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平成２６年２月１４日判決言渡同日原本交付裁判所書記官
平成２３年（ワ）第３４４５０号相応の対価請求事件
口頭弁論終結日平成２５年１２月９日
判決
名古屋市＜以下略＞
原告Ｘ
同訴訟代理人弁護士滝澤昌雄
愛知県豊田市＜以下略＞
被告トヨタ自動車株式会社
同訴訟代理人弁護士田中昌利
同上田一郎
同逵本憲祐
同清水亘
主文
１被告は，原告に対し，２７０２万５０００円及びこれに対する平
成１９年２月３日から支払済みまで年５分の割合による金員を支払
え。
２原告のその余の主位的請求及び予備的請求をいずれも棄却する。
３訴訟費用はこれを２０分し，その１９を原告の負担とし，その余
を被告の負担とする。
４この判決は，第１項に限り，仮に執行することができる。
事実及び理由
第１請求
（主位的請求）
被告は，原告に対し，５億円及びこれに対する平成１９年２月３日から支払
済みまで年５分の割合による金員を支払え。
（予備的請求その１）
被告は，原告に対し，５億円及びこれに対する平成１９年２月３日から支払
済みまで年５分の割合による金員を支払え。
（予備的請求その２）
被告は，原告に対し，５億円及びこれに対する平成１９年２月３日から支払
済みまで年５分の割合による金員を支払え。
第２事案の概要
本件は，原告が，原告と被告は，平成１２年５月頃，原告の構築した物流シ
ステムに関する理論を被告がコンピュータ上で物流支援システムとして具現化
することにつき原告が承認すること，及び被告の外部防御のため，上記理論を
原告が特許出願することに対し，被告が相応の対価を支払うことを合意し，さ
らに，平成１９年２月２日，上記合意を再確認したにもかかわらず，被告が上
記相応の対価を支払わないと主張して，主位的には，上記合意に基づく請求と
して，予備的には，債務不履行に基づく損害賠償請求又は不当利得返還請求と
して，５億円（合意に基づく請求及び債務不履行に基づく損害賠償請求につい
ては，上記理論をコンピュータ上で具現化することを認めたことの対価１８億
６０２０万円の一部である３億円，特許出願の対価９億３０１０万円の一部で
ある１億円，原告が上記理論の研究・構築に要した実費５５１４万２２０８円
及び特許出願に要した実費・労務費５３０４万７８８０円の合計額である１億
０８１９万００８８円の一部である１億円の合計額。不当利得返還請求につい
ては，上記理論をコンピュータ上で具現化することを認めたことの対価１８億
６０２０万円の一部である５億円）（附帯請求として，上記合意に基づく支払
期限である平成１９年２月２日の翌日から支払済みまで民法所定の年５分の割
合による遅延損害金）の支払を求める事案である。
１前提事実（争いのない事実以外は，証拠等を末尾に記載する。）
(1)当事者等
ア(ア)原告は，昭和４９年に被告に入社し，平成１９年８月に被告を定年
退職したが，その後も引き続き再雇用され，平成２３年７月３１日まで，
被告の名古屋オフィスにおいて勤務していた者である。
(イ)原告は，被告入社後，平成４年までは部品部（平成９年にアフター
マーケット部，平成１３年１月にアフターマーケット営業部，平成１９
年１月に国内部品用品部，平成２３年に国内部品部に順次改称された。
以下，改称の前後を通じて「アフマ部」という。）に，平成５年から平
成８年までは車両部に，同年以降はアフマ部供給管理室に所属していた。
イ被告は自動車の製造，販売等を業とする株式会社である。
(2)原告による研究
ア原告は，平成５年４月，名古屋市立大学大学院に入学し，被告における
勤務時間外に授業を受け，物流に関し研究活動を行うようになった。
イ原告は，平成１０年３月に上記大学院を修了するに当たり，「販売物流
施設の最適立地」と題する修士論文（甲８）（以下「本件論文」とい
う。）を作成した。
(3)被告におけるプロジェクトの推移等
ア被告は，平成１０年８月頃，アフマ部において，トヨタ部品東京共販株
式会社（以下「東京共販」という。）の業績改善を目的として，物流効率
化プロジェクト等から成る「東京プロジェクト」（以下，上記「東京プロ
ジェクト」のうち，物流効率化プロジェクトに係る部分を「本件プロジェ
クト」という。）を開始し，物流改善をサポートするためのシステム（後
に，「AdvancedLogisticsInnovationSystem&Engineering」から「＠
ＬＩＳｅシステム」との名称が付されたもの。以下「本件システム」とい
う。）の開発に着手した（甲５６，乙１０）。
イ本件プロジェクトは，被告，東京共販及び富士通株式会社（以下「富士
通」という。）の従業員によって進められ，原告は，システムインテグレ
ーターとして，本件プロジェクトに関与した（甲１７，乙１０）。
ウ本件システムのソフトウェアの要件書（甲１０の１ないし５）は平成１
３年３月２１日に完成し，上記要件書に基づく本件システムのソフトウェ
アは平成１４年３月頃に完成した。
被告は，その頃，被告の共販会社らに対し，本件システムの概要につい
て説明を行い，その後，東京共販を含む７共販会社において，本件システ
ムのソフトウェアを適用して物流改善のためのシミュレーションが行われ
た（甲４５の１ないし５，４６の１ないし３，４７の１・２，４８，４９
の１・２，５０の１ないし３，５１，５６）。
(4)原告による特許出願等
原告は，平成１５年から平成２２年にかけて，別紙特許権目録記載のとお
り，合計７件の発明について特許出願を行い，いずれも登録査定を受けた
（以下，同目録記載の特許権を併せて「本件特許権」といい，本件特許権に
係る特許出願を「本件特許出願」という。）（甲１ないし７，１２ないし１
４）。
(5)被告による一時金支払の申出
被告は，平成１９年２月２日，原告に対し，一時金として２５０万円を支
払うことを提示した。
２争点
(1)合意に基づく対価請求（主位的請求）の成否
ア合意に基づく対価請求権の成否
イ「相応の対価」の額
(2)債務不履行に基づく損害賠償請求（予備的請求①）の成否
ア債務不履行に基づく損害賠償請求権の成否
イ損害額
(3)不当利得返還請求（予備的請求②）の成否
ア不当利得返還請求権の成否
イ利得額
(4)遅延損害金の起算日
第３争点に対する当事者の主張
１争点(1)ア（合意に基づく対価請求権の成否）
（原告の主張）
(1)Ｘ理論の完成，その内容等
ア原告は，平成１０年１月頃に名古屋市立大学に提出した本件論文を基礎
として，平成１０年８月頃までに，物流システムに関する理論（以下「Ｘ
理論」ということがある。）を構築・完成させた。
イＸ理論は，以下の４つの基本構成を有する。
(ア)物流施設立地制御理論
顧客サービスＬ／Ｔ（リード・タイム〔顧客との合意に基づく商品毎
の配送所要時間〕）基準と顧客分布を基に，最適物流施設立地（位置・
数）を決定する制御理論。従前の多段階物流（商品が本社から支社へ，
支社から営業所へ，営業所から顧客へと階層的に配送され，支社から営
業所を飛び越えて直接顧客に配送されることはないという配送の流れ）
に固執することなく，本社や支社から商品を配送することもあり得ると
の考え（飛び越え理論）に立った上で，顧客との合意に基づき，商品毎
に配送許容時間（Ｔ時間）を決め，上記配送許容時間と顧客分布に基づ
き，全ての顧客をカバーできるように物流施設の立地を決めるというも
の。
具体的には，物流施設ｊから顧客ｉまでの配送所要時間を，顧客との
合意に基づく商品毎の配送許容時間であるＴ時間（サービスＬ／Ｔ基
準）以内に収めるべく，物流施設ｊが担当すべき顧客を，物流施設ｊを
中心とする時間円（配送許容時間Ｔに基づき半径を設定したもの）の範
囲内に位置する顧客と決め，顧客の全てがいずれかの時間円内に位置し，
かつ，時間円の総数ができるだけ少なくなるように時間円を顧客分布地
域に配置し，上記時間円の各中心を，物流施設の位置とする。なお，上
記のように，サービスＬ／Ｔ基準と顧客分布に基づき物流施設の立地を
決めるためには，物流施設から顧客までの距離を長さではなく時間で捉
えた時間地図が必要となるので，このような時間地図も，併せて原告が
発想し，創造した。
これにより，物流におけるサービスとコストとの関係に内在するトレ
ード・オフの関係を解決しつつ，物流施設の総数を抑制し，総コストを
低減させることが可能となるとともに，最適化された物流施設を，距離
マップ及び時間マップ上に表示することが可能となる。
(イ)配送制御理論
顧客分布及び顧客サービスＬ／Ｔ基準を基に，最適物流施設から当該
顧客までの最適配送コース（最短時間かつ最少配送回数のコース）を決
定する制御理論。顧客との合意に基づき，商品毎の配送許容時間である
Ｔ時間を決めた上で，上記Ｔ時間及び当該物流施設が担当する顧客の分
布に基づき，最少の配送回数で配送を完了できるよう，配送コースを決
めるというもの。
具体的には，物流施設ｊが担当する顧客ｉを，配送許容時間Ｔ時間以
内に位置する者に限定した上で，顧客を順にたどり，最後に立ち寄るべ
き配送先に至るまでの所要時間が，配送許容時間Ｔ内で，かつ，これに
近い時間になるよう，また，最後に立ち寄るべき配送先で積み荷が空に
なるよう，さらに，時間円の中の顧客にもれや重複がないよう，配送コ
ースを設定する。
これにより，配送コース・ダイヤ見直しを論理的かつリアルタイムで
行うことが可能となり，顧客サービスの向上と物流コスト改善を両立す
ることが可能となる。
(ウ)物流コスト制御理論
会社の決算情報から物流費の配分方式を確立し，物流原単位コスト
（商品１個当たりの物流コスト＝ミクロコスト）を算出等する制御理論。
現決算方式の書類・帳票類には物流費という項目はなく，物流コストを
的確に算出することが難しかったことから，物流コスト算出のための出
発点となる，物流施設別，商品別，作業工程（入庫，保管，出庫，配
送）別の物流コストである「物流原単位コスト」という概念を創造した
もの。
上記「物流原単位コスト」は，企業の決算情報（損益計算書，貸借対
照表）の項目の中で，物流に関連する項目を決め，当該項目の費用につ
いて，物流施設別に人員・トラック台数を配分し，さらに，物流施設の
商品別・作業工程別に作業時間データを配分することにより求められる。
これにより，各物流施設における商品別・作業工程別の物流コストを
明確な数値により把握し，その優劣を比較することができ，改善すべき
項目を明確にすることができる。
(エ)物流ネットワーク制御理論
上記(ウ)の物流コスト制御理論で得た商品１個当たりの物流コスト
（ミクロコスト）を用いて，物流ネットワーク上における商品の流れ
（流通＝商流，物流〔入庫，保管，出庫，配送〕）のシミュレーション
を行うことにより，改善前と改善後の全物流コスト（マクロコスト）を
算出するもの。
具体的には，ある物流施設の費用，作業工程の費用，商品の費用を求
め，これらを，それぞれ，変更後の対応する費用と比較することになる。
これにより，改善された物流モデルが論理的に優れており，かつ，顧
客サービスと物流コストの削減が飛躍的に向上することを立証すること
ができる。
ウＸ理論は，以上の４つの構成を基本として，物流施設立地制御理論（上
記イ(ア)），配送制御理論（上記イ(イ)）により，物流施設及び配送を定
量化・論理化・最適化し，更にこれらを前提として，物流コスト制御理論
（上記イ(ウ)）により，ミクロコストを創出した上で，物流業務について
社会的・経営的制約がある中で，実際に物流ネットワーク上を流れる商品
が最適ネットワーク・最適物流工程を流れるようシミュレーションを行い，
そのマクロコストを算出・比較することで（上記イ(エ)），最適物流戦
略・最適経営判断に資することを目的とするものである。
(2)本件合意の成立
ア被告は，平成８年頃から，流通・物流を含めた抜本的構造改革に取り組
んでいたところ，原告は，平成１０年６月頃，被告側からの依頼に基づき，
本件プロジェクト関係者に対し「Ｋ東京物流コストの削減アプローチ‐物
流ネットワークの解析による‐」と題する資料（甲１１の１ないし１０）
を配布してＸ理論の説明を行い，さらに，同年７月２１日にも打合せにお
いて資料（甲１１の１１ないし１５）を配布して説明を行った（以下，甲
１１の１ないし１５を併せて「本件説明資料」という。）。
原告は，同年８月頃，被告共販店室室長・Ｏから，本件プロジェクトへ
の参加及びＸ理論の本件プロジェクトへの利用を正式に依頼され，これを
受け入れた。
イ原告は，本件プロジェクトのリーダーとして，Ｘ理論をコンピュータ上
で具現化するための物流支援システムである本件システムのプログラムの
作成に携わり，平成１１年３月３０日頃，被告取締役らにＸ理論の概要に
ついて説明を行った。
ウ被告は，平成１１年頃，本件システムにおいて利用されているＸ理論が
職務発明に該当する可能性はないとの理解の下，原告に対し，同理論につ
いて特許を受ける権利の譲渡を提案したが，原告はこれを拒絶した。そこ
で，被告は，平成１２年４月１４日，①Ｘ理論をコンピュータ上で具現化
することについて原告から承認を受け，②外部防御のため，本件システム
について原告がその名義で特許出願を行うことを要請し，③これらについ
て原告に相応の対価を支払うことを決定し，同年５月頃，被告アフマ部部
長であったＱ（以下「Ｑ」という。）は，原告に対し，上記①ないし③に
ついて伝え，もって相応の対価の支払及び相応の対応を約し，原告はこれ
を受け入れた。
これにより，原告と被告との間に，原告が①Ｘ理論を本件システムにお
いてコンピュータ上で具現化することについて承認し，②本件システムに
ついて原告が特許出願を行うという債務を履行し，③被告がこれについて
相応の対価を支払うことを内容とする合意が成立したものである（以下
「本件合意」という。）。なお，ここでいう相応の対価とは，Ｘ理論のコ
ンピュータ上での具現化を認めることの対価及び外部防御のために特許出
願を行うことの対価という意味である。
エ被告アフマ部部長であったＲは，平成１６年４月２７日，原告に対し，
本件合意を尊重する必要がある旨述べ，また，同年５月１８日頃，被告が
Ｘ理論を使っている以上，対価支払の必要があること及び本件システムの
成り立ち等について整理が必要であること等を表明し（上記表明に基づき，
平成１７年４月１９日に原告が作成し，被告アフマ部の確認を受けた文書
が甲２９の１〔その後改訂されたものが甲２９の２・３〕である。），さ
らに，平成１６年５月２８日，上記Ｒ及び被告アフマ部総括室室長（Ｖ）
は，本件合意を尊重する必要がある旨の発言をして，本件合意の存在及び
内容について確認をした。加えて，被告は，知的財産部及びアフマ部にお
いて本件合意の扱いについて検討した上，平成１９年２月２日，原告に対
し，本件合意の対価として，極めて低額ではあるものの２５０万円の支払
を提案しているのであって，これにより，本件合意の存在及び内容につい
て再確認の合意をしている。
オ以上によれば，原告と被告との間に，本件合意が成立していることは明
らかである。
カ被告の主張に対する反論
(ア)被告は，Ｘ理論は本件プロジェクト開始後に原告，被告従業員及び
富士通従業員の共同で完成されたものであると主張するが，否認する。
Ｘ理論は，平成１０年８月までに，原告が単独で完成させたものであり，
被告や東京共販，富士通の従業員らと共同で完成させたものではない。
平成１０年８月までにＸ理論が完成していたことは，原告が平成１０
年６月及び７月に本件プロジェクト関係者に対しＸ理論の説明を行った
際に使用した本件説明資料（甲１１の１ないし１５）にＸ理論の要点・
骨子が記載されていること，同年８月１０日付けの被告アフマ部・Ｕか
ら原告へのメール（甲１６）で，Ｘ理論の説明を受けた所感が述べられ
ていること，同年８月１７日付け「Ｔプロジェクトについての再確認」
と題する文書（甲１７）において，「当ＰｒｊはＸＳＬ個人の知的所有
を出発・核としており」との記載があること，被告アフマ部が，平成１
０年８月から同年１２月の被告知財部との打合せにおいて，原告が平成
１０年８月の本件プロジェクト開始以前にＸ理論を完成させたことや，
被告の依頼により本件プロジェクトが上記理論を利用することになった
ことを繰り返し説明していること（甲１８の１ないし４），平成１１年
１月に，被告アフマ部が，本件システムのうち知的財産性が認められる
と評価される事項（合計１４件）を整理しており，そのうち大部分（合
計１１件）につき，原告の１００％業務発明又は業務寄りの発明である
と評価していること（甲１９），平成１２年３月１３日に，原告，被告
及び富士通で協議した結果，本件システムに対する原告のノウハウ比率
が７１％と評価されていること（甲２１の２），平成１６年５月１８日
付けの上記Ｕから原告へのメールに「Ｘさんの知的財産を使わせていた
だき，トヨタで大きな効果を生み，また，その状況や結果を踏まえて，
Ｘさんが更に研究を深めると言う良いサイクルを期待しておりまし
た。」との記載があることから明らかである。
(イ)また，被告は，「Ｘ理論」は乙７ないし９の記載内容と実質的に同
一又は極めて類似していると主張するが，被告が「甲１１から読み取れ
る理論」として整理する内容（被告の主張における【ａ】ないし
【ｇ】）は，原告の主張するＸ理論とは全く異なるものである。
すなわち，本件説明資料（甲１１の１ないし１５）は，課題を解決す
るための具体的構成について説明するためのものであり，例えば，本件
説明資料による説明後に作成された書面（甲１７）に，「ミクロ物流コ
スト」の記載があることからも明らかなとおり，物流ネットワークシス
テムにおける物流コスト分析の手法等を記載し，説明したものである。
被告の主張は，甲１１から読み取れるＸ理論の重要部分を無視又は意図
的に欠落させ，乙７ないし９に符合させるために一部を曲解したものに
すぎない。
これに対し，乙７ないし９には，解決すべき課題が漠然と記載されて
いるのみであり，課題解決のための具体的構成は全く記載されていない。
また，乙７ないし９は，立地・配送・コストが混然と論じられており，
物流ネットワーク上でのコスト把握についても何ら論じられていない。
(ウ)さらに，被告は，本件特許出願は被告の依頼に基づくものではない
とも主張するが，本件特許出願が被告の外部防御のため，その依頼に基
づきなされたものであることは，被告が，当初，原告から特許を受ける
権利の譲渡を受けて特許出願することを検討していたこと（甲１８の４，
１９，２０，２２），平成１２年４月１４日付け議事録（甲２８）に，
特許化申請は個人として行う旨の記載があること，被告アフマ部の公式
見解を示す書類（甲２７の３，２９の１ないし３）に，原告に特許取得
を依頼した旨の記載があること，本件特許出願の内容が，本件システム
の要件書（甲１０の１ないし３）の内容に沿うものであることから明ら
かである。
(3)原告が本件合意に基づく債務を履行したこと
ア原告は，平成１３年６月，Ｘ理論をコンピュータ上で実現するために必
要となる機能を説明した書面である要件書（甲１０の１ないし３）を作成
し，平成１４年３月，本件要件書を基に本件システムを完成させ，本件シ
ステムは，その後，東京共販ほか６共販店に導入された。
本件システムは，Ｘ理論をコンピュータ上で具現化したものであり，基
本的にＸ理論と同義である。
イ原告は，本件合意後，予定していた学会での発表を見合わせるとともに，
特許出願の準備作業に着手し，前記前提事実(4)のとおり，平成１５年以
降，被告における就業時間以外の時間を利用して順次特許出願を行った。
上記特許出願は，本件システムのうち，最も重要と考えられる部分を特許
請求の範囲に記載し，かつ，本件システムの内容を上記特許出願に係る明
細書において説明したものである。
(4)本件合意に基づく相応の対価請求
ア確かに，本件合意においては，「相応の対価」を支払う旨の合意が成立
しているのみで，具体的な金額の合意がされているものではない。しかし，
水戸地裁土浦支判平成１５年４月１０日（判例時報１８５７号１２０頁）
及びその控訴審である東京高判平成１６年９月２９日（判例時報１８８７
号９９頁）は，従業員である原告が，被告に入社する以前に実用新案登録
出願をした自由考案につき，被告に対し実施許諾をし，更にその後，権利
の一部を会社に譲渡したとして，その対価を請求した事案において，従業
員と会社との間で，上記権利の一部譲渡等の黙示の合意（本件無名契約）
の成立を認めた上で，上記譲渡等により会社側の受けた利益額，本件考案
の寄与の程度，本件無名契約締結の経緯その他諸般の事情を総合考慮して，
社会通念上相当と認められる額を対価額とすることが当事者の合理的意思
にかなうと判断している。
イ上記裁判例に示された法理に照らし，本件においても，本件合意に至る
経緯，本件合意の内容，本件システムの導入により被告が受けるべき利益，
その他諸般の事情を総合考慮して，社会通念上，相応と認められる額を対
価とするのが当事者の合理的意思にかなうものというべきである。なお，
本件合意は，特許利用料という観点ではなく，単純に，Ｘ理論の利用とい
う観点での対価支払を約したものであり，被告もこれを前提とした言動を
とってきているのであるから，特許利用料という観点で対価を算定するの
は相当ではない。
本件において，被告は，本件合意の存在を前提に，平成１９年２月２日
に，金額の具体的な提案まで行っているのであるから，これにより，本件
合意の内容が確認されているものということができ（「本件再確認の合
意」），この点からも，原告が，相応の対価請求をすることができること
が明らかである。
ウしたがって，原告は，本件合意の履行請求として，被告に対し，相応の
対価の支払請求をすることができる。
（被告の主張）
(1)原告の主張は，事実についてはその一部を否認し，法的主張は争う。
(2)「Ｘ理論」の内容について
ア原告は，「Ｘ理論」は平成１０年８月頃までに完成したものであると主
張し，その内容は争点(1)アに関する原告の主張(1)イのとおりであると主
張するが，否認する。
イ「Ｘ理論」の内容は，その完成時期であるとされる平成１０年８月頃ま
でに作成された資料である甲８，１１の１ないし１５，１６及び１７から
判断されるべきであるところ，本件説明資料（甲１１の１ないし１５）か
ら読み取れる理論は，以下の内容のものにとどまる。
「【ａ】物流コストと，（顧客へ提供できる）サービスはトレード・オフ
の関係にあることから，「物流戦略」としては，物流コストとサービスの
バランスをとることを目的とする。
そして，【ｂ】サービスに関して，「顧客サービス目標」として，「受
注～着荷Ｌ／Ｔ（注文を受けてから顧客の手に渡るまでの時間）を設定す
る。
その上で，物流改善案の具体的手段として，【ｃ】「顧客分布」を基に，
「営業所」の配置を検討するとともに，「営業所」にどのような機能を持
たせるかを検討し，
それを基に【ｄ】顧客への配送計画を策定する。
さらに，【ｅ】「本社・営業所別」に，「入庫～保管～出庫～配送」の
「工程別」に発生するコストを算出し，
【ｆ】上記【ｃ】及び【ｄ】に基づき決定された営業所の配置・機能及
び顧客の分布から導かれる「商品の流れ」に基づき，コストを算出する。
そして，【ｇ】物流改善案の具体的手段である上記【ｃ】及び【ｄ】を
適宜調整することで得られる各物流改善案について物流コストを算出し，
「顧客サービス目標」が満たされる条件下で物流コストが最も低くなる物
流改善策を探る。」
上記内容を超えて，原告が争点(1)アに関する原告の主張(1)イで主張す
るような内容の理論を本件説明資料から読み取ることはできない。
ウ原告が，争点(1)アに関する原告の主張(1)イで主張する「Ｘ理論」は，
原告が「Ｘ理論」の完成時期であると主張する平成１０年８月より後に作
成された本件システムに関する資料（本件システムのソフトウェアの要件
書等）に基づくものであるが，本件システムのソフトウェアは，本件プロ
ジェクトにおいて，原告を含む被告従業員，東京共販従業員及び富士通従
業員によって作り上げられたものであり，原告が平成１０年８月までに完
成させたものに当たらない。
エしたがって，原告が平成１０年８月までに完成させたという「Ｘ理論」
の内容は，上記アの限度にとどまるものであるところ，上記理論は，原告
が本件論文で引用している文献（乙７ないし９）に記載されている内容と
実質的に同一であり，原告が独自に考え出したものに当たらない。
すなわち，乙８の７９頁の「図表３－１物流計画業務の関連」におい
て記載されている内容は次のとおりである。
まず，【Ａ】「物流戦略」は，「顧客サービスと物流費のバランスをは
かる」ことが出発点であるとした上で，【Ｂ】「物流目標」を設定する。
そして，【Ｃ】「目標物流リードタイムを達成するための在庫拠点と配送
拠点を明確にする」ために，「物流拠点計画」を策定する。次に，【Ｄ】
「工場からの補充と配送を考慮して車両の運用計画を明確にする」ために，
「配車計画」を策定する。また，【Ｅ】「保管費」，「運送費」及び「荷
役費」を算出する。そして，【Ｆ】「保管費」，「運送費」，「荷役費」
（及び梱包費）を合計することで，「合計物流費」を算出し，合計物流費
を利用して，「物流計画の評価」を行う。また，「物流計画の評価」から
「物流拠点計画」へ処理のループを示す矢印が引かれていることから，
【Ｇ】物流計画の内容として【Ｃ】「物流拠点計画」，【Ｄ】「配車計
画」を適宜調整してシミュレーションすることにより，設定した「物流目
標」が満たされている条件下で，最もコストの低い物流計画を策定する。
上記【Ａ】ないし【Ｇ】の内容は，前記イでみた「Ｘ理論」の内容であ
る【ａ】ないし【ｇ】の内容と実質的に同一であることが明らかである。
(3)「本件合意」が成立していないこと
ア被告アフマ部・共販室は，平成１０年頃，低収益であった共販店の物流
改善のための方策について，当時，同部供給管理室に所属していた原告に
相談を持ち掛けたところ，原告は，積極的に物流改善のための施策の立案
等に参画する様子を見せた。原告は，このような経緯により，本件プロジ
ェクトに参加することになったものであり，被告の懇願により本件プロジ
ェクトに参加したものではない。また，本件プロジェクトにおいて，原告
が取得した知見（職務外での研究成果）を利用することは当然の前提とな
っていたものであり，被告がその利用を原告に懇願し，承認を受けたもの
でもない。
イ被告は，平成１０年から平成１１年にかけて，本件プロジェクトにおけ
る検討内容についての特許出願の必要性について検討し，上記検討内容に，
いわゆる業務発明（従業者の職務範囲には属さないが，使用者の業務範囲
に属する発明）に該当する発明が含まれる可能性があったことから，原告
に対し，上記発明が業務発明であれば，被告名義で特許出願を行うために
は原告から特許を受ける権利の譲渡を受ける必要がある旨説明し，大学教
授から特許を受ける権利の譲渡を受ける場合と同じ条件での権利譲渡を提
案したが，原告はこれを受諾しなかった。なお，上記譲渡条件を提案した
趣旨は，当該発明につき，職務発明であるかどうかを明確にせず，かつ，
職務発明ではない形で処理するのであれば，それが条件の上限であるとい
う趣旨にすぎない。
ウ上記のとおり，原告が，特許を受ける権利の譲渡を拒絶し，自ら特許出
願する意向を示したことから，被告は，平成１２年４月１２日に，被告ア
フマ部及び知財部で会議を行い，被告知財部から，当該発明につき原告名
義で特許出願をすることは選択肢の一つであることや，当該発明につき被
告による実施を確保するためには原告から確認を取っておくことが望まし
いこと，及び特許が成立した際には当該特許の有効性について検討した上
で，支払うべき実施料が存在すればこれを支払うことになることなどにつ
き見解が示された。このような経緯から明らかなとおり，被告は，本件シ
ステム関連の特許出願の必要性を強く認識していたものではなく，原告が
自ら出願したいのでればそれを否定する意向はないという程度の認識であ
った。
エ平成１２年５月頃，Ｑが，原告に対し，原告が被告における職務外での
研究成果に関して将来特許権を取得し，かつ，当該特許に係る発明すなわ
ち原告の職務外での研究成果を被告が本件システムの一部として利用する
のであれば，いくばくかの金員を支払う旨話した事実は認めるが，Ｑが
「相応の対価」との言葉を使用したか否かは不知であり，相応の対応をす
る旨約束したことは否認する。Ｑがこのような発言をした趣旨は，被告従
業員がその職務外でなした発明について特許権を取得した場合であって，
当該特許発明を被告が利用するときには，当該従業員に対して実施の状況
を勘案した対価を支払うのが当然であろうとの一般的認識を前提に，原告
が職務外でなした発明について特許権を取得し，被告が当該特許発明を利
用して利益を上げることになれば，必要に応じて，被告は原告に対し当該
特許発明の利用料を支払うことになるだろうという，特許制度上当然のこ
とを述べ，上記特許利用料により，原告が出願費用を少しでも回収できれ
ばよいとか，出願費用の足しになればいい，というＱの気持ちを伝えよう
としたものにすぎない。
オその後，平成１３年６月に本件システムのソフトウェアにつき要件書が
作成され，平成１４年３月頃に本件システムのソフトウェアが完成したも
のであるが，これらの要件書及びソフトウェアは，原告のみならず被告従
業員，本件システム開発のため被告へ出向中であった東京共販従業員及び
富士通従業員らの協力により作成されたものであり，原告のみにより，又
は原告の主導によって作成されたものではない。これは，本件システム開
発のために多くの人員が関与し，その完成まで相応の年月が費やされたこ
とや，本件システム開発に，物流支援用ソフトウェアを有していた富士通
の従業員が関与し，その知見を提供していたことからも明らかである。
カ平成１６年頃，被告アフマ部部長（Ｒ）は，原告又はＵに対し，本件シ
ステムに関する経緯を整理する必要がある旨話し，平成１７年頃，被告知
財部は，本件システムに関する発明が職務発明に該当する可能性及び先使
用（特許法７９条）の可能性を検討したことはあるが，被告従業員が，こ
れに加えて，原告に対し，本件合意を尊重する必要がある等の発言をした
事実は否認する。
キ被告は，平成１９年２月２日に，原告名義の特許及び特許出願（当時は
合計５件）を対象に，非独占的通常実施権の設定許諾を求め，その対価と
して，一時金２５０万円を支払う旨の提案を行った。これは，上記特許出
願の職務発明該当性等について論じることなく，原告との間の問題を解決
するためになされた提案にすぎない。
ク原告は，被告の上記提案を拒絶し，平成２０年３月３１日付けで，被告
代表取締役社長宛ての「ご通知」と題する書面（乙２）を送付したが，上
記書面には，本件合意及びこれを基礎付けると原告が主張する事実につい
て何ら言及されていなかった。
ケ以上の経緯に照らせば，原告と被告との間に，原告の主張するような内
容の「本件合意」が成立した事実がないことは明らかである。そもそも，
原告が取得した知見（職務外での研究成果）を本件プロジェクトにおいて
活用することは，本件プロジェクト開始当時から当然の前提となっていた
ものであるから，Ｘ理論の利用を原告が承諾することを，平成１２年５月
の時点で改めて合意する必要はない。また，原告は，Ｑに対し，本件特許
出願は自己実現のためであるから金はいらない旨を話していたものであり，
本件特許出願が被告の依頼によるものではないことは明らかである。なお，
Ｑは，被告のアフマ部部長にすぎず，職務分掌上，被告が原告に対し金銭
債務を負うような合意をする権限を有しない上，Ｑの発言の趣旨は上記エ
のとおりであるから，Ｑの発言を，被告が何らかの新たな債務を負担する
性質の意思表示とみることはできない。
仮にＱの発言が何らかの意思表示であると解されたとしても，原告の主
張する意思内容とＱの発言の趣旨は完全に食い違っているのであって，意
思表示の合致はそもそも存在しない。
(4)本件合意に基づく相応の対価請求について
前記(3)のとおり，本件において，原告の主張するような内容の「本件合
意」は成立していないから，原告が，被告に対し，本件合意に基づき相応の
対価請求をすることはできない。
２争点(1)イ（「相応の対価」の額）
（原告の主張）
(1)本件合意に基づき，原告は，相応の対価を請求することができるところ，
本件合意に至る経緯，本件合意の内容その他諸般の事情を考慮すれば，「相
応の対価」とは，①Ｘ理論のコンピュータ上における具現化を認めたことの
対価，②Ｘ理論を研究・構築するのに要した実費，③本件システムに関し特
許出願をしたことの対価，④上記特許出願に要する実費から構成されるもの
と解すべきである。
(2)①Ｘ理論のコンピュータ上における具現化を認めたことの対価について
アＸ理論のコンピュータ上における具現化を認めたことの対価を算定する
ためには，Ｘ理論の本質的価値を算出することを要するところ，上記本質
的価値を算出するためには，まず，Ｘ理論を具現化したものである本件シ
ステムの本質的価値を算出するのが相当である。
イ本件システムの価値について
本件システムは，物流コストの概念を明確化し，シミュレーションを繰
り返し行って従前の物流コストとシミュレーションによって得られた物流
コストを比較することにより，物流コストの最適化・最小化の実現という
レベルの経営判断を可能とするものであるから，従前の物流コストとシミ
ュレーションによって得られた物流コストとの差（「物流コスト削減効
果」）から本件システムの本質的価値を算定することは極めて合理的であ
る。そして，本件システムは，被告傘下の全共販店に導入される計画であ
ったから，本件システムによる物流コスト削減効果は，本件システム導入
により全共販店において見込まれる物流コスト削減効果によって検討され
るべきである。被告が２５０万円の額を提示する基礎となった算定方法は，
本件システムの第三者への販売実績，すなわち売上げがないことを根拠に
開発費を基礎に算出したものであり，不誠実かつアンフェアである。また，
本件システムに対する原告の寄与率を３分の１としていることにも合理的
根拠はない。
被告アフマ部が平成１２年３月１３日付けで行った物流コスト削減効果
の試算（既に本件システムのパイロットモデルを導入済みであった東京共
販における物流費用削減額・削減見込み額を基に，全共販店において本件
システムを導入し５年間実行した場合の物流費用削減額を試算したもの。
甲２１の２）によれば，上記削減額は，次のとおり，単年度当たり１０４
億８０００万円と算出されている。
(ア)物流施設立地制御システム
ａ施設費の削減３３．１億円
時間概念による顧客分布，サービス戦略（商品別Ｌ／Ｔ目標の設
定）により，全共販店の物流施設２７３か所のうち，３分の２である
１９９か所を削減することが可能である。したがって，総施設費８８．
９億円÷１９９／２７３＝６４．８億円を削減できるところ，これを
５年かけて順次導入した場合の５年平均削減額は３８．９億円となり，
物流コスト分析の貢献効果である１５％を控除すると，施設費削減効
果は３３．１億円／年となる。
ｂ物流コストの削減２２．１億円
「Ａ－ＴＯＰ（トヨタ自動車物流システム）将来構想効果」として，
東京共販において，物流施設の集約により，大物外装につき７％，そ
の他につき１８％（合計３億９０８０万円）のコスト削減が可能であ
る。したがって，全共販店においても，東京共販における上記削減額
３億９０８０万円を東京共販の受注割合０．０９で除した金額である
４３．４億円を削減可能であるところ，これを５年かけて順次導入し
た場合の５年平均削減額は２６．０億円／年となり，更に物流コスト
分析の貢献効果である１５％を控除すると，削減額は２２．１億円と
なる。
(イ)配送制御システム
ａ営業所トラック台数の削減６．７億円
配送基準（顧客配送先選定・サービスＬ／Ｔ）の設定によって，配
送顧客・回数削減が可能となり，営業所トラック台数を３分の１に削
減することが可能である。したがって，全国共販店営業所の有するト
ラック台数（６００台と推定される。）の３分の１である２００台
（１台当たりの傭車コスト６６０万円／年×２００台＝１３．２億
円）を削減できるところ，これを５年かけて順次導入した場合の５年
平均の物流コスト削減額は７．９億円となり，物流コスト分析の貢献
効果である１５％を控除すると，配送制御システムによるコスト削減
効果は６．７億円／年となる。
ｂ配送ダイヤ見直し工数の削減０．２億円
配送シミュレーションによれば，配送ダイヤ（工数）を，６日／週
を１日／週に削減可能である。したがって，現在の配送ダイヤ２０５
か月（６日×２７３拠点×３コース）を５年で３４か月（１日×２７
３拠点×３コース）まで削減でき，これにより，人件費（４６４万５
０００円／月）を０．２億円（４６４万５０００円×〔２０５－３４
か月〕＝０．２億円）削減可能である。上記配送ダイヤ見直しは直ち
に全部実行可能であるから，８５％を乗じる必要はない。
(ウ)物流コスト分析１５．７億円
上記(ア)（物流施設立地制御システム），上記(イ)（配送制御システ
ム）及び下記(エ)（物流ネットワーク制御システム）における各削減効
果のうち，それぞれ１５％は物流コスト分析によるシステム貢献効果と
して算定すべきところ，その合計額は１５．７億円となる。
(エ)物流ネットワーク制御システム
ａ本部（各共販店本社）トラック台数の削減４．４億円
物流ネットワーク図により，本部・営業所間の配送効率を実現し，
大動脈物流，夜間配送により，全国共販店本部トラック台数を３分の
１に削減することが可能である。したがって，全国共販店本部の有す
るトラック台数（４００台と推定される。）の３分の１である１３０
台（１台当たりの傭車コスト６６０万円／年×１３０台＝８．５８億
円／年）を削減できるところ，これを５年かけて順次導入した場合の
５年平均の物流コスト削減額は５．２億円となり，物流コスト分析の
貢献効果である１５％を控除すると，物流ネットワーク制御システム
によるコスト削減効果は４．４億円となる。
ｂ物流コストの削減２２．６億円
「Ａ－ＴＯＰ（トヨタ自動車物流システム）将来構想効果」として，
東京共販において，共販店本部・営業所間の多段階入・出庫・保管の
回避による集約効果により，大物外装につき２６％，その他につき１
６％（合計４億００１０万円）のコスト削減が可能である。したがっ
て，全共販店においても，年間物流（入荷～出庫）コスト２５９億円
（東京共販における物流（入庫～出庫）コスト２３．３億円〔甲４６
の２〕を東京共販の受注割合９％で除した額）のうち，東京共販にお
ける上記削減額４億０１０万円に対応する額である４４．４億円を削
減可能であるところ，これを５年かけて順次導入した場合の５年平均
物流コスト削減額は２６．６億円／年となり，更に物流コスト分析の
貢献効果である１５％を控除すると，削減額は２２．６億円となる。
ウ上記１０４億８０００万円は期待値であるので，原告は，その半額であ
る５２億４０００万円を単年度当たりのコスト削減効果として主張する。
上記数字が合理的であることは，平成１５年頃以降，本件システムを導
入した７共販店におけるシミュレーション結果（甲４５の１，４６の１）
が合計１０億８１００万円であり，これを全共販店（３４店）に適用した
場合，５２億５０５７万円となって，上記数値（５２億４０００万円）と
ほぼ一致することからも裏付けられる。
エ被告は，上記のとおり，物流コスト削減効果の算出に当たり，５年間の
効果を平均して計算を行っている上，被告は，導入効果に対し一定額の対
価を発明者に支払う実績報奨制度を有するのであるから，５年間のコスト
削減効果である２６２億円（５２億４０００万円×５年間）を＠ＬＩＳｅ
システムの価値と評価することは合理性を有する。
オ本件システムに対する原告の寄与率は７１％と算出されるから，２６２
億円に７１％を乗じた１８６億０２００万円がＸ理論の本質的価値であり，
原告は，これに１０％を乗じた１８億６０２０万円を，Ｘ理論の具現化を
原告が認めたことの対価として主張する。
(3)②Ｘ理論を研究・構築するのに要した実費について
ア原告は，被告における就業時間外に，被告の支援なくＸ理論を研究・構
築したものであるから，「相応の対価」の中に，上記研究・構築に要した
費用が含まれることは当然である。
イ原告は平成元年から研究を開始し，少なくとも平成１５年までの１５年
間にわたり研究を行ってきたものであるところ，下記(4)の特許出願のた
めの労務に従事した期間（平成１３年から平成２２年）との重複期間を除
くと，研究に従事した期間は１２年間となる。
原告は，上記期間において，月当たり６６時間（平日１日当たり１時間，
休日１日当たり５時間，１月当たりの平日２１日，休日９日として計算）
研究に従事したものであるところ，大学教授の平均年収は１１１４万円
（平成２２年厚生労働省調査）であるから，原告の時間当たりの対価は５
８０２円（１１１４万円÷１２か月÷８時間×２０日）となる。
したがって，原告がＸ理論の研究・構築に要した費用は，下記計算式の
とおり５５１４万２２０８円となる。
５８０２円×６６時間×１４４か月（１２年間）＝５５１４万２２０８円
(4)③本件システムに関し特許出願をしたことの実費について
原告は，前記前提事実(4)のとおり，本件特許出願を行ったものであると
ころ，前記(2)カの１８６億０２００円に５％を乗じた金額である９億３０
１０万円が，上記特許出願を行ったことの対価に当たる。
(5)④上記特許出願に要する実費について
ア原告は，平成２５年１０月までに，弁理士費用として５５１万９３４０
円，特許出願維持費用として２３９万８８００円（合計７９１万８１４０
円）を支出した（甲５３の１ないし３５，５４の１ないし１５）。
イ原告は，平成１３年から平成２２年までの１０年間にわたり，被告にお
ける就業時間外に，本件特許出願のための弁理士との打合せ等に従事して
きた。前記(3)イと同じく，原告が上記業務に従事した時間を月当たり６
６時間，時間当たり単価を５８０２円とみた場合，原告の本件特許出願に
対する労務費は，下記計算式のとおり４５９５万１８４０円となる。
５８０２円×６６時間×１２０か月（１０年）＝４５９５万１８４０円
(6)本件合意に基づく相応の対価の額は，上記(2)ないし(5)でみた①ないし
④の金額の合計額であるところ，原告は，主位的請求において，上記合計額
のうち，
①Ｘ理論のコンピュータ上における具現化を認めたことの対価１８億６０２
０円のうち３億円，
③本件システムに関し特許出願をしたことの対価９億３０１０万円のうち１
億円，
②Ｘ理論を研究・構築するのに要した実費５５１４万２２０８円，④上記特
許出願に要する実費７９１万８１４０円及び特許出願に対する労務費４５９
５万１８４０円の合計額１億０９０１万２１８８円のうち１億円，
の合計額である５億円を請求する。
（被告の主張）
(1)原告の主張は争う。
(2)原告が，本件合意に基づく「相応の対価」に含まれると主張する項目
（原告の主張(1)①ないし④）のうち，②Ｘ理論を研究・構築するのに要し
た実費については，ライセンサーが，実施料のほかに，開発委託契約ではな
いにもかかわらず当該発明の開発費を「実費」として上乗せ請求するような
主張であって，全く根拠がない。原告は，被告において，本件システムに関
する業務等の多忙を理由に（すなわち物流に関する研究に関連して）超過勤
務申請を行っているのであり，そうでありながら，同研究を「就業時間外
に」行ったと主張するのは自己矛盾であって，許されない。また，原告が自
らの意思で行った特許出願の費用（上記③）や労務費（上記④）を「相応の
対価」に含めることにも何ら根拠がない。
(3)①Ｘ理論のコンピュータ上における具現化を認めたことの対価について
ア原告は，本件システムの価値及びＸ理論の寄与から対価額を求めている
が，次のとおり，本件システム及びＸ理論の価値は，原告の主張するよう
な大きいものではない。
イそもそも，Ｘ理論に独自性がなく，価値に乏しいことは争点(1)アに関
する被告の主張(2)のとおりである。
また，原告は本件システムの価値をシミュレーションの効果額から導い
ているが，その根拠とする資料（甲２１の２）は被告社内の正式文書であ
るとはいい難く，証拠価値に乏しい。上記資料は，被告の全共販店で本件
システムによるシミュレーションを実施することを前提にしたものである
が，実際に本件システムを導入したのは全国３４共販店のうち７店にすぎ
ないから，上記資料は，期待される効果額を基に試算を積み重ねたものに
すぎず，現実の効果額を示したものではない。さらに，原告が本件システ
ムによるシミュレーションの効果として主張する内容は，シミュレーショ
ンの前提となるアイデアから導かれたものであり，その大半は，本件シス
テムの開発以前から被告や共販店に存在していたものである（乙１１，１
２）。加えて，本件システムによるシミュレーションの結果から好ましい
とされた施策であっても，現実の会社経営又は運用において直ちに実施す
ることが難しいものがあり，また，上記シミュレーション結果どおりの効
果が実際に共販店に利益として生じるものでもなかった。なお，東京共販
において経営合理化に最も効果があったのは，本件システムではなく，人
件費削減であった（乙１１）。
以上によれば，本件システムによるシミュレーションの効果額は，本件
システムという計算機を用いることにより，配送ルートを手計算で決定す
る手間が省けるという程度の極めて小さいものであり，上記効果に対する
Ｘ理論の寄与も小さいものにすぎない。
ウ以上によれば，Ｘ理論のコンピュータ上における具現化を認めたことの
対価に関する原告の主張には根拠がない。
３争点(2)ア（債務不履行に基づく損害賠償請求権の成否）
（原告の主張）
(1)仮に，本件合意が対価の具体性を欠くことを理由として，本件合意に基
づく対価請求ができない場合であっても，原告は，次のとおり，被告に対し，
債務不履行に基づく損害賠償請求として，相応の対価相当額の支払を求める
ことができる。
(2)本件合意から派生する付随義務としての誠実協議・交渉義務
原告は，争点(1)アにおいて主張したとおり，本件合意により定められた
義務をいずれも履行しているところ，これは，原告が，被告からの強い要請
に応じ，かつ，相応の対価を支払う旨の被告の言を信じたことによるもので
ある。加えて，被告は，日本の製造業を代表する大企業であり，原告が，雇
用契約継続中に，被告と対等な立場で本件合意の具体化のための協議・交渉
を提案することは不可能な状況であった。これらを考慮すれば，被告は，信
義則及び社会的公正の見地から，本件合意を遵守し，その内容を具体化すべ
く，原告との間で誠実に協議・交渉を継続すべき義務を負うものというべき
である。
(3)被告が上記誠実協議・交渉義務を尽くしていないこと
ア本件合意に基づく相応の対価とは，原告がＸ理論の具現化を認めること
の対価，原告の研究に要した実費，原告が特許出願をしたことの対価，特
許出願等に要する実費からなる４要素を総合考慮し，社会通念上相応と認
められる範囲の金額であり，被告は，上記誠実協議・交渉義務に基づく，
上記範囲内の金額を提示すべき義務を負う。
しかるに，被告は，上記範囲内から著しくかけ離れた金額である２５０
万円の提示しかしていないのであるから，被告は，上記義務を履行してい
ない。
イまた，被告は，本件合意を否定する趣旨の言動を取ってはならず，かつ，
原告の意見を十分に聴取し，原告の求めに応じ，対価算定のための資料や
根拠の開示に速やかに応じなければならないのであって，被告が過去の言
動と相反する言動に及び，又は原告の信頼を裏切る行為があれば，当然に
本件誠実協議・交渉義務違反となるというべきである。
しかるに，被告は，原告の定年再雇用時に再雇用契約の更新を拒絶する
姿勢をみせ，平成１４年から平成１６年頃，原告の勤務が深夜に及ぶ高負
荷状況となっていたにもかかわらずこれを適時に改めず，さらに，平成１
６年４月２７日には，原告を本件システムの担当から外そうとするなど，
本件合意に基づく相応の対応をしてこなかった。また，被告は，平成１７
年に先使用を理由として被告の対価支払義務を否定する発言をするなど，
本件合意を覆す言動を繰り返した。また，被告は，平成１９年２月２日に
対価の具体的提案をするに際し，原告の意見を十分に聴取せず，かつ，そ
の根拠を明らかにしなかった。
加えて，被告は，自ら強く要請して原告を本件システムの開発に従事さ
せ，特許出願をさせたにもかかわらず，平成１２年には，対価を決める際
には原告出願特許の有効性を否定することを画策し，実際に平成２０年１
１月２５日には，原告出願特許に無効理由がある可能性がある旨の主張を
展開するに至った。
(4)したがって，被告には，上記誠実協議・交渉義務違反の債務不履行があ
り，被告は，上記債務不履行に基づき，原告に対し損害を賠償すべき義務を
負う。
（被告の主張）
(1)原告の主張は争う。
(2)争点(1)アに関する被告の主張のとおり，本件合意が存在しない以上，被
告が，本件合意に基づき付随義務を負うこともない。Ｑによる，いくばくか
の金員を支払う旨の発言は，広い意味での原告の功労に報いるという趣旨の
ものであり，これにより何らかの付随義務が発生するようなものではない。
(3)原告が，付随義務違反に当たると主張する行為は，いずれも正当な理由
のあるものであり，被告につき，何らかの義務違反を構成するものではない。
４争点(2)イ（損害額）
（原告の主張）
(1)原告は，被告が誠実に本件合意に基づく義務を履行していれば，相応の
対価の支払を得られたはずであるにもかかわらず，被告の債務不履行により，
上記相応の対価の支払を受けることができなかった。したがって，原告は，
債務不履行に基づく損害賠償請求において，合意に基づく対価請求と同様に，
①Ｘ理論のコンピュータ上における具現化を認めたことの対価，②Ｘ理論を
研究・構築するのに要した実費，③本件システムに関し特許出願をしたこと
の対価，④上記特許出願に要する実費の合計額を請求することができる。
(2)原告は，債務不履行に基づく損害賠償請求として，上記①ないし④の合
計額のうち，
①Ｘ理論のコンピュータ上における具現化を認めたことの対価１８億６０
２０円のうち３億円，
③本件システムに関し特許出願をしたことの対価９億３０１０万円のうち
１億円，
②Ｘ理論を研究・構築するのに要した実費５５１４万２２０８円，④上記
特許出願に要する実費７９１万８１４０円及び特許出願に対する労務費４５
９５万１８４０円の合計額１億０９０１万２１８８円のうち１億円，
の合計５億円を請求する。
（被告の主張）
(1)原告の主張は争う。
(2)金銭債務の不履行に基づく損害賠償は，民法４１９条により遅延損害金
と定められているから，本件合意に基づく相応の対価支払義務の不履行によ
る損害賠償金として，「相応の対価」と同額の支払を請求する原告の主張は，
主張自体失当である。また，誠実交渉義務等の付随義務違反によって，本来
債務の履行によって得られるべき対価と同額の損害が発生するとの点につい
ても根拠がない。
５争点(3)ア（不当利得返還請求権の成否）
（原告の主張）
仮に本件合意の存在又は効力が認められない場合，被告は，対価を支払うこ
となくＸ理論をコンピュータ上で具現化し，これにより利益を得ているのであ
るから，原告は，上記利得の返還を求めることができる。
（被告の主張）
(1)原告の主張は争う。
(2)争点(1)アに関する被告の主張のとおり，本件システムは，原告が独力で
完成させた理論を具現化したものではないから，不当利得返還請求が成立す
る余地はない。そもそも，本件合意の成立が認められない場合，被告が相応
の対価を原告に支払うべき根拠が失われるのであるから，相応の対価が原告
の損失又は被告の利得となる根拠がない。
６争点(3)イ（利得額）
（原告の主張）
(1)被告は，Ｘ理論をコンピュータ上で具現化し，その対価相当額の利得を
得ており，原告は同額の損失を受けているのであるから，原告は，不当利得
返還請求において，Ｘ理論をコンピュータ上で具現化することを認めたこと
の対価を，原告の不当利得として返還請求することができる。
(2)原告は，不当利得返還請求において，上記Ｘ理論のコンピュータ上にお
ける具現化を認めたことの対価１８億６０２０円のうち５億円を請求する。
（被告の主張）
原告の主張は争う。
７争点(4)（遅延損害金の起算日）
（原告の主張）
(1)被告は平成１８年まで本件合意の具体化のための協議・交渉を提案して
きたことがなく，平成１９年２月２日に初めて原告に対し具体的金額（２５
０万円）を提示したものであるから，原被告間で本件合意の具体化のための
協議・交渉が開始された日は同日ということができる。
そうすると，原告と被告との間に，本件合意に基づく相応の対価の支払期
限を同日とする黙示の合意が成立しているものというべきである。
(2)したがって，主位的請求，予備的請求①及び②のいずれについても，遅
延損害金の起算日は平成１９年２月２日となる。
（被告の主張）
原告の主張は争う。
第４当裁判所の判断
１争点(1)ア（合意に基づく対価請求権の成否）
(1)前記前提事実に加え，証拠（各認定事実の末尾に摘示する。）及び弁論
の全趣旨によれば，争点(1)アに関し，以下の事実が認められる。
ア被告は，平成１０年頃から，アフマ部において，東京共販の業績改善の
ため，物流システムの改善を検討していたところ，前記前提事実(1)ア
(イ)及び(2)のとおり，当時，被告アフマ部供給管理室に所属していた原
告が，物流に関し個人的に研究活動を行い，本件論文を作成するなどして
いたことから，原告に依頼して，その研究内容等について説明を受けるこ
ととした（甲１１の１ないし１５，５６，原告本人）。
イ原告は，平成１０年６月頃，被告アフマ部関係者に対し，「Ｋ東京物流
コストの削減アプローチ－物流ネットワークの解析による－」と題する資
料（甲１１の１ないし１０）を用いて説明を行い，さらに，同年７月頃，
「Ｐｒｅ打合（第１回）」と題する資料（甲１１の１１ないし１５）を用
いて打合せを行った（甲１１の１ないし１５，甲５６，原告本人）。
ウ上記説明及び打合せの結果，被告アフマ部は，東京共販の物流システム
改善のために本件論文等を利用し，東京共販の物流効率化をサポートする
ためのシステム（本件システム）の開発を行うこととし，前記前提事実
(3)のとおり，平成１０年８月頃，本件プロジェクトを開始するに至った
（甲５６，乙１０）。なお，前記前提事実(3)イのとおり，本件プロジェ
クトは被告従業員，東京共販従業員及び富士通従業員で構成され，原告が
システムインテグレーターとして関与するものであった。
エ被告アフマ部従業員・Ｕは，同年８月１０日，原告に対し，「時間マッ
プ・最適立地・コスト分析は明らかに「立派なノウハウ」と考
マ
る
マ
。しかも
トヨタノウハウというよりＸさんノウハウであり，Ｘさん抜きでＴプロジ
ェクト（行く行くのＴＡＳＳ）は成り立たない。」，「特許・学会の話に
ついて，一度レクチャーして下さい。…今回の構想がうまく行ったとして，
学会での発表等，Ｘさんはまずどうしたいのか，富士通が何をする可能性
があるのか，留意すべき点は何なのか」等と記載したメールを送信した
（甲１６）。また，被告アフマ部共販店室スタッフリーダー・Ｗは，同月
１７日付けで，「Ｔプロジェクトについての再確認」と題する書面（甲１
７）を作成し，同書面中に，「Ⅱ知的所有について／当ＰｒｊはＸＳＬ
個人の知的所有を出発・核としており，当然「保護」「尊重」されるべき
である。／Ⅲ懸案事項／(1)知的所有の切り分け」等と記載した（甲１
７）。
オ被告知財部と被告アフマ部は，同年１２月１８日，「物流ネットワーク
制御システムの特許申請方法」を議題とする打合せを行い，被告アフマ部
からは，本件システムが個人の私的論文から出発したものであり，これを
システム化するものであること，システム化のための理論・推進方法は上
記論文に基づいていること，上記論文は原告が業務とは無関係に行った研
究の成果であることなどが示され，本件システムに関する特許出願等の扱
いにつき，知財部に対し伺いがなされた（甲１８の１・２）。これに対し，
被告知財部は，本件システムの出発点である本件論文の中にある特許内容
は業務発明（従業者の職務範囲に属しないことから職務発明には該当しな
いが，使用者の業務範囲に属する発明を指すものとして，被告知財部で用
いられていたもの〔甲１８の３，証人Ｑ〕。以下，そのような意味で「業
務発明」の語を使用する。），本件システムの中にある特許内容は職務発
明と扱う旨の見解を示し，被告知財部と被告アフマ部は，本件システムに
関し，業務発明部分（本件論文）と職務発明部分（本件システム）が切り
分けられたという認識を共有した。その上で，被告知財部と被告アフマ部
は，本件システムに関し，業務発明に該当する部分と，職務発明に該当す
る部分を明確に切り分ける作業を行うこと，職務発明については被告の規
定により，業務発明については知財部が条件を提示して原告と話し合いを
行うことにより，被告が譲渡を受け特許出願を行う予定とすること，富士
通の関与による部分についてもまとめる作業を行うことなどを確認した
（甲１８の３・４）。なお，上記打合せは，原告も同席して行われたもの
であった（甲１８の４）。
カ被告アフマ部は，上記打合せを受けて，本件システムについて分析を行
い，平成１１年１月１４日，知財部との打合せにおいて，本件システムに
関し知的財産性の認められる技術合計１４件のうち，原告の１００％業務
発明に該当するものは７件，１００％職務発明に該当するものは１件，そ
の中間に該当するもの（業務寄り）は４件，富士通の発明に該当するもの
は２件であるとの見解を示し，本件システムの骨格が本件論文に立脚して
いること及び本件論文は被告アフマ部が使用依頼をしたものであることか
ら，職務発明での処理は難しい旨の意見を表明した。これを受けて，被告
知財部は，原告から，業務発明を含めた全発明につき譲渡を受ける前提で
特許申請作業を急ぐこととした（以上につき甲１９）。
キ原告と被告知財部，被告アフマ部は，同年２月１５日，打合せを行い，
知財部は，譲渡条件が決まらないと次のステップ（特許申請処理）に進め
ないとして，原告に対し，その発明の譲渡条件として，被告の大学教授と
の発明規定に合わせた提案（出願費用は被告が負担し，発明実施の対価は
被告については無償とする。譲渡の対価は，通常出願１件につき２０万円，
重要出願１件につき４０万円とし，契約成立時に支払う。）をしたが（甲
２２），原告は上記対価による譲渡を拒絶した（甲５６，原告本人）。
ク原告は，平成１０年頃から，平成１１年３月２７日に開催される日本物
流学会中部支部会において研究成果を発表することを予定していたが，上
記のとおり，原告の研究成果の提供に基づき本件プロジェクトが進行し，
本件システムに関し特許出願を行うことの検討が行われている状況であっ
たことから，上記学会における発表により特許申請に影響が及ぶことを避
けるため，同年３月８日，上記学会における発表内容を，特許申請予定部
分を除いた序論及び実体調査モデルのみにとどめる旨の社外発表決裁書を
被告取締役宛てに提出し，承認する旨の決裁を得た（甲１５の１・２，２
５，５６）。
ケ(ア)被告知財部と被告アフマ部は，平成１２年３月１４日，本件システ
ムの特許化について打合せを行った。同打合せにおいて，被告アフマ部
は，業務発明により得た知的財産（ノウハウ）を生かし本件システム開
発を行ってきたことを前提として挙げた上で，本件システムに関し特許
化すべき項目（大項目として物流ネットワーク制御システム，物流コス
ト分析，配送制御システム，物流施設立地制御システム），当該項目に
おける原告，被告，富士通のノウハウの比率（原告の比率は上記大項目
順に９３．１％，６５．３％，５７．５％，６３．０％とされてい
る。）及び期待される効果を一覧表にしたもの（甲２１の２）を示し，
原告が，利用者側からの効果の評価とそれに見合う対価を求めているこ
とを示した。
(イ)これに対し，被告知財部（特許室）は，特許申請の方法としては①
被告が譲渡を受け被告が出願，②被告と個人（原告）が共同出願，③個
人（原告）が出願の３通りが考えられるが，共同出願（上記②）は前例
がなく，その必要性もないため考えられないこと，被告出願による特許
化（上記①）のためには被告が原告から特許を受ける権利の譲渡を受け
ることが前提となるが，業務発明・職務発明のいずれの場合であっても，
譲渡については現規定を適用する以外なく，新たな規定を設定する理由
は考えられないこと，本件システムの効果を実施前に評価することはで
きず，被告アフマ部から示された期待効果等の一覧表（上記(ア)）は現
段階では意味をもたないこと，職務発明の場合には，導入による効果に
対し５年間一定の対価を発明者に対し支払う実績報奨制度があるが，業
務発明の場合には，被告の規定上，譲渡条件が効果も含めた一時払い額
となっているので，本件システムの効果を譲渡対価に反映することがで
きず，現規定（大学教授の発明について，通常出願につき２０万円／円，
重要出願につき４０万円／円）以外の対応はできないこと，本件を業務
発明として取り扱うことは，昨年，知財部室長までは了解済みであり，
部長への報告も済んでいる事柄であるが，特許化申請の中で，同様のケ
ースを職務発明として扱っている例は多数あること等の見解を示した。
(ウ)これにより，知財部とアフマ部との間で，新たな譲渡条件の提示は
できず，原告からの特許を受ける権利の譲渡につき進展が期待できない
ことが確認され，被告アフマ部は，譲渡条件が決まらないと特許化処理
ができず，システム開発も不可となる旨の懸念を示し，被告知財部は，
本件システムの開発自体は被告による特許出願なしでも被告アフマ部の
裁量により可能だが，実施前に決着する必要がある旨の見解を示した。
(エ)上記打合せでは，さらに，本件システムについて特許化するか否か，
また，ライセンス料の取り扱い（ライセンス料が発生するか否か，その
場合の特許申請との関係，ライセンス料の決定方法〔効果評価の仕方〕，
ライセンス料の配分方法，ライセンス契約方法等）等についても検討が
され，まず，本件システムの特許化については，譲渡条件が成立してか
ら判定を行うが，特許化のためには，ロイヤリティ収入があること又は
他社けん制の必要があることが必要であり，被告のみ（共販店内のみ）
の活用であれば特許化は不要であるが，富士通に市販化の意思があれば
特許化が必要となること等が確認された。また，ライセンス料（ロイヤ
リティ）に関しては，特許と別にノウハウに対するロイヤリティは設定
せず，ロイヤリティは特許を受ける権利の譲渡対価に含めての一括払い
としたい旨の考えが示された（上記(ア)ないし(エ)につき甲２０，２１
の１・２）。
コ上記打合せを踏まえ，被告アフマ部と被告知財部は，同年４月１２日に
再度打合せを行い，被告アフマ部から，本件システムにつき原告個人が特
許出願を行うことについて問題はないか，原告個人と被告との間で契約を
交わす必要があるかについて問い合わせがされた。被告知財部は，これに
対し，原告個人が特許出願を行うことは出願の選択肢の一つであり問題は
ないこと，被告における実施を確保できるよう，原告個人から実施を拒否
しない旨の確認を取っておくことが望ましく，契約書（覚書）等を交わし
ておく方法でもよいが議事録等で記録に残す程度でもよいこと，覚書を交
わすのであれば，実施料は別途協議の上決定する旨表現すること（無償使
用では問題があるのでは？）との見解が示された。また，被告知財部から
は，上記実施料は特許の有効性を検討した上で決めることになり，その際
に特許の有効性を否定する活動を行わざるを得ないとの見解が示され，被
告アフマ部から，その場合原告個人の感情を損なわないよう十分に留意願
いたい旨の意見が表明された（甲２８）。
サ上記打合せ結果を受けて，同年５月頃，被告アフマ部の当時の部長であ
ったＱは，原告に対し，本件システムにつき，原告が個人として特許出願
を行うことを前提として，本件システムを被告が開発・実施することにつ
いて承認を求めるとともに，これに対し相応の対価を支払う旨の発言をし，
原告はこれを了承した（上記発言の具体的内容及びその法的効果について
は後記(2)で検討する。）（甲５６，乙１０，証人Ｑ，原告本人）。
シ本件システムのソフトウェアの要件書が平成１３年３月２１日に，上記
要件書に基づく本件システムのソフトウェアが平成１４年３月頃に完成し
たことは，前記前提事実(3)ウのとおりである。
ス原告は，平成１６年４月２７日，被告アフマ部部長・Ｒから，同年６月
から本件システムの担当から外す旨の通知を受けたことから，本件システ
ムに関する過去の経緯・約束が実行されていない旨を述べた。これに対し，
上記Ｒは，個人に帰属する知的財産を使う以上，払うべきものは払わなけ
ればならない，従前の経緯について整理が必要である旨の見解を表明し
（甲３３の１，３４），同部・Ｕは，上記見解に関し，前段はＱ部長と同
じ，後段はアフマ部部長として妥当な判断との評価を原告に伝達した（甲
３４）。原告は，これを受けて，平成１７年４月頃までにかけて，本件に
関する経緯をまとめた書面（甲２９の１）を作成し，上記書面は，同年６
月頃までにかけて２度にわたり改訂された（甲２９の２・３）。
セ被告知財部は，平成１７年１１月頃，被告は本件システムについて先使
用による通常実施権を有するから費用負担は生じない旨の見解を示し，原
告は，これに対し，先使用の要件を満たさない旨及びアフマ部Ｑ部長から
相応の対価・対応の確約を得ている旨などを反論した（甲３３の５，３
５）。同年１２月２０日，原告，被告アフマ部及び被告知財部は打合せを
行い，従前の経緯についての各自の認識を確認し，被告知財部からは，原
告の出願に係る発明が職務発明であるか否かについては事実を調査して明
確にすべきであるが，平成１２年４月１２日打合せの議事録（上記ケ）の
内容は尊重すべきである旨の見解が示された（甲２６の２・３）。
ソ前提事実(5)のとおり，被告（知財部）は，平成１９年２月２日，原告
に対し，本件特許発明の利用の対価として一時金２５０万円の提案を行っ
た。
タ原告は，平成２０年３月３１日，代理人弁護士から被告に宛てて通知書
（乙２）を発出し，上記ソの申し入れに係る対価額の算出根拠が不明であ
ること等から，上記申し入れを受け入れることができない旨を述べた上で，
本件特許発明の実施許諾契約の締結のためであるとして，上記対価額の算
出資料及び具体的算出根拠の開示を求めた（乙２）。
チこれを受けて，被告は，同年６月３０日付けで，原告に対し，上記２５
０万円は，本件システムの開発費（富士通に対し支払った開発関連費用）
１億２７７６万５５００円に，本件特許発明の寄与率として３分の１を乗
じ，さらに実施料率５％を乗じて算出したものである旨を，富士通から被
告に送られたメール等を添えて送付した（甲４０）。
ツ原告は，同年１０月１０日付け通知書（乙３）において，開発費ではな
く物流コスト削減効果を基に実施許諾料を算定すべきであると主張し，平
成１７年から平成２０年までの累積的な物流コスト削減効果は合計１５億
６０００万円であるから，これに５％を乗じた金額である７８００万円を
本件特許権の実施許諾料の一つの目安と考えることもできる旨を通知した
（乙３）。
テ被告は原告に対し協議の場を設けることを提案したが（乙４），原告は，
平成２０年１１月１０日付けで，本件特許権の実施許諾料として８億８４
００万円を請求する旨を通知し（甲４１の１），被告は，これに対し，本
件特許権に無効理由が存在する可能性があること等を述べ，協議の場を設
けることを更に提案した（乙５）。
ト原告は，平成２３年１０月２４日，本件訴訟を提起した（当裁判所に顕
著）。
(2)本件において，原告は，合意に基づく対価請求の根拠として，被告が，
平成１２年５月頃，被告アフマ部部長Ｑを通じて，原告に対し，①原告がＸ
理論を被告のコンピュータ上で具現することについて承認し，②外部防御の
ため原告がその名義で特許を出願すること，③被告が上記①，②に対し相応
の対価を支払うことを提案し，原告がこれを受け入れたことを主張する。
被告も，Ｑが，上記の頃に，原告に対し，原告が被告における職務外での
研究成果に関して将来特許権を取得し，かつ，当該特許に係る発明を本件シ
ステムの一部として利用するのであれば，いくばくかの金員を支払う旨を話
したことは認めているが，前記(1)サのＱの発言の趣旨について，Ｑが，原
告から，その研究成果について個人で特許出願をしたいという意向を聞いた
ことから，原告が特許権を取得した場合であって，被告が上記特許権を利用
して利益を上げた場合には，必要に応じて特許利用料を支払うことになるだ
ろうという特許制度上当然のことを述べ，特許利用料により原告が出願費用
を少しでも回収できればよいというＱの気持を個人的に伝えたものにすぎな
いと主張する。その主張の趣旨は，Ｑの発言は，知財部と被告アフマ部との
間の前記(1)ケ，コ等の打合せを踏まえた組織的なものではなく，また，被
告から原告による特許出願を依頼したり，「相応の対価」との表現をしたり
するなどの法的な合意とみられるような表現を用いたものでもないとすると
ころにあるものと解される。
そこで，Ｑの発言の趣旨及びその発言内容について検討することが必要と
なる。しかし，その発言の趣旨及び発言内容を検討するに当たっては，その
前提として，①原告がＸ理論と称するものの成立時期とその知的財産として
の価値，②Ｘ理論と本件システムとの関係を検討する必要があるから，以下
においては，まず，上記①，②の点を検討し，その上で，Ｑの発言の趣旨及
び発言内容について検討する。
ア「Ｘ理論」の成立時期と知的財産としての価値
原告は，原告のいうＸ理論は，本件論文を基礎として，平成１０年８月
頃までに完成させた物流理論であると主張するので，検討する。
(ア)本件論文の内容
ａ本件論文は，「物流施設立地の条件」を明確にし，「販売物流施設
の最適立地」を探ることを目的とするものであり（甲８・５頁），物
流施設立地の諸研究について概観した上で（第１章），実態調査に基
づき事例研究を行い（第２章），「物流施設立地の条件」の組み立て
を行って（第３章），その条件を，「分散型モデル」，「集約型モデ
ル」，「中間型モデル」の３類型において検証し，「集約型モデル」
が最適モデルであることについて論じた（第４章）ものである。
ｂ具体的にみると，第１章は，従前の諸研究の内容を概観し，その問
題点として，顧客分布把握と物流施設立地による顧客サービス目標の
実現について言及している研究がほとんどないことなどを示したもの
である（甲８・１７頁）。また，第２章は，「Ｐ社」モデルの考察を
行うことで，物流施設立地を検討する場合，物流施設は顧客サービス
目標が達成できる範囲内で可能な限り物流拠点化するより配送拠点化
する方がコスト面で有利であること，物流コストの８０％を入庫・出
庫・配送作業費が占めることから，物流施設立地検討を行う上では，
多段階の物流作業を回避するプランを策定することが重要であること
を結論として示したものである（甲８・３５頁）。
第３章は，第１・２章の検討結果に加え，顧客サービスと物流コス
トのバランスを図るためには顧客サービス目標の設定と物流コストの
把握が必要であるとの見解（甲８・３７頁）を踏まえて，物流施設立
地検討のための条件として６項目を挙げたものであり（甲８・４０頁
～４３頁），第４章は，その具体的検証及び意味付けをしたものであ
る（甲８・４４頁～）。
ｃ第４章について更に具体的にみると，第４章は，第３章でみた条件
を各モデルにおいて検証するためには，まず，各モデルにおける物流
作業及び物流コストの定量的把握が必要であるとして，その方法を示
し，これによって定量的に把握された物流作業回数及び物流コストを
用いて，各モデルの検証を行っている。このうち，分散型モデルにお
いては，顧客へのサービス目標時間（４時間）を前提として，配送車
３０分で行ける距離を３０分距離メッシュ（時間距離）とし，４メッ
シュに営業所を設けるものとしている（甲８・ｐ４７）。上記検証の
結果，「集約型モデル」においては，営業所併設型の物流施設を非在
庫化，配送拠点化することにより，入庫・保管・出庫作業の回数を減
らし，これらの作業に有するコストを抑えることができることや，本
部センターの活用（直送を行うなど）により，多段階の物流作業を回
避し，物流コストを抑えることができることが示されており，結論と
して，集約型モデルの方が物流作業・コスト面において有利であるこ
とが示されている。
ｄ第４章の結論部分の記載（甲８・７７頁）からは，本件論文が，顧
客サービス目標の評価（目標の設定及び顧客分布の把握により行
う。）及び物流コストの定量的把握を行った上で，物流コスト抑制の
ために集約型モデルを採用（物流施設の可能な限りの配送拠点化，多
段階物流の廃止）することで，一定の（当該顧客について設定され
る）顧客サービス水準を保ちながら，物流コスト抑制を達成できる物
流施設立地を提言しようとするものであることをうかがうことができ
る。
(イ)本件説明資料（甲１１の１ないし１５）の内容
ａ本件説明資料（甲１１の１ないし１５）は，前記のとおり，関係者
に対し研究概要を説明するために作成された資料であることから，断
片的かつ簡潔な記載によるものであり，これらの記載のみから何らか
の具体的理論を読み取ることは困難である。しかし，甲１１の１の
「Ⅰ目的」欄に，「物流コストとサービスはトレード・オフの関
係」等の表記とともに図が示されている。その図中のグラフにおいて
は，縦軸をコストとし横軸にサービスとして，現状と「ねらう点」を
対比的に示しており，「ねらう点」のサービスは現状からは微減であ
るのに対し，コストは大幅に低減されている図とされている。このこ
とからは，コストとサービスは相反する関係にあるが，サービス水準
を微減させつつコストを大きく下げられる点が「ねらう点」であるこ
とを読み取ることができる（甲５６によれば，ここにいうサービスの
微減とは，顧客との合意の範囲内でオーバーサービスを止めるという
ことであり，サービスの低下という意味ではない。以下，原告の主張
する意味でのサービスの低減を「サービスの合理的低減」と表記す
る。）。また，コストとサービスの関係を示した上記グラフと「物流
立地戦略」が「サークル的な相関」との表示でつながれていることに
加え，本件論文が，物流立地に応じた物流コストの定量的把握につい
て触れていること（上記(ア)ｃ）も考慮すれば，甲１１の１は，顧客
サービス及び物流コストを定量的に把握することができることを前提
に，これを改善の前後で比較することを示したものであり，上記比較
によって，「ねらう点」を達成しようとするものであるとみることが
できる。
ｂ甲１１の２及び１０の記載に，上記(ア)でみた本件論文の内容を加
味して見ると，甲１１の２及び１０は，顧客サービス目標の設定（受
注～着荷リードタイムの設定）を行い，さらに，顧客分布を把握した
上で，これらを基に，営業所の配置・顧客への配送を検討し，また，
物流コストを分析する必要性があることが記載されているとみること
ができる。また，このうち，物流コストの分析については，本社・営
業所別に，また，作業工程（入庫，保管，出庫，配送）別に，さらに
は工程内で，物流コストを分析する必要性があること及びその定量的
把握の方法が示されているものとみることができる（甲１１の２の物
流ネットワークシステムの欄内の上部には，サービス内容を考慮した
上での物流コストの定量的把握をした結果としての物流コストの例
〔入庫１５，保管２０，出庫３０，配送３５〕が示されており，同欄
の右下部には，上記コストの算出が，顧客，物流拠点，本部センター
での作業・費用の合計によって算出されることが示されている。）。
ｃ甲１１の１２ないし１４からは，抜本的コスト削減，施設の統廃合
等を目的として，現状の把握の必要性とその手法，サービスの合理的
低減を前提とするサービス戦略の見直し・多段階物流の回避等の手法
の実施が提言されたことをうかがうことができる。そして，配送に関
しては，配送Ｌ／Ｔ基準のほか，配送コース設定基準として，一周に
かかる時間，配送軒数，荷重が挙げられている（甲１１の１４）。ま
た，物流ネットワーク制御については，物流ネットワーク，商品の流
れ・物流コストの多頻度のシミュレーションによりシステム化をサポ
ートすることが示されている（甲１１の１２）。
(ウ)「Ｘ理論」の成立時期
以上によれば，本件論文の内容と本件説明資料の内容は照応しており，
本件説明資料による説明が終了し，本件プロジェクトが開始された平成
１２年８月頃には，上記(ア)及び(イ)の内容の理論（以下，上記(ア)及
び(イ)の内容をもつ理論を単に「Ｘ理論」という。）が完成していたも
のと認めるのが相当である。
(エ)Ｘ理論の知的財産としての価値
被告は，原告がＸ理論と主張する内容は，原告が本件論文で引用して
いる文献（乙７～９）に記載されている内容と実質的同一であると主張
し，その知的財産としての価値を否定する。そこで，上記(ア)及び(イ)
の内容のＸ理論が，乙７ないし９の内容と実質的に同一といえるかにつ
いて検討する。
ａ乙７ないし９の内容
乙７ないし９（いずれも唐澤豊・今野哲平著「物流情報システムの
設計」からの抜粋である。）をみると，これらの文献には「顧客サー
ビスは競争原理によりサービスレベルが設定され，そのサービスレベ
ルを達成するためにいかに最少の物流費でまかなうことができるか考
えるのが物流戦略である。」との記載があるなど（乙８・７７頁），
サービス水準は一定のものであることが前提とされていることがうか
がわれ（乙７・８３頁，乙９・２０４頁），コスト削減のためにサー
ビスを合理的に低減させることを許容することについては言及がない。
そのため，乙７ないし９には，物流費に関して各拠点における運送
費・保管費・荷役費の把握を要する旨の記載（乙７・８５頁），商品
別に又は地域別に物流費を把握することが必要である旨の記載や（乙
８・８０頁），輸送・配送手段の選択について，手段毎の物流費を算
出しコンピュータ上でコストの試算を行うことが，物流コスト低減の
ための対策についてシステムとして考えられる旨の記載（乙９・２０
２頁）はみられるが，サービス内容を考慮した上での上記計算の具体
的手法や，上記コストを営業所毎に定量的に比較検証すること，集約
型モデルの採用により，上記コストを削減できることが定量的に説明
可能であることなどが記載されている箇所は見当たらない（例えば，
乙７・８５頁では，「物流費に関しては，各拠点における運送費・保
管費・荷役費の把握をしなければならない。」としながらも，それに
続けて「これらの費用は物流量と比例関係にある。」としている。）。
以上によれば，本件論文及び本件説明資料から読み取ることのでき
るＸ理論の内容のうち，物流コストを下げるために，サービスを，許
容できる範囲において合理的に低減させることや，上記サービスの合
理的低減によるコスト削減効果を，変更の前後について定量的に比較
検証すること，上記定量的計算のための具体的手法（営業所毎に発生
する個別のコストの明確化），上記コスト削減は，集約型モデルの採
用（多段階物流の排除，営業所の配送拠点化）によって達成可能であ
ることなどは，乙７ないし９にも開示されていない独自のものという
ことができる。
ｂ被告の対応
被告アフマ部は，本件プロジェクトの開始当初から，本件システム
に含まれ得る技術的事項の特許化について検討の必要性を認識してい
たものとみられるのであって，被告アフマ部と被告知財部は，打合せ
を複数回にわたり行って，本件システムに含まれ得る技術的事項のう
ち，発明性のある部分はどの部分か，当該部分につき特許を受ける権
利が，誰に帰属するものであるかという点について具体的に検討し
（前記(1)オ，カ），さらに，平成１１年１月には，本件システムに
関し，原告から特許を受ける権利の譲渡を受けなければ，被告による
特許出願を行うことができないとの認識を共有した上で，原告から全
発明につき特許を受ける権利の譲渡を受けることを前提に，その条件
等について検討を進めていた（前記(1)カ）。
ｃ以上によれば，原告が本件プロジェクトの開始に当たり提供した知
見（Ｘ理論）に知的財産性がないものとは認められない。
イＸ理論と本件システムとの関係
(ア)Ｘ理論の内容は，前記アの(ア)及び(イ)のとおりであり，本件シス
テムの対比のために，その内容を具体的に述べれば，①物流施設の最適
立地を実現するためには，多段階物流を排除した集約型モデルが適切で
あり（前記(2)ア(ア)ａ，ｄ），顧客へのサービス目標時間（４時間）
を前提として，メッシュを用いた時間距離の考え方を示している（前記
(2)ア(ア)ｃ）。②配送に関しては，配送Ｌ／Ｔ基準のほか，配送コー
ス設定基準として，一周にかかる時間，配送軒数，荷重が挙げられてい
る（前記(2)ア(イ)ｃ）。③物流コストの分析については，本社・営業
所別に，また，作業工程（入庫，保管，出庫，配送）別に，さらには工
程内で，物流コストを分析する必要性があること及びその定量的把握の
方法が示されている（甲１１の２の物流ネットワークシステムの欄内の
上部には，サービス内容を考慮した上での物流コストの定量的把握をし
た結果としての物流コストの例〔入庫１５，保管２０，出庫３０，配送
３５〕が示されており，同欄の右下部には，上記コストの算出が，顧客，
物流拠点，本部センターでの作業・費用の合計によって算出されること
が示されている。）（前記(2)ア(イ)ｂ），④物流ネットワーク制御に
ついては，物流ネットワーク，商品の流れ・物流コストの多頻度のシミ
ュレーションによりシステム化をサポートすることが示されている（前
記(2)ア(イ)ｃ）。
(イ)次に，本件システムの内容は，次のとおりである（甲１０の１ない
し５，３６，３７）。
①物流施設立地制御システム
顧客分布・顧客サービスＬ／Ｔ基準を基に，最適物流施設立地（位
置・数）を決定し，配送制御（最適配送）・物流ネットワーク制御
（多段階物流の排除）を実現できるとするもの。具体的には，顧客と
の合意により，商品別に顧客サービスＬ／Ｔ基準を設定し，メッシュ
上に物流施設の候補となる交点を求め，上記物流施設候補と顧客との
間の距離・所要時間を求めた上で，最適立地円（全ての顧客を網羅し
た，指定顧客サービスＬ／Ｔ基準で最小値となる円の候補点位置）を
作成し，距離マップ・時間マップ上に表示するというものである。な
お，実現のために，上記物流施設候補から，候補地にならない所を削
除したり，現状施設等一部の施設を前提とした残候補地のみを検索し
たり，一部地域内での最適候補地を検索したりすることも可能である。
②配送制御システム
顧客分布・顧客サービスＬ／Ｔ基準を基に，最適配送コース・ダイ
ヤを作成し，かつ，パフォーマンスメジャー（配送評価基準）を新設
し，現状・改善後のコスト評価を行うことにより，最小コスト化を実
現できるとするもの。具体的には，トラック条件（トラック車格・単
価・契約形態），シミュレーション範囲，顧客受け取り時間を各指定
した上で，顧客分布を基にした配送コースを決定し，複数のコースを
組み合わせて最小（時間・距離）となる順路（コース）を決定して，
トラック組み合わせ・配送コース・配送評価を表示するというもので
ある。なお，トラックの積載率や配送時間に余裕がある場合にはトラ
ック車格・顧客納品時間を変更し，また，シミュレーションダイヤを
基に実走行を行った結果，移動時間が違う場合には，速度を修正する
ことにより，配送の最適化を図ることができる。
③物流コスト制御システム
決算情報（Ｐ／Ｌ・Ｂ／Ｓ）から物流費の配分方式を確立し，物流
原単位コスト（商品１個当たりコスト〔ミクロコスト〕）を算出する
ことができるというもの。具体的には，Ｐ／Ｌ・Ｂ／Ｓ情報，物流施
設毎の人員・トラック台数を入力し，さらに，現場実測により，商品
別に入庫・保管・出庫の作業時間を計り入力した上で，物流コスト・
作業工程別物流コスト・物流原単位コスト（ミクロコスト）を順次算
出して，改善前ミクロコストと改善後ミクロコストの対比表を表示す
るというものである。なお，改善後ミクロコストは，①物流施設立地
制御システム，②配送制御システム及び④物流ネットワーク制御シス
テムの各結果（新ミクロコスト情報）を反映して算出する。
④物流ネットワーク制御システム
ミクロコストを基に，商品の流れを繰り返しシミュレーションし，
改善前・改善後の全体コスト変化を算出し，最適物流を実現すること
ができるというもの。具体的には，地図上の現物流施設から商品別に
ネットワーク（物の流れ）と作業工程を指定し，さらに，地図上の新
物流施設から商品別に改編後のネットワーク（物の流れ）と作業工程
を指定して，指定されたネットワークに基づき，物流施設・商品別に
商品流れ図を表示し，また，物流施設別コスト・全社コストを算出し，
物流ネットワーク戦略を表示するというものである。
(ウ)上記(ア)と(イ)を対比すれば，本件システムは，Ｘ理論と比較して，
細部に至るまでより具体化され，かつ，必要な機能が付加されたもので
あって，この点においてＸ理論に相当の変容が加えられているというべ
きであるものの，Ｘ理論において示されている点のうち，他の文献にみ
られない独自のものとみられる点（前記(2)ア(エ)ａ）が，①物流立地
制御システム，②配送制御システム，③物流コスト制御システム，④物
流ネットワーク制御システムのそれぞれの骨格において反映されている
ものであって，本件システムがＸ理論を一つの出発点としていることは
否定できないものというべきである。
そして，本件システムの開発経緯をみても，被告は，前記(1)のとお
り，本件プロジェクト開始当初から，本件システムが原告の研究成果を
利用するものとなることを前提として，原告に帰属する発明部分につき，
譲渡条件等の検討を進めてきたものである。このほか，Ｘ理論が成立し
た頃に本件プロジェクトが開始されたという関係をも考慮すると，本件
システムは，原告の主張するＸ理論を一つの出発点として，これを取り
込みつつ，実用化に当たり必要となる機能，内容等を補充するなどして
完成に至ったものというべきであり，被告が主張するように，本件シス
テムのソフトウェアが，原告を含む被告従業員，東京共販従業員及び富
士通従業員らによって作り上げられたものであり，Ｘ理論とは無関係で
あるとみることはできない。
ウＱの発言の趣旨
(ア)前記(2)ア(エ)ｂの事実に加え，Ｑの着任時である平成１２年１月
時点では，平成１１年２月に，原告に対し，１件当たり２０万円又は４
０万円という譲渡条件の提案をしたものの拒絶され，新たな譲渡条件の
提案を検討している状況にあった（前記(1)キ）。
また，原告においては，上記のとおり，本件システムに含まれる技術
的事項につき特許化の検討が進められていたことから，特許申請に差し
障りが生じないよう，平成１１年３月２７日に予定していた学会発表の
内容を修正するとともに（前記(1)ク），被告アフマ部と知財部との打
合せの一部に参加するなどして（前記(1)オ），被告が，本件システム
に係る発明について原告から特許を受ける権利の譲渡を受けることを具
体的に検討していることを認識している状況にあったものであって，１
件当たり２０万円又は４０万円の対価による譲渡の提案（前記(1)キ）
は拒絶したものの，その発明につき特許を受ける権利を被告に譲渡する
こと自体を拒絶したものではなく，むしろ，平成１２年３月１４日の打
合せにおいて示されているとおり（前記(1)ケ），特許を受ける権利を
被告に譲渡することを前提に，本件システムの効果に見合った譲渡対価
を求めている状況にあったものとみることができる。
(イ)以上の被告と原告の本件システムに係る特許出願についての検討の
経緯等に照らせば，原告が，これらの経緯とは無関係に，Ｑに対し，本
件システムに関し，原告個人で特許出願する意向がある旨を伝えること
は考え難いというべきである。また，Ｑは，原告個人による特許出願の
可否についてアフマ部のＵを通じて知財部に確認したというにもかかわ
らず（証人Ｑ），本件プロジェクトに当初から関与し，従前の知財部と
の打合せにも同席していたＵが，上記(ア)でみた従前の経緯や，特許を
受ける権利の譲渡についての検討状況等についてＱに何ら伝えることな
く，知財部への問い合わせ結果として，個人での特許出願に問題がない
旨のみをＱに伝達したということも考え難い。
(ウ)むしろ，被告アフマ部が，Ｑの着任後である平成１２年３月１４日
に，原告が本件システムの効果に見合う対価を求めていることを踏まえ，
本件システムにより期待される物流コスト削減効果等についての一覧表
（甲２１の２）まで準備して，特許を受ける権利の譲渡条件について知
財部との間で検討を行ったものの（前記(1)ケ(ア)，(イ)），新たな譲
渡条件の提示がなく（前記(1)ケ(ウ)），原告から特許を受ける権利の
譲渡を受けることが困難な状況に至り，本件システムの開発が頓挫する
ことについて懸念を表明している状態にあったこと（前記(1)ケ(ウ)）
や，同年４月１２日の知財部との打合せにおいて，原告個人が特許出願
を行うのであれば，原告から当該特許発明の実施を拒否しない旨の確認
を取っておくことが望ましい旨の見解を知財部から示された状況にあっ
たこと（前記(1)コ）に照らせば，被告アフマ部は，本件システムの完
成後にその利用が妨げられることのないよう，原告に対し，原告が将来
取得することのあり得る特許権について，予め実施許諾する旨の確認を
原告から取っておくべき立場におかれていたものとみられるのであり，
Ｑが，被告アフマ部の部長として，原告にそのような確認を行うことは，
十分に考えられるものというべきである。
加えて，被告アフマ部において，物流関係の理論に通じている人物は
原告のほかにおらず（証人Ｑ），本件システムを完成させるためには，
原告が，引き続きその知識や研究成果等を本件プロジェクトにおいて提
供し続けることが不可欠であったとみられること，Ｑの着任時において，
本件プロジェクトを成功させることは，被告アフマ部における重要課題
であったとされること（証人Ｑ）も考慮すれば，Ｑが，原告の知識や研
究成果等を今後とも本件システム開発に利用することについて改めて了
承を受けておき，また，原告が，上記研究成果に関し将来特許権を取得
し，これが本件システムに関連することとなった場合に備えて，上記特
許権の利用につき予め原告から許諾を受けておくことで，本件システム
の開発及び利用が滞りなく行われることを確保したいと考え，原告に対
し，前記(1)サでみたような発言をするということは，自然かつ合理的
なことというべきである。
エＱの発言における表現の内容
(ア)前記ウ(ア)でみたとおり，原告は，特許を受ける権利の譲渡につき，
１件につき２０万円又は４０万円という譲渡条件に応じず，本件システ
ムの効果に応じた対価の支払を求めていたものであるから，上記のとお
り，Ｑが，原告に対しその研究成果等の利用や本件プロジェクトへの協
力等を求めるに際し，その対価について言及があったとみるのは自然な
流れであるというべきである。そして，被告知財部とアフマ部との打合
せにおいて，「覚書を交わすのであれば，実施料は別途協議の上決定す
る旨表現する」，「無償使用では問題があるのでは」との文言があるこ
と（前記(1)コ），１件につき２０万円又は４０万円という譲渡対価を
拒絶していた原告が，Ｑの発言に対し異議を述べていないこと（原告本
人，弁論の全趣旨），原告が，平成１６年頃から，Ｑから相応の対価を
支払う旨の確約を得た旨主張し続けていること（甲２７の３，２９の１
ないし３），被告アフマ部・Ｕが，個人に帰属する知的財産を使う以上，
支払うべきものは払わなければならないとの同部Ｒ部長の見解に関し，
Ｑと同じ見解である旨のコメントを加えていること（前記(1)ス）を併
せて考慮すれば，Ｑは，前記(1)サの発言に当たり，原告に対し，相応
の対価を支払う旨の法的な意味をもつ発言をしたものと認められる。
(イ)以上によれば，Ｑの発言内容は前記(1)サのとおりであると認めら
れ，これはＱが被告の組織の一員として発言した，法的な意味をもつ発
言であると解されるのであって，これに反する被告の主張は採用するこ
とができない。
オ他方，原告は，Ｑは，前記(1)サの発言に際し，原告に対し，原告個人
で特許出願を行うよう依頼したものであり，上記特許出願の対価を含めた
ものとして「相応の対価」との発言をしたものである旨主張する。
(ア)前記ウ(ア)でみたとおり，被告アフマ部は，本件プロジェクト開始
後間もない時期から，本件システムに含まれる技術的事項につき特許を
受ける権利の譲渡を受けることについて被告知財部との間で協議を重ね
てきたものであって，本件システムにつき被告が特許出願を行うことを
積極的に検討していたものとみられるものの，その後，Ｑの前記(1)サ
の発言に先立つ被告アフマ部と知財部との打合せ時（前記(1)コ）にお
いては，原告が特許出願を行うことが前提とされていたことがうかがわ
れるのであるから，被告が原告から特許を受ける権利の譲渡を受けるこ
とが困難であるとの結論に達した時点（前記(1)ケ(ウ)）より後の段階
で，原告と被告との間で，原告が特許出願を行う旨の話がされたことが
うかがわれる。もっとも，被告は，原告から特許を受ける権利の譲渡を
受けることについて検討を進めてきたものではあるが，平成１２年３月
１４日時点の打合せにおいては，実際に本件システムについて特許化す
るかどうかの判定は，富士通の動向等を考慮した上で，特許を受ける権
利の譲渡を受けた後に行うとの結論に達していたのであって（前記(1)
ケ(エ)），被告が，当時，本件システムについて特許化することが必須
であるとまで認識していたものとは解し難い。
(イ)他方，前記前提事実(4)でみたとおり，原告が特許出願を行ったの
は平成１５年以降のことであるところ，平成１２年５月時点で特許出願
について具体的な依頼があったというにもかかわらず，その出願が依頼
から約３年後となることについて，合理的な理由を直ちに見出し難い。
また，本件特許出願が被告の外部防御を目的として，その依頼と費用負
担の下でなされるべきものであるとすれば，本件特許出願に係る特許請
求の範囲の記載や明細書の記載内容，その登録査定の有無，登録内容，
要した費用等につき，被告に相談や報告がされてしかるべきであるにも
かかわらず，原告がこれらの点について被告に相談又は報告したことは
ないものと認められる（原告本人）。
(ウ)そうすると，原告と被告との間で，本件システムに関する特許出願
を原告が行う旨の話がされたことがあったとしても，これを，特許出願
費用を被告が負担することを前提として，本件特許出願を原告に積極的
に依頼する趣旨のものであったとみることはできず，また，そのような
趣旨の発言が，Ｑから原告に対しされた事実を認めることもできないと
いうべきである。
(エ)したがって，この点に関する原告の主張を採用することはできない。
(3)ア以上によれば，Ｑの発言による本件合意には，特許出願費用を被告が
負担することは含まれていなかったものと解されるところ，前記(2)ウ
(ウ)でみた被告内部での検討内容に照らせば，上記発言には，原告が将来
取得することのあり得る特許権の被告による実施について，原告からの権
利行使を防止するという趣旨が含まれるものと認められる。
イしかし，上記発言の時点において，原告が行う特許出願の具体的内容や
その予定時期は決まっていなかったものであるから，Ｑの上記発言を，将
来原告が取得することのあり得る特許権に係る発明についての実施許諾を
予約する趣旨を表示したものとみるのは相当ではない。むしろ，前記のと
おり，被告アフマ部において，本件プロジェクトの成功のためには原告か
らその研究成果等の提供を継続して受けることが不可欠であると認識され
ていたことがうかがわれることを考慮すれば，Ｑの上記発言は，上記特許
権に係る発明を含めた原告の研究成果に係る知的財産全般について，その
特許登録の成否にかかわらず，上記時点においてその使用の包括的な許諾
を申し入れる趣旨を表示するものであったとみるのが相当である。これは，
被告知財部が，アフマ部との打合せにおいて，「ロイヤリティは特許の譲
渡対価に含めて一括支払との考え方をとりたい。ノウハウに関するロイヤ
リティは特許とは別に設定しない」と述べ（前記(1)ケ(エ)），特許発明
とノウハウを区別して認識した上で，ノウハウ部分についても対価を支払
う必要があり得ることを認識していることとも整合するものというべきで
ある。
相応の対価を支払う旨のＱの発言は，このような包括的許諾に対し，こ
れに見合った対価を支払うことを表示するものであったと認めるのが相当
である。
ウ原告は，このような被告の意思表示に対し，これを承諾したものと認め
られるから（甲５６，原告本人），原告と被告との間には，原告が，その
研究成果に係る知的財産全般（将来原告が特許権を取得した場合には，当
該特許権に係る発明を含む。）について，その使用を包括的に許諾し，被
告が上記許諾につき相応の対価を支払う旨の合意が成立したものと認めら
れる。
(4)ア以上のとおり，原告と被告との間には，前記(3)でみたとおりの合意が
成立しているものと認められる。
イなお，上記合意の時点において，上記対価に関し，当事者間に具体的な
金額についての合意はなく，また，その額の算定の具体的方法につき，共
通認識があったものとも認められない。しかし，上記合意の内容に照らせ
ば，上記対価は，原告の提供した研究成果等に含まれる知的財産について
の使用許諾料としての性質を有するものと解されるのであって，当事者間
において，上記使用許諾料として社会通念上相当と認められる金額をその
対価とすることが念頭に置かれていたものとみるのが相当であり，そのよ
うな金額を支払うことにつき，当事者間に合意が成立したとみることが，
当事者の合理的意思に合致するものというべきである。
ウ原告は，これに加えて，「Ｘ理論」の研究・構築に要した費用，一般的
な特許出願・維持費用のほか原告が特許取得のために費やした労務費につ
いても，上記「相応の対価」に含んで支払う旨の合意が成立していると主
張するが，被告から原告に対し特許出願を行うについて積極的な依頼があ
ったとまでは認められないことは前述のとおりである上，前記(1)サでみ
たＱの発言の内容や，本件合意に至る経緯に照らしても，原被告間に，知
的財産の使用許諾料としての金員のほかに，上記原告が主張する費用を支
払う旨の合意があったものとは認められない。
(5)以上によれば，原告は，被告に対し，上記合意に基づき，原告の提供し
た研究成果等の知的財産（将来原告が特許権を取得した場合には，当該特許
権に係る発明を含む。）についての使用許諾料として社会的に相当と認めら
れる金額を請求することができる。
２争点(1)イ（「相応の対価」の額）
(1)ア争点(1)アに関する当裁判所の判断でみたとおり，原告は，被告との間
の合意に基づき，被告に対し，その知的財産の使用許諾料として，社会的
に相当と認められる額を請求することができるところ，原告は，上記額を，
被告が平成１２年３月１３日付けで行った物流費用削減額の試算結果を基
礎として算出すべきと主張する。
イしかし，上記合意は，将来原告が取得すべき特許権の使用を許諾する趣
旨を含む上（前記１(3)イ），原告は，本件合意の後，平成１６年４月２
７日までの間，本件合意に基づく対価の請求をしていないのであるから，
原告と被告が，本件合意時において，上記物流費用削減額の試算結果に基
づいた対価額を直ちに確定し，支払を行う意思であったとは考え難い。
むしろ，本件合意が「相応の対価」という文言を用いてされたものであ
ることや，原告が，「相応の対価」に加えて「相応の対応」も約束された
旨主張していること，被告アフマ部が，被告知財部との打合せにおいて，
本件システムの期待効果等の一覧表（甲２１の２）を示したのに対し，被
告知財部が，本件システムの効果を実施前に評価することはできず，上記
一覧表は現時点では意味をもたない旨のコメントをしていること（前記１
(1)ケ(イ)）に照らせば，原告と被告は，上記合意時において，同時点に
おいて存在する資料を基にして直ちに対価額を算定し，その支払を行うこ
とを予定していたものではなく，本件システムの完成を待った上で，完成
後の本件システムの内容や，同システムにおいて原告の提供した知見が実
際に利用されている程度，本件システムのソフトウェアの頒布・利用状況，
その導入効果，原告が取得した特許権の内容・数等を勘案し，さらに，被
告における原告の今後の処遇等との兼ね合いも考慮して，相当と認められ
る金額を上記「相応の対価」として，支払を行うことを念頭に置いていた
ものとみるのが相当というべきである。
ウしたがって，対価額の算定に当たっては，これらの事情を考慮して検討
するのが相当であるところ，考慮すべき事情として，証拠（各認定事実の
末尾に摘示する。）及び弁論の全趣旨によれば，次の事実が認められる。
(ア)本件システムは，①物流施設立地制御システム，②配送制御システ
ム，③物流コスト制御システム，④物流ネットワーク制御システムから
構成されるものであるところ，その具体的内容は前記１(2)イ(イ)でみ
たとおりである。
(イ)本件システムは，被告の共販会社ら（共販会社３３社及び沖縄トヨ
タ自動車株式会社・部品共販部）における事業の基幹システムであるＴ
ＡＳのオプションとすることを前提に開発が進められたものであり，Ｔ
ＡＳのデータを用いてシミュレーションを行うことが可能なものであっ
た（弁論の全趣旨）。
(ウ)被告の共販店のうち，東京，茨城，千葉，神奈川，栃木，北海道及
び山口の７共販店は，平成１７年頃までにかけて，本件システムの利用
登録を行い，本件システムを利用したシミュレーション及びこれを基に
した物流改善の方策等の検討を実施した。
上記シミュレーション及び検討は，被告アフマ部が，各共販店からの
委託に基づくコンサルティング業務として，各共販店とともに行ったも
のであり，被告アフマ部は，平成１７年１月１８日，上記検討に係る物
流改善の方策等及びこれによるコスト削減見込み額をまとめた。その結
果等は次のとおりである（以上につき甲４５の１ないし５，４６の１な
いし３，４７の１・２，４８，４９の１・２，５０の１ないし３，５１，
５６）。
ａ東京共販（甲４５の１・３，４６の２）
本件システムを利用して東京本部の廃止に伴う他県（千葉，埼玉，
神奈川，山梨）本部からの物流の可否の検証，現状のトラックコスト
（台数／距離）と新立地で配送した場合のトラックコストとの比較，
全体的コストの比較を行い，上記結果を踏まえて，①販売店配送を３
回／日から２回／日に減らし，かつ，本部から販売店への直接配送
（夜間早朝１回）を導入する，②販売店からの緊急便（２回／日）を
導入する，③２４時間物流を実現する，④外装配送基準を明確化する，
⑤受注締時間を延長し，早期納品を実現する，⑥高速道路使用を実施
する，⑦共販店営業所在庫・販売店在庫を充実する等の取組みを順次
実施することにより，年間３．５億円のコスト削減が見込まれるとし
た。
ｂ茨城共販（甲４５の１・４，５１）
本件システムを利用して配送ダイヤを順次見直し，さらに，営業
所出入庫業務の本部への集約化，本部商管作業時間の見直し（３交代
制の導入，メーカーフォロー品作業開始時間の早朝化等により早期配
送を実現），最終受注締め時間の延長等の取組みを導入することによ
り，年間８０００万円のコスト削減が見込まれるとした。
ｃ千葉共販（甲４５の１，４８）
本件システムを用いたシミュレーション結果を踏まえ，２か所の物
流施設（柏・松戸）を１施設（新柏）に統合することにより，年間３
０００万円のコスト削減が見込まれるとした。
ｄ神奈川共販（甲４５の１，４９の１・２）
本件システムを利用して配送体系の再構築案３種類について評価・
検討を行い，本部便を３便／日から２便／日へ変更する，鶴見営業所
と山と営業所を統合する，受注締め切り時間帯を延長する等の取組み
を導入することにより，年間４０００万円のコスト削減が見込まれる
とした。
ｅ山口共販（甲４５の１）
本件システムを利用したシミュレーション結果を踏まえ，販売店へ
の本部直送により，年間１０００万円のコスト削減が見込まれるとし
た。
ｆ北海道共販（甲４５の１・５，５０の１・２）
本件システムを利用したシミュレーション結果を踏まえ，苫小牧
本部の一本化，物流施設立地の再編成，受注締時間の延長，１日当た
り３便体制から２便体制への変更，本部から顧客への直送の実施，早
期納品・支社ターミナル化，外販配送・営業活動の見直しにより，年
間３０％（１８億７０００万円×３０％＝５億６１００万円）の削減
が目標とされるとした。
ｇ栃木共販（甲４５の１・５，５０の１・３）
本件システムを利用して物流施設の立地及び配送につきシミュレ
ーションを実施し，宇都宮営業所については統廃合が可能であるもの
の当面は現状維持とし，配送につき，販売店への本部直送，受注締め
時間の延長を実施することにより，年間１０００万円のコスト削減が
見込まれるとした。
(エ)上記共販店らは，上記検討に係る方策を順次実行したが，茨城共販
において，上記方策に基づき，いったん勝田営業所を廃止したものの，
平成１９年にその営業を再開するなど，実行が確保できなかった施策も
存在した（乙１１）。
(オ)前記(ウ)の７共販店以外の共販店においては，本件システムを用い
たシミュレーションは実施されず，被告は，平成１９年３月，富士通と
の間で締結していた本件システムの維持契約を更新しないことを決定し
た（乙１１）。
エ以上のとおり，東京，茨城，千葉，神奈川，栃木，北海道及び山口の７
共販店においては，本件システムを利用したシミュレーション結果に基づ
き，物流改善の方策等につき検討した結果，前記ウ(ウ)ａないしｇのとお
り，上記方策の実行により，１年当たり１０００万円ないし５億６１００
万円のコスト削減が見込まれるとの結果が導かれたものであるところ，本
件システムを用いてシミュレーションを行った結果，被告が利益を得てい
るものと認められるのであれば，被告の得た上記利益を算定の基礎として，
これに，原告の提供した知的財産の使用料率として相当と認められる料率
を乗じた金額を，前記「相応の対価」の額とするのが相当である。
そこで以下において，本件システムを用いたシミュレーションにより被
告が得た利益のうち，「相応の対価」の算定の基礎とすべき範囲（下記
オ）と，原告の提供した知的財産の使用料率として相当と認められる料率
（下記カ）について，順次検討する。
オ本件システムを用いたシミュレーションにより被告が得た利益のうち，
「相応の対価」算定の基礎とすべき範囲について
(ア)前記ウ(ウ)ａないしｇのとおり，前記７共販店においては，本件シ
ステムを利用したシミュレーション結果に基づき提案された方策を実行
することにより，１年当たり１０００万円から５億６１００万円（合計
１０億８１００万円）のコスト削減が見込まれるとされたものであると
ころ，本件システムが，各共販店における事業の基幹システムであるＴ
ＡＳのデータを用いてシミュレーションを行うものであって（前記ウ
(イ)），上記シミュレーションが，各共販店の実情に基づいて行われた
ものであり，上記シミュレーション結果に基づき提言された方策は，各
共販店における実現可能性を考慮したものとみられることも考慮すれば，
上記コスト削減見込額は，相応の実現可能性を含むものであったと認め
られる。
しかし他方で，前記共販店の中には，上記方策に基づき，いったん廃
止した営業所を復活させるなどしたものもあるというのであって（前記
ウ(エ)），本件システムを使用したシミュレーションに基づき提案され
た方策の中には，実際に実施されるに至らなかったものも存在すること
がうかがわれるものということができる。加えて，実際に上記方策を実
現した場合に，予測どおりのコスト削減効果が得られたことは立証され
ていないのであるから，前記コスト削減見込額の全部が，実際に上記共
販店によって達成されたとみることはできない。
そうすると，これらの事情を踏まえれば，上記コスト削減見込額のう
ち，実際に実現されたものとみることができる部分（被告が実際に得た
利益とみることができる部分）は，その半分程度にとどまるものとみる
のが相当である。また，被告の発明規定において，導入による効果に対
し５年間一定の対価を支払う旨の実績報奨制度が存在するとされること
（弁論の全趣旨）を考慮すれば，本件においても，被告が５年間におい
て得た利益（５年分のコスト削減額）を，「相応の対価」の算定の基礎
とするのが相当である。
(イ)前記共販店におけるコスト削減見込額の合計額（前記ウ(ウ)ａない
しｇの合計額）は１０億８１００万円であるところ，これに２分の１を
乗じ，５年分のコスト削減額を算出すると，その額は２７億０２５０万
円となり，同額が，「相応の対価」の算定の基礎とすべき金額（原告の
提供した知的財産の使用料率を乗じるべき金額）となる。
(ウ)この点に関し，原告は，本件システムは被告の共販店全店において
導入可能なものであったから，原告の得るべき対価額を計算するに当た
っては，実際に本件システムを利用した７店舗におけるコスト削減額で
はなく，全共販店において見込まれるコスト削減額を基礎とするべきで
ある旨主張する。しかし，上記７共販店以外の共販店らは，本件システ
ムを実際に利用したものではない上，本件システムは，既にその維持契
約を解消されているものであって（前記ウ(オ)），今後，上記７共販店
以外の共販店が本件システムを利用してコスト削減を達成する可能性も
存在しない。そうすると，全共販店において本件システムによってコス
ト削減が達成されると仮定した上で，上記コスト削減見込額を対価額算
定の基礎とすることは相当ではないというべきであって，この点に関す
る原告の主張は採用できない。
カ原告の提供した知的財産の使用料率について
本件システムは，サービスＬ／Ｔ基準を指定してシミュレーションを繰
り返し行い，コスト比較を行うことができるというものであり（前記(1)
ウ(ア)），その内容に照らし，前記１(2)ア(エ)でみたとおり，原告の提
供した知見のうち，従来の文献（乙７ないし９）にみられない点が反映さ
れているとみることのできるものである。しかし，前記１(2)イ(ウ)でみ
たとおり，本件システムは，原告の提供した知見（Ｘ理論）をその出発点
の一つとし，上記理論をその骨格において反映しているものではあるもの
の，上記知見を具体化するに当たり，上記知見に相当の変容を加えたもの
であって，本件システムの基礎となる理論面において，原告が寄与した割
合が，被告アフマ部において７１％と評価されているものである（甲２１
の２）ことを考慮しても，本件システムを全体としてみた場合において，
原告の貢献した割合を，それほど大きなものとみることはできない。
加えて，上記コスト削減は，本件システムを用いたシミュレーションの
みによって達成されたものではなく，上記シミュレーション結果を踏まえ
た上で，適切な方策を検討することによって達成されたものであると認め
られる。これは，本件システムによるシミュレーションの結果，廃止が適
切であるとの結果が出た物流施設についても，営業上の必要性があるとの
判断から廃止を見送るとの結論となり，方策としてその廃止を提案するに
至らなかったものがあること（前記ウ(ウ)ｇ）からも明らかである。
また，本件システムは，原告の提供した知見を，コンピュータ上で動作
させることができるよう，コンピュータにもたせるべき機能を検討・構築
し，プログラミングしたものであって，その検討・構築及びプログラミン
グのために，原告のほか，被告，東京共販及び富士通の従業員が関与し
（前記前提事実(3)イ），その要件書の完成まで約２年８か月，ソフトウ
ェアの完成まで約３年８か月を要したものである（前記前提事実(3)ウ）。
したがって，本件システムの全体の運用及びそれによる利益の増加とい
う実際面も含めて検討すると，原告の提供した知見が寄与した割合を，大
きいものとみることはできないというべきである。
他方，原告が合計７件の特許権を取得していること（前記前提事実
(4)），原告は平成２３年７月３１日まで被告の名古屋オフィスにおいて
勤務していたものであるが（前記前提事実(1)ア(ア)），原告が，本件シ
ステム開発に関与したことにより，被告において特段に有利な処遇を受け
た等の事実も見当たらないことも総合的に考慮すれば，原告の提供した知
的財産の使用料率としては，１パーセントが相当である。
キしたがって，本件システムを用いたシミュレーションにより，被告が５
年間において得た利益（前記５年分のコスト削減効果である２７億０２５
０万円）に，原告が提供した知的財産の使用料率である１パーセントを乗
じた額である２７０２万５０００円が，原告の提供した知的財産の使用許
諾料の額（「相応の対価」の額）として相当であると認められる。
クしたがって，原告は，被告に対し，原告と被告との間の合意に基づき，
２７０２万５０００円の支払を求めることができる。
(2)原告は，予備的請求として，債務不履行に基づく損害賠償又は不当利得
返還を請求するが，上記請求について認められ得る金額は，主位的請求につ
いて認められる上記金額（２７０２万５０００円）を超えるものではないと
認められる。
３争点(4)（遅延損害金の起算日）
原告と被告との間に，合意に基づく対価の支払時期の定めはされていなかっ
たものと認められる。しかし，原告が，平成１６年以降，被告に対し，上記合
意の履行を求めたのに対し（前記１(1)ス，セ），被告は，平成１９年２月２
日，２５０万円の支払を提示しているのであり，また，被告は，その直後の同
年３月には，富士通との間で締結していた本件システムの維持契約を更新しな
いことを決定したというのであるから，遅くとも２５０万円の支払を提示した
平成１９年２月２日時点においては，相当対価算定のため諸事情を考慮し得た
ものであって，同時点においては，上記合意に基づく対価の支払時期が到来し
ており，かつ，原告及び被告において，上記のとおり，合意に基づく対価の支
払時期が到来していることを認識していたものと認められる。
したがって，原告は，被告に対し，争点(1)イの当裁判所の判断に係る対価
額（２７０２万５０００円）に対し，上記支払時期の後の日である平成１９年
２月３日から支払済みまで民法所定の年５分の割合による遅延損害金の支払を
求めることができる。
４以上によれば，原告の請求は，被告に対し，２７０２万５０００円及びこれ
に対する平成１９年２月３日から支払済みまで年５分の割合による遅延損害金
の支払を求める限度で理由があるから，上記限度でこれを認容すべきこととな
る。
第５結論
したがって，主文のとおり判決する。
東京地方裁判所民事第２９部
裁判長裁判官大須賀滋
裁判官西村康夫
裁判官森川さつき
（別紙）
特許権目録
１特許番号特許第３６４４９５４号
発明の名称移動所要時間演算装置及びプログラム
出願日平成１５年１２月１５日
出願番号特願２００３－４１６４５１
登録日平成１７年２月１０日
２特許番号特許第４２１９３７２号
発明の名称単位費用演算装置及びプログラム
出願日平成１８年３月２９日
出願番号特願２００６－９２００５
優先権主張番号特願２００６－７９６２７
優先日平成１８年３月２２日
登録日平成２０年１１月２１日
３特許番号特許第４２３３３６１号
発明の名称配送拠点立地決定装置，決定方法，及びプログラム
出願日平成１５年３月１０日
出願番号特願２００３－６２８０８
登録日平成２０年１２月１９日
４特許番号特許第４７２１６７８号
発明の名称配送経路作成装置及びプログラム
出願日平成１６年９月１０日
出願番号特願２００４－２６４７５２
登録日平成２３年４月１５日
５特許番号特許第４９５４５８８号
発明の名称物流費用演算装置及びプログラム
出願日平成１８年４月５日
出願番号特願２００６－１０４１４５
登録日平成２４年３月２３日
６特許番号特許第４９６９０３３号
発明の名称配送可否分析装置，順路連結装置
出願日平成１６年９月２１日
出願番号特願２００４－２７４２４５
登録日平成２４年４月１３日
７特許番号特許第５０７９０６７号
発明の名称配送所属決定装置，及び，プログラム
出願日平成２２年１１月１日
出願番号特願２０１０－２４５５０８
分割の表示特願２００４－２６４７５２の分割
原出願日平成１６年９月１０日
登録日平成２４年９月７日

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