることとなった月が６月，９月又は１２月であるときは，当該超えるこ
ととなった月の翌々月の初日。）から当該年度の末日まで。（１号）
イ当該年度中の豚肉等の輸入数量が，当該年度の前年度までの過去３年度に
おける各年度の豚肉等の輸入数量を合計したものの３分の１に相当する数量
に１００分の１１９を乗じて得た数量としてあらかじめ財務大臣が告示する
数量を超えた場合当該年度の翌年度の初日（その超えることとなった月が
３月であるときは，同年度の５月１日。）から同年度の第一四半期の末日ま
で。（２号）
４国税通則法
国税通則法１１９条は，その１項において，国税（自動車重量税，印紙税及び
附帯税を除く。）の確定金額に１００円未満の端数があるとき，又はその全額が
１００円未満であるときは，その端数金額又はその全額を切り捨てる旨定めてい
る。
５ＷＴＯ協定（平成６年条約第１５号）
ＷＴＯ農業協定４条２項は，「加盟国は，次条及び附属書５に別段の定めがあ
る場合を除くほか，通常の関税に転換することが要求された措置その他これに類
するいかなる措置（注）も維持し，とり又は再びとってはならない。」と定め，
その（注）として，「これらの措置には，輸入数量制限（quantitativeimport
restrictions），可変輸入課徴金（variableimportlevies），最低輸入価格（m
inimumimportprices），裁量的輸入許可（discretionaryimportlicensing），
国家貿易企業を通じて維持される非関税措置（non-tariffmeasuresmaintained
throughstate-tradingenterprises），輸出自主規制（voluntaryexportrest
rains）その他これらに類する通常の関税以外の国境措置（特定の国について承認
された１９４７年のガットの規定からの逸脱として維持されているものであるか
ないかを問わない。）が含まれるが，１９９４年のガット又は世界貿易機関協定
附属書１Ａに含まれている他の多角的貿易協定における国際収支に関する規定そ
の他の農業に特定されない一般的な規定に基づいて維持される措置は含まれな
い。」と定めている。
６関税法基本通達（甲２１）
(1)関税法基本通達３－１は，関税法３条ただし書（条約による特別の規定）
に定める「関税についての特別の規定」とは，関税の税率のほか関税の軽減，
免除，払戻しその他関税の賦課及び徴収に関しての国内法の規定に対する特
別の規定をいう旨定めている。
(2)関税基本通達３－２は，関税法３条ただし書に規定する条約に規定された
税率の適用については，次によるとした上，その(1)の第１文において，ＷＴ
Ｏ協定の附属書１Ａの１９９４年の「関税及び貿易に関する一般協定」のＷ
ＴＯ協定に附属する譲許表の第３８表の日本国の譲許表に掲げられている税
率は，関税定率法の別表の税率及び関税暫定措置法の規定に基づく税率より
低い場合に適用される旨定めている。
以上
（別紙５）
本件差額関税制度の概要等
第１我が国における輸入貨物に係る関税の概要
１関税の課税標準及び関税率について
輸入貨物には，関税法及び関税定率法その他関税に関する法律により，関税
を課することとされており，条約中に関税についての特別の規定があるときは，
当該規定によるものとされている（関税法３条）。また，関税は，輸入貨物の
価格又は数量を課税標準として課すこととされ（関税定率法３条），税率につ
いては，関税定率法，関税暫定措置法等により定められている（関税暫定措置
法１条）。
関税は，課税方法の違いにより，従価税と従量税とに分類することができる。
従価税とは，課税物件たる物品の価格を課税標準として課される租税であり，
従量税とは，課税物件たる物品の個数，重量，長さ，容積，面積等の数量を課
税標準として課される租税である。また，関税には，上記のような単純な従価
税や従量税のほかに，従価税と従量税を組み合わせた関税，選択税(一品目につ
いて従価税率と従量税率の２種を定め，そのうちいずれか税額の高い方又は低
い方を課する方式の関税)や複合税(一品目について従量税と従価税とを結合し
た関税。例えば，従量金額に従価金額を加えたものを関税としたり，従量金額
から従価金額を控除したものを関税としたりするものなど。)などもある。
２輸入貨物の課税価格の決定方法について
関税の課税標準である輸入貨物の課税価格の決定方法については，関税定率
法４条から４条の４までに規定されているところ，関税定率法４条１項は，原
則的な課税価格の決定方法を定めており，輸入貨物の課税価格は，原則として
当該輸入貨物に係る輸入取引がされた時に買手により売手に対し又は売手のた
めに，当該輸入貨物につき現実に支払われた又は支払われるべき価格（以下「現
実支払価格」という。）に，その含まれていない限度において，同項各号に掲
げる運賃等の額を加えた価格とする旨定めている。
第２本件差額関税制度の概要
１本件差額関税制度の仕組み
(1)関税関係法規
ア本件差額関税制度とは，我が国に輸入される豚肉に対し，関税暫定措置
法２条２項，別表第１の３（暫定関税率表）及び別表第１の３の２（基準
輸入価格表）によって定められた暫定税率で課される関税の組合せの制度
である。
イ関税定率法３条及び別表（関税率表）第１部第２類０２０３（以下，関
税率表の分類番号を表記するに当たり，４桁の番号の場合には，「項」と
いい，さらに，「項」の下位の分類番号である６桁の番号の場合には，「号」
と表記する。関税暫定措置法においても同様とする。）によれば，豚肉の
関税率は，「いのししのもの」を除いて，輸入価格に対する５％の従価税
とされている。
ウ一方，ＷＴＯ協定の附属書１Ａの一部である１９９４年の「関税及び貿
易に関する一般協定」（以下，「関税及び貿易に関する一般協定」を「Ｇ
ＡＴＴ」という。）では，「各締約国は，他の締約国の通商に対し，この
協定に附属する該当の譲許表の該当の部に定める待遇より不利でない待遇
を許与するものとする。」と規定され（ＧＡＴＴ２条１項（a）），ＧＡＴ
Ｔに附属する譲許表は，ＧＡＴＴと不可分一体のものとされているところ
（ＧＡＴＴ２条７項），関税法３条ただし書は，条約中に関税について特
別の規定があるときは，当該規定によると規定していることから，我が国
における豚肉の関税率は，ＧＡＴＴに附属された譲許表の定める税率を超
えることができないということになる。
エそこで，我が国は，１９９４年のＧＡＴＴを含むＷＴＯ協定の締結に伴
う国内法的措置として，関税暫定措置法別表第１の３の関税率表０２０３
項において，豚肉について，上記の譲許表の定める水準の範囲内で関税定
率法及び譲許表に定める税率に代わる暫定税率を規定しており，これが平
成７年４月から施行されている現行の本件差額関税制度となっている。
(2)関税暫定措置法上の具体的な仕組み
ア本件差額関税制度は，輸入品の価格が一定の価格以下の場合には，豚肉
の重量１ｋｇ当たりの従量税（ただし，課税後の価格が一定の基準輸入価
格を超えるときには，基準輸入価格と輸入価格の差額に引き下げた額）を
課すことにより，国内養豚農家を保護する一方，輸入品の価格が一定の価
格より高いときには，一定率の従価税を課すことにより，輸入品の関税負
担を軽減し，消費者等の利益を図るという関税の組合せの制度である。
イ本件差額関税制度の仕組みについて，輸入品の輸入価格を横軸，関税を
課した課税後の価格を縦軸で表したグラフで図示すると，別紙６「図面目
録」記載①の図のとおりとなる（乙１０の２の２頁）。
この図でいう「枝肉」とは，関税暫定措置法別表第１の３の関税率表０
２０３項１１号及び０２０３項２１号に規定している「枝肉及び半丸枝肉」
のことであり，関税局の通達（平成１３年３月２８日付財関２２５号）に
おける分類例規の一部改正後の分類例規２類０２０３項によると，「原則
として，畜産物の価格安定等に関する法律施行規則別表第１に定める方法
により整形した豚肉をいうものとする。具体的には，と体をはく皮又はは
く毛し，内臓，頭部その他を除去したものを『枝肉』といい，当該「枝肉」
をせきついの中央にそって半体に切断したものを『半丸枝肉』という。」
とされている（乙１１）。
一方，上記の図でいう「部分肉」とは，関税暫定措置法別表第１の３の
関税率表０２０３項１２号，０２０３項１９号，０２０３項２２号及び０
２０３項２９号に規定している「部分肉」のことであり，具体的には，枝
肉から更に分割，整形し部位別に切り分けた肉のことである。
また，「基準輸入価格」とは，関税暫定措置法別表第１の３の２におい
て，豚肉の種類及び輸入期間ごとに定められている価格であり，ウルグア
イ・ラウンド交渉により譲許した従量税を引き下げ，この価格を超える部
分を関税として徴収しないこととして定められたものであり，豚肉の種類
や輸入時期によって定まる固定された価格である。
そして，「分岐点価格」とは，基準輸入価格を従価税の税率に１を加え
た数で除したものをいい，「従量税適用限度価格」とは，基準輸入価格か
ら１ｋｇ当たりの従量税額を控除した価格という。
ウ本件差額関税制度により本件各輸入貨物に適用される関税率
(ア)通常の場合における関税率について
豚肉については，関税暫定措置法２条，別表第１の３及び別表第１の
３の２に基づき，具体的には，課税価格が１ｋｇにつき，①従量税適
用限度価格以下のものについては，貨物重量を基準として課する税率（従
量税），②従量税適用限度価格を超え，分岐点価格以下のものについ
ては，従量税を基準輸入価格と課税価格との差額に引き下げた額（差額
関税），③分岐点価格を超えるものについては，課税価格を基準とし
て課する税率（従価税）という３つの税率が定められている。
そして，本件各輸入貨物である「豚の肉（生鮮のもの及び冷蔵し又は
冷凍したものに限る。）」のうちの「冷凍したもの」のうちの「その他
のもの」のうちの「二その他のもの」（関税暫定措置法２条２項及び
別表第１の３の０２０３項２９号２）については，通常時における基準
輸入価格は１ｋｇにつき５４６円５３銭とされており，税率は次のとお
りとなる。
①従量税適用限度価格（基準輸入価格５４６円５３銭／ｋｇ－従量税
額４８２円／ｋｇ＝６４円５３銭／ｋｇ）以下のもの…従量税（４８
２円／ｋｇ）
②従量税適用限度価格を超え分岐点価格（基準輸入価格５４６円５３
銭／ｋｇ÷（１＋従価税率０．０４３）＝約５２４円／ｋｇ）以下の
もの…基準輸入価格（５４６円５３銭／ｋｇ）－課税価格
③分岐点価格を超えるもの…従価税（４．３％）
(イ)関税の緊急措置がとられた場合の関税率について
ａ豚肉の輸入数量の急増に対応するため，豚肉の輸入数量がある基準
を超えた場合には，関税暫定措置法７条の６に基づく措置がとられ，
基準輸入価格，又は，従量税及び従価税の税率が引き上げられる（以
下，同条１項に基づく措置を「第１項措置」，同条２項に基づく措置
を「第２項措置」，同条３項に基づく措置を「第３項措置」という。）。
ｂ第１項措置は，①年度初日から各月末まで（第３四半期まで）の豚
肉等の輸入数量の累計が，直近３年度の間における，年度初日から当
該各月の属する四半期末までの平均輸入数量の１１９％を超えた場合
又は②年度初日から各月末までの豚肉等の輸入数量の累計が，直近３
年度の平均輸入数量の１１９％を超えた場合，以後，所定の期間中に
行われる輸入に対し，本件各輸入貨物である「豚の肉（生鮮のもの及
び冷蔵し又は冷凍したものに限る。）」のうちの「冷凍したもの」の
うちの「その他のもの」のうちの「二その他のもの」（関税暫定措
置法２条２項及び別表第１の３の０２０３項２９号２）について，基
準輸入価格が１ｋｇにつき６８１円０８銭まで，これに基づいて計算
される分岐点価格が１ｋｇにつき約６５３円（６８１円０８銭／ｋｇ
÷１．０４３＝約６５３円）まで，それぞれ引き上げられる。
要件及び発動期間を整理すると，次の表のとおりとなる。
超える月基準数量発動日終了日
４月直近３年間の４～６月の
平均輸入数量×１１９％
７月１日翌年
３月３１日５月
６月８月１日
７月直近３年間の４～９月の
平均輸入数量×１１９％
１０月１日
８月
９月１１月１日
１０月直近３年間の４～１２月の
平均輸入数量×１１９％
１月１日
１１月
１２月２月１日
１月直近３年度の
平均輸入数量×１１９％
４月１日６月３０日
２月
３月５月１日
ｃ本件各課税処分の対象となった本件輸入（納税）申告の期間におい
ては，別表の③「第１項措置発動期間」欄のとおり，第２項措置及び
第３項措置は発動されなかったが，第１項措置が発動されていた時期
があったところ（乙６の１及び２，弁論の全趣旨），第１項措置が発
動されていた時期の冷凍豚部分肉に係る適用税率は，次のとおりとな
る。
①従量税適用限度価格（６８１円０８銭／ｋｇ－４８２円／ｋｇ＝
１９９円０８銭／ｋｇ）以下のもの…従量税（４８２円／ｋｇ）
②従量税適用限度価格を超え分岐点価格（約６５３円／ｋｇ）以下
のもの…基準輸入価格（６８１円０８銭／ｋｇ）－課税価格
③分岐点価格を超えるもの…従価税（４．３％）
２本件差額関税制度が設けられた経緯
(1)はじめに
豚肉は，夏場は豚が太りにくくなり出荷頭数が減少すること等により価格
が上昇する一方，秋から冬にかけては出荷頭数が増加すること等により価格
が下落することから，年間を通じた価格変動が激しいという特性がある一方
で，国産と輸入品との品質の差が小さい等の特徴がある。
昭和４０年代前半に国内外から豚肉の輸入自由化を求める声が高まる中，
輸入数量制限が撤廃されると，安価な豚肉が大量輸入され，国内養豚の生産
基盤が縮小する懸念があった一方で，消費者に豚肉を安定供給することも期
待された。このため，昭和４６年１０月に豚肉の輸入が自由化された際，安
価な豚肉が大量に輸入されることによる国内需給の混乱を防止するとともに，
国内生産に影響を与えないようにする一方で，高価な豚肉を低関税で輸入す
ることができるようにして，豚肉の安定供給を図ることを目的として，かつ
ての差額関税制度（以下「旧差額関税制度」という。）が設けられた。
しかし，その後，昭和６１年（１９８６年）から開始され，平成６年（１
９９４年）４月１５日に世界貿易機関（以下「ＷＴＯ」という。）加盟の１
２０数か国が調印して妥結したウルグアイ・ラウンド交渉の最終結果を受け
て，必要な制度変更が行われ，現在の本件差額関税制度となった。具体的に
は，従量税適用と従価税適用の分岐となる輸入価格である分岐点価格が譲許
表で定められるとともに，分岐点価格以下のものに課していた関税を従量税
に置き換えて譲許した上で，更に関係国との協議の結果を踏まえて，分岐点
価格を引き下げるとともに，従量税のうち基準輸入価格を超える部分を自主
的に引き下げることとしたものであり，その経緯の詳細は，次のとおりであ
る。
(2)ウルグアイ・ラウンド交渉合意前
ウルグアイ・ラウンド交渉合意前の旧差額関税制度は，別紙６「図面目録」
記載②の図のとおり，輸入価格が分岐点価格以下のもの（上記の図のＡの部
分）は，畜産物の価格安定等に関する法律（平成１４年法律第１２６号によ
る改正前のもの）に基づく豚肉の安定基準価格と安定上位価格の合計額の２
分の１に相当する額として定められる基準輸入価格（部分肉については，は
く皮した枝肉に係る基準輸入価格を０・７５で除して得た額）と輸入価格の
差額が課税され，輸入価格が分岐点価格を超えるもの（上記の図のＢの部分）
は，従価税（５％）が課せられる仕組みとなっていた。また，分岐点価格も
基準輸入価格と連動して毎年度変わり得るものであった（その場合の数式は，
分岐点価格＝基準輸入価格÷（１＋従価税率／１００）の式で求められてい
た。）。（乙１０の２の３頁）
上記の「安定基準価格」と「安定上位価格」は，農林水産省が毎年，豚肉
の生産条件等を考慮し，畜産振興審議会（現食料・農業・農村政策審議会）
の意見を聴いて決定するものであったことから（平成１４年法律第１２６号
による改正前の畜産物の価格安定等に関する法律３条１項。なお，安定基準
価格は，その額を下って指定食肉等の価格が低落することを防止することを
目的として定められ，安定上位価格は，その額を超えて指定食肉等の価格が
騰貴することを防止することを目的として定められる（同条３項）。），当
時の基準輸入価格は，毎年度変わり得るものであった。
旧差額関税制度は，前記のとおり，昭和４６年１０月に創設され，ウルグ
アイ・ラウンド交渉の妥結後の平成７年４月における制度変更まで実施され
ていた。
(3)ウルグアイ・ラウンド交渉による譲許（ステップ１）
豚肉の関税は，ウルグアイ・ラウンド交渉の過程において，まず，別紙６
「図面目録」記載③の図のとおり，輸入価格が分岐点価格以下のもの（上記
の図のＡの部分）については，基準期間（１９８６年から１９８８年まで）
における豚肉の内外価格差（国内と外国における豚肉の価格の差のことをい
う。）の平均値に相当する関税相当量である１ｋｇにつき４２５円（以下の
税率に関する具体的な数値は枝肉に係るものである。）を従量税として課し，
分岐点価格を超えるもの（上記の図のＢの部分）については，５.０％の従価
税を課すこととして，従量税と従価税に置き換えて関税化した上，譲許され
た。分岐点価格は，基準期間における分岐点価格の平均である１ｋｇにつき
５５３円（枝肉ベース）とされた。（乙１０の２の４頁）
このように旧差額関税制度を従量税と従価税に置き換えて関税化したのは，
１９９１年（平成３年）１２月に，その当時のＧＡＴＴ事務局長であったＰ
６がウルグアイ・ラウンド交渉の妥結を目指して示した最終合意文書案（以
下「Ｐ６・ペーパー」という。）において提案された，加盟国において国境
措置を包括的に関税化するという提案内容（乙１３の１０５頁）に基づくも
のであった。このＰ６・ペーパーに示された包括的関税化の考え方に基づき，
加盟国間で具体的な交渉がなされたが，このような交渉過程における加盟国
の合意事項は，関税の具体的な削減率等を定めた加盟国に共通に適用される
基本ルールである「ModalitiesfortheEstablishmentofSpecificBindi
ngCommitmentsundertheReformProgramme:NotebytheChairmanofth
eMarketAccessGroup」（いわゆるモダリティ文書）と呼ばれる合意された
作業用文書に記載されている（乙１０の２の添付資料２，乙１４）。このよ
うな交渉の過程で，加盟国は，農産品の関税化を要請されたが，このモダリ
ティ文書に記載されているとおり，この関税化に当たり，加盟国は，従価税
か従量税かのいずれで譲許してもよいが，実際の内外価格差（国内と外国に
おける実際の価格差のことをいう。）といった客観的な数値を用いるべきで
あるとされていた（乙１０の２の添付資料２）。豚肉についての我が国の上
記ステップにおける譲許は，このような合意にのっとったものであった。ま
た，その際，従量税と従価税との分岐点価格は，１９８６年から１９８８年
の３か年の分岐点価格の平均値として計算上求められた価格であった。（乙
１０の２）
(4)ウルグアイ・ラウンド交渉による譲許（ステップ２）
次に，この関税をウルグアイ・ラウンド交渉過程において，農産品の品目
毎の最低削減率である１５％を削減して譲許水準とすることとされた（１９
９５年度から２０００年度まで段階的に引き下げた。）。このような合意事
項は，前記のモダリティ文書に記載されている。（乙１０の２の添付資料２）
豚肉の場合，この１５％を削減するという合意に基づき，従量税は１ｋｇ
につき４２５円から３６１円（枝肉ベース）に，従価税は５.０％から４.３％
に引き下げることとされた。また，分岐点価格についても，従量税の削減額
と同額の１ｋｇにつき６４円削減し，１ｋｇにつき５５３円から４８９円（枝
肉ベース）に引き下げることとされた（別紙６「図面目録」記載④の図）。
（乙１０の２）
この豚肉についての譲許の内容を含む譲許表は，平成６年（１９９４年）
４月１５日に調印されたウルグアイ・ラウンド最終合意によるＷＴＯ協定の
附属書１Ａの一部となり，その後必要な国内批准手続を経て，同年１２月２
８日付の官報で公告（乙１０の２の添付資料３・同日付け官報）されている。
前記のとおり，この譲許表は，関税法３条ただし書により我が国において直
接効力を有しており，関税の税率における上限を画するものとなっているが，
後記(5)のとおり，関税暫定措置法でこの上限の範囲内で従量税部分の税率が
修正されている（ステップ３）。
(5)ウルグアイ・ラウンド交渉における関係国との協議の結果に基づく自主的
引下げ（ステップ３）
さらに，ウルグアイ･ラウンド交渉における関係国との協議を踏まえて，ウ
ルグアイ・ラウンド交渉で譲許した範囲内で従量税部分を自主的に引き下げ
ることとされた。すなわち，別紙６「図面目録」記載⑤の図のとおり，まず，
分岐点価格について，ステップ２（前記(4)参照）において譲許した１ｋｇに
つき４８９円から３９３円（枝肉ベース）まで更に引き下げることとされた。
このように分岐点価格を引き下げたのは，関係国からの強い要請に応じるも
のであり，平成６年１０月２１日の内閣の閣議決定により決定され，関係国
にその旨通報された（乙１０の２の添付資料４・同日付け閣議決定案。この
閣議決定案は同報告書添付資料５におけるＷＴＯ事務局から加盟国への回付
内容と同内容であり，閣議決定案のまま閣議決定されている。）。このステ
ップにおいて，分岐点価格１ｋｇにつき３９３円（枝肉ベース）及び５２４
円（部分肉ベース）から，逆算して，基準輸入価格４０９円９０銭（枝肉ベ
ース，３９３円／ｋｇ×（１＋4.3／100））及び５４６円５３銭（部分肉ベ
ース，５２４円／ｋｇ×（１＋4.3／100））が計算され，これが，現行の関
税暫定措置法別表第１の３の２の基準輸入価格とされている。
さらに，分岐点価格の前後で課税後の価格が逆転しないように，別紙６「図
面目録」記載⑤の図のとおり，分岐点価格ちょうどで輸入されるものの課税
後の価格１ｋｇにつき４０９円９０銭（枝肉ベース）を基準輸入価格とし，
分岐点価格以下で輸入されるものに課される従量税のうち基準輸入価格を超
える部分は課さない仕組みとされた。
この自主的引下げについては，１９９４年（平成６年）１２月２７日付で，
日本国政府から当時のＧＡＴＴ事務局に通報され，１９９５年（平成７年）
２月１６日付でＷＴＯ事務局から加盟国に回付されている（乙１０の２の添
付資料５）。
以上のとおり，豚肉の旧差額関税制度は，ウルグアイ・ラウンド交渉を経
て，従量税と従価税との組合せによる関税とされ，平成７年４月から施行さ
れている現行の本件差額関税制度となった。
以上
（別紙７）
本件各更正処分等の根拠及び適法性
１原告が納税すべき関税額について
本件各更正処分等の対象となった本件各輸入（納税）申告は，すべて，Ｐ２
製の冷凍豚部分肉（本件各輸入貨物）の輸入に係るものである。
本件各輸入貨物の価格については，Ｐ１が，Ｐ２と交渉して別表の⑥「真正
単価」欄記載の真正単価を決定し，本件各輸入貨物の代金については，上記の
真正単価に別表の⑦「合計重量（ｋｇ）」欄記載の貨物重量を乗じた金額が送
金されていたから，上記の真正単価に上記の貨物重量を乗じた別表の⑪「真正
関税課税標準額（円）」欄記載の価格が関税定率法４条１項にいう現実支払価
格となり，本件各輸入貨物の課税価格ということになる。
上記の真正単価に基づき算出された現実支払価格に基づいて本件各輸入貨物
について関税額を計算すると，別表の⑬「更正後関税額（円）」欄記載のとお
りとなる。なお，税率については，第１項措置の発動期間内か否かで異なるこ
とから，以下，それぞれ具体例を挙げて説明する。
(1)第１項措置の発動期間外（平成１６年４月１日から同年７月３１日までの
間）の輸入（納税）申告のもの
従量税適用限度価格は１ｋｇにつき６４．５３円，基準輸入価格は１ｋｇ
につき５４６．５３円，分岐点価格は１ｋｇにつき５２４円である。
東京税関大井出張所長に対する平成１６年４月１日付け輸入（納税）申告
（申告番号１１４９４７６７９００）を例とすると，次のとおりとなる。
ア真正単価（別表の⑥欄）３００円／ｋｇ
上記金額は，Ｐ２作成の請求書（インボイス）に記載された金額である。
イ関税率（別表の⑫欄）２４６．５３００円／ｋｇ
上記金額は，真正単価１ｋｇにつき３００円と基準輸入価格１ｋｇにつ
き５４６．５３円との差額である。
ウ合計重量（別表の⑦欄）２万７２４５．２８ｋｇ
豚肉の重量である。
エ更正後関税額（別表の⑬欄）６７１万６７００円
上記ウの合計重量に，上記イの関税率を乗じ，関税法１３条の４及び国
税通則法１１９条１項の規定により１００円未満の端数を切り捨てた金額
である。
(2)第１項措置の発動期間（平成１５年８月１日から平成１６年３月３１日ま
での間及び平成１６年８月１日から平成１７年３月３１日までの間）内の輸
入（納税）申告のもの
従量税適用限度価格は１ｋｇにつき１９９．０８円，基準輸入価格は，１
ｋｇにつき６８１．０８円，分岐点価格は１ｋｇにつき６５３．０００９円
である。
東京税関大井出張所長に対する平成１６年１月２８日付け輸入（納税）申
告（申告番号１１４７３５７４０００）を例とすると，次のとおりとなる。
ア真正単価（別表の⑥欄）５８０円／ｋｇ
上記金額は，Ｐ２作成の請求書（インボイス）に記載された金額である。
イ関税率（別表の⑫欄）１０１．０８００円／ｋｇ
上記金額は，真正単価１ｋｇにつき５８０円と基準輸入価格１ｋｇにつ
き６８１．０８円との差額である。
ウ合計重量（別表の⑦欄）２万７０４１．３０ｋｇ
輸入（納税）申告した豚肉の重量である
エ更正後関税額（別表の⑬欄）２７３万３３００円
上記ウの合計重量に，上記イの関税率を乗じ，関税法１３条の４及び国
税通則法１１９条１項の規定により１００円未満の端数を切り捨てた金額
である。
２原告が納付すべき過少申告加算税について
(1)過少申告加算税の税率は，原則としては更正によって増加した関税額（納
付すべき額）の１０％である（関税法１２条の２第１項）が，増差税額が過
大である場合には，一定額を超える部分について，更に５％加重される。具
体的には，増差税額が当初申告税額又は５０万円のいずれか多い金額を超え
る場合には，当該超える部分の５％に相当する金額が加重される（同条２項）。
本件各輸入（納税）申告は，いずれも増差税額が当初申告税額及び５０万
円を超えることから，当該超える部分の５％に相当する金額が加重されるこ
ととなる。
本件各更正処分により新たに納付すべきこととなった関税額を基準に，過
少申告加算税額を計算すると，別表の⑱「加算税合計額（円）」欄記載の金
額となる。
(2)具体的に，東京税関大井出張所長に対する平成１６年４月１日付け輸入
（納税）申告（申告番号１１４９４７６７９００）を例とすると，次のとお
りとなる。
ア加算税１０％（別表の⑮欄）６１万円
上記金額は，関税法１２条の２第１項の規定により，更正処分により原
告が新たに納付すべきこととなった関税額（ただし，同条５項の規定によ
り読み替えて準用する同法１２条３項の規定により１万円未満の端数を切
り捨てた後のもの）に１０％を乗じて計算した金額である。
イ加算税５％（別表の⑰欄）２７万４０００円
上記金額は，関税法１２条の２第２項の規定により，更正処分により原
告が新たに納付すべきこととなった関税額のうち，当初申告税額を超える
部分に相当する金額（別表の⑮欄。ただし，同条５項の規定により読み替
えて準用する同法１２条３項の規定により１万円未満の端数を切り捨てた
後のもの）に５％を乗じて計算した金額である。
ウ加算税合計額（別表の⑱欄）８８万４０００円
上記金額は，上記アの金額と上記イの金額の合計額である。
３本件各更正処分等の適法性
(1)本件各更正処分の適法性
本件各輸入貨物に係る原告の納付すべき関税額は，前記１のとおり算出さ
れるものであり，この金額は，別表の⑬「更正後関税額（円）」欄記載の税
額のとおりであるところ，これらの金額は，いずれも本件各更正処分におけ
る金額と同額であるから，本件各更正処分はいずれも適法である。
(2)本件各賦課決定処分の根拠及び適法性
上記(1)のとおり，本件各更正処分はいずれも適法であるところ，原告は本
件各輸入貨物に係る関税について，納付すべき税額を過少に申告していたも
のであり，納付すべき税額を過少に申告していたことについて，関税法１２
条の２第３項に規定する正当な理由は存しない。
したがって，本件各更正処分に伴って課されるべき過少申告加算税の額は，
前記２のとおり，関税法１２条の２第１項，２項及び５項の規定に基づき，
関税について，本件各更正処分によって新たに納付すべきこととなった税額
にそれぞれ上記規定に定める税率を乗じて算出されるものであり，この金額
は，別表の⑱「加算税合計額（円）」欄記載の税額のとおりであるところ，
これらの金額は，いずれも本件各賦課決定処分における金額と同額であるか
ら，本件各賦課決定処分は，いずれも適法である。
以上
（別紙８）
原告の主張
第１ＷＴＯ農業協定４条２項の直接適用可能性
１直接適用可能性の概念
条約の「直接適用可能性」とは，要するに，「それ以上の措置の必要性なしに
適用され得る」ということを意味する。
２関税法３条ただし書によりＷＴＯ農業協定４条２項は直接適用されること
(1)関税法３条ただし書
我が国は，関税に係る条約の直接適用に関し，国内法によって明確な規定
を設けて，大方針を明確にしている。その国内法とは，関税法３条ただし書
である。具体的には，同条は，「輸入貨物（信書を除く。）には，この法律
及び関税定率法その他関税に関する法律により，関税を課する。ただし，条
約中に関税について特別の規定があるときは，当該規定による。」と規定し
ている。
したがって，条約中に関税について特別の規定があるときは，関税法３条
ただし書により，当該特別の規定が我が国において直接適用されることにな
る。
(2)関税法３条ただし書による譲許表の直接適用
例えば，ＷＴＯ協定には日本国の譲許表（端的にいうと，譲許表記載の水
準を超えないように関税率を定めることに関する対外的約束であり，譲許表
記載の関税率を「譲許税率」という。）が設けられているところ，譲許表は
「税率の所定の水準を超える税率の禁止」を定めるものであるがゆえに，税
率に係る「特別の規定」（関税法３条ただし書）に該当する。
したがって，我が国の法律の定める関税率が譲許税率を超える場合，譲許
税率が関税法３条ただし書によって直接適用されることにより，法律の定め
る関税率のうちの譲許税率を超える部分は無効となる。
(3)ＷＴＯ農業協定４条２項は，関税法３条ただし書の「条約中の関税につい
ての特別の規定」に該当すること
関税法基本通達３－１は，「法３条ただし書≪条約による特別規定」に定
める「関税についての特別の規定」とは，関税の税率のほか関税の軽減，免
除，払い出しその他関税の賦課及び徴収に関しての国内法の規定に対する特
別の規定をいう。」と定めており，関税の税率のほかに，賦課及び徴収を含
めて，すべてにわたる適用があるとしている。
そして，ＷＴＯ農業協定４条２項の内容は，端的にいうと「課税標準及び
税率を同項記載の禁止の制度に該当しないよう定めることの対外的約束」で
あり，「課税標準設定及び税率設定の禁止枠組み」を定めるものであるから，
関税法３条ただし書の「特別の規定」に該当する。
(4)ＷＴＯ協定の関税法３条ただし書による直接適用に関する日本国政府の
見解
ア日本国政府は，これまでに，ＷＴＯ協定に関する直接適用について，公
式な見解を示している。
イまず，日本国政府が示した公式な見解で最も重要なものは，アンチダン
ピング委員会におけるわが国政府の見解Ｇ/ＡＤＰ/Ｑ１/ＪＰＮ/６（甲３
０）であり，これは，在ジュネーブ国際機関日本政府代表部が，１９９６
年７月２９日，韓国が発した質問に対して提出した回答であって，「ＷＴ
Ｏ協定１８条５項および３２条６項に従って行う法令規則の通告」と題す
る文書である。
この文書において，「我が国の関税法は，ＷＴＯ協定の規定は直接適用
可能である（canbedirectlyapplied）と確認している。仮に抵触があ
れば，ＷＴＯ協定が国内法に優越する」との見解を表明している。
ウまた，財務省の関税課長は，関税・外国為替審議会関税分科会企画部会
（平成２６年８月５日）において，関税法３条ただし書について，「同３
条ただし書の規定に基づきまして，経済連携協定等といった条約中に関税
についての特別の規定があるときは，これら条約中の規定を直接適用して
関税を課すこととされてございます。」と述べている。
エ財務省ホームページでは，関税法３条ただし書についての質問に対し，
「ＷＴＯ協定等の条約において輸入者等の権利義務及び関税率適用のため
の課税要件が明確であり，国内法の規定を整備することなくその適用が可
能なものについては，関税法第３条ただし書により条約の規定を適用され
ることとされております。したがいまして，この場合の条約の規定につい
ては，同時に国内法たる性質を持つものであると解されます。」との返答
がされている。
オ以上によれば，ＷＴＯ農業協定４条２項が関税法３条ただし書によって
我が国において直接適用されるという原告の主張は，まさに，日本国政府
が明言して公表している取扱いと全く合致する。
３条約の直接適用可能性の基準（要件）
関税法３条ただし書によって，「条約中の関税についての特別の規定」に該
当すると言っても，直接適用可能性がないような条約の規定がある場合に，そ
れもが直接適用されるわけではない。当然のことながら，直接適用するのにふ
さわしい規定でなければ直接適用することができないからである。
そして，条約の直接適用可能性は，主観的基準と客観的基準から判断する必
要がある。
４条約の直接適用可能性についての主観的基準
(1)直接適用可能性の主観的基準として，条約締結国による私人の権利義務の
創設の意思は必要ではないこと
直接適用可能性が認められるための主観的基準として，条約締結国による
私人の権利義務の創設の意思が必要であるという考え方は，直接適用される
場面をあまりに狭く限定しすぎるという点と個人の権利義務を創設していな
くても直接適用されている条約が現に存在することを説明できないという点
で問題がある。
特に後者については，譲許表による譲許税率を考えれば分かり易い。すな
わち，譲許表とは，譲許表記載の水準を超えないよう関税率を定めることの
対外的約束であって，何らかの個人の権利義務を創設するものではないから，
もし主観的要件として個人の権利義務の創設の意思が必要であるとの立場を
とってしまうと，譲許表は主観的要件を欠き直接適用可能性がないとの結論
が導かれてしまうが，実際には，譲許表については直接適用可能性が認めら
れている。
(2)直接適用可能性の主観的基準として，条約締結国が直接適用することを積
極的に意図したことは必要ではないこと
ア次に，直接適用可能性の主観的基準として，条約締結国が直接適用する
ことを積極的に意図したことは不要である。
イまず，直接適用可能性の主観的基準として，直接適用についての条約締
結国の積極的意図を要求してしまうと，このような積極的意図がない条約
は，直接適用可能性がないということになってしまうところ，例えば，特
に多国間条約については，この条約は直接適用可能であるという積極的な
当事国の意思が条約の中で明示されることはほとんどなく，条約の「準備
作業」を調べてみても，特に多数国間条約の場合は，そのような当事国の
意思が見いだされることはほとんどないし，条約の個々の規定についても，
それが直接適用可能であるという積極的な当事国の意思が出されることは
ほとんどないことから，直接適用可能であるという積極的な当事国の意思
を厳格に要求すると，ほとんどの条約（規定）は直接適用可能ではないこ
とになってしまう。
ウこのような見解に対しては，ＷＴＯ協定の中でも直接適用を義務付けて
いる附属文書がある（ＧＡＴＳなど）という反論が予想されるものの，直
接適用を義務付けることを明示していることと，直接適用可能ではないと
いうこととの間には大きな差がある。すなわち，当事国が条約の直接適用
を排除する否定的な意思を条約の中で明示した場合について，条約の当事
国は，特定の国内的実施の方法を規定し，条約の直接適用可能性を否定す
ることもできる。条約自体が当事国の意思に基づいて成立するのであるか
ら，当事国のこのような意思も尊重される必要があり，そうでなければ，
条約が直接適用されることを望まない国家はそもそも条約を締結しないと
いうことになってしまう。
エ条約の直接適用可能性の主観的基準として，条約締結国が直接適用する
ことを積極的に意図したことが必要であるという立場に立つと，ある国が，
かかる積極的意図が認められない条約について，条約の直接適用，すなわ
ち，条約違反の国内状態について，国内司法機関が是正を行った場合，当
該国の処理は条約の使い方を誤っているとの認定を招くことになってしま
う。
しかしながら，各国の憲法秩序，国内法秩序は多様であり，条約の国内
完全実施をどのように実現するかは，各国の主権の問題である。そして，
条約締結時に，条約の国内完全実施の方法について，直接適用の方法によ
ることを明示的に排除していないのであれば，当然，条約締結国の一つが，
直接適用の方法によって国内完全実施を行うことも，主権の行使方法とし
て許されるべきものである。
したがって，直接適用可能性の主観的基準として，直接適用についての
積極的意図を要求する見解は，結果として，他国の主権行使を不当に制約
することになり，採ることができない。
(3)条約が国内において直接適用可能かを決定するのは国内法であること
ア結局のところ，各国ごとの是正方法（これはすなわち主権の行使である。）
を尊重するためには，「（条約中に直接適用可能性の排除が明示されない限
り）原則として直接適用可能性は認めた上で，各々の国に，直接適用を排
除する国内法制を採用するか否かの選択肢を与える」と解する以外に，整
合性ある解釈論を構成することはできない。
イＷＴＯ協定もそうであるが，二国間協定はいざ知らず，多国間協定の場
においては，締約当事国の関心は，条約が完全に実施されることにだけあ
る。
すなわち，各国ごとに憲法秩序，国内法秩序は異なる，ということが当
然の前提となっているため，条約が国内でどのように実施されるかという
ことについて，締約当事国には関心がないのが通常である。
つまり，条約の直接適用可能性についての主観的基準として，直接適用
についての積極的意思なるものを要求する見解は，現在の多国間条約締結
交渉の実態をそもそも無視した机上の空論という他はない。
(4)直接適用可能性についての主観的要件の総括
前記(3)アで述べたとおり，条約の国内における完全実施の方法について各
国の主権を尊重するには，「（条約中に直接適用可能性の排除が明示されな
い限り）原則として直接適用可能性は認めた上で，各々の国に，直接適用を
排除する国内法制を採用するか否かの選択肢を与える」と解する以外に，各
国それぞれの主権と整合する解釈論を構成することはできない。そして，か
かる解釈論を採用した場合，条約の直接適用可能性の主観的基準は，①条
約締結国の総意として直接適用可能性を排除しているのか否かと，②当該
国が直接適用を排除する国内法制を採用する意思を有するか否かがメルクマ
ールとなる。
すなわち，ある条約が，ある国において，直接適用可能性が認められるた
めの主観的基準を整理して述べれば，条約締結国の総意として，直接適用可
能性を排除していないこと，及び，当該国において，当該条約の直接適用可
能性を排除する国内法制採用の意思がないことの２つとなる。
(5)ＷＴＯ農業協定４条２項について条約締結国の総意として直接適用可能
性を排除していないこと
アＷＴＯ農業協定４条２項につき，直接適用可能性についての主観的基準
のうち，直接適用可能性を排除するという条約締結国の総意はない。
(ア)「関税と貿易に関する一般協定」（以下「ＧＡＴＴ」という。）及
びその発展的解消であるＷＴＯ協定は，第二次世界大戦が各国のブロッ
ク経済の採用によって起こったことの反省として生み出された自由貿易
体制を目指すものであって，ＷＴＯ協定そのものには，これを各国が積
極的に遵守することを奨励こそすれ，抑圧する契機は存在し得ない。
したがって，ＷＴＯ協定そのものは，各国が国内の条約違反状態の是
正を，立法機関，行政機関だけではなく，司法機関によっても行うこと
を奨励こそすれ，排除するものではないところであり，実際，ＷＴＯ協
定内に，国内司法機関による是正を排除する旨の条項は存在しない。
(イ)また，ＷＴＯ農業協定４条２項は，ＧＡＴＴ時代になしえなかった
農業分野での完全関税化を実現したものであり，ＷＴＯ農業協定の要と
いうべき条項であって，ＷＴＯ農業協定の中でも，特に各国の遵守が求
められる規定として位置付けられる。
特にＷＴＯ農業協定４条２項の（注）で列挙された最低輸入価格制度，
可変課徴金等の個別の制度は，ＷＴＯ農業協定締結時にこれを採用する
国が存在したため，各個別の制度を厳に禁止する趣旨でわざわざ個別に
制度を列挙して掲名したものであり，世界貿易機関（以下「ＷＴＯ」と
いう。）体制の下では絶対的に禁止されるべきものである。
したがって，ＷＴＯ農業協定４条２項は，同項違反という条約違反状
態の是正を，ある国が，立法機関，行政機関だけではなく，司法機関に
よっても行うことを奨励こそすれ，排除するものではない。
(ウ)さらに，ＷＴＯは，ＧＡＴＴよりも実効性の高い紛争解決制度を用
意しており，ＷＴＯはＧＡＴＴ以上にＷＴＯ協定を各国が遵守するため
の体制強化を図っているところである。それゆえ，各国が自主的にＷＴ
Ｏ協定違反の国内状態を是正することは，上記のようなＷＴＯの目的に
合致こそすれ，反するものではない。
この点については，ＷＴＯの紛争解決制度の存在（及びその前提とし
ての加盟国間での協議，交渉による解決の予定）をもって，ＷＴＯ協定
違反の是正方法はこの紛争解決制度（ないし，その前提としての加盟国
間の協議，交渉）の利用に限定されるかのような考え方もある。
しかしながら，ＷＴＯ協定における紛争解決制度（ないし，その前提
としての加盟国間の協議，交渉）は，ＷＴＯ協定違反についての「国家
間」の紛争を解決する場というだけのことであって，それ以上でも，以
下でもない。すなわち，この紛争解決制度（ないし，その前提としての
加盟国間の協議，交渉）は，ＷＴＯ協定違反を自国で自覚していても，
他国の指摘をうけるまで条約違反状態を放置することを許容するという
システムではない。
また，この紛争解決制度（ないし，その前提としての加盟国間の協議・
交渉）の存在は，ある国が，立法機関，行政機関が是正しないＷＴＯ協
定違反の国内状態を，司法機関によって自主的に是正するという主権の
行使について，何か制約をもたらすものでもない。
このように，紛争解決制度の存在は，ＷＴＯ協定の直接適用可能性を
排除するという機能を持たないのである。
イ以上のとおり，ＷＴＯ農業協定４条２項には，直接適用可能性を排除す
るという締約国の総意は認められない。
(6)我が国においてＷＴＯ農業協定４条２項の直接適用可能性を排除する国
内法制採用の意思がないこと
アＷＴＯ農業協定４条２項の直接適用可能性に係る主観的基準に関し，我
が国において，同項の直接適用可能性を排除する国内法制採用の意思はな
い。
イ我が国は，憲法９８条２項で国際協調主義を定め，かつその前文におい
ても「国際社会において名誉ある地位を占めたい」と宣言しているように，
また，条約と法律とでは条約の方が優先するとの公定解釈が存在している
とおり，そもそも，条約についての直接適用可能性を排除するという国内
法制を採用していない。
ウまた，関税法３条ただし書にあるとおり，関税に関する特別の条約規定
を直接適用する旨の定めまであり，むしろ，関税に関する事項については，
条約についての直接適用可能性を積極的に認めていこうとする国内法制を，
我が国は採用している。
エさらに，我が国は，ＷＴＯ協定の規定に適合していない各国の制度を不
公正貿易報告書として発行して国内外に訴え，各国に対しＷＴＯ協定の遵
守を求めていく，ということを通商政策の柱としており，かかる通商政策
を説得力あらしめるため，ＷＴＯ協定の規定の直接適用可能性を排除する
国内法制は採り得ないという状況にもある。
オ加えて，実際問題として，我が国には，ＷＴＯ農業協定４条２項の直接
適用可能性を排除する国内法制は存在しない。
カ以上のとおり，我が国は，そもそも条約全般について直接適用可能性を
排除するという法秩序は採用しておらず，また，関税に係る事項について
は，むしろ積極的に直接適用可能性を認めようとする関税法３条ただし書
を用意しているのであり，さらに，通商政策上もＷＴＯ協定の直接適用可
能性を排除する国内法制を取りにくい政策を採用しており，加えて，ＷＴ
Ｏ農業協定４条２項の直接適用可能性を排除する国内法制が我が国には存
在しない以上，我が国には，ＷＴＯ農業協定４条２項について，その直接
適用可能性を排除する意思は存在しないというべきである。
(7)小括
以上のとおりであるから，ＷＴＯ農業協定４条２項は，直接適用可能性に
ついての主観的基準を満たしている。
５条約の直接適用可能性についての客観的基準
(1)明確性
ア条約の規定が明確でなければ，直接適用可能性はない。例えば，一般的
抽象的な概念を含んでいる条約条項は，直接適用され得ない。
イこの点，ＷＴＯ農業協定４条２項についてみるに，そこでいう「通常の
関税」とは定率関税及び定額関税のことであり，また，「最低輸入価格」と
は，一般に輸入産品の輸入価格と特定の価格限界との差額を関税額とする
ものであって，当該特定の輸入産品が当該価格限界を下回って国内市場に
侵入することのないようにする措置であるから，これらの内容は自明であ
り，疑義を挟む余地はない。その他「これに類する」の解釈については，
本件では主として最低輸入価格が問題となる以上，少なくとも本件には関
係がないし，関係があるにしても，「解釈」によって判断することは法の適
用に関する通常の手段であり，「一義的に解釈を示す」ことができないとい
うことはありえない。
(2)完全性
次に，条約が直接適用可能性を有するためには，客観的基準として，条約
条項の完全性が必要となる。条約の執行に必要な機関や手続についての定め
がなければ，実際上直接適用されることは困難であるから，ここでいう完全
性とは，条約の執行に必要な機関や手続が定められているという意味である。
そして，条約の執行に必要な機関や手続に欠けるか否かは，各国ごとに補
足的措置がとられているか否かによるから，条約の条項が完全であるか否か
は国ごとに異なることになる。
我が国について，ＷＴＯ農業協定４条２項の執行に必要な機関や手続が定
められているかについてみるに，機関としては税関があり，手続は関税三法
が詳細に定めているのであるから，ＷＴＯ農業協定４条２項は完全性に欠け
るところはない。そもそも，関税法３条ただし書があることそれ自体が，そ
のような完全性の裏付けがあることを初めから前提としているところである。
(3)小括
以上のとおりであるから，ＷＴＯ農業協定４条２項という条約条項は，直
接適用可能性についての客観的基準を満たしている。
６被告の主張に対する反論等
(1)アメリカ合衆国（以下「米国」という。）とヨーロッパ共同体（以下「Ｅ
Ｕ」という。）がそれぞれの国内法秩序に従ってＷＴＯ協定の国内（域内）
の直接適用を認めていないことは，我が国において直接適用を認めない理由
とならないこと
ア他国の事情が影響を与えないこと
米国及びＥＵにおいてＷＴＯ協定は直接適用されていないから，我が国
においても裁判所がＷＴＯ協定に直接適用可能性を認めて外交交渉の手
足を縛るべきでないといういう考え方もあるが，直接適用可能性は，それ
ぞれの国の憲法秩序（米国の場合）ないし共同体法秩序（ＥＵの場合）の
問題であって，外交交渉の手足を縛るとか縛らないとかの判断は，我が国
の憲法秩序を揺るがす理由とはなり得ない。
また，日本国憲法の前文には「国際社会において名誉ある地位を占めた
い」という理念が示されている。そうである以上は，この理念の体現を，
他国の法秩序のあり方との比較によって妨害するようなことがあっては
ならない。
さらに，事柄は，罪刑法定主義の問題であり，基本的人権に関わるもの
であるから，そもそも外交交渉の有利不利といった程度の理由により，個
人の罪責を問う，問わないなどということの判断が左右されるべきではな
い。
したがって，裁判所が，国際交渉における利益不利益を考慮すること自
体が，行政府及び立法府の権限に属する判断をしていることであって，職
域を超えており，これこそがむしろ権力分立の理念に違背するというべき
である。
イ我が国の通商政策
我が国は，諸外国に対しＷＴＯ協定や経済協定等の国際ルールの遵守を
求めるという通商政策を採用している。そして，そのことを国内外に示す
ために，我が国は，毎年，「不公正貿易報告書」を作成し，ＷＴＯ協定や
経済協定等の国際ルールの遵守の確保を訴え続けている。すなわち，我が
国は，特定国との貿易に関し自国に不利な結果が生じていることだけを理
由にして，相手国が適用する政策，措置を非難するということは決して行
わず，常に，ＷＴＯ協定を基本とする国際ルールに違反しているというこ
とを根拠にして，相手国が適用する政策，措置を非難するという方針を採
用してきたのである。
このように，相手国に対してルールの遵守を求めるというのが我が国の
基本スタンスなのであるから，その通商政策を実効あらしめるため，すな
わち，我が国が行う相手国に対する非難を説得力あらしめるためには，そ
の大前提として，我が国自身がその国際ルールを守るということが必要に
なる。
もし，米国やＥＵにおいて直接適用が否定されている以上，ＷＴＯ協定
の義務履行に著しい不均衡を生じるおそれがあるので，ＷＴＯ協定の直接
適用は否定するなどという上記通商政策に反する立論を示すとすると，諸
外国に，「日本政府は，他国に対しては国際ルールの遵守と言っているけ
れども，自国では，これを守らないことにお墨付きを与えているではない
か」とつけ込ませる格好の材料を与えるもので，むしろ逆に通商交渉にお
ける我が国の交渉力を大幅に削ぐということになりかねない。我が国が国
民の最善の利益に繋がるよう，高邁な理念を持って通商政策を展開してい
るにもかかわらず，それを根幹から揺るがすこととなる結果を導く結論を
裁判所が示すとすると，これこそは行政の裁量権行使に対する司法による
悪しき浸食である。三権分立の原則に鑑みても裁判所がそのような判断を
示すことはできないと言わなければならない。
ウ東京高等裁判所平成２５年１１月７日判決及び最高裁判所平成２６年３
月２８日決定の理解
(ア)上記ア及びイからすると，東京高等裁判所平成２５年１１月７日判
決（以下「東京高裁平成２５年判決」という。）は，ＷＴＯ農業協定４
条２項の直接適用可能性についての判断を誤ったものというべきである。
(イ)まず，そもそも，東京高裁平成２５年判決は，関税法３条ただし書
について触れるところがなく，これは適用すべき法令について誤ったも
のではないかと考えられる。
また，東京高裁平成２５年判決については，①我が国は，ＷＴＯの
アンチダンピング委員会において，「我が国の関税法は，ＷＴＯ協定の
規定は直接適用可能である（canbedirectlyapplied）と確認し，仮に
抵触があれば，ＷＴＯ協定が国内法に優越する」との見解を１９９６年
に表明していること，②関税法３条は，輸入貨物への課税に関し，「た
だし，条約中に関税について特別の規定があるときは，当該規定による」
と定めていること，③差額関税も関税法および関税定率法に基づいて
徴収されるものであることから，我が国の公的見解からすると関税法３
条によりＷＴＯ協定との抵触が問題となる可能性は残ると思われること
などを指摘され，批判されている。
(ウ)次に，東京高裁平成２５年判決の上告審である最高裁判所平成２６
年３月２８日決定（以下「最高裁平成２６年決定」という。）について
は，仮に最高裁判所が，東京高裁平成２５年判決と同じく関税法３条た
だし書の存在に気が付かないまま，憲法９８条２項に照らしてＷＴＯ農
業協定４条２項の直接適用について否定したとすると，本来，最高裁平
成２６年決定においては，上告人の憲法９８条２項違反をいう主張に対
し，「憲法９８条２項違反をいう点は，……であるから，前提を欠き」
との記載がなされる性質のものであると思われるところ，最高裁平成２
６年決定は「上告趣意は，憲法違反をいう点を含め，実質は単なる法令
違反の主張」とするのみである。
そうすると，最高裁平成２６年決定を，「東京高裁判決が示した農業
協定４条２項は直接適用されないとの結論を支持するものである」と理
解することは誤解であるように思われる。最高裁平成２６年決定は，東
京高裁平成２５年判決について，「適用法条の誤りがあるに過ぎないの
であるから上告理由にはならない」と述べているだけのことであると理
解されるように思われるからである。
エ小括
以上のようなことであるから，米国とＥＵがそれぞれの国内法秩序に従
ってＷＴＯ協定の国内（域内）適用を認めていないことは，我が国におい
て直接適用を認めない理由となり得ない。
(2)三権分立，国内法制の状況等を理由にＷＴＯ農業協定４条２項の直接適用
を否定する主張は失当であること
被告において，「我が国の三権分立の在り方や国内法制の状況等から検討す
ると，ＷＴＯは加盟国の利益の均衡に基づいて貿易自由化を推進する多国間
条約体制であるという性格を有するものであるから，我が国国内におけるＷ
ＴＯ協定の実施の在り方においては，各加盟国の多様な政策判断や我が国の
国内情勢等を総合考慮する必要がある。」という主張がされることも想定され
る。
しかしながら，このような言明については，仮にそれを支持するとしても，
そうであるからといって，関税法３条ただし書において直接適用が明定され
ていることを無視する理由にはなり得ず，ましてやその帰結として個人の罪
責を問う結果となることを許すものではあり得ない。
「加盟国の利益の均衡」とか「多様な政策判断」とか「我が国の国内情勢
等」といった程度のあいまいな理由によって，罪刑法定主義を蔑ろにしたり，
個人の基本的人権が蹂躙したりされることが許されるものではない。
(3)国会又は政府の裁量権を理由に，ＷＴＯ農業協定４条２項の直接適用を否
定する主張は失当であること
被告において，「どの品目についてどのような関税制度を設けるかは柔軟に
決定することが必要であり，こうした役割を最適に果たし得るのは国会又は
政府であって，その柔軟な意思決定を可能にするために国会又は政府に広範
な裁量権を与えることが相当である。」という主張がされることも想定される。
しかし，我が国は，そのような裁量権に基づいてＷＴＯ協定を締結し，国
会はこれを承認しているところ，ＷＴＯ農業協定４条２項は，その重要な中
身を構成する条約条項である。そうすると，右裁量権行使の結果として，現
在のＷＴＯ農業協定４条２項があるということである。
また，我が国の政府は，ＷＴＯ協定の締結前に，関税法３条ただし書を国
会に提出し，国会はこの法条を可決成立させていた。つまり，政府は，ウル
グアイ・ラウンドの交渉を続けている経過において，関税法３条ただし書が
既に長年にわたって施行されていることを十分に意識していたのであり，ま
た，この交渉中，この条項が廃止されることが想定される状況にもなかった
ということには特に注意しなければならない。
このように，我が国の政府及び国会は，その裁量権の行使により，関税法
３条ただし書を存置しつつ，ＷＴＯ農業協定４条２項という条約条項の締結，
承認を行っていたのであり，我が国の憲法秩序は条約優位なのであるから，
政府，国会に裁量権があると言っても，自らが意思決定した条約条項に基づ
く義務に違背する法律を成立，施行，適用する裁量までもが，政府及び国会
に与えられているわけではないから，「柔軟に決定する必要」があるとしても，
ＷＴＯ農業協定４条２項に明白に違反するような内容を法定する裁量権は，
政府にも国会にもないのである。
以上によれば，関税法３条ただし書があるにもかかわらず，ＷＴＯ農業協
定４条２項の直接適用可能性を否定するということは，結局のところ，既に
国会の議決を経た条約条項であって，かつ，直接適用しなければならないこ
とが法律上も明示されているものについて，裁判所がこれを裁判規範として
使ってはならないということと同じであり，相当ではない。
７直接適用可能性に関する結論
以上によれば，ＷＴＯ農業協定は，我が国において直接適用可能性を有して
おり，法律の定める関税の仕組みがＷＴＯ農業協定４条２項で禁止される制度
に該当する場合，同項が直接適用されて，当該仕組みが無効化されるのである。
第２本件差額関税制度は農業協定４条２項に違背すること
１本件差額関税制度は，通常の関税に該当しないこと
「通常の関税」とは，従量税，従価税又はその組合せをいうところ，本件差
額関税制度のうちの関税として基準輸入価格と課税価格の差額を課すという部
分は，従量税率でもなければ，従価税率でもないから，上記の部分は，「通常の
関税」ではなく，「通常の関税に転換することが要求された措置その他これに類
するいかなる措置（注）も維持し，とり又は再びとってはならない。」と定める
ＷＴＯ農業協定４条２項に違背する。従量税が適用になる部分の税率の引下げ
が自主的に行われたものであったとしても，従量税であったものが従量税でな
くなったとすれば，その関税は，従量税，従価税又はその組み合わせではなく
なり，通常の関税ではないということになる。
なお，ＷＴＯ協定の一部である我が国の譲許税率表には，関税として基準輸
入価格と課税価格の差額を課すという部分に関する記載は一切ないのであって，
当該部分は従量税率がそのまま適用される表現になっている。したがって，現
行の本件差額関税制度は，日本国の譲許表と異なっており，外見的にも実際的
にも我が国は国際的に二枚舌を使った結果となっている。
２本件差額関税制度は最低輸入価格又は可変輸入課徴金に該当すること
(1)ＷＴＯ農業協定４条２項は，可変輸入課徴金や最低輸入価格を禁止してい
る。①可変輸入課徴金とは，基準価格（境界価格）と国際価格（輸入価格）
との差額を調整金として徴収するものであり，国際価格が変動すると調整金
の額も変動するために，可変輸入課徴金という呼称が与えられる。ＥＵ（欧
州連合）は，ウルグアイ・ラウンド合意に基づいて可変課徴金を廃止して，
一般関税に移行したことは周知のとおりである。また，②最低輸入価格と
は，一般に輸入産品の輸入価格と特定の価格限界との差額を関税額とするも
のであって，当該特定の輸入産品が当該価格限界を下回って国内市場に侵入
することのないようにする措置である。
(2)本件差額関税制度は，課税価格と基準輸入価格の差額を関税として賦課す
るというものであり，基準輸入価格が特定の価格限界としての機能を有して
いることからすると，ＷＴＯ農業協定４条２項の（注）が，特に掲名して禁
じている最低輸入価格に該当することは明らかである。
すなわち，１９９５年にＷＴＯが発足し，新たにＷＴＯ農業協定によって
農産物についても関税化が導入されるまでは，我が国では海外の安い豚肉の
輸入により畜産農家が損害を受けないように，国内価格を参考にして基準価
格を設け，輸入肉がこれより低い価格で輸入されるときは，基準価格との差
額を関税として徴収することによって，輸入肉が国内市場に出る時は国内産
肉と競争関係に立つように操作されていた。これが農業産品の関税化を規定
したＷＴＯ農業協定４条２項の（注）が禁止する輸入数量制限，可変輸入課
徴金，最低輸入価格，裁量的輸入許可等のうち可変輸入課徴金ないし最低輸
入価格に当たるとされることを予期して，対策として考案されたのが，従量
税による関税化による譲許を得た上，これを一方的に一定額まで免除して実
質的に従前の差額関税制度を維持するという解決策であったことは明らかで
ある。
そして，関税化に当たって従価税とするか従量税とするかはＷＴＯ加盟国
が自由に決められることであり，譲許表に記載すれば特に他の加盟国から異
議が出て交渉の対象とならない限り，そのまま承認される。我が国が提示し
た１ｋｇにつき４８２円という従量税はそのままでは極端に高い国内価格を
もたらすことになるため，豚肉輸出国の反発を招くのみならず，国内的にも
実行不可能である。そこで，基準価格を超える税額を免除するということで
関係国の了承を得たとされているが，結果は従前の制度とほとんど異ならな
いこととなった。
(3)本件差額関税制度には，わずかながら従量税となっている部分はあるもの
の，部分肉の輸入価格が１ｋｇにつき６４.５３円以下の豚肉などはあり得な
いことであって，輸入実績も皆無であるのであるから，従量税部分の存在を
理由として本件差額関税制度がＷＴＯ農業協定４条２項の（注）に規定され
た最低輸入価格に該当しないなどということはできない。
(4)そうすると，本件差額関税制度がＷＴＯ農業協定４条２項に違背すること
が明らかである。
これは，平成１２年農林水産省文書「ＷＴＯ農業交渉の課題と論点」や農
林水産省食肉鶏卵課長による「わが国における最近の食肉需給動向と今後の
見通し」という講演の講演録が収録された「自由化後の牛肉流通食肉研究
会編」において，本件差額関税制度がＷＴＯ農業協定が締結される以前の差
額関税制度を維持又は復活したものであると述べられていることからも明ら
かである。
(5)そして，我が国の実定法秩序において，条約は法律に優越するから，関税
暫定措置法の定める本件差額関税制度のうち，関税として基準価格と課税価
格の差額を課すとする部分の規定は，ＷＴＯ農業協定４条２項に違背するの
であるから，無効である。
３被告の主張に対する反論等
(1)現行の本件差額関税制度がＷＴＯ協定の発効後も残存していることがＷ
ＴＯ協定農業協定に違反しないことを意味しないこと
アＷＴＯ農業協定４条２項に違反する本件差額関税制度が，同項の発効後
も残存できたのは，当時の農水省による国内外に対する欺罔的説明がされ
たからである。
イＧＡＴＴウルグアイ・ラウンドにおいて食肉類についての交渉に当たっ
た当時の担当官である食肉鶏卵課長は，講演資料として使用された別紙６
「図面目録」記載⑥の４つの図により，自分がいかにして各国の担当者を
欺罔して，廃止したはずの豚肉の差額関税制度を復活させたかを詳しく説
明している。
(ア)上記の４つの図のうちの左上の図が，ＧＡＴＴウルグアイ・ラウン
ド交渉が妥結するまでに施行されていた豚肉の差額関税制度であり，１
９９３年当時の分岐点４６０円よりも低い価格で輸入された豚肉は，す
べて差額関税の下にあった。
ところが，このような差額関税制度は，１ｋｇにつき４８２.５円を最
低輸入価格とする最低価格輸入制度以外の何ものでもあり得ない。これ
はＧＡＴＴウルグアイ・ラウンドの合意の禁じるところである。認めら
れるものは，従価税率か，従量税率か，それらの混合でしかない。
(イ)そこで，当時の農林水産省が考えて我が国の譲許税率表として提出
したものは，前記の４つの図のうちの左下の図のような従価税率と従量
税率の組合せであった。なお，譲許税率とは，関税についてはここまで
引き下げるという国際約束のことを言う。
(ウ)我が国の譲許表もＷＴＯ協定の不可分の一部であり，従って，国際
条約であり，憲法９８条２項に従って遵守する義務を負うものである。
(エ)しかしながら，前記の左下の図に見るように，譲許税率表を図に直
して見ると，不自然なぎざぎざがある税率構造になってしまう。
(オ)そこで，農林水産省は，前記の４つの図のうちの右下図のように従
量税部分の突出した部分を切り取って，なめらかな折れ線グラフにする
という説明を編み出した。切り取った部分については，譲許税率表より
は関税負担が減少しているのであるから，国際条約に違反したことには
ならないという説明がつけられている。
ウところが，上記のような説明は，単なる詭弁でしかない。すなわち，減
税であろうとなかろうと，結果として生じている折れ線グラフのフラット
な部分は，ＷＴＯ農業協定４条２項の（注）が明文で禁じている最低輸入
価格となっている。あるいは少なくとも，同項本文のいう「通常の関税」
ではない。すなわち，説明の仕方をどのように工夫しようとも，本件差額
関税制度は結果としてＷＴＯ農業協定４条２項違反なのである。しかも，
同項本文の末尾には，わざわざ「又は再びとってはならない。」とまで記さ
れているところである。
エそもそも，譲許税率表に示した従量税の定め方が，あらかじめ差額関税
部分を生じてしまうような税率であって，左下図のぎざぎざを生じてしま
うようなことを仕組むから，このような減税という説明をすることが可能
になるのである。当初から，きちんとした従量税率の定め方をしておけば，
ぎざぎざを生じる必要もなく，そうすればぎざぎざを取るために減税をす
る必要もなく，減税をした結果として最低輸入価格制度を作出するという
事態にはならなかったのである。
オなお，現在では，このような差額関税制度があるのも，豚肉ただ一つに
ついてのみである。
このことは，本件差額関税制度が，いかに異常な関税であり，決して「通
常の関税」の範疇には入らないことを示す証左でもある。
(2)ＷＴＯ加盟国に対する通知はＷＴＯ農業協定４条２項違反の瑕疵を治癒
するものではないこと
ア譲許表記載の関税からその一部を免除した実行税率への変更については，
我が国の政府からＷＴＯに報告がなされ，１９９５年２月２８日付けでＷ
ＴＯ加盟国に対する通知（以下「本件通知」という。）もされている。
イ本件通知は，１９９４年１２月２７日に我が国の政府代表部からＧＡＴ
Ｔ事務局に提出され，ＷＴＯ協定成立後の１９９５年２月１６日付けで一
定範囲に配布されたことが窺える「L/7621」と題されるＧＡＴＴの頭書が
ある書面であると考えられるところ，そこでは，「ゲート・プライス」を将
来引き下げることが約されているとともに，そのゲート・プライスより低
い価格による輸入豚肉については，譲許関税額を超えない従量税（specifi
cduty）を課すると述べられているだけで，具体的な適用税率については
何も述べていない。実際問題として，その内容を具体的な「税率」として
表示することは不可能で，「ゲート・プライスと輸入価格の差額に相当する
関税」と言わざるとえず，これは従量税として正確に表示できない性質の
ものである。
また，本件通知のもととなったのは，Ｐ７駐米大使からＰ８通商代表に
提出されたとされる書簡の「附属書２：豚肉に関する措置」のようである
が，その(5)には，「１９９４年の関税及び貿易に関する一般協定に付属す
る日本国の譲許表に規定されている適用のある関税率よりも高くない税率
の従量税を適用する」と記載されており，ＷＴＯに提出されたとされる上
記書面はその翻訳と見て取れる。このＰ７大使の書面は平成６年１０月２
１日閣議決定案「世界貿易機関を設立するマラケシュ協定に付属される農
業に関する協定の実施に関連する我が国政府の措置等について」と題する
書面に付された別紙１とされているので，同じ頃に作成され，Ｐ８通商代
表に手交されたと推測される。
ウしかしながら，そもそも，譲許税率より低い実行税率を採用することは
日常的なことであって，「通知」しなければできないことではないから，本
件通知はＷＴＯにおいて何ら実体法上の効果を持つことのない単なる通知
文書にすぎず，本件通知が加盟国に対してされたとしても，関税暫定措置
法２条２項及び同法別表第１の３の豚肉に係る部分がＷＴＯ違反であるこ
とは，何ら治癒されるものではない。
エまた，本件通知では，その２(5)において，「ＧＰ（＝分岐点価格のこと）
の水準未満のc.i.f価格で輸入される豚肉及び豚肉加工品について，日本
国政府は，…日本国の譲許表において規定されている適用のある関税率よ
りも高くない税率の従量税を適用する」と記載されている。
しかしながら，「ＧＰ」の水準未満の現行の豚肉に係る我が国の関税制
度は，１ｋｇにつき４８．９円（ＷＴＯ成立当時は１ｋｇにつき５８円）
以下の枝肉については従量税を，そして，１ｋｇにつき４８．９円からＧ
Ｐまでの枝肉については基準輸入価格と輸入価格との差額の関税を課すと
いう内容になっている。
このうち，１ｋｇにつき４８．９円（ＷＴＯ成立当時は１ｋｇにつき５
８円）以下で輸入される枝肉は現実には存在せず，取引される蓋然性もゼ
ロというほかないから，この部分の存在により，本件差額関税制度が最低
輸入価格を定めたものではないということはできない。
また，基準輸入価格と輸入価格との差額を関税として課す部分について
は，そもそも「基準輸入価格と輸入価格との差額」という形でしか，税率
を表現することはできず，これを「従量税」として表示することは不可能
である。
つまり，本件通知は，現実には「従量税」なるものを課すことはないに
もかかわらず，言葉の記載上「譲許表において規定されている…関税率よ
りも高くない税率の従量税を適用する」との欺瞞的表現を行うことで，各
国に対し，あたかも，我が国は豚肉に対して従量税を課すかのように欺罔
行為を行ったものなのである。
このような我が国の行為は，各国を欺罔するものとして，国際的に許さ
れることのない暴挙と言わざるを得ない。
(3)譲許関税額よりも低くてもＷＴＯ農業協定への適合性は別途問題とされ
るべきこと
ア譲許税率は上限を定めるものであるから，譲許税率を下回る税率を採用
することは認められる。
イしかしながら，自由競争市場というものは，品質と価格による競争が保
障されて初めて実現されるものである。これは，独占禁止法を学ぶ際の初
歩であり，同法が定められている我が国では，既に公知の事実である。裏
を返せば，品質と価格による競争が阻害されれば，自由競争市場は歪めら
れてしまうということである。
この点，無論，関税は，国内業者保護のために，輸入産品の価格にハン
ディキャップを負わせるものであるから，元来，価格競争を歪める効果を
持っている。
しかしながら，従量税，従価税の場合には，国外の業者が価格の引き下
げをすれば，「輸入価格＋関税」の合計額は，原則，それに併せて何かし
らは下がり，従量税，従価税の下では，価格引き下げ努力が完全に無効化
されることは原則としてなく，国内業者は，国外業者による不断の価格引
き下げ圧力に晒されるし，また，国外業者同士も，当該域内において価格
競争を繰り広げることになるものである。このように，従価税，従量税は，
価格競争を歪ませるといっても，その歪みの程度は，そこまで大きくはな
いものである。そうであるからこそウルグアイ・ラウンドの農業交渉では
「関税化」即ち「従量税又は従価税のみを認める」という理念が掲げられ
て，例外を一切認めないこととしたのである。
これに対して，最低輸入価格制度の場合，当該最低輸入価格から価格の
引下げを行っても，その引下げ分が全て関税として賦課されるため，「輸
入価格＋関税」の合計額は変わらないことになってしまう。つまり，同制
度は，国外業者の引下げ努力を，完全に無効化してしまう。その結果，国
内業者は，国外業者相互間の不断の価格引下げ圧力に晒されることがなく
なってしまい，また，国外業者同士も，差額関税制度を採用する輸出相手
国に関しては価格競争を行う意義を失うことになってしまうのである。
このように，最低輸入価格制度は，国内業者と国外業者の価格競争及び
国外業者同士の価格競争を歪ませる程度が極めて大きいことから，ＷＴＯ
農業協定４条２項は，特に明示的に最低輸入価格制度を制度として採用す
ることを禁止しているのである。
ウ以上のとおり，最低輸入価格制度がＷＴＯ農業協定４条２項によって禁
止されるのは，関税額の多寡ではなく，上記イで述べたとおり，同制度自
体が内包する極度の市場歪曲性にあるから，関税額が譲許表より低いこと
は最低輸入価格制度の内包する市場歪曲性を何ら治癒するものではなく，
譲許表より低い関税額を定めている最低輸入価格制度も，市場を大きく歪
曲するものであるから，やはりＷＴＯ農業協定４条２項違反となるもので
ある。
なお，チリ・プライスバンド事件では，チリ政府が最初に採用した関税
の計算方法によれば，場合によって関税額が譲許関税額を超える場合があ
ったところ，これが違法であるとされたことから，チリ政府は法律を改正
し，関税額はどんな場合も譲許額を超えないものとすると定めたが，これ
について再び争われた事件（いわゆる21.5条事件）において，ＷＴＯ上級
委員会は，関税額が譲許額を超えないとしてもＷＴＯ農業協定違反を治癒
するものではないと判断している。
第３結論
１現行関税暫定措置法の定める本件差額関税制度が無効である場合に適用され
るべき関税率
関税には，国定税率と協定税率とがある。国定税率の方が低い場合，協定税
率ではなく，国定税率が適用される（これを国際租税法の領域では，プリザベ
ーション・クローズという場合がある。）。
そして，我が国において，国定税率を定める一般法は関税定率法であり，関
税暫定措置法はその一般法に対する特別法であるから，特別法たる関税暫定措
置法が無効であるということになると，特別法の存在によって施行が封じられ
ていた一般法が適用になる。
この点，一般法である関税定率法の定める豚肉の関税率は，関税定率法３条
及び関税定率法別表によって，例えば０２０３項１１号２について，５％と定
められており，日本国の譲許表のぎざぎざ様の協定税率と比較するとき，国定
税率である５％の従価税率は，分岐点価格以上の輸入価格を除けば，譲許税率
より低いのであるから，国定税率である５％が適用になる。
２本件の場合
そこで，本件の場合についてこれをみると，本件各更正処分における納付す
べき関税の額はすべて誤りであることが明らかである。
３結論
よって，本件各更正処分等は取り消されなければならない。
以上
（別紙９）
被告の主張
第１ＷＴＯ農業協定４条２項には直接適用可能性（裁判規範性）が認められない
こと
１はじめに
(1)本件においてＷＴＯ農業協定４条２項を裁判規範として用いるためには，
同条項に直接適用可能性が認められなければならないこと
ア被告の主張
被告は，本件において，国内の司法裁判所がある事項を判断するに当た
り直接適用して結論を導き出すことができる法規範という意味で「裁判規
範」という語を用いている。また，被告は，本件において，ある条項が「直
接適用可能」であれば，同条項には上記の意味における裁判規範性が認め
られるという関係に立つことを意味するものとして「直接適用可能」とい
う語を用いている。
したがって，本件差額関税制度の有効性を判断するに当たり，ＷＴＯ農
業協定４条２項を裁判規範として用いるためには，同条項に直接適用可能
性が認められなければならない。
なお，我が国において国会による承認を経て締結し公布された条約は，
憲法９８条２項，７条１号により国内的効力を有し，法律に優位すると解
されている。しかし，これは，我が国の憲法体制においては，条約が他に
特段の立法措置を講ずるまでもなく我が国の法体系に受け容れられること
（すなわち自動的に受容されること）を意味しているにとどまるから（条
約の国内的効力の問題），個々の国民が条約を直接の法的根拠として具体
的な権利ないし法的地位を主張したり，あるいは，裁判所が法的紛争を解
決するに当たり条約を直接適用して結論を導いたりすることが可能かとい
う問題（条約の直接適用可能性の問題）は，条約の国内的効力の問題とは
別途検討する必要がある（東京高裁平成５年３月５日判決・判例時報１４
６６号４０頁，東京高裁平成２５年１１月２７日判決（以下「東京高裁平
成２５年判決」という。）。
イ原告の主張に対する反論
(ア)上記アに関し，原告は，憲法は「憲法－条約－法律というハイアラ
ーキー」を定めているから，「ある条約条項が直接適用可能ではなく，
法律によって国内法化されている場合を考えて，当該条約条項を国内法
化する法律が，当該条約条項に違反した内容になっているのではないか
ということを裁判所において判断することができるか否か（すなわち，
裁判規範性）についても『直接適用可能性とイコールという理由で裁判
規範性がない』という趣旨までをも含む言明であるとすれば，それは短
絡的である」，「直接適用可能でなくとも，法律の条約適合性を判断す
る裁判規範として位置付けることは可能である」などと主張し，その実
例として，租税条約における限度税率を例に挙げる。
(イ)しかし，原告は，一般的に条約が国内法に優位すると解されている
ことを強調するが，原告が提出した証拠においても，一般的に条約が国
内法に優位すると解されていることと，当該条約に直接適用可能性が認
められることとの間には何らの論理的関連性もないことが述べられてい
る。
(ウ)したがって，原告の上記主張はいずれも理由がない。
(2)直接適用可能性の判断基準（要件）について
条約は，国際法の一形式であるが，これを締結するのは国家であって，国
家間の権利義務関係を定立することを主眼とする。このため，条約が直接国
内法上の効果を期待し，国民に権利を与え義務を課すことをも目的とする場
合には，原則として，その目的を達成するため国家機関に立法義務を課し又
は行政措置を執ることを命じ，これを受けて，立法機関が法律を制定し，ま
た，行政機関が法令に基づきその権限内にある事項について行政措置を執る
ことになる。したがって，条約の内容が私人相互間又は私人と国家間の法律
関係に適用可能なものとして裁判所等の国家機関を拘束するためには，原則
として，上記のような国内措置による補完が必要であり，現にそのような国
内法が多数制定されている。
これに対し，例外的に，条約の規定がそのままの形で国内的に直接適用し
得ると判断される場合がある。いかなる場合に条約の直接適用が可能となる
かについては，一般に，「第一に『主観的要件』として，条約の作成・実施
の過程の事情により，私人の権利義務を定め直接に国内裁判所で執行可能な
内容のものにするという，条約締結国の意思が確認できること」，「第二に
『客観的要件』として，私人の権利義務が明白，確定的，完全かつ詳細に定
められていて，その内容を具体化する法令にまつまでもなく国内的に執行可
能な条約規定であること」を考慮して判断せざるを得ないとか，内容が明確
かつ具体的で国家の裁量の余地がない条約（規定）であることを要するなど
とされている。
よって，ある条約の規定を国内裁判所において直接裁判規範として適用す
るためには，①条約締結国の国内裁判所で執行可能なものにするという条
約条約締結国の具体的な意思が確認できること（主観的基準），及び，②そ
の内容を具体化する法令を待つまでもなく国内で直接適用できるだけの具体
性及び明確性があること（客観的基準）を要すると考えられる。
２ＷＴＯ農業協定４条２項は直接適用可能性に関する主観的基準を満たさない
こと
(1)被告の主張
前記１(2)で述べたとおり，条約の直接適用可能性についての主観的基準
（要件）を満たすためには，条約締結国の国内においてまで，当該条約にお
ける個人の権利義務や規制等をそのまま創設するという条約締結国の意思が
確認できることが必要である。
しかるに，我が国は，ＷＴＯ協定の交渉過程において，ＷＴＯ農業協定４
条２項の直接適用可能性について議論されたとは認識しておらず，ＷＴＯ協
定の関連規定の内容やその交渉経緯，ＷＴＯ農業協定４条２項の国内実施措
置等によれば，我が国が，ＷＴＯ農業協定４条２項について，私人に対し，
「通常の関税」に当たらない国境措置を適用されない権利を認めてこれを直
接に国内裁判所で執行可能にするなどという意思を有していなかったことは
明らかである。
したがって，ＷＴＯ農業協定４条２項は直接適用可能性に関する主観的基
準を満たさない。
その要点は以下のとおりである。
アＷＴＯ農業協定はＷＴＯ協定の一部であるところ，ＷＴＯ協定は，加盟
国間の国際貿易関係を規律し，多角的貿易体制の基礎を成す基本原則を維
持するとともに同体制の基本目的を達成するものとして位置づけられてお
り，各加盟国に対して，自国の法令等をＷＴＯ農業協定を含む附属書の定
める義務に適合したものとすることを義務付けている。これによれば，Ｗ
ＴＯ農業協定４条２項は，私人の権利義務を定め，また，それが直接適用
されることを予定しているとはいい難い。
また，ＷＴＯ協定を巡る紛争については，第一次的には加盟国間の協議
や交渉によって解決が図られることが予定されている上，ＷＴＯ紛争解決
手続による救済は，加盟国による対象協定に適合しない措置の撤回によっ
て図られ，私人に対する損害賠償等は想定されていない。ＷＴＯ協定にお
ける紛争解決手続は，飽くまで加盟国間の紛争解決のための場を提供する
ものであり，私人が関与することは想定されていない。
以上のとおり，ＷＴＯ協定の性格やその関連規定の内容を検討すると，
ＷＴＯ農業協定４条２項は加盟国に直接適用されることを予定していな
いものと考えるのが自然である。
イ世界貿易機関（以下「ＷＴＯ」という。）の主要加盟国であるアメリカ
合衆国（以下「米国」という。）及びヨーロッパ共同体（以下「ＥＵ」と
いう。）では，ＷＴＯ協定の締結当初から，ＷＴＯ協定は国内において直
接適用可能性がないものとして取り扱われていることが認められ，主要加
盟国においては，当初から，ＷＴＯ協定は原則として直接適用可能性がな
いものとして理解されていたことがうかがわれる。そして，我が国は，Ｗ
ＴＯ農業協定４条２項の交渉過程において，その直接適用可能性が加盟国
間で議論されたとも認識していない。そうすると，同規定に直接適用可能
性が認められないことは，加盟国間においても前提とされていたことがう
かがわれる。
ウまた，ＷＴＯ農業協定の作成経緯を踏まえると，市場アクセスについて
定めるＷＴＯ農業協定４条２項の趣旨は，農産品貿易に係る国際的な規律
を強化する目的の下，締約国に対して特例措置を適用したものを除き通常
の関税以外の国境措置を包括的に関税化する国際法上の義務を負わせるこ
とを規定するものであり，私人の権利義務に着目したものとはいえない。
以上のとおり，ＷＴＯ農業協定４条２項の性格やその規定内容から見て
も，我が国が，ＷＴＯ農業協定４条２項が私人に対し「通常の関税」に当
たらない国境措置を適用されない権利を認めてこれを直接に国内裁判所
で執行可能にするなどという意思を有していたことをうかがわせる事情
は認められない。
エさらに，我が国による条約の締結に当たっては，一般的に，当該条約上
の義務を国内的に実施し得る体制が整っていることが締結の前提であり，
そのために国内立法措置が必要であれば，かかる措置を執った上で条約を
締結することとされているから，条約を締結するに当たり，当該条約上の
義務を実施するための国内立法措置が執られている場合には，一般的に，
我が国において，当該義務につき直接適用することは想定されていないと
いうべきである。
しかるに，我が国がＷＴＯ協定を締結するに当たっては，ＷＴＯ協定を
国内的に実施するための国内措置を執ることが必要とされ，ＷＴＯ農業協
定４条２項が関係する関税化については，その実施のため，関税定率法等
の改正，加工原料乳生産者補給金等暫定措置法の改正，主要食糧の需給・
価格安定法の制定等の立法措置が執られた。
このように，ＷＴＯ協定の締結に当たっては，ＷＴＯ農業協定４条２項
の実施に関連して関税定率法等の改正等の立法措置が執られたほか，同項
の直接適用可能性について国会等において議論が行われたことも確認さ
れていない。
オ以上のとおり，ＷＴＯ協定の性格やその関連規定の内容，他の主要加盟
国におけるＷＴＯ農業協定を含むＷＴＯ協定の取扱い，ＷＴＯ農業協定４
条２項の性格及び規定内容並びにその国内実施に関連する措置等に照らし
ても，我が国が，ＷＴＯ農業協定４条２項について，私人に対し，「通常
の関税」に当たらない国境措置を適用されない権利を認めてこれを直接に
国内裁判所で執行可能にするなどという意思を有していなかったことは明
らかである。
(2)原告の主張に対する反論
ア原告は，条約の直接適用可能性が認められるための主観的基準として，
条約締結国による私人の権利義務を創設する意思が必要であるという主張
について，前近代的なものであるなどと主張する。そして，直接適用可能
性が認められていることに争いがない譲許表を例に挙げ，これは個人の権
利義務を創設するものではないから被告の主張によると直接適用可能性は
認められないはずであるから，被告は自己矛盾に陥っているなどと主張す
る。
しかしながら，前記のとおり，条約は，原則として国家間の権利義務関
係を定めるものであるから，我が国において条約の内容が私人相互間又は
私人と国家間の法律関係に適用可能なものとして裁判所等の国家機関を
拘束するためには，原則として国内措置が必要であるとされている。例外
的に，当該条約について国内措置が執られていなくとも，直接に国内裁判
所で執行可能な内容のものとする国家の意思が認められる場合には，国内
裁判所でこれを執行したとしても，立法や行政による裁量権の行使を制約
することはないとされている。
そして，被告は，上記の観点から，我が国が，ＷＴＯ農業協定４条２項
について，私人に対し，「通常の関税」に当たらない国境措置を適用され
ない権利を認めてこれを直接国内裁判所で執行可能にするなどという意
思を有していたとはいえないから，同条項に直接適用可能性を認めること
はできないと主張したものである。すなわち，被告は，主観的基準（要件）
として，「条約締結国による私人の権利義務の創設の意思」が必要である
などと主張しているのではなく，「国内措置なしに国内裁判所で執行可能
にする意思」が必要であると主張したものである。そして，本件において，
国内裁判所がＷＴＯ農業協定４条２項を裁判規範として用いて本件差額
関税制度の効力を判断できるということは，実質的には，我が国が，同条
項について，私人に対し「通常の関税」に当たらない国境措置を適用され
ない権利を認め，これを国内措置なしに国内裁判所で執行可能とする意思
を有していたということができるところ，被告は，前記(1)のとおり，Ｗ
ＴＯ農業協定４条２項の性格等に鑑みると，我が国がこのような意思を有
していたとはいえないと主張したものである。
したがって，原告の上記主張は，被告の主張を正解しない誤ったもので
あって，理由がない。
イまた，原告は，直接適用可能性の主観的基準として，条約締結国の積極
的な意思を要求する見解は，結果として，他国の主権行使を不当に制約す
ることになるなどと主張する。
しかし，本件で問題となっている条約の直接適用可能性とは，条約を直
接の法的根拠として，個々の国民が具体的な権利ないし法的地位を主張し
たり，あるいは，国内の司法裁判所が法的紛争を解決するに当たり条約を
直接適用して結論を導き出したりすることができるか否かという問題で
あり，これは純粋な国内問題である。
したがって，直接適用可能性の主観的基準として，我が国の積極的な意
思を要求することは，他国の主権行使と何ら関係がなく，原告の上記主張
は理由がない。
ウさらに，原告は，条約締結国の意思は直接適用可能性を排除する基準と
してのみ機能すると主張するが，条約は原則として，国家と国家の権利義
務関係を定めるにすぎず，国民の権利等を直接創設するものではないとい
う国際法上の原則からすれば，やはり，条約が直接適用可能であるかどう
かは，厳格に考える必要があり，条約の規定を国内的に直接適用するため
には，条約締結国の国内においてまで，当該条約における国民の権利義務
や規制等をそのまま創設するという条約締結国の意思が確認できることが
必要である。
したがって，原告の上記主張は理由がない。
エ以上のとおり，原告の直接適用可能性の主観的基準に係る主張は，その
前提において誤りがあるから，原告が主張するところの「直接適用可能性
についての２つの要件」及びこれに基づく本件への当てはめもまた，誤っ
ている。
オその他，原告は，我が国においてＷＴＯ農業協定４条２項の直接適用可
能性を排除する意思がないなどと主張し，その理由として，条約が法律に
優先するという公定解釈が存在し，また，我が国は，関税に関する事項に
ついて直接適用可能性を積極的に認めていこうとする国内法制を採ってい
るなどとも主張する。
しかし，前記１(1)アのとおり，一般的に条約が国内法に優位すると解さ
れていることは，当該条約に直接適用可能性が認められることと何ら論理
的関連性がない。また，原告が言及する関税法３条ただし書は，直接適用
可能性が認められる条約の規定は直接適用するということを注意的に定め
た規定（確認規定）にすぎないから，直接適用可能性を積極的に認めた規
定といえないことは明らかである。
したがって，原告の上記主張は理由がない。
カまた，原告は，①「直接適用がある条約条項について国内法化する立
法があったからといって，直接適用が排除されることにはならない」から，
ＷＴＯ農業協定４条２項の国内法化措置が行われているのであれば，直接
適用は問題とならないとする被告の主張は失当であり，また，②同項の
国内法化措置について裁判所が同項を裁判規範として用いて条約違反との
判断をすることに何らの障害もないなどと主張する。
しかし，被告は，上記①について，我が国がＷＴＯ農業協定を含むＷＴ
Ｏ協定を締結するに当たり，ＷＴＯ農業協定４条２項に関する義務を国内
的に実施するための立法措置を執っているから，ＷＴＯ農業協定４条２項
を直接適用可能とする意思があったとはいえないと主張したものであり，
ＷＴＯ農業協定４条２項そのものが別途「国内法化」されたと主張してい
るものではない。そうすると，ＷＴＯ農業協定４条２項そのものが別途「国
内法化」されたことを前提とする原告の上記①及び②の主張は，被告の主
張を正解しておらず，その前提において誤っており，失当である。
したがって，原告の上記主張は理由がない。
３ＷＴＯ農業協定４条２項は直接適用可能性に関する客観的基準（要件）を満
たさないこと
(1)被告の主張
ア権力分立の原則によれば，法の定立は原則として立法府の権限であり，
司法府が不明確で国家に広い裁量の余地を残している条約の規定を直接適
用すると，実質的に司法府が法の定立をすることになり，立法府の権限を
侵害することになるなどとされている。これによれば，一般的抽象的な概
念を含んでいる条約の規定は，一般的には国家に合理的な裁量の余地を残
していると解されることから，いわゆる客観的基準に基づけば具体性及び
明確性を欠き，国内的に直接適用できる規定であるということはできない。
すなわち，条約の規定を国内的に直接適用するためには，当該規定の文
言につき条約解釈の原則に従って解釈した上で，そのまま国内的に適用で
きる程度に明確であることが必要である。条約解釈の原則に従って解釈し
たとしても依然として規定の意味内容が不明確であるもの（一般的抽象的
な概念を含んでいる場合など，国家に裁量の余地を残す規定であると解さ
れるようなものを含む。）は，いわゆる客観的基準における明確性を欠く
ことになる。
イこの点，ＷＴＯ農業協定４条２項をみると，同項は，「通常の関税に転
換することが要求された措置」を禁止しており，これに該当する措置がど
のようなものであるかについて，その（注）で，「…最低輸入価格…その
他これらに類する通常の関税以外の国境措置…が含まれる」と例示してい
る。ＷＴＯ農業協定は条約であるから，前記アで述べたとおり，条約解釈
の原則に従って「文脈によりかつその趣旨及び目的に照らして与えられる
用語の通常の意味に従い」解釈されなくてはならないところ（条約法条約
３１条１項），ＷＴＯ農業協定４条２項によって禁止される措置は，その
（注）に例示が置かれているものの，こうした措置を特定するための明確
な基準はどの条文にも含まれていないため，これらの意義は明確でないと
いわざるを得ない。
２００６年の第２次チリ価格帯事件における小委員会（パネル）報告は，
上記のような条約解釈の原則を踏まえて，「最低輸入価格」の一応の定義
を示しているが，当該措置に該当するか否かを判断するための明確な基準
までも解釈により示すことは困難である。すなわち，第１次及び第２次チ
リ価格帯事件の小委員会や上級委員会において，条約法条約に規定された
解釈の原則に従って判断してもその解釈が分かれたように，ＷＴＯ農業協
定４条２項の趣旨目的に照らして解釈してもなお，「通常の関税に転換す
ることが要求された措置その他これに類するいかなる措置」，さらには「…
可変輸入課徴金，最低輸入価格，…これらに類する通常の関税以外の国境
措置」について完全に具体的かつ明確な解釈を確定させることは困難であ
るといわざるを得ない。
ウまた，上記のとおり，国家に合理的な裁量の余地を残していると解され
る規定は国内的に直接適用できないと解されるところ，ＷＴＯ農業協定４
条２項は，これに違反した場合の効果については何ら定めていないから，
その効果は一義的に明らかでなく，加盟国の裁量に委ねられていると解さ
れる。
エ以上によれば，条約解釈の原則に従って解釈したとしても，ＷＴＯ農業
協定４条２項の規定内容が，当該内容を具体化する法令を待つまでもなく
国内で直接適用できるだけの具体性及び明確性を有するとは認められない。
(2)原告の主張に対する反論
原告は，ＷＴＯ農業協定４条２項が「最低輸入価格を維持し，とり又は再
びとってはならない」と規定していることに疑義を挟む余地はない上，「最
低輸入価格」の定義についても一切争いがない，一義的に明確なものである
とし，同項は国内法として直接適用可能な程度に規定内容が明確である旨主
張する。
しかし，上記のとおり，「最低輸入価格」の意義は，ＷＴＯの紛争解決手
続における小委員会及び上級委員会による判断でも一応の定義が示されてい
るにとどまる上，第１次及び第２次チリ価格帯事件においても，チリの価格
帯制度の最低輸入価格該当性について判断するに当たり，この定義に該当す
るか否かが決め手とされていたものでもない。ＷＴＯ農業協定４条２項は，
通常の関税に転換することを要求された措置等を執ってはいけないという意
味では明確であるものの，かかる措置の内容は一義的に明確ではないのであ
る。
したがって，原告の上記主張は理由がない。
４まとめ
以上のとおり，ＷＴＯ農業協定４条２項を裁判規範として用いるためには，
同条項に直接適用可能性が認められなければならないところ，直接適用可能性
は，主観的基準及び客観的基準を満たすか否かを踏まえて判断されるべきであ
る。
そして，主観的基準を満たすためには，条約締結国の国内においてまで，当
該条約の規定を直接適用するという条約締結国の意思が確認できる必要がある
ところ，ＷＴＯ農業協定４条２項の関連規定の内容やその交渉経緯等によれば，
我が国が，ＷＴＯ農業協定４条２項について，個人の権利義務や規制等をその
まま創設したり，同条項を直接適用したりする意思を有していなかったことは
明らかであるから，主観的基準を満たさないといえる。また，ＷＴＯ農業協定
４条２項の規定内容は，当該内容を具体化する法令を待つまでもなく国内で直
接適用できるだけの具体性及び明確性を有するとも認められないから，客観的
基準も満たさないといえる。
したがって，ＷＴＯ農業協定４条２項には直接適用可能性が認められないか
ら，これを裁判規範として用いることはできない。
第２本件差額関税制度はＷＴＯ農業協定４条２項に適合していること
１被告の主張
(1)ＷＴＯ農業協定４条２項の解釈について
ア条約の解釈については条約法条約３１条及び３２条で定められていると
ころ，条約の規定を適用する上では，当該規定の文言につき，上記条約解
釈の原則に従って解釈する必要がある。
イまず，ＷＴＯ農業協定４条２項は「通常の関税」に当たらない措置を禁
止したものであるところ，この「通常の関税」をその用語が用いられてい
た通常の意味や経緯等に従って解釈すると，「従量税，従価税又はその組
合せの形式で譲許されたもの」をいうと解される。第１次チリ価格帯事件
の上級委員会も，「通常の関税」とは「従価税又は従量税（又はその組合
せ）の形式をとるもの」であるとして，同様に解している。
したがって，関税という「税」の形式で課税されていたとしても，それ
が「従量税，従価税又はその組合せの形式で譲許」されていない措置は，
そもそも「通常の関税」に当たらないから，ＷＴＯ農業協定４条２項に適
合しない。
ウ次に，ＷＴＯ農業協定４条２項の趣旨目的は，加盟国において従来様々
な非関税措置によって農業貿易が阻害されてきた状況を踏まえ，農業保護
のためには専ら関税による保護だけが許されるとして，貿易障壁をより透
明にするとともに障壁の高さの測定を容易にし，農産品についての市場ア
クセスを改善しようとした点（関税化）にある。
この点について，第１次チリ価格帯事件の上級委員会は，チリの価格帯
制度がＷＴＯ農業協定４条２項に適合しているか否かを判断するに当たり，
「経験的根拠に基づくアプローチ」を行って，「注１に記載された全ての
国境措置が，通常の関税が行う方法と違った方法で，農産物輸入の量を規
制し，価格を歪曲する共通の目的と効果を持っていることに注目する。さ
らに，これら措置の全てが，また，共通して，国内価格を海外価格変動か
ら切り離し，したがって，海外価格の国内市場への伝達を妨げている。」
（パラ２２７）と述べ，その上で，チリの価格帯制度は，透明性や予測可
能性を著しく欠く手段を採用しており，いずれも輸入量規制効果及び価格
伝達阻害効果を持っているとして，ＷＴＯ農業協定４条２項に適合しない
と判断している。そして，同上級委員会が，「…透明性の欠如及び税水準
の予測可能性の欠如は，輸入量規制をもたらす。（中略）また，海外価格
の国内市場への伝達を妨げて輸入価格の歪曲の一因となる。」と判断して
いることに鑑みると，当該措置が実質的に透明性及び予測可能性を著しく
欠いている場合には，通常であれば，輸入量規制効果及び価格伝達阻害効
果があるということができる。
したがって，上述した「通常の関税」の形式を満たす措置であっても，
実質的に見て透明性及び予測可能性を著しく欠いている場合には，ＷＴＯ
農業協定４条２項の趣旨目的に反し，同条項に適合しないと考えられる。
エ以上の点をまとめると，ＷＴＯ農業協定４条２項の解釈については，①
関税という「税」の形式で課税されていたとしても，それが「従量税，従
価税又はその組合せの形式で譲許」されていない措置は，そもそも「通常
の関税」ではない。また，「通常の」関税の形式を採るものであっても，
②実質的に見て，関税化の特質である透明性及び予測可能性を著しく欠
いている場合には，ＷＴＯ農業協定４条２項の趣旨目的に反し，同条項に
適合しないということができる。
なお，第１次及び第２次チリ価格帯事件の上級委員会は，チリの価格帯
制度が透明性及び予測可能性を著しく欠いていることを認めた上で，その
効果にも言及しているが，これは，ＷＴＯ農業協定４条が市場アクセスの
改善を志向している点を踏まえ，方法だけでなく効果の点からも，チリの
価格帯制度が同条項に反していることを明らかにするとともに，（注）に
挙げられた措置との類似性を具体的に検討したためとも考えられる。
(2)本件差額関税制度は最低輸入価格又はこれに類する「措置」に当たらな
いこと
アはじめに
本件差額関税制度は，従量税と従価税の組合せで譲許された関税である
から，「通常の関税」に当たる。また，本件差額関税制度は，実質的に見
て透明性及び予測可能性を著しく欠くものとはいえないから，ＷＴＯ農業
協定４条２項の趣旨にも反しない。さらに，効果の点に着目して見ても，
本件差額関税制度には輸入量規制効果や価格伝達阻害効果は認められず，
第１次及び第２次チリ価格帯事件の上級委員会が挙げたような「最低輸入
価格」としての特徴を有するものではない。したがって，本件差額関税制
度は最低輸入価格又はこれに類する措置に当たらない。
以下，上記の点を更にふえんして述べる。
イ本件差額関税制度は「通常の関税」に当たること
本件差額関税制度は，輸入価格が分岐点価格以下の場合には，豚肉の重
量１ｋｇ当たりの従量税（ただし，課税後価格が一定の基準輸入価格を超
えるときには，基準輸入価格と輸入価格の差額に引き下げた額）を課すこ
とにより，国内養豚農家を保護する一方，輸入価格が分岐点価格より高い
ときには，一定率の従価税を課すことにより，輸入品の関税負担を軽減し，
消費者等の利益を図るという関税の組合せの制度である。これは，ウルグ
アイ・ラウンド農業交渉以前は関税譲許の対象とはなっていなかった豚肉
について，ウルグアイ・ラウンド農業交渉の結果，モダリティ文書に従っ
て譲許したものである。
したがって，同制度は「通常の関税」に当たるものである。
ウ本件差額関税制度は，透明性及び予測可能性を著しく欠く措置ではない
こと
(ア)ＷＴＯ農業協定４条２項は，貿易障壁をより透明にし，障壁の高さ
の測定を容易にすることで，農産品についての市場アクセスを改善しよ
うとした規定であることから，ある措置について透明性及び予測可能性
が実質的に欠如しているか否かは，当該措置の結果として生じる課税水
準と関連づけて検討されるべきである。第１次チリ価格帯事件の上級委
員会も同様の点を検討している。
(イ)このような課税水準との関係から本件差額関税制度を見るに，本件
差額関税制度において課税額を変動させる諸要素（従量率，従価率，基
準輸入価格，分岐点価格及び従量税適用限度価格）は，いずれも，当該
数値自体又はその算出方法が法律で明確に規定されている。
したがって，第１次チリ価格帯事件の上級委員会が述べているような
事態，すなわち，「輸出者が，関税額が幾らになるかを知らず合理的に
予測することもできない」事態は，本件差額関税制度の下では生じ得な
い。チリの価格帯制度は，変動する下限価格と参照価格との差に基づい
て追加の従量税を課すものであり，下限価格と参照価格の決定過程が不
透明であったため，譲許税率の範囲内で幾らの追加税が課されるのかが
予測できないものであったが，このような特徴は本件差額関税制度には
ないのである。
(ウ)よって，本件差額関税制度は透明性及び予測可能性の欠如という特
徴的な性質を持っていないから，これが実質的にＷＴＯ農業協定４条２
項の趣旨目的に反する措置であるともいえない。
エ本件差額関税制度は，その効果の点から見ても，「最低輸入価格」とし
ての特徴を有するものではないこと
(ア)以上のとおり，本件差額関税制度は「通常の関税」の形式を有して
いる上，実質的に見て透明性及び予測可能性が欠如する措置ではないか
ら，ＷＴＯ農業協定４条２項の趣旨目的には反しない。
したがって，本件差額関税制度は，ＷＴＯ農業協定４条２項に適合し
た措置といえる。このことは，次に述べるとおり，本件差額関税制度の
効果等に照らしても明らかである。
(イ)第１次チリ価格帯事件の上級委員会は，（注）に列挙された措置が
いずれも輸入量規制効果及び価格伝達阻害効果を有しているとし，また，
第１次及び第２次のチリ価格帯事件において，「最低輸入価格」とは，
「本質的に，通常輸入産品の取引価格と特定の価格限界との差額に基づ
いて査定される輸入関税を賦課することによって，当該特定の輸入産品
が当該価格限界を下回って国内市場に侵入することのないようにする措
置」と定義されており，その特徴として第２次チリ価格帯事件の上級委
員会が挙げたのは，①ある船荷に適用できる参照価格が下限価格を下
回った場合，追加の従量税はそれらの数値の差に基づいて付加されるこ
と，②当該措置によって，チリ市場における産品の輸入価格が下限価
格以下に下がることは非常にありそうもないこと，③下限価格は，少
なくとも国内目標価格の代理又は代替物になる程度まで機能すること，
④下限価格と比較して参照価格が低くなればなるほど，追加従量税は
高くなり，保護貿易の効果はそれだけ大きくなること，⑤措置によっ
て国内市場への世界価格の下落の伝搬が歪められることである。
(ウ)以下，上記の各点について，本件差額関税制度と比較する。
ａ確かにウルグアイ・ラウンド農業交渉前の豚肉の差額関税制度では，
最低輸入価格として機能し得る基準輸入価格が存在したが，ウルグア
イ・ラウンド農業交渉合意によってこのような基準輸入価格を含む豚
肉の差額関税制度は廃止され，輸入価格と分岐点価格の高低のみによ
って従価税又は従量税が課されることとなり（関税譲許。ステップ１。
別紙６「図面目録」記載③の図），その後，国際的合意に基づいて従
価税及び従量税が引き下げられた（ステップ２。別紙６「図面目録」
記載④の図）。すなわち，ステップ１及びステップ２では，輸入され
る豚肉に課される関税は，輸入価格が分岐点価格以下であれば従量税
のみであり，輸入価格が分岐点価格を上回れば従価税のみであり，輸
入価格が下落すれば，従量税であれ従価税であれ，いずれにせよ課税
後の価格も下落するのである。
したがって，ステップ１及びステップ２を経た後の差額関税制度は，
輸入価格の下落によって保護貿易の効果が大きくなるとか（輸入量規
制効果），国内市場への世界価格の下落の伝搬が歪められる（価格伝
達阻害効果）などといった，第２次チリ価格帯事件上級委員会が挙げ
る最低輸入価格に共通する特徴（前記(イ)④及び⑤）を有していない
ことは明らかである。
ｂまた，関係国との協議を踏まえて，国内措置として従量税部分を自
主的に引き下げることとなったこと（ステップ３。別紙６「図面目録」
記載⑤の図）に伴い，輸入価格が分岐点価格と同額の場合の課税後の
価格を「基準輸入価格」とし，輸入価格が分岐点価格以下の場合の従
量税のうち基準輸入価格を超える部分はこれを課さない仕組みとした
が，ステップ３において新しく設定された基準輸入価格の機能を分析
すると，これは障壁を低減させる方向に働くものでしかなく，譲許さ
れた従量率に基づく課税の一部を免除して貿易を促進するものと評価
できる。
そうすると，ステップ３を経た後の差額関税制度についても，輸入
価格の下落によって保護貿易の効果が大きくなるとか，国内市場への
世界価格の下落の伝搬が歪められるなどといった，第２次チリ価格帯
事件上級委員会が挙げる最低輸入価格の共通の特徴（前記ア④及び⑤）
を有していないことは明らかである。
ｃ以上のように，「基準輸入価格」が持つ意味は，ウルグアイ・ラウ
ンド農業交渉合意前と後とでは，１８０度異なるのである。
(エ)したがって，上記で述べた最低輸入価格の特徴を勘案しても，本件
差額関税制度が，性質や方法，効果の面において，最低輸入価格と十分
な「相似性又は類似性」を有するとか「同じ種類又は性質」であるとは
認められない。
(3)まとめ
以上のとおり，第１次チリ価格帯事件の上級委員会によるＷＴＯ農業協定
４条２項の解釈によれば，本件差額関税制度がＷＴＯ農業協定４条２項に適
合しているか否かを判断するに当たっては，それが「通常の関税」の形式を
採るものか否か，実質的に見て，関税化の特質である透明性及び予測可能性
を欠くものか否かという観点から検討すべきである。
そして，本件差額関税制度は，従量税及び従価税の組合せの形式で譲許さ
れたものであるから，「通常の関税」の形式を採るものであり，また，透明
性及び予測可能性が欠如するという性質も有していない。
更に付言すれば，本件差額関税制度は，ＷＴＯ農業協定４条２項の（注）
に列挙された「措置」が共通して有するとされる効果（輸入量規制効果及び
価格伝達阻害効果）を有するものではなく，また，第２次チリ価格帯事件の
上級委員会が挙げた「最低輸入価格」の特徴を有するものでもない。
したがって，本件差額関税制度はＷＴＯ農業協定４条２項に適合している
というべきである。
２原告の主張に対する反論
(1)原告は，「通常の関税」とは「従価税，従量税又はその組合せ」であると
ころ，従量税を自主的に引き下げたことによって従量税であったものが従量
税でなくなったなどとし，本件差額関税制度はその定義上「通常の関税」で
はなくなったと主張する。
しかし，一般に従量税とは，課税物件たる物品の個数，重量，長さ，容積，
面積等の数量を課税標準として課される租税であって，例えば，重量を課税
標準とする場合には，「重量×○円／kg」と表せるところ，輸入価格が従量
税適用限度価格を超えて分岐点価格以下である場合には，「１キログラムに
つき枝肉（部分肉）に係る基準輸入価格と課税価格との差額」が課せられ（関
税暫定措置法別表第１の３），これは，課税物件たる物品の重量を課税標準
として課される租税である。
したがって，従量税を自主的に引き下げた部分についても，その課税の実
質が従量税であることには変わりがないから，これが従量税でなくなったこ
とを前提とする原告の上記主張は理由がない。
(2)また，原告は，本件差額関税制度において，従量税適用限度価格以下で輸
入される蓋然性はないから，基準輸入価格が価格限界としての機能を持ち，
最低輸入価格に当たる旨主張する。
しかし，平成１６年に従量税適用限度価格以下で１万５５９ｋｇ輸入され
た実績があるから，原告の主張は前提において誤っている。また，前記１で
述べたとおり，被告は，本件差額関税制度に従量税適用限度価格帯があるこ
とのみを理由として，本件差額関税制度が最低輸入価格に当たらないと主張
しているものでもない。
したがって，原告の上記主張は理由がない。
(3)さらに，原告は，ＷＴＯ農業協定４条２項が最低輸入価格制度を禁止する
のは，これが自由競争市場を大きく歪めるからであるとした上で，本件差額
関税制度は，国外業者の引下げ努力を完全に無効化し，価格競争を歪ませる
程度が極めて大きいなどとも主張する。
しかし，ＷＴＯ農業協定の作成経緯に鑑みれば，ＷＴＯ農業協定４条２項
の趣旨は，農産品貿易に係る国際的な規律を強化する目的の下，それまで鉱
工業品に比べて限定的な形でのみ「関税と貿易に関する一般協定」の規律が
適用され，関税以外の貿易障壁が残っていた農産品貿易について，特例措置
を適用したものを除き通常の関税以外の国境措置を包括的に関税化する国際
法上の義務を負わせることを規定するものである。すなわち，同項は，関税
以外の措置による貿易障壁をなくすことに主眼が置かれており（第１次チリ
価格帯事件のパネル報告パラ７．５７及び７．５８），同項の（注）に列挙
された措置は，過去に採られてきた非関税障壁の実例を列挙したものにすぎ
ない（第１次チリ価格帯事件の上級委員会報告パラ２０９）。
したがって，原告の上記主張はその前提において誤っている。
(4)以上のとおり，本件差額関税制度がＷＴＯ農業協定４条２項に違反してい
るとする原告の主張はいずれも理由がない。
なお，原告は，公刊された書籍（甲２４）の記述を取り上げて，本件差額
関税制度が最低輸入価格であることは所管官庁の農林水産省が認めているな
どとも主張するが，そもそも同書籍は１９９４年（平成６年）に刊行された
ものである。我が国は，ウルグアイ・ラウンド交渉合意を受けて，平成７年
４月に差額関税制度を従価税及び従量税の組合せの形に変更しているから，
上記書籍の記述は，ＷＴＯ農業協定締結以前の差額関税制度について述べた
ものにすぎない。したがって，原告の上記主張も失当である。
以上

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