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平成１７年(行ケ)第１０５８８号審決取消請求事件
平成１９年３月２７日判決言渡，平成１９年２月２２日口頭弁論終結
判決
原告武田薬品工業株式会社
訴訟代理人弁護士片山英二，北原潤一
同弁理士小林浩，高橋秀一
被告特許庁長官中嶋誠
指定代理人中野孝一，柳和子，塚中哲雄，森田ひとみ，田中敬規
主文
原告の請求を棄却する。
訴訟費用は原告の負担とする。
事実及び理由
第１原告の求めた裁判
「特許庁が不服２００４−１５１５３号事件について平成１７年６月１３日にし
た審決を取り消す」との判決。。
第２事案の概要
本件は，後記本件特許発明の特許権者である原告が，特許権存続期間の延長登録
出願をして拒絶査定を受け，これを不服として審判請求をしたところ，審判請求は
成り立たないとの審決がなされたため，同審決の取消しを求めた事案である。
１特許庁における手続の経緯
()本件特許（甲第１号証）1
特許権者：武田薬品工業株式会社（原告）
発明の名称：抗菌剤」「
特許出願日：平成２年２月９日（特願平２−２９９６０号）
優先権主張日：平成元年２月１０日，同年９月１５日（日本）
設定登録日：平成７年１２月８日
特許番号：特許第１９９７９６８号
()本件出願（甲第２号証）2
出願人：武田薬品工業株式会社（原告）
出願日：平成１２年１２月２１日
出願番号：特許権存続期間延長登録願２０００−７００１６７号
()本件手続3
拒絶査定日：平成１６年６月１０日（甲第３号証）
審判請求日：平成１６年７月２１日（不服２００４−１５１５３号）
審決日：平成１７年６月１３日
審決の結論：本件審判の請求は，成り立たない」「。
審決謄本送達日：平成１７年６月２７日
２本件特許発明の要旨
審決が対象とした発明（以下，請求項１に記載された発明を「本件特許発明」と
いう。なお，請求項の数は２個である）の要旨は，以下のとおりである。。
「請求項１】式【
〔式中，Ｒは水素，メトキシまたはトリフルオロメチルを，ＲおよびＲは同123
一または異なって水素またはメチルを，Ｒはフッ素化された炭化水素残基を，ｎ
は０または１をそれぞれ示す〕で表される化合物またはその塩を含有してなる抗。
菌剤。
【請求項２】
（省略」）
３審決の理由の要点
審決の理由は，以下のとおりであるが，要するに，本件出願において，特許法６
７条２項の政令で定める処分として特定された処分（薬事法１４条６項に規定する
。「」。）医薬品の製造の承認事項の一部変更に係る同項の承認以下本件処分という
は，本件特許発明の「抗菌剤」という用途についてなされたものということはでき
ないから「抗菌剤」の用途に係る本件特許発明を実施するために本件処分が必要，
であったとは認められない，とするものである。
()本件出願について1
「本件出願は，特許発明の実施について特許法第６７条第２項の政令に定める処分を受ける
ことが必要であったとして，４年３月２２日の特許権存続期間の延長を求めるものであり，そ
の政令で定める処分として，以下の内容を特定している。
（１）延長登録の理由となる処分
薬事法第１４条第６項に規定する医薬品の製造の承認事項の一部変更に係る同項の承認
（２）処分を特定する番号
承認番号２０４００ＡＭＺ０１１０５０００号
（３）処分を受けた日
平成１２年９月２２日
（４）処分の対象となった物
ランソプラゾール
（５）処分の対象となった物について特定された用途
胃潰瘍又は十二指腸潰瘍におけるヘリコバクター・ピロリの除菌の補助」
()審決の判断2
「４−１）特許法第６８条の２は『特許権の存続期間が延長された場合・・・の当該特許権（，
の効力は，その延長登録の理由となった第６７条第２項の政令で定める処分の対象となった物
（その処分においてその物の使用される特定の用途が定められている場合にあっては，当該用
途に使用されるその物）についての当該特許発明の実施以外の行為には，及ばない』と規定。
しており，この規定に照らすと，延長登録が認められるためには，政令で定める当該処分の範
囲と延長登録出願の対象である特許発明の範囲とが重複していることが必要である。
（４−２）これを本件についてみるに，本件出願の添付資料である，平成２年１１月２９日付
け医薬品製造承認申請書（販売名タケプロンカプセル３０，その別紙()，()及び別紙『ラ）12
ンソプラゾール基準品の規格及び試験方法，並びに平成１１年２月１６日付け医薬品製造承』
認事項一部変更承認申請書（販売名タケプロンカプセル３０）によれば，本件処分の対象とな
った物は『ランソプラゾール』であって，本件特許発明の化合物においてＲ＝水素，Ｒ＝
メチル，Ｒ＝水素，Ｒ＝トリフルオロエチル，ｎ＝１としたものと一致するから，本件特
許発明の物と重複している。
（４−３）一方，本件処分においてランソプラゾールに追加された用途は，上記添付資料によ
れば『胃潰瘍又は十二指腸潰瘍におけるＨｐの除菌の補助』であり，本件特許発明の用途で，
ある『抗菌（剤』とは文言上一致していない。）
（４−４）そこで，本件処分で追加された『・・・Ｈｐの除菌の補助』という用途が『抗菌，
（剤』という本件特許発明の用途と，文言は相違しても実質的に重複するか否かについて，）
以下に検討する。
一般に『抗菌』は『除菌』を包含する広い概念又は上位概念を示す用語であることが認め，
られる。したがって，本件処分で追加された『・・・Ｈｐの除菌の補助』という用途が『・・
・Ｈｐの除菌』という用途と実質的に同一である限りにおいては『抗菌（剤』が『除菌の補，）
助』をも包含し，両用途は重複することとなる。しかしながら，本件処分で追加された『・・
・Ｈｐの除菌の補助』という用途は『・・・Ｈｐの除菌』という用途と同一視することはで，
きない。その理由は以下のとおりである。
平成１６年３月２５日付け意見書に参考資料１として添付された『タケプロンカプセル１５
及び同３０の添付文書情報』の【薬効薬理】の欄には『３．ヘリコバクター・ピロリ除菌の，
補助作用・・・()（省略）()アモキシシリン及びクラリスロマイシンとの３剤療法における12
ランソプラゾールの役割は胃内ｐＨを上昇させることにより，アモキシシリン及びクラリスロ
マイシンの抗菌活性を高めることにあると考えられる』と記載され，ランソプラゾールの除。
菌の補助が該成分自身の抗菌作用に由来する効能効果でないことが明らかである（クラリスロ
マイシン，アモキシシリン及びランソプラゾールを，以下単に『３剤』ということがある。）
また上記添付文書の記載の基礎となったランソプラゾールの承認申請の審査結果に係る国立
医薬品食品衛生研究所の『審査報告書（衛研発第２７０１号）の１４頁１６∼１９行及び２』
８頁１∼９行によれば，当該承認申請の審査においては，ランソプラゾールが弱いＨｐ抗菌作
用を持つという事実は認識しながらも，３剤併用時のランソプラゾールの作用効果は，あくま
で他の２剤の抗菌力を高めたり分解を抑制したりすることによって『除菌の補助（胃内ｐＨの
調節』を行うものとして確認されている。）
さらに上記報告書の『審査結果』の項の６∼７頁によれば，３剤併用療法において新たに追
加された各薬剤の用途（効果・効能）については，ランソプラゾールが『胃潰瘍又は十二指腸
潰瘍におけるＨｐの除菌の補助』と記載されているのに対し，アモキシシリン及びクラリスロ
マイシンは『胃潰瘍又は十二指腸潰瘍におけるＨｐ感染』と記載されている。また同報告書の
『新医薬品第四調査会における審査の概要』の項の１９頁２６∼３２行をみても，各薬剤が奏
する作用に関し『Ｈｐの除菌』と『除菌の補助（胃内ｐＨの調節』とは区別して記載されて）
いるすなわち同報告書では３剤併用療法においてランソプラゾールについて認められた・。，『
・・Ｈｐの除菌の補助』という用途は，Ｈｐに対して除菌又は抗菌作用を発揮する役割を果た
す他の２剤の用途とは相違するものとして認識されていることが明らかである。
そうすると，これら添付文書及びその基礎となった審査報告書の記載内容からみて，承認申
請の審査で３剤併用療法において新たに認められたランソプラゾールの『・・・Ｈｐの除菌の
補助』という用途は『・・・Ｈｐの除菌』という用途と実質的に同一とみることはできない，
から，結局，本件処分で追加されたランソプラゾールの『・・・Ｈｐの除菌の補助』という用
途は，他の２剤の用途とは異なり，本件特許の『抗菌剤』という用途と実質的に重複すると言
うことはできない。
（４−５）この点に関し請求人は，平成１６年１１月１８日付けの審判請求書の手続補正書に
おいて，本件処分で新たに認められたランソプラゾールの用途が文言上『Ｈｐの除菌の補助』
という表現であっても，これは３剤併用療法におけるランソプラゾールがそれ自体としての抗
菌作用の発揮以上に他の抗菌剤の抗菌力の向上や分解の防止という主要な役割を果たすことが
当局に重視されたに過ぎず，ランソプラゾール自体が単独でＨｐに対する選択的抗菌作用を有
することを当局は認めた上で承認を与えているのであるから，本件処分で追加された『Ｈｐの
除菌の補助』という用途は『Ｈｐの除菌』という用途と実質的に同義であるか，又は『Ｈｐの
除菌』若しくは『３剤の組合せによる抗菌剤』という用途の下位概念であることを主張すると
ともに，平成１７年３月２２日付けのＦＡＸによる審尋書に対する平成１７年４月１５日付け
回答書において，本件処分の審査では『除菌』という用語は菌に対する作用の程度（強さ）に
関して『抗菌』という用語と区別して使用されていることを考慮すれば『審査報告書』にラ，
ンソプラゾールが『除菌』効果を有しないという記載があったとしても，そのことは『抗菌』
効果がないことを意味せず，むしろランソプラゾールがＨｐに対する『抗菌』作用を持つこと
を当局は否定していないのであるから『抗菌剤』に係る本件特許発明を実施するためには本，
件処分が必要であったことを主張している。
（４−６）しかしながら，たとえランソプラゾールがそれ自体単独で『抗菌』作用を有するこ
とが事実であっても（そもそも『抗菌剤』に係る本件特許が存在すること自体，ランソプラゾ
ールが『抗菌』作用を有することを前提としているから，このことは当然の事実であることは
措くとして，本件出願に係る延長登録が認められるためには，あくまで本件処分の範囲（物）
と用途と本件特許発明の範囲物と用途とが重複していることが必要であることは上記４）（）（
−１）で述べたとおりであり，本件処分で追加されたランソプラゾールの『・・・Ｈｐの除菌
の補助』という用途が，本件特許発明の『抗菌剤』という用途と文言上一致していないばかり
か，実質的にも重複しないことは，上記（４−３）及び（４−４）で述べたとおりであって，
本件処分は本件特許発明の『抗菌剤』という用途についてされたものということはできないか
，，らランソプラゾールがそれ自体単独でＨｐに対する抗菌作用を有するか否かにかかわりなく
『抗菌剤』の用途に係る本件特許発明を実施するために『Ｈｐの除菌の補助』の用途を追加す
る本件処分が必要であったとは認められない」。
()審決の「むすび」3
「したがって，本件処分は，本件出願に係る特許発明の実施に必要な処分であったとは認め
られないから，本件出願は特許法第６７条の３第１項第１号の規定に該当し，本件特許権存続
期間の延長登録を受けることができない」。
第３原告の主張（審決取消事由）の要点
審決は，著しい理由不備があり，また，本件処分において，対象である物である
「ランソプラゾール（本件特許発明に係る化合物の一般名）について特定された」
用途である「胃潰瘍又は十二指腸潰瘍におけるヘリコバクター・ピロリの除菌の補
助（以下，ヘリコバクター・ピロリを「Ｈｐ」と，この特定された用途を，単に」
「Ｈｐの除菌の補助」又は「除菌の補助」ということがある）が，本件特許発明。
における「抗菌（剤」という用途と実質的に重複しないと誤って判断したもので）
あるから，取り消されるべきである。
１取消事由１（著しい理由不備）
審決は「一般に『抗菌』は『除菌』を包含する広い概念又は上位概念を示す用，，
語であることが認められるとしながらしたがって本件処分で追加された・。」，「，『
・・Ｈｐの除菌の補助』という用途が『・・・Ｈｐの除菌』という用途と実質的に
同一である限りにおいては『抗菌（剤』が『除菌の補助』をも包含し，両用途は，）
重複することとなる「しかしながら，本件処分で追加された『・・・Ｈｐの除。」，
菌の補助』という用途は『・・・Ｈｐの除菌』という用途と同一視することはで，
きない」と判断したのみで，除菌の補助と抗菌とが実質的に重複しないとの結論。
を導いたものである。
Ｈｐの除菌の補助という用途がＨｐの除菌という用途と実質的に同一であれば，
，，。Ｈｐの除菌の補助が抗菌に包含され両用途が重複することはそのとおりである
しかしながら，仮に，Ｈｐの除菌の補助という用途がＨｐの除菌という用途と同一
でなかったとしても，直ちに，除菌の補助と抗菌とが実質的に重複しないというこ
とはできない。なぜなら，抗菌は除菌の上位概念であるから，抗菌という概念は，
除菌以外の下位概念の領域を有するところ，除菌の補助が当該領域において抗菌と
いう概念に含まれ，これと重複する可能性があるからである。すなわち，抗菌と除
菌の補助とが重複しないことを論証するためには，除菌の補助が，除菌と実質的に
同一でないことを示すだけでは不十分であり，除菌の補助が，抗菌に属するあらゆ
る下位概念と実質的に同一でないことを示さなければならない。
したがって，単に，除菌の補助が除菌と実質的に同一でないという理由のみで，
，，除菌の補助が抗菌と実質的に重複しないと結論付けた審決には論理の飛躍があり
著しい理由不備が存するものというべきである。
２取消事由２（除菌の補助が，本件特許発明における抗菌という用途と実質的に
重複しないとした判断の誤り）
()審決は「タケプロンカプセル１５」及び「タケプロンカプセル３０（い1，」
ずれもランソプラゾールの販売名）の添付文書情報（乙第１号証。以下「本件添付
文書情報」という）の【薬効薬理】欄３に「ヘリコバクター・ピロリ除菌の補助。，
作用」との標題で「アモキシシリン及びクラリスロマイシンとの３剤療法におけ，
るランソプラゾールの役割は胃内ｐＨを上昇させることにより，アモキシシリン及
びクラリスロマイシンの抗菌活性を高めることにあると考えられる」との記載が。
あり（以下，アモキシシリン，クラリスロマイシン及びランソプラゾールを，単に
「３剤」ということがある，また，ランソプラゾールの承認申請の審査結果に係。）
（）（。る国立医薬品食品衛生研究所の審査報告書衛研発第２７０１号甲第２２号証
以下「本件審査報告書」という）に「ランソプラゾールは弱いＨｐ抗菌作用を持。，
つが，Ｈｐ除菌における３剤併用のメリットは，Ｈｐに対して抗菌力を示す３剤に
よる相加作用ではなく，抗菌薬アモキシシリン及びクラリスロマイシン２剤の抗菌
力を高め，胃酸によるこれら２剤の分解を抑制するために，ランソプラゾールが組
，。」（），み合わされ相乗作用が期待されていることを確認した１４頁１６∼１９行
「これらの３剤を組み合わせることによって，ランソプラゾールによる胃内ｐＨの
上昇は，アモキシリンの胃内での分解を抑制し，クラリスロマイシンの抗菌作用を
高め，アモキシシリンとクラリスロマイシンのＨｐに対する相加・相乗的除菌効果
の上昇をもたらす（２８頁４∼７行）等の記載があることに基づいて「同報告。」，
書では，３剤併用療法においてランソプラゾールについて認められた『・・・Ｈｐ
の除菌の補助』という用途は，Ｈｐに対して除菌又は抗菌作用を発揮する役割を
果たす他の２剤の用途とは相違するものとして認識されていることが明らかで
ある。そうすると，これら添付文書及びその基礎となった審査報告書の記載内容
からみて，承認申請の審査で３剤併用療法において新たに認められたランソプラゾ
ールの『・・・Ｈｐの除菌の補助』という用途は『・・・Ｈｐの除菌』という用，
途と実質的に同一とみることはできない」とし，ひいて，ランソプラゾールの『Ｈ
ｐの除菌の補助』という用途と本件特許発明の『抗菌剤』という用途が実質的に重
複するということはできない，と判断した。
審決のこの判断は，ランソプラゾールのＨｐの除菌の補助という用途の範囲を，
胃内のｐＨの調節というランソプラゾールの作用の一つに基づき限定解釈したこと
によって，導かれたものと考えられるが，行政処分である本件処分の対象である医
薬品の効能，効果（用途）と，行政処分の対象ではない当該医薬品の作用機序とを
混同したものであって，誤りである。
（なお，被告は，原告がその主張で用いる「作用機序」という語の用い方が誤りで
，「」，「」あってランソプラゾールの胃内のｐＨの調節作用等については薬理作用
という語を用いるべきであると主張するがこれを作用機序と表記するか薬，「」，「
理作用」と表記するかは，単なる言葉の問題にすぎない）。
()すなわち，本件処分は，薬事法１４条６項（平成１１年法律第１６０号に2
。，，。）よる改正前のもの以下同法１４条を引用する場合は同改正前のものを指す
に基づく，販売名「タケプロンカプセル３０」に係る医薬品製造承認事項一部変更
承認（効能及び効果」を「胃潰瘍，十二指腸潰瘍，吻合部潰瘍，逆流性食道炎，「
症候群」から「胃潰瘍，十二指腸潰瘍，吻合部潰瘍，逆流性食道Zollinger-Ellison
炎，症候群，胃潰瘍又は十二指腸潰瘍におけるヘリコバクター・Zollinger-Ellison
ピロリの除菌の補助」に変更すること等を変更事項とするもの）であるところ，同
（，，法１４条による医薬品の製造承認本件と関連のある医療用医薬品に限定しまた
製造承認事項一部変更承認を含む。以下同じ）の構造上，承認の要件である，当。
該医薬品の有効性（同条２項１号の「効能，効果」を有すること）の審査の対象と
なるのは，その医薬品が臨床現場において使用される特定の用途（特定の治療法）
との関係における効能，効果それ自体であり，当該医薬品が，その投与を受けた患
者の体内でどのようなメカニズムにより上記効能，効果を発現するかという，医薬
品の作用機序までは，有効性審査の対象となるものではない。承認審査の過程にお
いては，当該医薬品の作用機序についても検討されるのが通例であるが，審査の対
象はあくまで，当該医薬品の特定の治療法に係る効能，効果それ自体であって，医
薬品の作用機序は，臨床試験の結果によって確認される医薬品の効能，効果の論拠
を科学的に説明するための情報として位置付けられるものである。
そうすると，医薬品の製造承認という行政処分において，処分の対象である医薬
品の効能，効果（用途）は，臨床現場における特定の治療法との関係で，その意味
内容や範囲が確定されるものであり，医薬品の作用機序に基づいて確定されるもの
ではない。たとえば，承認に係る効能，効果を発現するに至る当該医薬品の作用機
序が，承認審査の段階で議論されたものと異なることが，承認後に判明したとして
も，そのことをもって，当該医薬品が，承認に係る効能，効果と異なる効能，効果
を有する医薬品であると判断されるものではない。
()本件処分は，ランソプラゾールにつき，アモキシシリンとクラリスロマイ3
シンとの併用において「胃潰瘍又は十二指腸潰瘍におけるヘリコバクター・ピロリ
の除菌の補助」を効能，効果とするものである。
しかるところ，審決は，ランソプラゾールの効能，効果である「除菌の補助」と
「胃内ｐＨの調節」とを同義であるものとして，上記判断をしたものである。
しかしながら「胃内ｐＨの調節」とは「除菌の補助」という効能，効果と同一，，
ではなく「除菌の補助」という効能，効果を発現するためのメカニズム（作用機，
序）である。そして，上記のとおり，作用機序自体は，医薬品の製造承認という行
，。，政処分において処分の対象ではない本件処分におけるランソプラゾールの効能
効果は「Ｈｐの除菌の補助，すなわち，アモキシシリン及びクラリスロマイシン，」
と併用して除菌療法に使用されることにより，除菌を補い助けることであって，ど
のような作用機序で除菌を補い助けるかは，本件処分の対象である効能，効果の範
囲とは無関係である。のみならず，審決は，本件審査報告書の１４頁１６∼１９行
及び２８頁１∼９行の記載を要約するに当たり「除菌の補助（胃内ｐＨの調節」，）
との表記を用いて，本件審査報告書が，あたかも除菌の補助と胃内ｐＨの調節とを
同義としているかのように記載しているが，本件審査報告書の各該当箇所には「除
菌の補助（胃内ｐＨの調節」との表記はなく，かつ，各該当箇所の記載は，除菌）
の補助と胃内ｐＨの調節とを同義と判断したものでもない。本件審査報告書の１９
「（）」，頁２６∼３２行の記載中には除菌の補助胃内ｐＨの調節との表記があるが
この記載部分は「Ｈｐの除菌」と「潰瘍治療又は潰瘍の再発防止」との区別に力，
点があるのであって，除菌の補助と胃内ｐＨの調節とを同義としているものではな
い。
したがって，除菌の補助と胃内ｐＨの調節とが同義であるものとした上で，ラン
ソプラゾールの「Ｈｐの除菌の補助」という用途を「Ｈｐの除菌」という用途と実
質的に同一とみることはできないとした審決の判断は誤りである。
()上記のとおり「除菌の補助」という効能，効果を発現するための作用機序4，
は，本件処分の対象ではないから，ランソプラゾールをアモキシシリン及びクラリ
スロマイシンと併用して除菌療法に使用した場合の「Ｈｐの除菌の補助，すなわ」
ち，Ｈｐの除菌を補い助けるための作用機序は，胃内ｐＨの調節に限られず，たと
えば，静菌作用，すなわち「菌の増殖を一時的に止めること」であっても，また，
胃内ｐＨの調節作用と静菌作用の双方でＨｐの除菌を補い助けることであっても，
本件処分の効力の範囲内である。
他方，抗菌剤における「抗菌」とは「菌に対抗すること」であり，除菌（菌を取
り除くこと，殺菌（菌を死滅させること，静菌などは，いずれも抗菌の概念に含））
まれるし，また，静菌作用を有する薬剤，すなわち，静菌剤は，抗菌剤の概念に含
まれるものである。
そして，ランソプラゾールは，Ｈｐの静菌作用を有するものであるところ，臨床
現場において，ランソプラゾールを静菌剤として，アモキシシリン及びクラリスロ
マイシンと併用し，Ｈｐの除菌療法に使用することは「Ｈｐの除菌の補助」とい，
う本件処分で承認された効能，効果の範囲内の行為であり，ランソプラゾールが，
臨床現場において静菌剤としてＨｐの除菌療法に使用されることを認識しつつ除，「
菌の補助」という効能，効果を有するものとして，これを製剤化し，販売すること
は，本件処分の効力の範囲内の行為であるとともに「ランソプラゾールを含有し，
てなる抗菌剤」の発明である本件特許発明の実施に該当するものである。
したがって，ランソプラゾールの「Ｈｐの除菌の補助」という用途と本件特許発
明の「抗菌（剤」という用途は重複するものであり，実質的に重複するというこ）
とはできないとした審決の判断は誤りである。
()被告は，本件添付文書情報及び本件審査報告書の記載から見て，本件処分5
において，ランソプラゾールに係る「除菌の補助」とは，ランソプラゾールが胃内
ｐＨの調節を行い，アモキシシリン及びクラリスロマイシンの胃酸による分解を防
ぐことによって，アモキシシリン及びクラリスロマイシンの除菌作用を補助するこ
とを意味するものであって，ランソプラゾールの薬理作用は，除菌作用でも抗菌作
用でもないことを述べ，本件処分で認められたランソプラゾールの用途は抗菌剤と
しての用途とはいえないと主張する。
，「」，，しかしながら本件処分の対象である除菌の補助という効能効果の意味を
本件処分に至る審査過程において，当該効能，効果をもたらす作用機序（被告のい
う「薬理作用）として最も有力視されたものだけに基づく効能，効果に限定しな」
ければならない必然性は存在せず「除菌の補助」に対する抗菌作用の貢献が審査，
の過程で完全に否定されたものでない以上，たとえ，抗菌作用が胃内ｐＨの調節作
用と比べて「除菌の補助」への貢献度が低いものであったとしても，胃内ｐＨの調
節作用とともに抗菌作用が貢献した結果としての「除菌の補助」についても，本件
処分により承認されたものと解することができる。
薬事法による製造承認の制度は，申請に係る医薬品が申請に係る効能，効果を有
するものとして承認を与えるものであって，当該効能，効果をもたらす作用機序に
ついて承認を与えるという構造にはなっておらず，これを一義的に確定することは
必須ではない。承認に係る効能，効果をもたらす可能性のある作用機序が複数あり
得る場合，そのうちのある作用機序につき，承認に至る審査の過程において，当該
効能，効果をもたらすものでないことが明確に確認されたといったような特段の事
情がない限り，当該作用機序によってもたらされる当該効能，効果についても，承
認の処分により薬事法上の禁止が解除されたことになるとの理解を前提として，特
許発明との間の重複の有無を判断すべきである。
()仮に，本件処分によって承認された効能，効果である「除菌の補助」の意6
義を「胃内ｐＨの調節作用のみによってもたらされる除菌の補助」と限定して解，
したとしても，ランソプラゾールにおいて，胃内ｐＨの調節作用は，Ｈｐ抗菌作用
をもたらすメカニズムの一つと考えられるから「胃内ｐＨの調節作用のみによっ，
てもたらされる除菌の補助」という効能，効果は「抗菌作用によってもたらされ，
る除菌の補助」を概念上包含することになり，かかる効能，効果は本件特許発明の
「抗菌剤」の用途と重複するということができる。
すなわちランソプラゾールはプロトンポンプ阻害薬以下略称を用いてＰ，，（，「
ＰＩ」という）に含まれるものであるところ「」。，HelicobacterResearchvol.8,no.1
所収の小池智幸外９名による「酸分泌抑制薬による尿素呼気試験の偽陰性化」と題
する論文（甲第３０号証）には，ＰＰＩによる胃内中性化（胃内ｐＨの上昇）が，
Ｈｐ以外の細菌の胃内での増殖を引き起こし，その結果としてＨｐの発育や活性が
抑制される可能性があることや，上記胃内ｐＨの上昇が，低ｐＨの胃中でもＨｐが
生存できる根拠であるＨｐのウレアーゼ活性の低下を引き起こすと推察されること
が記載されており，ＰＰＩの胃内ｐＨの調節作用も，Ｈｐの静菌（抗菌）作用をも
たらすメカニズムの一つであると考えられているのである。
したがって，仮に「除菌の補助」の意義を「胃内ｐＨの調節作用のみによって，，
もたらされる除菌の補助」と限定して解した場合であっても，本件処分によって承
認された効能，効果（用途）は，本件特許発明の用途と重複するものである。
第４被告の反論の要点
１取消事由１（著しい理由不備）に対し
原告は「除菌の補助」が「除菌」と実質的に同一でないという理由のみで，除，
菌の補助が「抗菌」と実質的に重複しないと結論付けた審決には，論理の飛躍があ
り，著しい理由不備が存すると主張するが，誤りである。
すなわち，特許権の存続期間の延長登録出願において，特許法６７条２項の「そ
の特許発明の実施について安全性の確保等を目的とする法律の規定による許可その
他の処分であって当該処分の目的，手続等からみて当該処分を的確に行うには相当
」（「」。）の期間を要するものとして政令で定めるもの以下政令で定める処分という
を受けることにより禁止が解除された範囲と，特許発明の範囲とが重複していなけ
れば，同法６７条の３第１項１号の「その特許発明の実施に第６７条第２項の政令
で定める処分を受けることが必要であったとは認められないとき」に当たること。
になり，存続期間の延長登録出願は拒絶される。しかるところ，本件特許発明は，
抗菌作用（本件特許出願に係る公告公報（甲第１号証）に掲載された本件特許に係
る明細書（以下「本件明細書」という）の実験例１によれば「Ｈｐの発育阻止作。，
用）を利用した医薬用途発明であり，用途発明については，処分の範囲と特許発」
明の範囲とは，物と用途によって画されることになる。そして，本件特許発明にお
ける物（化合物群）と本件処分の対象となった物（ランソプラゾール）とが重複し
ていることは明らかであるが本件出願においては本件処分で認められた用途除，，（
菌の補助という効能，効果）が，本件特許発明に係る用途（抗菌剤）と，文言上，
，，一致していないのであるからこれが実質的に重複するか否かを判断するためには
除菌の補助という効能，効果が，用途発明である本件特許発明が利用する用途（抗
菌作用又はＨｐの発育阻止作用）を利用した効能，効果であるか否かを実体的に判
断せざるを得ない。
，，（，），そこで審決は本件処分で認められた用途除菌の補助という効能効果が
（），，，本件特許発明に係る用途抗菌剤と文言上一致していないことを指摘した上
本件添付文書情報及びその基礎となった本件審査報告書の記載から見て，本件処分
，「」，においてランソプラゾールにつき特定された効能効果である除菌の補助とは
ランソプラゾールが胃内ｐＨの調節を行い，アモキシシリン及びクラリスロマイシ
ンの胃酸による分解を防ぐことによって，アモキシシリン及びクラリスロマイシン
の除菌作用を補助することを意味すること，すなわち，本件添付文書情報及び本件
審査報告書に，Ｈｐの除菌はアモキシシリン及びクラリスロマイシンの働きによっ
て行われ，本件処分で認められた効能，効果である「除菌の補助」に寄与するラン
ソプラゾールの作用は抗菌作用ではないことが明記されていることに基づきラ，，「
ンソプラゾールの除菌の補助が該成分自身の抗菌作用に由来する効能効果でないこ
とが明らかである」旨指摘して，除菌の補助が抗菌と実質的に重複しないと判断し
たものであり，原告主張の誤りはない。
２取消事由２（除菌の補助が，本件特許発明における抗菌という用途と実質的に
重複しないとした判断の誤り）に対し
()原告は，薬事法１４条による医薬品の製造承認において，承認の要件であ1
る，当該医薬品の有効性の審査の対象となるのは，その医薬品の効能，効果それ自
体であり，当該医薬品が，その投与を受けた患者の体内でどのようなメカニズムに
より上記効能，効果を発現するかという，医薬品の作用機序までは，有効性審査の
，，「」，対象となるものではなくランソプラゾールの効能効果である除菌の補助と
当該効能，効果を発現するための作用機序である「胃内ｐＨの調節」とを同義であ
るものとして，除菌の補助が，本件特許発明における抗菌という用途と実質的に重
複しないとの判断をした審決は誤りであると主張する。
（なお，一般に，薬物の「作用（薬理作用」という語と「作用機序」という語は），
区別されて使用されている「薬理作用」とは，薬物が生体に働きかけて起こす作。
用のことをいい，たとえば，ランソプラゾールの「胃内ｐＨの調節」作用は薬理作
用である。そして，薬理作用が生体に有利に作用した結果が効能，効果になる。こ
れに対し「作用機序」とは，薬物が生体の細胞に働きかけて組織，器官，個体の，
生理学的な反応を引き起こす諸過程のことをいい，薬物がある「薬理作用」を発現
するための生化学的又は生理学的な「メカニズム」とも言い換えられる。以下，原
告の主張する「作用機序」は「薬理作用」の意味であると理解して反論する），。
しかしながら，処分に係る効能，効果（用途）を特許発明の用途と対比して，そ
の重複の有無を検討する際に，両者の文言が異なっているときには，当然，その実
体を判断しなければならない。本件についていえば，本件処分で認められた「Ｈｐ
の除菌の補助」という効能，効果（用途）が，本件特許発明と同じく抗菌作用に基
づくものであるか，あるいは胃酸抑制作用など他の薬理作用を利用したものである
かによって，両用途が重複するか否かの判断が変わってくることは当然であり，し
たがって，本件処分で認められた「Ｈｐの除菌の補助」の意味を理解する必要があ
る。そして，そのために，添付文書（本件添付文書情報）や，本件審査報告書のよ
うな審査資料を参照することも常識的な手段である。
しかるところ，上記１のとおり，本件添付文書情報及びその基礎となった本件審
査報告書の記載から見て，本件処分においてランソプラゾールにつき特定された効
能，効果である「Ｈｐの除菌の補助」とは，ランソプラゾールが胃内ｐＨの調節を
行い，アモキシシリン及びクラリスロマイシンの胃酸による分解を防ぐことによっ
て，アモキシシリン及びクラリスロマイシンの除菌作用を補助することを意味する
ものであって，ランソプラゾールの薬理作用は，除菌作用を発揮する他の２剤（ア
モキシシリン及びクラリスロマイシン）とは相違するものであることが認められる
ので，審決は，本件処分で認められた除菌の補助という効能，効果を得るために利
用されているランソプラゾールの（薬理）作用が「胃内ｐＨの調節」作用であり，
除菌作用でも抗菌作用でもないことを述べ，本件処分で認められたランソプラゾー
ルの用途は抗菌剤としての用途とは言えないとの判断をしたものである。
()原告は，ランソプラゾールを，静菌剤としてアモキシシリン及びクラリス2
ロマイシンと併用し，Ｈｐの除菌療法に使用することは「Ｈｐの除菌の補助」と，
，，，いう本件処分で承認された効能効果の範囲内の行為でありランソプラゾールが
臨床現場において静菌剤としてＨｐの除菌療法に使用されることを認識しつつ除，「
菌の補助」という効能，効果を有するものとして，これを製剤化し，販売すること
は，本件処分の効力の範囲内の行為であるとともに「ランソプラゾールを含有し，
」。てなる抗菌剤の発明である本件特許発明の実施に該当するものであると主張する
しかしながら，本件処分において，ランソプラゾールについて認められた効能，
効果（除菌の補助）の範囲内に，静菌剤（抗菌剤）としての使用（行為）が存在す
るというためには，３剤併用Ｈｐ除菌療法の用法用量に従って使用したときに，ラ
ンソプラゾールの静菌作用（抗菌作用）が発揮され，その作用が除菌の補助という
効能，効果をもたらしていることが，本件処分に当たって確認され，製造承認がな
されたことが明らかにされなければならないが，そのようなことは明らかにされて
いない。また，ランソプラゾールを使用したことが「抗菌剤」に係る医薬用途発，
明である本件特許発明の実施に該当するといえるためには，ランソプラゾールが単
に抗菌作用を持っているだけでは足りず，これに抗菌作用を発揮させるための使用
でなければならない。そうでなければ，物の有する性質（薬理作用）を専ら利用す
る用途発明を実施したことにならないからである。しかるに，ランソプラゾールは
抗菌作用ではなく，あくまでｐＨ調節作用を発揮して他の２剤を補助するための除
菌補助剤として承認されたのであるから，除菌療法に使用されるという認識とは関
係なく，当該使用は「抗菌剤」に係る本件特許発明の実施に該当しない。，
()したがって，原告の主張は誤りであり，審決に原告主張の誤りはない。3
第５当裁判所の判断
１本件処分について
()甲第４（医薬品製造承認事項一部変更承認書，第５（医薬品製造承認事項1）
一部変更承認申請書，第２２号証（本件審査報告書，乙第１号証（本件添付文書））
情報）及び弁論の全趣旨によれば，以下の事実を認めることができる。
ア本件処分は，販売名「タケプロンカプセル３０」に係る，薬事法１４条６項
に基づく医薬品製造承認事項一部変更承認であり，変更事項は「効能及び効果」，
Zollinger-Ellisonについて従前の胃潰瘍十二指腸潰瘍吻合部潰瘍逆流性食道炎，「，，，，
症候群」に「胃潰瘍又は十二指腸潰瘍におけるヘリコバクター・ピロリの除菌の補
助」を追加し，これに伴って「用法及び用量」につき「胃潰瘍又は十二指腸潰瘍，，
」，「，におけるヘリコバクター・ピロリの除菌の補助の場合に係るものとして通常
成人にはランソプラゾールとして１回３０ｍｇ，アモキシシリンとして１回７５０
ｍｇ（力価）及びクラリスロマイシンとして１回２００ｍｇ（力価）の３剤を同時
に１日２回，７日間経口投与する。なお，クラリスロマイシンは，必要に応じて適
。，（）。」宜増量することができるただし１回４００ｍｇ力価１日２回を上限とする
を付け加えた点である。
，（「」イ本件処分と並行してアモキシシリン販売名・アモリンカプセル１２５
等）及びクラリスロマイシン（販売名・クラリス錠２００」等）についても，医「
薬品製造承認事項一部変更承認の処分がなされたところ，その変更事項は「効能，
及び効果」について「胃潰瘍又は十二指腸潰瘍におけるヘリコバクター・ピロリ，
感染」を追加し「用法及び用量」につき「胃潰瘍又は十二指腸潰瘍におけるヘリ，，
コバクター・ピロリ感染」に係るものとして，上記アと同旨の内容を付加した点で
ある。
ウ本件処分後の「タケプロンカプセル３０」の添付文書（タケプロンカプセ「
ル１５」の添付文書を兼ねる）の「薬効薬理」欄には「ヘリコバクター・ピロリ。，
除菌の補助作用」として「()アモキシシリン及びクラリスロマイシンとの３剤療，2
法におけるランソプラゾールの役割は胃内ｐＨを上昇させることにより，アモキシ
シリン及びクラリスロマイシンの抗菌活性を高めることにあると考えられる」と。
の記載がある。
エ本件処分並びに上記イのアモキシシリン及びクラリスロマイシンについての
医薬品製造承認事項一部変更承認の処分に係る承認申請に関し，医薬品医療機器審
査センターでの審査の結果を記載した，国立医薬品食品衛生研究所長作成の厚生省
医薬安全局長宛て審査報告書（本件審査報告書）には，以下の記載がある。
(ア)「本剤はランソプラゾール，アモキシシリン及びクラリスロマイシンの併
用投与による胃潰瘍又は十二脂腸潰瘍におけるＨｐの除菌を目的とした薬剤であ
る（１１頁１１∼１３行）」
(イ)「また，ランソプラゾールは弱いＨｐ抗菌作用を持つが，Ｈｐ除菌におけ
，，る３剤併用のメリットはＨｐに対して抗菌力を示す３剤による相加作用ではなく
抗菌薬アモキシシリン及びクラリスロマイシン２剤の抗菌力を高め，胃酸によるこ
れら２剤の分解を抑制するために，ランソプラゾールが組み合わされ，相乗作用が
期待されていることを確認した（１４頁１６∼１９行）。」
(ウ)「また，調査会は，申請者に，①３剤併用療法の副作用及び投与期間につ
いての適切な情報伝達を行い，患者に対しては適切な情報伝達及び十分な服薬指導
を行うこと，②３剤併用の『効能・効果』は『胃潰瘍又は十二指腸潰瘍におけるヘ
』，『』リコバクター・ピロリの除菌であり各薬剤はヘリコバクター・ピロリの除菌
又は『除菌の補助（胃内ｐＨの調節』を行っているにすぎない。したがって『潰），
瘍の治療』あるいは『潰瘍の再発防止』については，国内において検証されていな
いことを，臨床現場及び患者に十分に情報提供すること，等を指導した（１９頁。」
２６∼３２行）
(エ)「胃潰瘍，十二脂腸潰瘍患者で，Ｈｐ感染が明らかな患者に対して，ラン
ソプラゾール，アモキシシリン，クラリスロマイシン各単剤それぞれでは，Ｈｐ除
菌を行うことは不十分であることが明らかである。しかしながら，これらの３剤を
組み合わせることによって，ランソプラゾールによる胃内ｐＨの上昇は，アモキシ
シリンの胃内での分解を抑制し，クラリスロマイシンの抗菌作用を高め，アモキシ
シリンとクラリスロマイシンのＨｐに対する相加・相乗的効果をもたらす・・・。
これらの成績は併用療法による除菌効果を裏付けるものであり，各単剤のみで除菌
効果を裏付けるものではない。そのため，用法・用量の記載は・・・併用する薬剤
の用量も明記させた（２８頁２∼１３行）。」
()上記()の各事実によれば，本件処分は，ランソプラゾール，アモキシシリ21
ン，クラリスロマイシンの３剤併用療法によるＨｐ除菌作用において，ランソプラ
ゾールによる胃内ｐＨの上昇が，アモキシシリンの胃内での分解を抑制し，クラリ
スロマイシンの抗菌作用を高め，アモキシシリン及びクラリスロマイシン２剤のＨ
ｐの除菌に係る相加・相乗的効果をもたらすことを認め「効能及び効果」を「胃，
潰瘍又は十二指腸潰瘍におけるヘリコバクター・ピロリの除菌の補助」とし，この
「効能及び効果」に係る「用法及び用量」を，アモキシシリン及びクラリスロマイ
シンとの各所定量の同時投与として，なされたものであること，これに対し，アモ
，，キシシリン及びクラリスロマイシンは３剤併用療法によるＨｐ除菌作用において
Ｈｐの除菌効果そのものが確認され，この２剤に対しては「胃潰瘍又は十二指腸，
潰瘍におけるヘリコバクター・ピロリ感染」を追加された「効能及び効果」とする
医薬品製造承認事項一部変更承認の処分がなされたことを認めることができる。３
剤併用療法によるＨｐ除菌作用において，ランソプラゾールがこれと異なる作用を
経て，アモキシシリン及びクラリスロマイシン２剤のＨｐの除菌に係る相加・相乗
的効果を発現，向上させる事実が確認され，それが本件処分がなされるにつき考慮
されたとの事実を認めるに足りる証拠はない。
２取消事由１（著しい理由不備）について
原告は「抗菌」が「除菌」の上位概念であって，除菌以外の下位概念の領域を，
有するところ「除菌の補助」が当該領域において抗菌という概念に含まれ，抗菌，
と重複する可能性があるから，除菌の補助が除菌と実質的に同一でないという理由
のみで，除菌の補助が抗菌と実質的に重複しないと結論付けた審決には，論理の飛
躍があり，著しい理由不備が存すると主張する。
しかるところ，原告の上記主張は，形式論理上は，成り立たないでもない。しか
しながら，抗菌の下位概念に包含されるもので，文言上「除菌の補助」と最も近，
いと考えられるものは除菌であるから審決が本件処分に係る効能効果用「」，，，（
途）である「除菌の補助」と，本件特許発明の用途である「抗菌（剤」との実体）
的な重複の有無を判断するに当たり「除菌の補助」という用途を，抗菌の下位概，
念のうちの「除菌」という用途と対比して実質的な同一性を検討し，これを否定す
る判断をした以上，除菌以外の下位概念についてまで，検討を及ぼさなくとも，特
段の事情のない限り「除菌の補助」と「抗菌」との実体的な重複の有無の判断に，
おいて足りるものというべきであり，上記特段の事情の存在を認めるに足りる証拠
もない。
なお，原告は，後記のとおり，除菌以外の抗菌の下位概念である「静菌」という
用途が「除菌の補助」と重複すると主張するが，上記１のとおり，本件審査報告，
書及び本件添付文書情報，その他の資料上，３剤併用療法によるＨｐ除菌作用にお
いて，ランソプラゾールが，その静菌作用により，アモキシシリン及びクラリスロ
マイシン２剤のＨｐの除菌に係る相加・相乗的効果を発現，向上させる事実が確認
され，それが本件処分がなされるにつき考慮されたことを窺わせる根拠はなく，審
決は，このことにより「静菌」という下位概念との重複は論ずるまでもないと判，
断したものと解されるところ，後記３の()のイ，ウで説示するところによれば，3
審決のかかる判断が誤りであるということはできない。
したがって，審決に，原告主張の理由不備があるということはできない。
３取消事由２（除菌の補助が，本件特許発明における抗菌という用途と実質的に
重複しないとした判断の誤り）について
()特許法６７条２項，６７条の３第１項によれば，特許権の存続期間の延長1
は，その特許発明の実施に，政令で定める処分を受けることが必要である場合にな
され，その特許発明の実施に，政令で定める処分を受けることが必要であったとは
認められないときは，特許権の存続期間の延長登録の出願は拒絶されるところ，同
「，法６８条の２に特許権の存続期間が延長された場合・・・の当該特許権の効力は
その延長登録の理由となった第６７条第２項の政令で定める処分の対象となった物
（その処分においてその物の使用される特定の用途が定められている場合にあって
，），は当該用途に使用されるその物についての当該特許発明の実施以外の行為には
及ばない」との規定があること，及び，本件特許発明が，いわゆる用途発明であ。
って特許請求の範囲の請求項１記載の化合物ランソプラゾールの抗菌作用性，（）（
質）を専ら利用する発明であることにかんがみれば，本件特許発明の実施に本件処
分を受けることが必要であるというためには，本件処分において定められた特定の
用途である「胃潰瘍又は十二指腸潰瘍におけるヘリコバクター・ピロリの除菌の補
助」と，本件特許発明の用途である「抗菌」とが重複することが必要であり，これ
が重複すると認められないときは，同法６７条の３第１項により，本件出願は拒絶
されるべきものと解される。
，，なお本件特許発明の実施に本件処分を受けることが必要であるというためには
本件処分において定められた特定の用途と，用途発明である本件特許発明の用途と
が重複することのほか，本件処分の対象となった物と，物の発明である本件特許発
明で特定された物とが重複すること（すなわち，本件処分及び本件特許発明をそれ
ぞれ画する物と用途の双方が重複すること）が，もとより必要であるが，物が重複
することについては，審決がこれを認めており，当事者間に争いがない。
()しかるところ，審決は，本件添付文書情報の記載内容に基づき「ランソプ2
」，ラゾールの除菌の補助が該成分自身の抗菌作用に由来する効能効果でないことを
また，本件審査報告書の記載内容に基づき「承認申請の審査においては・・・３，，
剤併用時のランソプラゾールの作用効果は，あくまで他の２剤の抗菌力を高めたり
分解を抑制したりすることによって『除菌の補助（胃内ｐＨの調節』を行うもの）
として確認されている」こと，及び本件審査報告書では「３剤併用療法において，
ランソプラゾールについて認められた『・・・Ｈｐの除菌の補助』という用途は，
Ｈｐに対して除菌又は抗菌作用を発揮する役割を果たす他の２剤（判決注：アモキ
シシリン及びクラリスロマイシン）の用途とは相違するものとして認識されている
こと」を，それぞれ認定した上「承認申請の審査で３剤併用療法において新たに，
認められたランソプラゾールの『・・・Ｈｐの除菌の補助』という用途は『・・，
・Ｈｐの除菌』という用途と実質的に同一とみることはできないから，結局，本件
処分で追加されたランソプラゾールの『・・・Ｈｐの除菌の補助』という用途は，
他の２剤の用途とは異なり，本件特許の『抗菌剤』という用途と実質的に重複する
と言うことはできない」と判断したものである。
そして，上記１の認定事実に照らして，審決の上記各認定事項に誤りはなく，こ
れらの認定事項に基づく上記判断にも誤りはないものと認められる。
()これに対し，原告は，審決の上記認定判断が誤りであると主張するので，3
以下，原告の当該主張の論拠について，順次検討する（なお，被告は，原告の「作
用機序」という語の用い方が誤りであって「薬理作用」という語を用いるべきで，
，，「」，あると主張するが少なくとも本件において原告の使用する作用機序の語と
被告の使用する「薬理作用」の語は，いわゆる言葉の問題以上に相違するものでは
ないと認められるから，差し当たり，原告の用語に従って「作用機序」の語を用，
いることにする。。）
アまず，原告は，医薬品の製造承認という行政処分において，処分の対象であ
る医薬品の効能，効果（用途）は，臨床現場における特定の治療法との関係で，そ
の意味内容や範囲が確定されるものであり，当該医薬品がどのようなメカニズムに
より上記効能，効果を発現するかという，作用機序に基づいて確定されるものでは
ないと主張するところ，本件につき，当該主張に係る「臨床現場における特定の治
療法との関係」が「３剤併用Ｈｐ除菌療法の用法用量に従った使用との関係」と，
いう意味であれば，本件処分に係る行政処分としての効力の範囲の問題としては，
原告主張のとおりと考えられる。すなわち，仮に，本件処分後に，ランソプラゾー
ル，アモキシシリン，クラリスロマイシンの３剤併用療法によるＨｐ除菌作用にお
いて，ランソプラゾールが，アモキシシリン及びクラリスロマイシン２剤のＨｐの
除菌に係る相加・相乗的効果をもたらす作用機序が，ランソプラゾールによる胃内
ｐＨの上昇が，アモキシシリンの胃内での分解を抑制し，クラリスロマイシンの抗
菌作用を高めることによるものではなく，例えば，Ｈｐ菌の増殖を一時的に止める
静菌作用によるものであることが判明したとしても，本件処分が誤りであるとか，
新たな医薬品製造承認事項一部変更承認が必要であるとされるものではない。
しかるところ，原告は，このことを根拠として，審決が，ランソプラゾールの効
能，効果である「Ｈｐの除菌の補助」と「胃内ｐＨの調節」という作用機序とを同
義であるものとして判断した誤りがあると主張する。
しかしながら，審決が「除菌の補助（胃内ｐＨの調節」という表記を用いたと，）
しても，それは，ランソプラゾールが，胃内ｐＨの調節という作用機序によって，
アモキシシリン及びクラリスロマイシン２剤のＨｐの除菌効果を補助するという趣
旨であって，審決が「Ｈｐの除菌の補助」と「胃内ｐＨの調節」という作用機序，
とを同義であるものとしているものではないことは，その説示に照らして明らかで
ある（本件審査報告書も，同様の趣旨で「除菌の補助（胃内ｐＨの調節」との表，）
記を用いていることは，上記１の()のエの(ウ)のとおりである。そして，本件1。）
処分が，行政処分としての効力の範囲としては，３剤併用療法におけるランソプラ
ゾールの「Ｈｐの除菌の補助」という効能，効果が，胃内ｐＨの調節（上昇）とい
う特定の作用機序に基づく場合に限られるものではないとしても，審決が，本件特
許権存続期間の延長登録出願の当否を判断するに当たって「Ｈｐの除菌の補助」，
という効能，効果をもたらす作用機序について検討したことをもって，誤りという
ことはできない。
すなわち仮に本件出願に対する当否の判断に当たりランソプラゾールの除，，，「
菌の補助」という効能，効果をもたらす作用機序を全く考慮してはならないとすれ
ば，本件処分におけるランソプラゾールの効能，効果（用途）と，用途発明である
本件特許発明の用途とが重複するか否かは，本件処分に係る「除菌の補助」との文
言と，本件特許発明の用途である「抗菌（剤」との文言が一致するかどうかに従）
って，これを検討する以外に方法はなく，そうであれば「除菌の補助」との文言，
と「抗菌（剤」との文言は一致していないから，本件処分で追加されたランソプ，）
「」，，「（）」ラゾールのＨｐの除菌の補助という用途は直ちに本件特許発明の抗菌剤
という用途と重複していないと評価されざるを得ない。
しかるところ，審決は「本件処分においてランソプラゾールに追加された用途，
は・・・胃潰瘍又は十二指腸潰瘍におけるＨｐの除菌の補助』であり，本件特許，『
発明の用途である『抗菌（剤』とは文言上一致していない（審決書３頁３０行∼）」
４頁２行）とした上で「本件処分で追加された『・・・Ｈｐの除菌の補助』とい，
う用途が『抗菌（剤』という本件特許発明の用途と，文言は相違しても実質的に，）
重複するか否かについて（同４頁３∼５行，さらに判断をしているのであり，そ」）
の判断過程において「Ｈｐの除菌の補助」という効能，効果をもたらす作用機序，
を取り上げて検討しているものであるところ，このように「除菌の補助」と「抗，
（）」，，菌剤との重複の有無を単に文言上の一致・不一致だけに求めるのではなく
文言は相違しても実質的に重複するか否かという検討を経て判断することはまこと
に相当であり，そして，その場合に，実質的に重複するか否かを判断するための資
料は「除菌の補助」という効能，効果をもたらす作用機序以外に見当たらないか，
ら，審決が，本件出願の当否を判断するに当たって「Ｈｐの除菌の補助」という，
効能，効果をもたらす作用機序について検討したことは当然であり，これを誤りと
することはできない。
イ次に，上記のとおり，本件処分の行政処分としての効力の範囲としては，３
「」，，剤併用療法におけるランソプラゾールのＨｐの除菌の補助という効能効果が
胃内ｐＨの調節（上昇）という特定の作用機序に基づく場合に限られるものではな
く，例えば，仮に，Ｈｐ菌の増殖を一時的に止める静菌作用によるものであること
が判明した場合であっても，また，胃内ｐＨの調節と静菌作用の双方によるもので
あることが判明した場合であっても，本件処分の効力が及ぶものと考えられるとこ
ろ，原告は「静菌」は「抗菌」の概念に含まれ，かつ，ランソプラゾールはＨｐ，
の静菌作用を有するものであるから，ランソプラゾールを静菌剤として，アモキシ
シリン及びクラリスロマイシンと併用し，Ｈｐの除菌療法に使用することは「Ｈ，
ｐの除菌の補助」という効能，効果の範囲内の行為であり，ランソプラゾールが，
臨床現場において静菌剤としてＨｐの除菌療法に使用されることを認識しつつ除，「
菌の補助」という効能，効果を有するものとして，これを製剤化し，販売すること
は，本件処分の効力の範囲内の行為であるとともに「ランソプラゾールを含有し，
」。てなる抗菌剤の発明である本件特許発明の実施に該当するものであると主張する
しかしながら，本件処分が，ランソプラゾール，アモキシシリン，クラリスロマ
イシンの３剤併用療法によるＨｐ除菌作用において，ランソプラゾールによる胃内
ｐＨの上昇が，アモキシシリンの胃内での分解を抑制し，クラリスロマイシンの抗
菌作用を高め，アモキシシリン及びクラリスロマイシン２剤のＨｐの除菌に係る相
加・相乗的効果をもたらすことを認めてなされたものであること，３剤併用療法に
よるＨｐ除菌作用において，ランソプラゾールが，静菌作用等，これと異なる作用
により，アモキシシリン及びクラリスロマイシン２剤のＨｐの除菌に係る相加・相
乗的効果を発現，向上させる事実が確認され，それが本件処分がなされるにつき考
慮された形跡が認められないことは，上記１のとおりである。そして，上記アのと
おり，本件処分におけるランソプラゾールの効能，効果（用途）と本件特許発明の
用途とが，実質的に重複するか否かの判断に当たって，ランソプラゾールの「除菌
の補助」という効能，効果をもたらす作用機序について検討する場合には，本件処
分がなされるにつき，考慮された作用機序に基づいてこれを行うべきものであり，
仮に「静菌」が「抗菌」の概念に含まれ，また，ランソプラゾールが，Ｈｐの静，
菌作用を有するものであるとしても，３剤併用療法によるＨｐ除菌作用において，
ランソプラゾールの静菌作用が，アモキシシリン及びクラリスロマイシン２剤のＨ
ｐの除菌に係る相加・相乗的効果をもたらすとの，本件処分において考慮された形
跡のない作用機序について検討すべきであるとすることはできない。
この点につき，原告は「除菌の補助」という効能，効果の意味を，本件処分に，
至る審査過程において，当該効能，効果をもたらす作用機序として最も有力視され
，，たものだけに基づく効能効果に限定しなければならない必然性は存在しないとか
抗菌作用が胃内ｐＨの調節作用と比べて「除菌の補助」への貢献度が低いものであ
ったとしても，胃内ｐＨの調節作用とともに抗菌作用が貢献した結果としての「除
菌の補助」についても，本件処分により承認されたものと解されると主張するが，
上記のとおり，本件処分がなされるにつき，３剤併用療法によるＨｐ除菌作用にお
いて，ランソプラゾールの静菌作用が，胃内ｐＨの調節作用より貢献度が低いにせ
よ，アモキシシリン及びクラリスロマイシン２剤のＨｐの除菌に係る相加・相乗的
効果を発現，向上させる事実が確認され，それが本件処分がなされるにつき考慮さ
れたという形跡はないのであるから，上記主張は，前提を誤るものといわざるを得
ない。
また，原告は，薬事法による製造承認の制度は，申請に係る医薬品が申請に係る
効能，効果を有するものとして承認を与えるものであって，当該効能，効果をもた
らす作用機序について承認を与えるという構造にはなっていないから，製造承認に
係る効能，効果をもたらす可能性のある作用機序が複数あり得る場合，承認に至る
審査の過程において，ある作用機序が，当該効能，効果をもたらすものでないこと
が明確に確認されたといったような事情がない限り，当該作用機序によってもたら
される当該効能，効果についても，承認の処分により薬事法上の禁止が解除された
ことになるとの理解を前提として，特許発明との間の重複の有無を判断すべきであ
ると主張する。しかしながら，薬事法による製造承認の制度の構造が，原告主張の
とおりであり，本件処分の行政処分としての効力の範囲としては，３剤併用療法に
おけるランソプラゾールの「Ｈｐの除菌の補助」という効能，効果が，胃内ｐＨの
調節（上昇）という特定の作用機序に基づく場合に限られるものではなく，本件処
分後に，Ｈｐ菌の増殖を一時的に止める静菌作用によるものであることが判明した
場合であっても，本件処分の効力が及ぶものと考えられるとしても，当該効能，効
果が，Ｈｐ菌の増殖を一時的に止める静菌作用によるものであることが判明した場
合というのは，あくまで仮定の議論であり，現実に，そのような作用機序が認めら
れるとして，本件処分に当たって考慮されたものではない。そして，少なくとも本
件においては，上記アのとおり，本件処分に係る「除菌の補助」との文言と，用途
「（）」，発明である本件特許発明の用途である抗菌剤との文言が一致しない場合に
これが実質的に重複するか否かを判断するために，ランソプラゾールの「除菌の補
」，，助という効能効果をもたらす作用機序について検討することを要するのであり
この場合の検討の対象である作用機序が，本件処分に係る審査の段階で否定されな
かった（むしろ「言及されなかった」というべきである）というだけの，仮定の，。
もので足りるということはできない。
したがって，原告の上記主張も失当である。
ウ原告は，小池智幸外９名による「酸分泌抑制薬による尿素呼気試験の偽陰性
」（），（）化と題する論文甲第３０号証にＰＰＩによる胃内中性化胃内ｐＨの上昇
が，Ｈｐ以外の細菌の胃内での増殖を引き起こし，その結果としてＨｐの発育や活
性が抑制される可能性があることや，上記胃内ｐＨの上昇が，低ｐＨの胃中でもＨ
ｐが生存できる根拠であるＨｐのウレアーゼ活性の低下を引き起こすと推察される
ことが記載されているから，ＰＰＩに含まれるランソプラゾールの胃内ｐＨの調節
作用も，Ｈｐの静菌（抗菌）作用をもたらすメカニズムの一つであり，ランソプラ
ゾールの「除菌の補助」の意義を「胃内ｐＨの調節作用のみによってもたらされ，
る除菌の補助」と解した場合であっても，本件処分によって承認された効能，効果
（用途）は，本件特許発明の用途と重複すると主張する。
しかしながら，仮に，ランソプラゾールの胃内ｐＨの調節作用が，Ｈｐの静菌作
用をもたらすメカニズムの一つであるとしても，本件処分が，ランソプラゾール，
，，アモキシシリンクラリスロマイシンの３剤併用療法によるＨｐ除菌作用において
ランソプラゾールによる胃内ｐＨの上昇が，アモキシシリンの胃内での分解を抑制
し，クラリスロマイシンの抗菌作用を高め，アモキシシリン及びクラリスロマイシ
ン２剤のＨｐの除菌に係る相加・相乗的効果をもたらすことを認めてなされたもの
，，，であることは上記１のとおりであり本件審査報告書及び本件添付文書情報には
ランソプラゾールの胃内ｐＨの調節作用が，Ｈｐの静菌作用をもたらし，Ｈｐの静
菌作用がアモキシシリン及びクラリスロマイシン２剤のＨｐの除菌に係る相加・相
乗的効果をもたらすというような作用機序については記載も示唆もされておらず，
他に，本件処分が，そのような作用機序を認めてなされたことを認めるに足りる証
拠もない。
そうすると，ランソプラゾールの胃内ｐＨの調節作用が，Ｈｐの静菌（抗菌）作
用をもたらすメカニズムの一つであるとしても，本件処分におけるランソプラゾー
ルの「除菌の補助」という効能，効果が「抗菌作用によってもたらされる除菌の，
補助」を概念上包含するということはできず，原告の上記主張も失当である。
４結論
以上によれば，原告の主張はすべて理由がなく，原告の請求は棄却されるべきで
ある。
知的財産高等裁判所第４部
裁判長裁判官
塚原朋一
裁判官
石原直樹
裁判官
佐藤達文

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