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平成２０年８月２９日判決言渡同日原本領収裁判所書記官
平成１８年（ワ）第１９８０２号育成者権侵害差止等請求事件
口頭弁論終結日平成２０年７月２２日
判決
群馬県桐生市＜以下略＞
原告森産業株式会社
訴訟代理人弁護士太田恒久
同石井妙子
同深野和男
同川端小織
同伊藤隆史
北海道白老郡＜以下略＞
被告有限会社うめつぼ
訴訟代理人弁護士矢花公平
主文
１被告は，別紙１記載１及び２の種苗を生産し，調整し，譲渡の申
出をし，譲渡し，又はこれらの行為をする目的をもって保管しては
ならない。
２被告は，原告に対し，２０７万５０００円及びこれに対する平成
１８年９月２４日から支払済みまで年５分の割合による金員を支払
え。
３原告のその余の請求をいずれも棄却する。
４訴訟費用は，これを３分し，その２を原告の負担とし，その余は
被告の負担とする。
５この判決の第２項は，仮に執行することができる。
事実及び理由
第１請求
１主文第１項と同旨
２被告は，別紙１記載１及び２の種苗の生産に供した，別紙２記載の設備及
び材料を廃棄せよ。
３被告は，原告に対し，６４５万４５１９円及びこれに対する平成１８年９
月２４日から支払済みまで年５分の割合による金員を支払え。
４被告は，北海道新聞（全道版朝刊）及び日本農業新聞（北海道版）に，縦
２段以上（上下６７ミリ以上），横１／２以上（左右１９２ミリ以上）の大
きさで，表題１０ポイント以上本文８ポイント以上の文字で，別紙３記載の
謝罪広告を各１回掲載せよ。
第２事案の概要
１事案の要旨
本件は，種苗法に基づき品種登録されたしいたけの育成者権を有する原告
が，被告が上記しいたけの種菌から菌床を製造し，販売等をした行為が原告
の育成者権を侵害するなどと主張して，被告に対し，種苗法３３条１項，２
項に基づき，別紙１記載１及び２の種苗の生産，譲渡等の差止め及び別紙２
記載の設備等の廃棄を，民法７０９条（種苗法３４条１項，２項）に基づ
き，不法行為による損害賠償を，種苗法４４条に基づき，原告の信用回復に
必要な措置として別紙３記載の謝罪広告の掲載を求めた事案である。
２争いのない事実
(1)当事者
ア原告は，食用茸，栽培用種菌及び種駒の製造，販売等を業とする株式
会社である。
イ被告は，しいたけ菌床の製造，販売等を業とする特例有限会社であ
る。
(2)原告の育成者権
ア(ア)明治製菓株式会社（以下「明治製菓」という。）は，品種登録番
号第７２１９号として品種登録されたしいたけ（平成７年９月２８日
出願，平成１１年４月１５日登録，登録品種の名称「ＪＭＳ５Ｋ−
１６」。以下，この登録品種を「登録品種Ａ」という。）の育成者
権（以下「本件育成者権Ａ」という。）を有していた。
(イ)原告は，平成１４年９月１２日，明治製菓から，本件育成者権Ａ
を譲り受け，平成１５年２月２８日，その旨の移転登録を受けた。
(ウ)登録品種Ａは，別紙１中の別紙１−Ａの「重要な形質欄」記載の
形質について「重要な形質に係る特性欄」記載の特性を有する。
イ(ア)原告と甲は，品種登録番号第７１６６号として品種登録されたし
いたけ（平成７年３月１０日出願，平成１１年３月１７日登録，登録
品種の名称「ＭＭ−２号」。以下，この登録品種を「登録品種Ｂ」と
いう。）の育成者権（以下「本件育成者権Ｂ」という。）を共有して
いる。
(イ)登録品種Ｂは，別紙１中の別紙１−Ｂの「重要な形質欄」記載の
形質について「重要な形質に係る特性欄」記載の特性を有する。
(3)被告の行為
ア被告は，業として，登録品種Ａの種菌を用いて菌床を製造し（以下，
この菌床を「菌床Ａ」という。），平成１６年１月１５日から平成１７
年２月２４日までの間，以下のとおり，菌床Ａ合計３万５５００玉（代
金合計３９６万５０００円）を販売した。
売却年月日売却先売却数（玉）単価（円）
①平16.１.15東磐井地方森林組合10,000110
②平16.10.21乙１6,000120
③平16.11.７東磐井地方森林組合9,500110
④平17.２.24東磐井地方森林組合10,000110
合計35,500玉3,965,000円
イ被告は，業として，登録品種Ｂの種菌を用いて菌床を製造し（以下，
この菌床を「菌床Ｂ」という。），平成１５年１月１７日から平成１７
年５月１０日までの間，以下のとおり，菌床Ｂ合計７万９０００玉（代
金合計９１６万円）を販売した。
売却年月日売却先売却数（玉）単価（円）
①平15.１.17乙２5,000110
②平15.２.14乙３7,000110
③平15.４.23乙４4,000110
④平16.３.12乙３7,000110
⑤平16.３.31乙５5,000110
⑥平16.４.４乙６4,000110
⑦平16.４.13乙７2,000110
⑧平16.５.９乙４6,000110
⑨平16.５.15乙８2,000110
⑩平17.３.15乙６7,000110
⑪平17.３.29乙３9,000110
⑫平17.４.５乙９7,000110
⑬平17.４.16乙７3,000110
⑭平17.５.９乙４8,000110
⑮平17.５.10乙８3,000110
合計79,000玉9,160,000円
ウなお，種菌は，種苗の一形態であり，しいたけの種菌を用いて（すな
わち，種菌を培地に接種して）菌床を製造し，菌床内でしいたけ菌（種
菌）を増殖させることは，種苗の生産に該当し，また，製造された菌床
を販売することは，種苗の譲渡に該当する。
３争点
本件の争点は，本件育成者権Ａ，Ｂについての被告の通常利用権の成否及
び効力（争点１），本件育成者権Ａ，Ｂの侵害行為についての被告の過失の
推定（種苗法３５条）を覆す事情の有無（争点２），原告の差止請求及び廃
棄請求の可否（争点３），被告が賠償すべき原告の損害額（争点４），原告
の謝罪広告掲載請求の可否（争点５）である。
第３争点に関する当事者の主張
１争点１（通常利用権の成否及び効力）について
(1)被告の主張
ア本件育成者権Ａについての通常利用権
(ア)被告は，平成１４年９月１７日，明治製菓から，登録品種Ａの種
菌を購入した。被告は，その際，明治製菓から，本件育成者権Ａにつ
いて上記種菌を用いて菌床を製造，販売することの通常利用権の許諾
を受けた。
(イ)被告は，前記(ア)の通常利用権に基づいて，平成１５年１１月１
８日から同月２１日までの間に前記(ア)の種菌を用いて菌床Ａ１万玉
を製造し，前記第２の２(3)ア①のとおり，平成１６年１月１５日，こ
れを東磐井地方森林組合に販売した。
したがって，被告による上記菌床Ａ１万玉の製造，販売は，本件育
成者権Ａの侵害に当たらない。
イ本件育成者権Ｂについての通常利用権
(ア)被告は，平成１４年１２月から平成１５年３月までの間，甲が代
表者を務める有限会社宮本産業（以下「宮本産業」という。）から，
登録品種Ｂの種菌を購入した。被告は，その際，甲から，本件育成者
権Ｂについて上記種菌を用いて菌床を製造，販売することの通常利用
権の許諾を受けた。
(イ)甲は，被告に対して前記(ア)のとおり通常利用権を許諾すること
について，原告の同意を得た。
(ウ)被告は，前記(ア)の通常利用権に基づいて，前記(ア)の種菌を用
いて菌床Ｂを製造し，前記第２の２(3)イ①ないし⑨のとおり，菌床Ｂ
合計４万２０００玉を販売した。
したがって，被告による上記菌床Ｂ合計４万２０００玉の製造，販
売は，本件育成者権Ｂの侵害に当たらない。
(2)原告の反論
ア本件育成者権Ａについての通常利用権の主張に対し
被告主張の菌床Ａ１万玉は，被告が明治産業から購入した登録品種Ａ
の種菌を用いて製造したこと，被告が明治製菓から本件育成者権Ａにつ
いて通常利用権の許諾を受けたことは，いずれも否認する。
また，仮に被告が明治製菓から本件育成者権Ａについて通常利用権の
許諾を受けたとしても，明治製菓から本件育成者権Ａを譲り受け，その
移転登録を受けた原告に対し，上記通常利用権の効力を主張することは
できない（種苗法３２条３項）。
イ本件育成者権Ｂについての通常利用権の主張に対し
被告主張の菌床Ｂ合計４万２０００玉は，被告が宮本産業から購入し
た登録品種Ｂの種菌を用いて製造したこと，被告が甲から本件育成者権
Ｂについて通常利用権の許諾を受けたことは，いずれも否認する。
また，仮に被告が甲から本件育成者権Ｂについて通常利用権の許諾を
受けたとしても，本件育成者権Ｂの共有者である原告は，上記通常利用
権の許諾について同意した事実はないから，上記通常利用権の許諾の効
果は生じない（種苗法２３条３項）。
２争点２（種苗法３５条の過失の推定を覆す事情の有無）について
(1)被告の主張
ア菌床Ａの製造，販売に関する無過失
(ア)被告は，平成１５年８月から平成１７年５月までの間，原告の代
理店である株式会社オー・エス・エフ（以下「オー・エス・エフ」と
いう。）から，登録品種Ａの種菌を購入し，上記種菌を用いて前記第
２の２(3)ア②ないし④に係る菌床Ａ合計２万５５００玉を製造，販売
した。
被告代表者は，被告がオー・エス・エフから上記種菌を購入した
際，オー・エス・エフは被告が菌床の製造，販売の事業を行っている
ことを十分承知していながら，オー・エス・エフから通常利用権の許
諾の話は出なかったことなどから，上記種菌の購入代金には，上記種
菌を用いて菌床を製造，販売することについての通常利用権の許諾料
が含まれているものと信じ，また，オー・エス・エフが原告の正規代
理店であることから，オー・エス・エフは原告から本件育成者権Ａに
ついての通常利用権の許諾権限が付与されているものと信じた。
そして，被告代表者においてオー・エス・エフを通じて原告から本
件育成者権Ａについての通常利用権の許諾を受けたものと信じたこと
に相当の理由があるから，過失はない。
(イ)以上によれば，被告には，前記第２の２(3)ア②ないし④に係る菌
床Ａ合計２万５５００玉の製造，販売による本件育成者権Ａの侵害に
ついて過失はない。
イ菌床Ｂの製造，販売に関する無過失
(ア)ａ被告は，前記１(1)イ(ア)，(ウ)のとおり，宮本産業から購入し
た登録品種Ｂの種菌を用いて，前記第２の２(3)イ①ないし⑨に係る
菌床Ｂ合計４万２０００玉を製造，販売した。
ｂ被告代表者は，被告が前記ａの種菌を購入した際，宮本産業は被
告が菌床の製造，販売の事業を行っていることを十分承知していた
ことから，前記ａの種菌の購入代金には，前記ａの種菌を用いて菌
床を製造，販売することについての通常利用権の許諾料が含まれて
いるものと信じた。
また，被告代表者は，その際，甲から，宮本産業が販売した登録
品種Ｂについては同社が責任を持つと告げられたため，甲の被告に
対する本件育成者権Ｂについての通常利用権の許諾につき原告から
同意があったものと信じた。
そして，被告代表者において甲の被告に対する本件育成者権Ｂに
ついての通常利用権の許諾につき原告から同意があったものと信じ
たことに相当の理由があるから，過失はない。
ｃ以上によれば，被告には，前記第２の２(3)イ①ないし⑨に係る菌
床Ｂ合計４万２０００玉の製造，販売による本件育成者権Ｂの侵害
について過失はない。
(イ)ａ被告は，平成１７年１月２４日，丙から，有限会社振興園（以
下「振興園」という。）製造の「ＭＴ−２」と称するしいたけ種菌
を購入し，上記種菌から前記第２の２(3)イ⑩ないし⑮に係る菌床Ｂ
合計３万７０００玉を製造した。
ｂ前記ａの種菌は，登録品種Ｂと同一品種であった。
しかし，前記ａの種菌の容器のラベルに「しいたけ種菌ＭＴ−
２」と記載されていたこと，被告には種菌の品種を確認する技術も
設備もなく，容器のラベル記載の種菌の品種名を信じるしかなかっ
たこと，登録品種の種苗を業として譲渡する者には，当該登録品種
の名称の使用義務があり（種苗法２２条１項），名称の使用義務違
反に対しては過料の制裁があること（平成１９年法律第４９号によ
る改正前の種苗法６２条）から，被告代表者には，前記ａの種菌を
購入した当時，前記ａの種菌が登録品種Ｂと同一品種の種菌である
との認識はなかった。
そして，被告代表者において前記ａの種菌を購入した当時前記ａ
の種菌が登録品種Ｂと同一品種の種菌であるとの認識はなかったこ
とに相当の理由があるから，過失はない。
ｃ以上によれば，被告には，前記第２の２(3)イ⑩ないし⑮に係る菌
床Ｂ合計３万７０００玉の製造，販売による本件育成者権Ｂの侵害
について過失はない。
(2)原告の反論
ア菌床Ａの製造，販売に関する無過失の主張に対し
被告が原告の代理店であるオー・エス・エフから購入した登録品種Ａ
の種菌を用いて前記第２の２(3)ア②ないし④に係る菌床Ａを製造，販売
したことは認める。
しかし，原告は，オー・エス・エフに限らず，原告の代理店に対し，
原告の育成者権について通常利用権を許諾する権限を付与していない。
このことは，被告代表者が被告の設立前に原告の従業員として勤務した
経験のあること，被告がかつて原告の代理店であったことなどから，被
告代表者は十分知っていたはずである。
したがって，被告代表者が，オー・エス・エフから上記種菌を購入し
た当時，オー・エス・エフには原告から本件育成者権Ａについての通常
利用権の許諾権限が付与されており，上記種菌の購入代金に通常利用権
の許諾料が含まれているものと信じていなかったことは明らかである。
イ菌床Ｂの製造，販売に関する無過失の主張に対し
(ア)被告代表者が宮本産業から購入した登録品種Ｂの種菌の購入代金
に通常利用権の許諾料が含まれているものと信じたこと，被告代表者
が甲の被告に対する本件育成者権Ｂについての通常利用権の許諾につ
き原告から同意があったものと信じたことは，いずれも否認する。
(イ)被告が，丙から購入した振興園製造の「ＭＴ−２」と称する種菌
を用いて前記第２の２(3)イ⑩ないし⑮に係る菌床Ｂ合計３万７０００
玉を製造したことは認める。
しかし，被告代表者において上記種菌が登録品種Ｂと同一品種であ
ることの認識がなかったことは否認する。
むしろ，以下のとおり，被告代表者は，上記種菌が登録品種Ｂと同
一品種であることを知っていたことは明らかである。
ａ被告代表者は，当初，原告の代理店である振興園に対し，被告が
直接登録品種Ｂの種菌の購入の申込みをするため電話をした。しか
し，振興園は，原告との代理店契約の中で北海道地域では種菌等の
販売をしない旨の取決めをしていたため，被告の所在地が北海道内
であることを知って，これを断った。
振興園は，平成１５年９月ころに自社のホームページを立ち上げ
た当初から，同ホームページ上に，「※ＭＴ−２号は森産業株式会
社の登録品種（ＭＭ２号）です。」と表示していた。また，振興園
は，平成１６年から平成１８年にかけて顧客に対して発送した取扱
商品の価格表にも，「ＭＴ−２（ＭＭ−２）」と表示していた。
被告代表者は，上記のとおり，登録品種Ｂの種菌を購入する目的
で振興園に電話をした当時，振興園のホームページや価格表によ
り，「ＭＴ−２」が登録品種Ｂ（ＭＭ−２号）と同一品種であるこ
とを知っていた。
ｂ振興園が前記ａのとおり被告からの登録品種Ｂの種菌の購入の申
込みを断った直後の平成１７年１月１８日，丙は，振興園に対し，
登録品種Ｂの種菌を発注した。振興園は，丙からの発注を受けて，
同月１９日，丙に対し，登録品種Ｂ（同一品種）の種菌を納品し，
同月２４日，被告は，丙から上記種菌の納品を受けた。
被告は，前記ａのとおり，振興園から登録品種Ｂの種菌を購入の
申込みを断られたため，やむなく丙に振興園から上記種菌を購入す
ることを依頼したものである。
また，被告代表者と丙は，「１号」は原告の取扱品種である「Ｍ
Ｍ−１号」を，「２号」は原告の登録品種Ｂである「ＭＭ−２号」
を意味する略称であることを了解した上で，被告代表者が丙を介し
て購入するしいたけの種菌を「１号」，「２号」という呼び方で呼
んでいた。
３争点３（差止請求及び廃棄請求の可否）について
(1)原告の主張
ア前記第２の２(3)ア，イのとおり，被告は，業として登録品種Ａ，Ｂの
種菌から菌床Ａ，Ｂを製造し，販売したことにより，原告の本件育成者
権Ａ，Ｂを侵害した。
また，被告は，登録品種Ａ，Ｂと同一又は特性により明確に区別され
ない品種の種苗を，菌床の形態として生産した上で販売する目的をもっ
て現に保管し，また，菌床Ａ，Ｂを販売する目的をもって現に保管して
いる。
イ前記アの事情に照らすならば，被告は，現在も本件育成者権Ａ，Ｂを
侵害し，今後も別紙１記載１及び２の種苗を生産し，調整し，譲渡の申
出をし，譲渡し，又はこれらの行為をする目的をもって保管することに
より本件育成者権Ａ，Ｂを侵害するおそれがあるから，被告による別紙
１記載１及び２の種苗の生産，譲渡等の差止めの必要がある。
また，上記侵害の予防に必要な行為として，被告が別紙１記載１及び
２の種苗の生産に供した，別紙２記載の設備等の廃棄が必要である。
ウしたがって，原告は，被告に対し，種苗法３３条１項，２項に基づ
き，別紙１記載１及び２の種苗の生産，譲渡等の差止めとともに，別紙
１記載１及び２の種苗の生産に供した，別紙２記載の設備等の廃棄を求
めることができる。
(2)被告の反論
被告は，登録品種Ａ，Ｂと同一又は特性により明確に区別されない品種
の種苗（菌床の形態を含む。）を現在保管していない。
また，被告は，原告から本件育成者権Ａ，Ｂの侵害をしているとの指摘
を受けた際に，侵害と疑われる行為を止めて，菌床などを廃棄した。
したがって，原告主張の差止め及び廃棄の必要性はない。
４争点４（原告の損害額）
(1)原告の主張
ア逸失利益
(ア)種苗法３４条１項に基づく損害額（選択的主張）
原告が，被告による本件育成者権Ａ，Ｂの侵害について，種苗法３
４条１項に基づき，被告に対し請求することのできる損害額は，以下
のとおり，合計１８７万５０００円である。
ａ菌床Ａの販売による損害額
被告は，前記第２の２(3)アのとおり菌床Ａ合計３万５５００玉を
販売し，原告の本件育成者権Ａを侵害した。
そして，原告は，北海道内で販売する登録品種Ａの菌床を，協力
工場に委託する方法で製造し，製造された菌床を１玉当たり１１５
円で協力工場から購入し，１玉当たり１４０円で農家等に販売して
いることによれば，原告は，被告の上記侵害行為がなければ，登録
品種Ａの菌床を販売することができたものであり，その１玉当たり
の原告の利益額は２５円である。
したがって，被告の菌床Ａの販売により原告が受けた損害額は，
種苗法３４条１項により，８８万７５００円となる。
（計算式：３５，５００玉×２５円＝８８７，５００円）
ｂ菌床Ｂの販売による損害額
被告は，前記第２の２(3)イのとおり菌床Ｂ合計７万９０００玉を
販売し，原告及び甲が共有する本件育成者権Ｂを侵害した。
そして，原告は，北海道内で販売する登録品種Ｂの菌床を，協力
工場に委託する方法で製造し，製造された菌床を１玉当たり１１５
円で協力工場から購入し，１玉当たり１４０円で農家等に販売して
いることによれば，原告は，被告の上記侵害行為がなければ，登録
品種Ｂの菌床を販売することができたものであり，その１玉当たり
の原告の利益額は２５円である。また，本件育成者権Ｂについての
原告の共有持分は２分の１である。
したがって，被告の菌床Ｂの販売により原告が受けた損害額は，
種苗法３４条１項により，９８万７５００円となる。
（計算式：７９，０００玉×２５円×１／２＝９８７，５００円）
ｃ合計額１８７万５０００円（ａ＋ｂ）
(イ)種苗法３４条２項に基づく損害額（選択的主張）
原告が，被告による本件育成者権Ａ，Ｂの侵害について，種苗法３
４条２項に基づき，被告に対し請求することのできる損害額は，以下
のとおり，合計３００万円である。
ａ菌床Ａの販売による損害額
被告は，前記第２の２(3)アのとおり菌床Ａ合計３万５５００玉を
販売し，原告の本件育成者権Ａを侵害した。
そして，菌床Ａの販売により被告が得た利益額は，菌床Ａ１玉当
たり４０円であるから合計１４２万円である。
したがって，被告が得た上記利益額１４２万円は，種苗法３４条
２項により，被告の菌床Ａの販売により原告が受けた損害額と推定
される。
（計算式：３５，５００玉×４０円＝１，４２０，０００円）
ｂ菌床Ｂの販売による損害額
被告は，前記第２の２(3)イのとおり菌床Ｂ合計７万９０００玉を
販売し，原告及び甲が共有する本件育成者権Ｂを侵害した。
そして，菌床Ｂの販売により被告が得た利益額は菌床Ａ１玉当た
り４０円（合計３１６万円）である。また，本件育成者権Ｂについ
ての原告の共有持分は２分の１である。
したがって，被告が得た上記利益額の２分の１に相当する１５８
万円は，種苗法３４条２項により，被告の菌床Ｂの販売により原告
が受けた損害額と推定される。
（計算式：７９，０００玉×４０円×１／２＝１，５８０，０００
円）
ｃ合計額３００万円（ａ＋ｂ）
イ調査費用
原告は，被告による本件育成者権Ａ，Ｂの侵害の事実を確認するた
め，現地調査に原告の社員を派遣したり，被告が販売した菌床の対峙培
養試験を行い，別紙４のとおり，合計２４５万４５１９円の費用を要し
た。
ウ弁護士費用
被告の本件育成者権Ａ，Ｂの侵害行為と相当因果関係のある原告の弁
護士費用相当額の損害は，１００万円が相当である。
エまとめ
以上によれば，原告は，被告に対し，民法７０９条及び種苗法３４条
１項又は２項に基づき，不法行為による損害賠償として合計６４５万４
５１９円（前記アないしウの合計額。ただし，前記アのうち，(ア)の額
と(イ)の額は選択的主張。）及びこれに対する不法行為の後である平成
１８年９月２４日（訴状送達の日の翌日）から支払済みまで民法所定の
年５分の割合による遅延損害金の支払を求めることができる。
(2)被告の反論
ア原告主張の損害額は，いずれも否認する。
イ(ア)被告による菌床Ａの販売数３万５５００玉及び菌床Ｂの販売数７
万９０００玉は，被告の営業力による販売結果であり，原告が登録品
種Ａ，Ｂの菌床の販売をしたとしても同様の販売結果を出すことはで
きなかった。したがって，原告の種苗法３４条１項に基づく損害額の
主張（原告の主張ア(ア)）は，失当である。
(イ)菌床Ａ１玉当たりの生産原価は１０５円，菌床Ａ１玉当たりの被
告の利益は５円又は１５円であり，菌床Ｂ１玉当たりの被告の利益は
６円又は１６円である。したがって，原告の種苗法３４条２項に基づ
く損害額の主張（原告の主張ア(イ)）は，その前提を欠くものであ
る。
(ウ)被告は，本件において菌床Ａ，Ｂの販売時期，販売先，販売数量
等について自ら進んで事実関係を明らかにしている。したがって，仮
に被告において本件育成者権Ａ，Ｂの侵害の事実があるとしても，そ
の事実と原告主張の調査費用（原告の主張イ）との間に相当因果関係
がない。
５争点５（謝罪広告掲載請求の可否）について
(1)原告の主張
ア被告が，本件育成者権Ａ，Ｂを有する原告の許諾を得ることなく，前
記第２の２(3)ア，イに係る菌床Ａ，Ｂを，原告が販売する登録品種Ａ，
Ｂの各菌床よりも廉価で販売したことにより，登録品種Ａ，Ｂの種菌及
び菌床の価格相場や商品イメージを低下させ，原告の業務上の信用が害
された。
イしたがって，原告は，被告に対し，種苗法４４条に基づき，原告の業
務上の信用を回復するのに必要な措置として別紙３記載の謝罪広告の掲
載を求めることができる。
(2)被告の反論
原告の主張は争う。
第４当裁判所の判断
１前提事実
前記第２の２の事実と証拠（甲３，５，８ないし１１，１７，１８，２２
ないし２７，３８，３９，４１，４３，４５，乙１ないし８，１１ないし１
３，１７，１８（いずれも枝番のあるものは枝番を含む。），証人丁，被告
代表者）及び弁論の全趣旨を総合すれば，以下の事実が認められる。
(1)ア原告は，昭和１８年に設立された後，食用茸，栽培用種菌及び種駒の
製造，販売等の事業を展開し，平成５年から，しいたけ菌床の製造，販
売を開始した。
原告は，販売するしいたけ菌床を自社工場で製造するか，協力工場に
委託して製造していた。協力工場は，原告の委託を受けて，原告から購
入した種菌を用いてしいたけ菌床を製造し，原告は，製造された菌床を
協力工場から買い取って，農家等に販売していた。なお，原告は，その
際，協力工場に対し，原告が育成者権を有する種菌を用いて，菌床を製
造することを許諾していた。
原告は，北海道内で販売するしいたけ菌床については，通常，協力工
場に委託して製造していた。
イ被告代表者は，昭和５３年に原告に入社した後，札幌営業所長を経
て，北海道支社次長兼流通課長となった後，平成１１年６月２０日，原
告を退職した。
被告代表者は，平成１１年８月２６日，しいたけ菌床の製造，販売等
を業とする被告（本店所在地・北海道白老郡）を設立した。
被告は，平成１１年９月１日，原告との間で代理店契約を締結し，原
告の代理店となった。その後，原告と被告は，平成１２年９月３０日付
けで代理店契約を解消した。
(2)ア被告は，平成１２年１１月ころ，本件育成者権Ａを有していた明治製
菓の特約店となり，明治製菓から登録品種Ａの種菌を購入するようにな
った。
一方で，被告は，その当時，甲が代表者を務める宮本産業から購入し
た別の品種の種菌（名称・「ＭＭ−１」）を用いて，しいたけ菌床を製
造し，北海道内で販売していた。また，被告は，平成１３年１月ころか
ら，宮本産業から，原告及び甲共有の本件育成者権Ｂに係る登録品種Ｂ
の種菌を購入していた。
なお，宮本産業は，被告に販売する上記各種菌の製造を振興園に委託
し，振興園が直接被告に上記各種菌を納品していた。
イ(ア)明治製菓と原告は，平成１４年７月，明治製菓が同年１０月１日
付けでしいたけ種菌の製造販売権及び種菌事業を原告に譲渡すること
に合意した旨公表した。
原告は，平成１４年９月１２日，明治製菓から，本件育成者権Ａを
譲り受け，平成１５年２月２８日，その旨の移転登録を受けた。
(イ)原告は，平成１４年１０月に明治製菓から種菌事業の譲渡を受け
た際，明治製菓の特約店を原告の代理店として基本的に引き継ぐこと
となったが，被告が原告の代理店となる意思がないことを表明したこ
となどもあって，被告は，原告の代理店とならなかった。
一方で，明治製菓の特約店であったオー・エス・エフは，明治製菓
の上記種菌事業の譲渡に伴って，原告の代理店となり，被告に対し，
登録品種Ａの種菌を販売するようになった。
ウ原告と宮本産業は，平成１５年１月３０日，宮本産業が同年６月３０
日をもってしいたけ種菌，菌床及び栄養体（テンパック）の販売事業を
廃止し，その事業廃止に伴い，同年７月１日以降北海道地域における宮
本産業の商圏を原告に譲り渡す旨の覚書を締結した。
振興園は，宮本産業の上記事業廃止に伴い，原告及び甲から，登録品
種Ｂの種菌の培養，同種菌を用いて菌床を製造，販売することの許諾を
受けた。
(3)ア被告は，登録品種Ａの種菌を用いて菌床Ａを製造し，平成１６年１月
１５日から平成１７年２月２４日までの間に東磐井地方森林組合等に合
計３万５５００玉（前記第２の２(3)ア①ないし④）を販売した。
被告が販売した上記菌床Ａのうち２万５５００玉（前記第２の２(3)ア
②ないし④）は，被告がオー・エス・エフから購入した登録品種Ａの種
菌を用いて製造されたものであった。
イまた，被告は，登録品種Ｂ（登録品種の名称・「ＭＭ−２号」）の種
菌を用いて菌床Ｂを製造し，平成１５年１月１７日から平成１７年５月
１０日までの間に乙２等に合計７万９０００玉（前記第２の２(3)イ①な
いし⑮）を販売した。
被告が販売した上記菌床Ｂのうち３万７０００玉（前記第２の２(3)イ
⑩ないし⑮）は，被告が丙から購入した登録品種Ｂの種菌を用いて製造
されたものであった。
上記種菌は，丙が平成１７年１月１９日に振興園から購入して，被告
に譲渡したものであり，上記種菌の容器のラベルには，「しいたけ種菌
ＭＴ−２」（乙１７の別紙１）と表示されていた。このうち「ＭＴ−
２」の部分は，「ＭＭ−２」と記載された元のラベルの上に，「ＭＭ−
２」との記載が隠れるようにシール（甲４５の２）が追加して貼られた
ものであった。
なお，振興園は，顧客に配布する「菌床椎茸種菌及び資材価格表」（
甲２７。「平成１６年度用」，「平成１７年度用」，「平成１８年度
用」）の商品名欄に「種菌」として「ＭＴ−２（ＭＭ−２）」と記載し
ていた。また，振興園は，平成１８年４月２０日当時，自社のホームペ
ージにおいて「※ＭＴ−２号は森産業株式会社の登録品種（ＭＭ２号）
です。」と掲載していた。
(4)ア原告は，平成１７年８月２９日付け内容証明郵便で，被告に対し，被
告が平成１７年２月２４日に東磐井地方森林組合に販売した「椎茸菌床
１．３Ｋ５号」と称するしいたけ菌床の品種は，対峙培養試験の結果，
原告が育成者権を有する登録品種Ａと同一又は特性により明確に区別さ
れない品種と考えられる，被告の上記行為等は原告の育成者権を侵害す
る行為であり，原告所有の品種を用いた菌床を販売すること等の利用行
為を一切停止することを求める，平成１４年１０月以降被告が原告所有
の品種を用いて製造，販売（無償譲渡を含む）した菌床の納品日，販売
先，品種名，数量，販売金額等について本書面到達後５日以内に書面で
回答を求めるなどと通知した。
これに対して被告は，平成１７年９月３日付け内容証明郵便で，原告
に対し，被告は東磐井地方森林組合に登録品種Ａの菌床合計３万玉を納
品販売（ただし，５００玉は無償譲渡）した，被告は，原告が育成者権
を有するしいたけ種菌を正規ルートから購入したと認識していたもので
あり，利用権の許諾を認識せずに用いていたことについて謝罪する，被
告は，今後原告が育成者権を有するしいたけ品種を用いたしいたけ菌床
の納品・販売行為を一切停止することを約束するなどと回答し，さら
に，平成１７年１０月２６日付け内容証明郵便で，被告は乙１に登録品
種Ａの菌床６０００玉を販売したなどと回答した。
イ原告は，平成１７年１０月２８日付け内容証明郵便で，被告に対し，
原告の調査の結果，被告が乙２ほか複数の顧客に納品したしいたけ菌床
の品種は，原告が育成者権を有する登録品種Ｂと同一又は特性により明
確に区別されない品種であることが確認されている，平成１４年１０月
以降被告が原告所有の品種を用いて製造，販売（無償譲渡を含む）した
菌床の納品日，販売先，品種名，数量，販売金額等について本書面到達
後５日以内に書面で再度回答を求めるなどと通知した。
これに対して被告は，平成１７年１１月４日付け内容証明郵便で，原
告に対し，登録品種Ｂの菌床の納品，販売先，数量，販売金額，「ＭＴ
−２」の菌床の納品，販売先，数量，販売金額を回答するとともに，「
ＭＴ−２」の菌床は被告が丙から譲り受けた種菌「ＭＴ−２」を用いて
製造したが，原告の調査の結果，「ＭＴ−２」が登録品種Ｂと明確に区
別できない品種であることが判明すれば，顧客に対し原告から購入する
ことをお願いするなどと回答した。
ウ原告は，平成１７年１２月１６日付け内容証明郵便で，被告に対し，
被告の平成１７年１１月４日付け回答書を踏まえ，育成者権侵害による
損害賠償として合計３０６８万円を請求する旨通知した。
原告は，被告が平成１７年１２月２２日付け内容証明郵便で上記損害
賠償の請求を拒絶したため，平成１８年１月１９日付け内容証明郵便
で，被告に対し，再度，上記損害賠償を請求する旨通知した。
エ被告の代理人弁護士は，平成１８年２月２日付け内容証明郵便で，原
告に対し，被告が結果的に原告の育成者権を侵害していたことについて
改めて謝罪する，しかるべき賠償について被告に履行すべき責任がある
と考えており，被告としては話合いによって円満な解決を図りたいが，
被告には支払能力がなく，今後も収益が改善される見通しはないことな
どから，原告の現状の請求額の支払には応じられない旨回答し，さら
に，平成１８年３月３０日付け内容証明郵便で，原告の代理人弁護士に
対し，原告の請求に対して毎月３０万円を１０回，合計３００万円を支
払う旨の和解案を提示した。
オ原告は，平成１８年９月７日，本件訴訟を提起した。
２争点１（通常利用権の成否及び効力）について
(1)しいたけの種菌を用いて菌床を製造し，菌床内でしいたけ菌（種菌）を
増殖させることは，種苗の生産に該当し，また，製造された菌床を販売す
ることは，種苗の譲渡に該当するから（前記第２の２(3)ウ），前記１(3)
ア，イのとおり被告が登録品種Ａ，Ｂの種菌から菌床Ａ，Ｂをそれぞれ製
造し，菌床Ａ合計３万５５００玉，菌床Ｂ合計７万９０００玉を販売した
行為は，登録品種Ａ又は登録品種Ｂの「利用」（種苗法２条５項１号）に
該当し，原告が有する本件育成者権Ａ，Ｂの侵害に当たるものと認められ
る。
(2)これに対し被告は，前記(1)の菌床Ａ，Ｂの製造，販売の一部について
は，被告が許諾を受けた通常利用権に基づくものであるから，本件育成者
権Ａ，Ｂの侵害に当たらない旨主張するが，以下のとおり，いずれも理由
がない。
アまず，被告は，被告が製造，販売した菌床Ａのうち１万玉（前記第２
の２(3)ア①）は，本件育成者権Ａを有していた明治製菓から購入した登
録品種Ａの種菌を用いた菌床であり，かつ，その購入の際明治製菓から
菌床の製造，販売につき通常利用権の許諾を受けたから，上記菌床Ａ１
万玉の製造，販売は，原告の本件育成者権Ａの侵害に当たらない旨主張
する。
しかし，被告の主張は，以下のとおり，理由がない。
(ア)種苗法３２条３項は，通常利用権は，その登録をしたときは，そ
の育成者権をその後に取得した者に対しても，その効力を生ずる旨規
定している。上記規定によれば，通常利用権は，育成者権者から通常
利用権の許諾を受けることにより発生するが，未登録の通常利用権者
は，その許諾を受けた後に当該育成者権を譲り受けた新たな育成者権
者に対し，自己の通常利用権を対抗することができないものと解され
る。
そして，原告は，平成１４年９月１２日，明治製菓から本件育成者
権Ａを譲り受け，平成１５年２月２８日，その旨の移転登録を受けた
ところ（前記１(2)イ(ア)），被告の主張によれば，被告が明治製菓か
ら購入した登録品種Ａの種菌を用いて菌床Ａ１万玉を製造したのは，
平成１５年１１月１８日から同月２１日までの間であるというのであ
るから（前記第３の１(1)ア(イ)），上記菌床Ａ１万玉の販売はもとよ
り，その製造についても，原告が本件育成者権Ａの移転登録を受けた
後であることとなる。
しかるに，被告は，明治製菓から許諾を受けたとする通常利用権に
つき登録を受けたことについて何ら主張立証をしていないから，被告
が許諾を受けたかどうかを判断するまでもなく，被告は，明治製菓か
ら本件育成者権Ａを譲り受け，その移転登録を受けた原告に対し，上
記通常利用権を対抗することができないというべきである。
(イ)したがって，被告による菌床Ａ１万玉の製造，販売は，原告の本
件育成者権Ａの侵害に当たらないとの被告の前記主張は，理由がな
い。
イ次に，被告は，被告が製造，販売した菌床Ｂのうち合計４万２０００
玉（前記第２の２(3)イ①ないし⑨）は，本件育成者権Ｂを原告と共有す
る甲から菌床の製造，販売につき通常利用権の許諾を受け，かつ，上記
通常利用権の許諾につき原告の同意を得たから，上記菌床合計４万２０
００玉の製造，販売は，原告の本件育成者権Ｂの侵害に当たらない旨主
張する。
しかし，被告の主張は，以下のとおり，理由がない。
(ア)種苗法２３条３項は，育成者権が共有に係るときは，各共有者
は，他の共有者の同意を得なければ，その育成者権について他人に通
常利用権を許諾することができない旨規定している。
しかるに，本件育成者権Ｂは原告及び甲の共有に係るものである
が，本件全証拠によっても，原告が被告主張の通常利用権の許諾につ
き同意したことを認めるに足りない。かえって，①被告は，原告が被
告主張の通常利用権の許諾につき同意をした時期，経緯等について具
体的な主張をしていないこと，②前記１(4)イ，ウのとおり，原告は本
件訴訟提起前に被告による登録品種Ｂの種菌を用いた菌床の製造，販
売が原告の本件育成者権Ｂの侵害に当たることを前提に被告に対し損
害賠償を請求していることに照らすならば，原告は被告に対して本件
育成者権Ｂにつき通常利用権を許諾することを同意したことはないも
のとうかがわれる。
そうすると，その余の点について判断するまでもなく，被告主張の
通常利用権の許諾の効果を原告に主張することはできない。
(イ)したがって，被告による菌床Ｂ合計４万２０００玉の製造，販売
は，原告の本件育成者権Ｂの侵害に当たらないとの被告の前記主張
は，理由がない。
３争点２（種苗法３５条の過失の推定を覆す事情の有無）について
(1)種苗法３５条は，他人の育成者権又は専用利用権を侵害した者は，その
侵害の行為について過失があったものと推定すると規定している。この推
定は，法律上の推定であり，推定を覆滅するには侵害者において過失がな
かったこと（無過失）を主張立証する必要があるものと解される。
被告は，前記２(1)認定の菌床Ａ，Ｂの製造，販売による本件育成者権
Ａ，Ｂの侵害について，その一部につき無過失を主張するが，以下のとお
り，いずれも理由がない。
(2)被告は，被告が製造，販売した菌床Ａのうち合計２万５５００玉（前記
第２の２(3)ア②ないし④）は，原告の代理店であるオー・エス・エフから
購入した登録品種Ａの種菌を用いた菌床であるが，被告代表者は，上記種
菌の購入の際，オー・エス・エフを通じて原告から本件育成者権Ａについ
ての通常利用権の許諾を受けたものと信じ，そのように信じたことに相当
の理由があるから，上記菌床Ａ合計２万５５００玉の製造，販売による本
件育成者権Ａの侵害について無過失である旨主張する。
しかし，被告の主張は，以下のとおり，理由がない。
ア被告は，被告代表者は，被告が原告の代理店であるオー・エス・エフ
から登録品種Ａの種菌を購入した際，被告が菌床の製造，販売の事業を
行っていることを十分承知していたオー・エス・エフから通常利用権の
許諾の話は出なかったことなどから，上記種菌の購入代金には菌床の製
造，販売についての通常利用権の許諾料が含まれているものと信じ，ま
た，オー・エス・エフが原告の正規代理店であることから，オー・エス
・エフは原告から本件育成者権Ａについての通常利用権の許諾権限が付
与されているものと信じた旨主張する。
しかしながら，①原告は，オー・エス・エフはもとより，原告と代理
店契約を締結した代理店に対し，原告の育成者権について原告を代理し
て通常利用権を許諾する権限を付与したことはなかったこと（証人丁，
弁論の全趣旨），②被告代表者は，昭和５３年から平成１１年６月２０
日に退職するまでの約２１年間，原告に勤務した経験があること（前記
１(1)イ），③被告代表者が上記退職後に設立した被告においては，平成
１１年９月１日から平成１２年９月３０日までの間，原告の代理店であ
ったこと（前記１(1)イ）に照らすならば，被告代表者は，被告がオー・
エス・エフから登録品種Ａの種菌を購入した際，オー・エス・エフが原
告の代理店であるからといって原告から本件育成者権Ａについて通常利
用権を許諾する権限を付与されているものではないことを知っていた疑
いを払拭することができない。
また，仮に被告代表者がオー・エス・エフに上記通常利用権の許諾権
限が付与されていると信じたとしても，被告主張の諸事情をもって，そ
のように信じたことについて相当な理由があるということはできない。
イしたがって，菌床Ａ合計２万５５００玉の製造，販売による本件育成
者権Ａの侵害についての無過失をいう被告の前記主張は，採用すること
ができない。
(3)ア被告は，被告代表者は，被告が製造，販売した菌床Ｂのうち合計４万
２０００玉（前記第２の２(3)イ①ないし⑨）に関し甲から受けた通常利
用権の許諾につき原告の同意を得たものと信じ，そのように信じたこと
に相当の理由があるから，上記菌床Ｂ合計４万２０００玉の製造，販売
による本件育成者権Ｂの侵害について無過失である旨主張する。
しかし，被告の主張は，以下のとおり，理由がない。
(ア)被告は，被告代表者は，被告が宮本産業から登録品種Ｂの種菌を
購入した際，宮本産業は被告が菌床の製造，販売の事業を行っている
ことを十分承知していたことから，上記種菌の購入代金には菌床の製
造，販売についての通常利用権の許諾料が含まれているものと信じ，
また，被告代表者は，その際，本件育成者権Ｂの共有者である甲か
ら，宮本産業が販売した登録品種Ｂについては同社が責任を持つと告
げられたため，甲の被告に対する本件育成者権Ｂについての通常利用
権の許諾につき原告から同意があったものと信じた旨主張する。
しかしながら，しいたけ種の育成者権につき通常利用権を許諾する
ことは，種菌，菌床等の販売に係る原告の営業上の利益に重大な影響
を及ぼす可能性のある事項であることは，前記１(1)イのとおり原告に
長年勤務した経験のある被告代表者は当然認識していたはずであり，
被告が主張するように本件育成者権Ｂの共有者の一人である甲が，被
告代表者に対して，宮本産業から購入した登録品種Ｂについては宮本
産業が責任を持つと単に告げたからといって，本件育成者権Ｂの他の
共有者である原告の同意があったものと信じたことにつき相当の理由
があるということはできないし，また，被告主張の他の事情をもっ
て，そのように信じたことについて相当な理由があるということもで
きない。
(イ)したがって，菌床Ｂ合計４万２０００玉の製造，販売による本件
育成者権Ｂの侵害についての無過失をいう被告の前記主張は，採用す
ることができない。
イ被告は，被告が製造，販売した菌床Ｂのうち合計３万７０００玉（前
記第２の２(3)イ⑩ないし⑮）は，丙から購入した登録品種Ｂと同一品種
の種菌を用いた菌床であるが，被告代表者において被告が上記種菌を購
入した当時上記種菌が登録品種Ｂと同一品種の種菌であるとの認識はな
く，その認識がなかったことに相当の理由があるから，上記菌床Ｂ合計
３万７０００玉の製造，販売による本件育成者権Ｂの侵害について無過
失である旨主張する。
しかし，被告の主張は，以下のとおり，理由がない。
(ア)被告は，被告が丙から購入した種菌の容器のラベルに「しいたけ
種菌ＭＴ−２」と記載されていたこと，被告には種菌の品種を確認す
る技術も設備もなく，容器のラベル記載の種菌の品種名を信じるしか
なかったこと，登録品種の種苗を業として譲渡する者には，当該登録
品種の名称の使用義務があり（種苗法２２条１項），名称の使用義務
違反に対しては過料の制裁があることから，被告代表者には，上記種
菌が登録品種Ｂと同一品種の種菌であるとの認識はなかった旨主張す
る。
そこで検討するに，被告が丙から購入した，振興園製造に係る登録
品種Ｂと同一品種の種菌の容器のラベルには，「しいたけ種菌ＭＴ−
２」（乙１７の別紙１）と表示されていたこと，このうち「ＭＴ−
２」の部分は，「ＭＭ−２」と記載された元のラベルの上に，「ＭＭ
−２」との記載が隠れるようにシール（甲４５の２）が追加して貼ら
れたものであったことは，前記１(3)イ認定のとおりである。
そして，①被告は，平成１３年１月ころから，宮本産業から，登録
品種Ｂ（登録品種の名称・「ＭＭ−２号」）の種菌を購入していた
が，その種菌は，宮本産業から委託を受けた振興園が製造し，振興園
から直接納品を受けていたこと（前記１(2)ア），②振興園は，宮本産
業が平成１５年６月３０日付けで事業を廃止した後，原告及び甲から
許諾を受けて登録品種Ｂの種菌を製造，販売することの許諾を受け（
前記１(2)ウ），製造した登録品種Ｂの種菌を「ＭＴ−２」の商品名で
販売するようになったが（前記１(3)イ），その種菌の容器のラベル
は，上記のとおり「ＭＭ−２」と記載された元のラベルの上に「ＭＴ
−２」のシールを追加して貼ったものを使用していたこと（甲２７，
４５の２，乙１７の別紙１，証人丁），③乙１７の別紙１の写真によ
れば，「ＭＴ−２」のうち「Ｔ」の文字の下にうっすらと「Ｍ」とも
読むことができるような文字が隠れていることがうかがわれることに
照らすならば，被告においては，「しいたけ種菌ＭＴ−２」と表示さ
れた容器のラベル中に品種名を隠すように「ＭＴ−２」とのシール貼
付部分があることに気付き，「ＭＴ−２」は登録品種名であるのかど
うかについて疑念を持ってしかるべきであったものと認められる。そ
して，被告代表者において振興園に問い合わせるなどして「ＭＴ−
２」が登録品種名であるのかどうか等について調査，確認すれば，振
興園が登録品種Ｂの種菌を「ＭＴ−２」の商品名で製造，販売してい
たことは容易に判明したことが認められる。
しかるに，被告代表者の供述によれば，被告代表者は，「ＭＴ−
２」は登録品種名であるのかどうか等について調査，確認を行ってい
ないから，被告代表者において，丙から購入した種菌の容器のラベル
の「しいたけ種菌ＭＴ−２」の表示を信じ，上記種菌が登録品種Ｂと
同一品種であることを認識しなかったとしても，そのように信じたこ
とに相当の理由があるということはできない。
また，被告の主張するように登録品種の種苗を業として譲渡する者
には，当該登録品種の名称の使用義務があり，名称の使用義務違反に
対しては過料の制裁があることを考慮しても，上記のとおり種菌の容
器のラベルに疑念を抱くべき事情があることに照らすならば，被告代
表者において，上記種菌の容器のラベルの「しいたけ種菌ＭＴ−２」
の表示を信じたことに相当の理由があるということはできない。
(イ)したがって，菌床Ｂ合計３万７０００玉の製造，販売による本件
育成者権Ｂの侵害についての無過失をいう被告の前記主張は，採用す
ることができない。
４争点３（差止請求及び廃棄請求の可否）について
(1)差止請求について
ア被告が登録品種Ａ，Ｂの種菌から菌床Ａ，Ｂをそれぞれ製造し，販売
した行為が，原告が有する本件育成者権Ａ，Ｂの侵害に当たることは，
前記２(1)のとおりである。
これに対し被告は，本件訴訟において，被告による菌床Ａ，Ｂの製造
販売が本件育成者権Ａ，Ｂの侵害に当たること自体を争い，また，侵害
行為について無過失を主張している（なお，被告の主張に理由がないこ
とは，前記２及び３において説示したとおりである。）。
イ原告は，被告は，登録品種Ａ又は登録品種Ｂと同一若しくは特性によ
り明確に区別されない品種の種苗を，菌床の形態として生産した上で販
売する目的をもって現に保管し，また，菌床Ａ及び菌床Ｂを販売する目
的をもって現に保管することにより，現に本件育成者権Ａ，Ｂの侵害行
為を行っている旨主張するが，本件全証拠によっても，上記各保管の事
実を認めるに足りない。
しかし，前記１の認定事実及び弁論の全趣旨によれば，登録品種Ａ及
び登録品種Ｂの種菌は，現在も原告又はその代理店等によって販売され
ており，被告が，原告の代理店等から直接又は第三者を介して，上記種
菌を入手し，これを用いて菌床を製造することは可能であるものと認め
られる。
ウ前記ア及びイの事情を総合すれば，被告において，将来，登録品種Ａ
又は登録品種Ｂの種菌から菌床を製造するなどして別紙１記載１又は２
の種苗を生産し，更には同種苗について調整し，譲渡の申出をし，譲渡
し，又はこれらの行為をする目的をもって保管する行為を行うことによ
り，原告の本件育成者権Ａ，Ｂを侵害するおそれがあるものと認められ
る。
したがって，原告は，種苗法３３条１項に基づき，被告に対し，上記
行為の差止めを求めることができるというべきであるから，原告の本件
差止請求は理由がある。
(2)廃棄請求について
ア種苗法３３条２項は，育成者権者が差止請求権を行使するに際し，侵
害行為を組成した，収穫物若しくは加工品又は侵害の行為に供した物の
廃棄その他の侵害の予防に必要な行為を請求することができると規定し
ている。
上記規定によれば，侵害の行為に供した物の廃棄は「侵害の予防に必
要な行為」の例示であるから，侵害の行為に供した物であるからといっ
て当然に廃棄を求めることができるものではなく，種苗法３３条２項に
基づく侵害の予防に必要な行為としての侵害の行為に供した物の廃棄請
求は，現に行われ又は将来行われるおそれがある侵害行為の態様，育成
者権者が行使する差止請求権の具体的内容等に照らし，差止請求権の行
使を実効あらしめるものであって，かつ，差止請求権の実現のために必
要な範囲内のものである場合に限り許されるものと解される。
これを本件についてみるに，①前記(1)ウのとおり将来行われるおそれ
のある侵害行為は，登録品種Ａ又は登録品種Ｂの種菌から菌床を製造す
るなどして別紙１記載１又は２の種苗を生産し，更には同種苗について
調整し，譲渡の申出をし，譲渡し，又はこれらの行為をする目的をもっ
て保管する行為であり，原告は被告による上記生産，譲渡等の行為の差
止請求権を有すること，②原告が廃棄を求める別紙２記載の「菌床仕込
設備」及び「培養設備」は，いずれもしいたけ菌床の製造工程に使用す
るものとしては汎用性のあるものであること，③被告は登録品種Ａ又は
登録品種Ｂの種菌以外の種菌からも菌床を製造し，販売していたこと（
前記１(2)ア）に照らすならば，別紙２記載の「菌床仕込設備」及び「培
養設備」は，もっぱら登録品種Ａ又は登録品種Ｂの種菌を用いた菌床の
製造の用に供されたものではなく，被告において他の種菌を用いた菌床
の製造にも用いることができるものであるといえるから，上記「菌床仕
込設備」及び「培養設備」についての原告の廃棄請求は，差止請求権の
実現のために必要な範囲を超えるものと解される。
次に，別紙２記載の「材料」についての原告の廃棄請求は，菌床Ａ，
Ｂの製造に供された物の廃棄を求めるものであり，上記「材料」は，い
ずれも使用済みの材料であって，その原形を留めているものとは考えら
れないし，また，被告が，現在菌床Ａ，Ｂを保管しているものと認めら
れないことは前記(1)イのとおりであるから，上記廃棄請求は，被告が占
有していないものを対象とするものである。
イ以上によれば，原告の本件廃棄請求は，差止請求権の実現のために必
要な範囲を超えるものであるか，又は被告が占有していないものを対象
とするものであるから，いずれも理由がない。
５争点４（原告の損害額）について
(1)逸失利益について
ア(ア)被告が菌床Ａ合計３万５５００玉，菌床Ｂ合計７万９０００玉を
販売したことにより，原告の本件育成者権Ａ，Ｂを侵害したことは，
前記２(1)のとおりである。
そして，前記１(1)アの認定事実，証拠（甲３２ないし３９（枝番の
あるものは枝番を含む。））及び弁論の全趣旨を総合すれば，①原告
は，北海道内において，自社又は代理店を通じて，協力工場によって
委託製造された登録品種Ａ及び登録品種Ｂの各菌床を，農家等に販売
していたこと，②平成１７年当時，しいたけの品種に関わらず，原告
の協力工場からの買取価格は菌床１玉当たり１１５円（消費税抜
き），原告の農家等に対する販売価格は送料・荷造費別途で１玉当た
り１４０円（消費税抜き）であったことが認められる。
上記認定事実によれば，被告による上記侵害行為がなければ，原告
は登録品種Ａ，Ｂの各菌床を販売することができたこと，上記各菌床
１玉当たりの原告の利益額は２５円を下らないことが認められる。
したがって，原告が種苗法３４条１項に基づき被告に対し請求する
ことのできる損害額は，原告主張のとおり，合計１８７万５０００円
を下らないものと認められる（計算式は，菌床Ａにつき３５，５００
玉×２５円＝８８７，５００円，菌床Ｂにつき７９，０００玉×２５
円×１／２＝９８７，５００円）。
(イ)これに対し被告は，被告による菌床Ａの販売数３万５５００玉及
び菌床Ｂの販売数７万９０００玉は，被告の営業力による販売結果で
あり，原告が登録品種Ａ，Ｂの菌床の販売をしたとしても同様の販売
結果を出すことはできなかったと主張する。
しかし，原告が上記販売数量を販売することができなかったとする
具体的事情を認めるに足りる証拠はなく，被告の上記主張は理由がな
い。
イなお，原告は，種苗法３４条２項に基づく損害額を選択的に主張して
いるが，本件において菌床Ａ又は菌床Ｂの１玉当たりの被告の利益額が
前記ア(ア)認定の原告の利益額を上回ることを認めるに足りる十分な証
拠はないから，上記主張は採用することができない。
(2)調査費用について
ア原告は，被告による本件育成者権Ａ，Ｂの侵害の事実を確認するた
め，現地調査に原告の社員を派遣したり，被告が販売した菌床の対峙培
養試験を行い，別紙４のとおり，合計２４５万４５１９円の費用を要し
たと主張する。
しかし，原告の主張は，以下のとおり理由がない。
(ア)別紙４には，「１．社員の現地調査」の項目に原告社員による現
地調査費用（旅費及び調査時間に応じた人件費）と，「２．対峙培養
試験の費用」の項目に対峙培養試験の実施に要した人件費とが，調査
費用として計上されている。
原告は，上記調査費用を裏付ける証拠として，現地調査を行ったと
される原告従業員戊ら作成に係る「出張復命書兼旅費精算書」（甲６
の１ないし甲６の３０）及び戊ら（対峙培養試験を行ったとされる原
告従業員己を含む。）の平成１７年８月分の給与台帳（甲７の１ない
し甲７の６）を提出している。
しかし，まず，現地調査の点については，上記「出張復命書兼旅費
精算書」の記載によっても，同一日中に現地調査に必要な訪問先以外
の訪問先を訪れている例（甲６の３等）も見られること，また，同一
の訪問先においても，通常の営業活動と被告が菌床Ａ，Ｂを販売した
かどうかの確認に要する作業との明確な区別は困難であること等を考
慮すると，実際に現地調査のためだけに別紙４記載のとおりの旅費及
び調査時間を必要としたのかどうかという点は，明らかではない。
また，現地調査又は対峙培養試験について，原告従業員らが通常の
日常業務に加えてこれらの追加的な業務を行ったことにより，原告に
おいて，時間外労働による割増賃金の支払を余儀なくされたといった
ような，本件の調査のために通常の労務費として支出すべき給与等の
費用に加えて具体的な費用が現実に追加的に発生したと認めるに足り
る証拠はない。
(イ)加えて，前記１(4)に認定のとおり，被告は，本件訴訟の提起前
に，原告の求めに応じて，菌床Ａ，Ｂの販売時期，販売先，販売数量
等を具体的に開示している。
(ウ)前記(ア)及び(イ)の事情を総合すれば，原告主張の調査費用は，
被告の本件育成者権Ａ，Ｂの侵害による不法行為と相当因果関係のあ
る損害であると認めることはできない。
(3)弁護士費用について
原告は，本件訴訟の遂行のため弁護士費用の負担を余儀なくされたもの
であり，本件訴訟に至る経緯，本件訴訟の審理の経過等諸般の事情にかん
がみると，被告の本件育成者権Ａ，Ｂの侵害による不法行為と相当因果関
係のある弁護士費用相当額の原告の損害額は，２０万円と認めるのが相当
である。
(4)小括
以上によれば，原告は，被告に対し，不法行為による損害賠償として合
計２０７万５０００円（前記(1)及び(3)の合計額）及びこれに対する不法
行為の後である平成１８年９月２４日（訴状送達の日の翌日）から支払済
みまで民法所定の年５分の割合による遅延損害金の支払を求めることがで
きる。
６争点５（謝罪広告掲載請求の可否）について
(1)原告は，被告が，本件育成者権Ａ，Ｂを有する原告の許諾を得ることな
く，菌床Ａ，Ｂを，原告が販売する登録品種Ａ，Ｂの各菌床よりも廉価で
販売したことにより，登録品種Ａ，Ｂの種菌及び菌床の価格相場や商品イ
メージを低下させ，原告の業務上の信用が害されたと主張する。
しかし，本件全証拠によっても，被告による菌床Ａ，Ｂの販売により，
登録品種Ａ，Ｂの種菌又は菌床の価格相場や商品イメージが具体的に低下
したことを認めるに足りない。
したがって，被告による菌床Ａ，Ｂの販売により原告の業務上の信用が
害されたとの原告の主張は，その前提を欠くものである。
(2)以上によれば，原告の本件謝罪広告掲載請求は，理由がない。
７結論
以上によれば，原告の本訴請求は，被告に対し，別紙１記載１及び２の種
苗の生産，譲渡等の差止め並びに２０７万５０００円及びこれに対する平成
１８年９月２４日から支払済みまで年５分の割合による金員の支払を求める
限度で理由があるからこれを認容することとし，その余の請求は理由がない
からこれを棄却することとして，主文のとおり判決する。
東京地方裁判所民事第４６部
裁判長裁判官大鷹一郎
裁判官杉浦正典
裁判官古庄研
別紙１−Ａ），（別紙１−Ｂ），（別紙４）は，省略（
（別紙１）
１別紙１−Ａの「重要な形質欄」記載の形質について「重要な形質に係る特性
欄」記載の特性を有するしいたけ種の種苗（菌床の形態のものを含む。）
２別紙１−Ｂの「重要な形質欄」記載の形質について「重要な形質に係る特性
欄」記載の特性を有するしいたけ種の種苗（菌床の形態のものを含む。）
（別紙２）
ミキサーオガクズ，栄養源，水を混合攪拌するための装置
チェーンコンベアミキサーで攪拌されたものを袋詰機に移送する装置
袋詰機チェーンコンベアから流れてきたものを袋単位に詰
め込む装置
菌詰込作業台詰め込まれた培地を手で押したり調整，若しくはコ
ンテナに載せ換えるための作業台
床殺菌釜培地を殺菌する装置
殺菌釜用台車殺菌釜内に培地を投入する際の棚でありかつ台車
仕殺菌トレー（６床用）１トレーに６床載せて，殺菌釜の台車に載せる
バーナー
込オイルタンク殺菌釜の付属装置
防油提
設接種機殺菌された培地に種菌を接種する装置
栽培袋のシーラー接種の終わったものの栽培袋上部をシーリングする
備装置
接種作業台接種完了したものをシーリングするまでに一時溜め
込む台
クリーンベンチ無菌状態で種菌を接種するための装置
コンプレッサー袋詰機動作用の装置
種菌
材オガクズ
料栽培袋
フスマ，米糠等の栄養源
培培養ハウス
養培養ハウス内の棚
設暖房機培養温度を保つためのもの
備冷房機培養温度を保つためのもの
フォークリフト菌床の出荷・移動時に使用
（別紙３）
謝罪広告
当社は，森産業株式会社（群馬県桐生市）が育成者権を有するしいたけ菌床「
ＪＭＳ５Ｋ―１６」（品種登録番号第７２１９号）および「ＭＭ−２号」（品
種登録番号第７１６６号，甲と共有）を，同社の許諾を得ずに製造・販売し，同
社の育成者権を侵害し，同社に損害を与えました。
今後このような行為を二度と行わないことを誓約し，同社に対し深くお詫び申
し上げます。
有限会社うめつぼ

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